代谢研究发了11分的Nature Communications，我来解析下其内在的套路精华！

如今，科研界对代谢的研究已经如火如荼，同样是做代谢，如何能脱颖而出，关键是学习牛人的思路和方法！话不多说，进入正题。

这是发表于《Nature Communications》的一篇文章，终究是影响因子最吸引人（IF＝11.878）。

本文通过非靶向代谢组学、多种稳定同位素标记的代谢流分析及转录组学等技术阐述了癌症基因型和代谢依赖之间的分子联系，为靶向代谢治疗中的患者分层提供了依据。

Part one

1、EGFR活化促进丝氨酸合成

作者从TCGA数据库中进一步证实了上调的丝氨酸代谢。BAF3模型抑制剂研究结果显示，BAF3-EGFR细胞对丝氨酸合成抑制有反应，而BAF3-FGFR1细胞对丝氨酸合成抑制无反应，NCT503 结果相同。人肺癌细胞检测增值抑制率结果显示，同样验证了上面的结论。作者又进行了体内验证。

2、丝氨酸生成的增加是如何导致EGFR依赖性癌细胞恶性生长的？

作者采用同位素标记法对葡萄糖进行标记，结果表明EGFR通过促进SSP来为DNA/RNA合成提供核苷酸。与FGFR1活化细胞相比EGFR活化细胞相对较少依赖于丝氨酸的外援供应。

3、EGFR活化究竟如何实现激活SSP？

作者从BAF3细胞模型、TCGA数据验证以及PDX模型中对SSP相关蛋白表达进行验证，发现表达显著上调，并可以用抑制剂进行逆转。作者又进行了TCGA共突变和基因沉默验证。

Part two

1、FGFR活化增强有氧糖酵解和乳酸循环

作者对BAF3模型进行葡萄糖消耗和乳酸产生检测，乳酸和葡萄糖同位素标记验证FGFR突变细胞似乎更倾向于在体外消耗乳酸盐用于TCA供应，并且乳酸可以作为TCA循环中与葡萄糖同等的能源。OCR、ATP、ROS检测再次验证了这个结论。

与第二部分的EGFR验证相同，作者做了相关蛋白表达检测并抑制剂测试对瘤提及的影响，并进行了野生型验证。不同的是增加了CRISPR / Cas9基础的筛选。

Part three

1、ATF4和MYC协调代谢重编程

作者探究FGFR和EGFR依赖性细胞中转录组重编程的TF。发现MYC和ATF4分别在FGFR依赖的细胞和EGFR活化细胞中发挥着更为主导的作用。网络分析验证，主导性分析证明MYC和ATF4分别在FGFR和EGFR突变细胞中起主导作用。

代谢重编程它为癌症患者创造了新的治疗机会并推动越来越多的抗癌药物发现。什么是代谢重编程呢？代谢重编程就是由因代谢酶的遗传改变或致癌基因激活而引起的某个代谢通路发生变化。

 

最后附上总的代谢图，本文通过非靶向代谢组学、多种稳定同位素标记的代谢流分析及转录组学等技术阐述了癌症基因型和代谢依赖之间的分子联系，为靶向代谢治疗中的患者分层提供了依据。

据说点“在看”的都成功发表SCI了呢

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来源: qq

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