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没做实验!3个月发6分+SCI,这13个生信数据库快看过来……

没做实验!3个月发6分+SCI,这13个生信数据库快看过来……

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@各位医学研究生,假期余额告急,眼看着又要开学了,你们的论文完成的怎么样了?

反正我是丝毫没进展,我的生信文章数据分析还一直卡着……

前几天准备做GO和KEGG富集,才发现我连差异分析基因都没有。

只能紧急求助我的师姐(师姐曾三个月搞定一篇二区6分生信文章,却因缺席一次实验室被导师骂了!)

现在“生信难发高分”好像已经成为科研人的共识,但其实生信研究是有套路的,只要掌握了这些研究套路,不仅写起来很快,发高分也指日可待!

针对想快速发文的科研人来说,生信发文的优势还是很明显的:

优势一:生信分析的方法不难实现

只要肯用心去学,熟练运用生信分析,那写起SCI都是很简单的。

优势二:省时省力省经费

靠做实验发文章,不仅耗费时间,经费投入还很大,如果在生信文章里加入一些基本的实验验证,不仅能够省下很多的实验费用,也能够使文章的内容更加丰富,也更容易被接收。

但对初学者来说,最大的困难可能就是数据库的使用了。

生信挖掘的基本都是国外数据库,界面全英文,如何操作就是“卡脖子”的第一步!

师姐给我发来的13个生信数据库教程,完美解决了我生信发文的头号困难!

13个生信数据库涉及生信文章的四大组成板块:表达差异,功能聚类,交互网络与临床意义包含肿瘤和非肿瘤!

不仅教你数据库的基本操作,更会教你生信发文的思路、套路,让你一波带走一篇生信文章!

我也为大家争取到一波福利!13个生信数据库教程限时免费,相信有了这个教程,大家2023年第一篇SCI能更快见刊!(免费名额有限,赶紧扫描下方二维码,抢占名额~)

目录↓↓↓

13个生信数据库

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表达差异





89页TCGA数据库教程

TCGA官网提供检索以及简单的分析功能,数据下载后可通过工具进行分析,用的分析工具如R语言(有很多不同功能的R语言包),也有一些工具无需数据下载即可对TCGA的数据进行分析。








89页GEO数据库教程

GEO是著名的基因表达综合数据库,并自带GEO2R可以进行差异表达基因的分析,大家应该都有所耳闻!







64页ICGC数据库教程

ICGC数据库可作为TCGA数据库的补充,进行肿瘤相关研究。在一些高分的实验性论著中,也常常可以见到使用IGC数据库的身影。







61页Networkanalyst数据库教程

Networkanalyst数据库可以简单便捷地实现芯片或测序数据的处理和可视化分析。




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功能聚类





63页DAVID数据库教程

DAVID数据库可以简单便捷地实现多基因KEGG和GO富集分析。








93页GeneCards数据库教程

Genecards数据库是可检索的人类基因综合数据库,除了自建的信息外,还整合了超过150个外链数据库或网站的数据,其中125个网站数据自动同步更新。





49页GSEA数据库教程

传统的富集分析只能定位到功能,而GSEA则可以通过预定义的基因集在排序好的基因列表中的分布回答某通路被抑制还是激活。



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交互网络





69页JASPAR肿瘤数据库教程

JASPAR总共包含9个数据集,是一个收录转录因子与DNA结合位点以及结合模式的开源的公共数据库,不需要注册或登录就可以使用。








74页TARGET肿瘤数据库教程

TARGET数据库,一个针对儿童肿瘤的专业权威数据库,其数据更细分、更全面,是儿童肿瘤数据挖掘研究的宝藏数据库。






60页STRING数据库教程

STRING数据库全称为search tool for the retrieval of interacting genes/proteins,基因/蛋白相互作用检索搜查工具,用来构建蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI网络)。



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临床意义





41页CCLE数据库教程

CCLE数据库可简单便捷地实现基因在多个癌细胞系中的信息查询及可视化分析。










84页KM plotter数据库教程

利用KM plotter数据库可快速获得泛癌的生存曲线,出图即可用于文献发表,无需任何处理。







89页UALCAN数据库教程

UALCAN数据库可简单便捷地实现对公共数据分析、作图,在加速癌症研究方面非常有帮助。



总之,无论你是想发个3分,还是在5分陷入了瓶颈的,又或是想冲击8+,都能在这13个生信数据库教程里找到发文新思路!赶紧扫码,抢占免费名额吧~


2023


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