2023年张锋发表4篇Nature，Science及Cell

RNA引导系统利用引导RNA和靶核酸序列之间的互补性来识别遗传元件，在原核生物和真核生物的生物过程中都起着核心作用。例如，原核CRISPR-Cas系统为细菌和古细菌提供了对外来遗传因子的适应性免疫。Cas效应物，如Cas9和Cas12，执行引导RNA依赖的DNA切割。虽然目前已经研究了一些真核生物RNA引导系统，如RNA干扰和核糖体RNA修饰，但真核生物是否有RNA引导的内切酶仍不清楚。

最近报道了一类新的原核生物RNA引导系统(称为OMEGA)。OMEGA效应物TnpB被认为是Cas12的始祖，具有RNA引导的内切酶活性。TnpB也可能是真核转座子编码的Fanzor (Fz)蛋白的祖先，这提高了真核生物也配备CRISPR-Cas/OMEGA样可编程RNA引导内切酶的可能性。

2023年6月28日，博德研究所张锋团队在Nature 在线发表题为“Fanzor is a eukaryotic programmable RNA-guided endonuclease”的研究论文，该研究报告了Fz的生化特性，表明它是一种RNA引导的DNA内切酶。该研究还表明Fz可以被重新编程用于人类基因组工程应用。该研究利用冷冻电镜分析了Spizellomyces punctatus Fz (SpuFz)在2.7Å的结构，揭示了Fz、TnpB和Cas12之间的核心区域的保守性，尽管同源RNA结构不同。总之，该研究结果表明Fz是真核生物的OMEGA系统，表明RNA引导的内切酶存在于生命的所有三个领域。

另外，2023年4月6日，博德研究所张锋团队在Science 在线发表题为“Structure of the R2 non-LTR retrotransposon initiating target-primed reverse transcription”的研究论文，该研究报道了Bombyx mori R2 non-LTR逆转录转座子在其核糖体DNA靶点处启动TPRT的冷冻电子显微镜结构。目标DNA序列在插入位点被解开，并被上游基序识别。逆转录酶(RT)结构域的延伸识别逆转录转座子RNA，并引导3 '端进入RT活性位点以模板逆转录。该研究使用Cas9在体外将R2重定向到非原生序列，这表明未来可以作为一种基于可重编程RNA的基因插入工具。