关键词:COVID;突变株;监测
1,BA.2.86家族逐渐成为主流毒株之一
在全球普遍放开的情况下,新冠的主流毒株也越来越趋向一致。美国和英国尽管也已经取消了全面监测,但仍有持续的数据更新,故对其他国家仍有借鉴意义。
这个周末,美国疾控中心(CDC)没有如期发布每两周一次的新冠毒株检查报告【1】。但科学家Raj于11月9日在其推特(Musk已改名为X)上公布了全球的新冠毒株检测结果【2】;另外,英国卫生部的检测结果同样详尽【3】。Raj公布的全球新冠毒株检测显示:目前最常检出毒株为HK.3,占10.7%;其余如下图所示。其中红色标记的毒株是比例在增长的毒株,也正是英国检测到的周增长率最快的四个毒株,按照增长率依次为:JG.3,HV.1,JN.1,HK.3。HK.3 (10.7%)HV.1 (9.2%)EG.5.1.1 (6.9%)
EG.5.1.3 (4.6%)
EG.5.1 (4.6%)JG.3 (3.5%)JD.1.1 (2.9%)
FL.1.5.1 (2.4%)--
BA.2.86.1 (2%)JN.1 (1.3%)检测指标中最早反映疫情变化的是废水中新冠病毒浓度和新冠检测阳性率,这两项指标都显示,美国新冠疫情不再改善、而是再次绷紧。根据美国废水中新冠病毒监测网站更新到11月6日的数据【4】,从六月底开始持续增高的美国废水新冠病毒浓度在8月底达到最近半年的高峰640拷贝数/mL,目前已降低到424拷贝数/mL。需要警惕的是,从10月中旬开始,废水中新冠病毒浓度再次缓慢增高。
与此同时,仅从美国CDC更新到10月28日的数据显示,最近2周美国新冠病毒检出率未再降低(橙线所示),最新一周检出阳性率为9%,较之前一周无显著变化【5】。
(美国新冠住院(蓝色柱状图)和检出阳性率(橙线)变化。图源:美国CDC)根据美国CDC截止到10月28日的数据,美国因新冠去急诊就诊的病例数(橙线)较一周前降低了5.3%;截止到10月28日的数据显示,因新冠感染而住院的人数(蓝色柱状图)较过去一周增长了0.1%【6】。新冠病毒通过免疫逃逸来避开人类已经建立起来的免疫保护。英国政府的COVID监控显示【3】,目前新冠病毒XBB.1.9的后代中具有FLip双突变的亚型仍然成为10月底检测中的主流毒株。同时,前一阵子在学界掀起巨浪的BA.2.86及其子代也出现在英国的监测体系内,已经占新检出毒株的9.2%;分别由5.1%(BA.2.86.1)+ 1.3%(JN.1)+ 1.1% (JN.2) + 1.7%(JN.3)组成。
从新冠毒株的增长优势看,XBB.1.9的第5代孙JG.3周增长率最高,达78.12%;其次是XBB.1.9的另一个第五代孙HV.1,周增长率为32.16;BA.2.86.1的周增长率为31.39%,居第三位;HK.3居第四位,周增长率为16.4%。
正是由于这些新的突变,以及美国CDC报告的2023年重症患者的特征,促使美国CDC继续督促老年人及免疫功能低下的人群及时接种更新的疫苗(2023-2024年度是针对XBB.1.5毒株);一旦确诊,及时口服抗病毒药物预防重症。
我们会继续保持关注,提供最新的新冠相关科学报告和数据。【1】 https://covid.cdc.gov/covid-data-tracker/#variant-proportions【2】 https://twitter.com/RajlabN/status/1722450394373034459【3】 https://www.gov.uk/government/publications/sars-cov-2-genome-sequence-prevalence-and-growth-rate/sars-cov-2-genome-sequence-prevalence-and-growth-rate-update-11-october-2023【4】 https://biobot.io/data/【5】 https://covid.cdc.gov/covid-data-tracker/#maps_positivity-week【6】 https://covid.cdc.gov/covid-data-tracker/#maps_new-admissions-rate-county本文只是分享和解读公开的研究论文及其发现,以作科学文献记录和科研启发用;并不代表作者或本公众号的观点。为了给大家提供一个完整而客观的信息视角,我们有时会分享有冲突或不同的研究结果。请大家理解,随着对疾病的研究不断深入,新的证据有可能修改或推翻之前的结论。
编辑:Henry,微信号:Healsan;加好友请注明理由。助理:ChatGPT作者简介:美国Healsan Consulting(恒祥咨询),专长于Healsan医学大数据分析、及基于大数据的Hanson临床科研支持。主要为医院科研处、生物制药公司和医生科学家提供分析和报告,成为诸多机构的“临床科研外挂”。点击👆;From Bench to Bedside, Healsan Paves the Path.更多阅读:
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