纯生信SCI,11.5分,这种生信分析套路一路狂飚,别人都发了3篇SCI了,你还没用起来嘛?
最近,很多小伙伴都在说,生信很难发,一直被拒稿……
生信的套路迭代实在太快,想要快准狠发表自己的第一篇生信文章,我们就要学会从不变的套路找到一个新的套路!
如果你现在面临着:
想发生信文章,没有思路 着急毕业,想快速发一篇文章 工作很忙,没时间学R语言
课程大纲
Day1:【基础学习】
什么是生信研究?
生信研究的参数结构
生信发文现状
Day2:【课题设计】
生信发文流程
如何判断疾病能不能做生信分析
课题设计
生信研究的套路
Day3:【实操复现】
数据库和工具介绍
单基因肿瘤/非肿瘤/临床预测模型等套路实操复现
01
八大生信新套路
高手如何玩转生信分析?本次伴学营会为大家带来八大高分套路。
本篇文章,先带大家看一看双疾病双向孟德尔随机化分析和单细胞转录组分析!(更多高分套路,大家可以扫描文末二维码,免费学哦~)
>>> 双疾病双向孟德尔随机化分析
在双向孟德尔随机化中,利用已知的基因变异作为"工具变量“来模拟随机的基因表达或功能的变化。这些工具变量必须满足一定的条件,以确保其与感兴趣的特征或疾病之间不存在直接的关联,仅通过影响其他基因间接地影响了这些特征。通过将这些工具变量应用于双向的因果推断,研究人员可以更好地理解多个基因对多个特征的影响方式
双疾病可以运用双向孟德尔随机化方法进行研究,主要是因为在双疾病研究中,可能存在多个基因对多个疾病的影响,而单一的孟德尔随机化方法往往无法考虑到这种复杂性。双向孟德尔随机化方法可以更好地决多个基因与多个疾病之间的因果关系问题,从而提供更准确的结论。
双疾病双向孟德尔随机化分析有以下优势:
考虑问题的复杂性:双向孟德尔随机化可以应对多个基因与多个疾病之间可能的复杂相互作用。这种方法能够更准确地揭示基因与疾病之间的因果效应,避免过度简化问题。
混淆因素控制:由于多个基因和多个疾病之间可能存在交互作用,传统的单因素分析方法很难有效控制混淆因素。双向孟德尔随机化可以通过工具变量来减少混淆因素,提供更可靠的因果关系判断。
更好地理解问题:运用双向孟德尔随机化研究双疾病关联,可以揭示两种疾病之间的共同遗传风险因子、生物学途径和分子机制。这有助于更全面地理解双疾病之间的联系,为药物开发和个性化医疗提供新的线索。
>>>单细胞转录组分析
单细胞转录组分析是生信领域的一项重要研究方向,致力于对单个细胞的基因表达进行全面的分析。传统的转录组分析通常是对大量细胞的平均表达水平进行测定,而单细胞转录组分析则可以对每个细胞的基因表达进行独立测定,从而揭示细胞间的异质性和多样性。
单细胞转录组分析具有以下优势:
揭示细胞异质性:传统的转录组分析通常是对大量细胞进行平均测定,无法区分不同细胞之间的异质性。而单细胞转录组分析可以在单个细胞水平上获取基因表达信息,从而揭示细胞之间的差异和多样性。
发现新的细胞类型和亚群:单细胞转录组分析可以发现以前未知的细胞类型和亚群,帮助更全面地了解生物系统的复杂性。
精准的细胞状态分析:单细胞转录组分析可以捕捉细胞在不同状态下的基因表达变化,帮助研究人员了解细胞发育和功能的动态变化。
探索细胞间相互作用:通过单细胞转录组分析,可以了解细胞之间的相互作用和通讯,揭示细胞的功能调控网络
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02
六大生信常规套路
>>> 单基因肿瘤生信研究套路
单基因分析是生信研究中最经典且基本的套路之一。它主要针对一个特定基因,通过不同的统计学和计算生物学方法,深入研究其功能和调控机制。随着高通量测序技术的发展,我们能够轻松获取大量基因表达和变异数据,为单基因分析提供了丰富的信息资源。
通过单基因分析,我们能够深入研究基因在生物体内的表达和调控情况,进而探索其与生物学过程和疾病发展的关联。单基因分析的方法主要包括差异表达分析、富集分析、功能注释等,这些方法帮助我们发现与特定生物学过程或疾病相关的基因,并从中挖掘出有价值的信息。
单基因分析的优势在于其相对简单的分析方法和套路。对初学者来说,学习单基因套路是一种低门槛的入门方式帮助他们快速上手生信分析。此外,单基因分析也是学术发表的一个可行途径,其结果可以产生多样化的论文成果,既有潜力发表高质量的SCI论文,也适合批量发表低分SCI文章。
尽管单基因分析的套路相对固定,但仍需注意不宜死板地照本宣科。为提升文章的创新性,可以尝试针对前人涉足较少的领域进行研究,或结合其他研究方向进行深入分析。充分发掘基因间相互作用,或者从新的角度探索基因的功能,都能为单基因分析带来更加新颖和有意义的成果。
总体而言,单基因分析作为生信研究的基石,是生物学研究中不可或缺的一部分。学习和掌握单基因分析的方法不仅能为生信初学者提供稳固的学习基础,还为深入探索基因功能、疾病机制以及生物学规律打下坚实的基础。
>>> 临床预测模型套路
临床预测模型套路是指在生物信息学领域中,通过利用临床数据和基因组学数据,构建和应用预测模型来预测疾病发生、进展、治疗效果等临床相关的特征或结果。临床预测模型套路通常需要根据特定的研究目的获取数据并选择特征,之后需要构建模型并进行模型性能的评估,。
发表临床预测模型套路可以带来客观性、高准确性、实证效果和应用证明、实用性、可迭代性、交叉学科合作和影响力等方面的优势。由于临床预测模型套路在这些方面的优势,一篇数据来源和描述客观性强、模型特征选择合理,模型验证充分且验证结果可靠,应用前景广阔的临床预测模型套路文章,可以发表影响因子较高的生信SCI。
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03
零代码发生信SCI
看完这么多生信套路,小伙伴是不是第一反应就是我要学代码了,什么R啊,Linux啊,Python啊,想想都会感觉到害怕……
其实,零代码也可以发生信!
生信发表级图片、数据分析等内容,用仙桃工具,一键就能出图出结果!
在本次伴学营讲师,会实操演示如何使用仙桃工具,复现多种生信研究套路。无论你是初学者还是资深研究者,都能从中受益,提升科研效率,早日发表SCI,顺利毕业和晋升。
写在最后:
代码从来都不是生信发文的必需品,人的精力有限,很难做到兼顾。与其在代码上耗费大量时间,不如将这些繁琐的工作交给仙桃工具来完成!
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