关键词:COVID;突变株;监测
1,BA.2.86家族在美国快速增长
在全球普遍放开的情况下,新冠的主流毒株也越来越趋向一致。美国尽管也已经取消了全面监测,但仍有持续的数据更新,故对其他国家仍有借鉴意义。
2023年11月27日,美国疾控中心(CDC)如期发布每两周一次的新冠毒株检查报告【1】。检测数据显示:
1)HV.1仍然是美国最常见检出毒株,且已经占到31.7%;
2)EG.5占比13.1%;
3)BA.2.86占比8.8%。
其他常检出毒株还包括JD.1.1,HK.3,FL.1.5.1,JG.3等。
(美国最常检出新冠毒株。图源:美国CDC)
从这些新冠毒株的进化树可以看到,除了BA.2.86及其家族异军突起,目前主流毒株几乎都来自于XBB.1.9家族。
2,美国新冠病毒监测显示疫情再次开始绷紧
检测指标中最早反映疫情变化的是废水中新冠病毒浓度和新冠检测阳性率,这两项指标都显示,美国新冠疫情不再改善、而是再次绷紧。
废水中新冠病毒浓度再次增高
根据美国废水中新冠病毒监测网站更新到11月27日的数据【2】,美国废水新冠病毒浓度最近1个月再次缓慢增高,目前已经增长到到553拷贝数/mL。
与此同时,仅从美国CDC更新到11月18日的数据显示,最近2周美国新冠病毒检出率变化不大(橙线所示),最新一周检出阳性率为8.2%,较之前一周无显著变化【3】。
(美国新冠住院(蓝色柱状图)和检出阳性率(橙线)变化。图源:美国CDC)根据美国CDC截止到11月18日的数据,美国因新冠去急诊就诊的病例数(橙线)较一周前增高了1.8%;截止到10月28日的数据显示,因新冠感染而住院的人数(蓝色柱状图)较过去一周增长了9.7%【6】。针对BA.2.86的快速增长,美国CDC描述的临床流行病学特征如下【5】:CDC 预计 BA.2.86 及其分支(如JN.1) 在 SARS-CoV-2 基因组序列中所占的比例将继续增加。
目前,BA.2.86 似乎并未导致美国感染或住院人数的增加。
CDC 促成并同意世界卫生组织最近关于 BA.2.86 的风险评估根据现有的有限证据,表明与其他流行的变种相比,该变种造成的公共健康风险较低。
更新的 COVID-19 疫苗预计将增强对 BA.2.86 的保护,就像对其他变种的保护一样。
正如之前的更新中提到的,COVID-19 测试和治疗预计对这种变种(包括其分支 JN.1)有效。
目前无法知道 BA.2.86 感染是否会产生与其他变种不同的症状。一般来说,不同变体的 COVID-19 症状往往相似。症状的类型及其严重程度通常更多地取决于一个人的免疫力,而不是引起感染的变体。
也就是说,美国CDC认为根据目前的证据,BA.2.86并不会导致更严重的流行及更严重的临床症状;与此同时,目前已有的检测手段仍能够有效检出BA.2.86、更新的疫苗(针对XBB.1.5抗原)对BA.2.86有预防保护。
这个结论与英国检测数据相似【6】,从新冠毒株的增长优势看,XBB.1.9的第5代孙JG.3周增长率最高,达78.12%;其次是XBB.1.9的另一个第五代孙HV.1,周增长率为32.16;BA.2.86.1的周增长率为31.39%,居第三位;HK.3居第四位,周增长率为16.4%。我们会继续保持关注,提供最新的新冠相关科学报告和数据。【1】 https://covid.cdc.gov/covid-data-tracker/#variant-proportions【2】 https://biobot.io/data/【3】 https://covid.cdc.gov/covid-data-tracker/#maps_positivity-week【4】 https://covid.cdc.gov/covid-data-tracker/#maps_new-admissions-rate-county【5】 https://www.cdc.gov/respiratory-viruses/whats-new/covid-19-variant-update-2023-11-27.html【6】 https://www.gov.uk/government/publications/sars-cov-2-genome-sequence-prevalence-and-growth-rate/sars-cov-2-genome-sequence-prevalence-and-growth-rate-update-8-november-2023本文只是分享和解读公开的研究论文及其发现,以作科学文献记录和科研启发用;并不代表作者或本公众号的观点。为了给大家提供一个完整而客观的信息视角,我们有时会分享有冲突或不同的研究结果。请大家理解,随着对疾病的研究不断深入,新的证据有可能修改或推翻之前的结论。
编辑:Henry,微信号:Healsan;加好友请注明理由。助理:ChatGPT作者简介:美国Healsan Consulting(恒祥咨询),专长于Healsan医学大数据分析、及基于大数据的Hanson临床科研支持。主要为医院科研处、生物制药公司和医生科学家提供分析和报告,成为诸多机构的“临床科研外挂”。点击👆;From Bench to Bedside, Healsan Paves the Path.(点击👆图片,进入自己感兴趣的专辑。或获得点击“资源”,浏览本公众号所有资源。)