在医学研究中,信号通路一直是重中之重。信号通路像是桥梁,将生物分子和临床疾病联系在了一起,使临床表型和基础研究相结合。
在不同的文章中,虽然研究的是不同的分子,但是却有可能具有相似的研究框架,甚至是相同的疾病模型。所以,在同样的科研套路中,发生变化的其实只有分子或者是药物,或者信号通路。变量,就是课题中的主角和配角演员。我们以国内团队某影响因子48.8分研究为例:国人研究团队联合发表,其通讯作者来自中科院、中山大学附属第二医院、陆军军医大学第三附属医院。(来源:PubMed)标题:《Antiandrogen treatment induces stromal cell reprogramming to promote castration resistance in prostate cancer。》
期刊:Cancer Cell(影响因子48.8分,中科院&JCR双一区!)
该研究就重点强调了 SPP1-ERK 信号在肿瘤治疗中的作用,靶向 SPP1 和 ERK 信号,可抑制肿瘤相关成纤维细胞(CAFs)表型转换,进而提高肿瘤治疗效果。但想靠信号通路发高分文章并不容易。看了那么多高分文章,你对信号通路到底了解多少呢?想Get答案的同学,赶紧到我们的信号通路伴学营中看看吧!
老师不仅会帮大家解决以上关于信号通路的难点,教给大家信号通路研究相关的超多科研干货知识,还会教你学会正确使用功能强大的AI工具!即便你是0基础科研小白,看完也能轻松上手信号通路研究!拿捏90%分子研究机制!点击下方图片 添加班主任学习
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现在,小刀先带各位同学提前了解一下课程内容~
本节伴学营课程共分为3大部分,为期2天教学!看完课程大纲,你就能明白这节课有多么系统细节。
课程大纲
一是明确该通路中的配体和受体、蛋白激酶,以及转录因子,具体表现为提炼出该条通路有代表性的待测分子。也就是说,检测哪些分子的表达能够指示该条通路的状态。二是理解该条信号通路的活化过程,及其受到的正调控和负调控。推荐大家的学习顺序就是按照受体的类型来分门别类地去记忆。在本节伴学营的一开始,老师就为我们详细介绍了信号通路的核心成员!信号通路是什么?核心成员有哪些?信号通路传导过程中的普遍规律是什么?……建议0基础学员逐字逐句听讲记录!全都是干货!
想要结合信号通路设计出一个3分+高分课题,我们首先要了解信号通路在课题中扮演什么角色?信号通路在课题中应该是万年配角,很少作为主角出现,通常是做因变量。但是,信号通路中的某个关键分子,是可以作为课题的主变量来出现的。我们现在提及的,都是把一群分子当做一个整体的这种信号通路。信号通路作为因变量,可以有间接机制,也可以有直接机制。那么,下游通路如何筛选?该信号通路为什么被激活了,由何种分子介导?信号通路激活后,细胞为何发生了变化?……本伴学营里全都讲到了!最重要的是,老师讲清楚了如何利用AI工具——LibreChat的强大功能,辅助完成课题设计!
在伴学营课程中,老师列举了2种信号通路的检测方法,一种是Western Blot,另一种是细胞免疫荧光检测(又称IF检测)。从检测原理到检测过程中的注意事项,老师全都讲解清楚了!课上,老师以几篇文献为例,介绍了Western Blot和免疫荧光显示是如何表达出XXX信号通路的状态发生了改变。
在伴学营课程中,老师列举了3种信号通路的常用筛选策略。一般来讲,在一项研究中,我们会根据前期研究或者数据分析,先确定一个主变量分子,也就是我们课题的主角。然后操作主变量(过表达、敲除),接着去检测一些表型,发现有一些表型的确发生了改变,这时候我们再进一步去探究其中的机制,也就是需要解释操作主变量后为什么表型发生了改变,其中机制就包括了某信号通路的激活。当然,这个主变量也可以是某一种药物。但是通路一般是不能作为主变量的,信号通路是万年配角,总是作为解释机制的演员,而不能做主角。在已经明确检测到表型时,其实我们已经知晓了这个课题的头和尾,或者叫机制链条的起点和终点。这种时候,我们采取模式一和模式二。除了常规的筛选分子的方法,针对信号通路,有没有特异性更好的方法可以选择呢?在伴学营中,老师详细介绍了生物芯片技术的本质、类型、原理,以及它在信号通路筛选中的应用。
检索信号通路时,我们最常用的数据库就是KEGG数据库。KEGG数据库是一个综合数据库,它整合了基因组、化学和系统功能信息,并建立了跨物种间的联系。它基于可计算的形式捕捉和组织实验得到的证据,形成系统的功能知识库,并能通过强大的图形功能展现信号途径及各分子间的关系。在伴学营中,老师详细介绍了KEGG数据库的常用功能,以及如何利用AI工具快速学会使用KEGG数据!学会本节课后,无需你再费劲心思找KEGG数据库的使用方法,绞尽脑汁想如何做信号通路相关的课题设计!二元间接机制是最简单的。包括,药物调控通路,导致某表型,也包括分子调控通路,导致某表型。二元直接机制相对复杂一些,一般指分子通过相互作用激活了某通路,导致了某表型。如果想用药物来作为起点,也可以,那么可能需要知道该药物的化学结构,以及它能否与通路上游的成员发生交互作用。随后,反馈环路也是出现特别多的中高级套路。通路被激活后,导致了某些分子的表达发生了变化,这些分子正好也是该通路中的成员,因此构成了正反馈环路或负反馈环路。其实,信号通路除了参与二元直接/间接机制的文章以外,还参与了三元变量机制的研究。总的来说,目前信号通路可选择的套路模式还是很多的,想发高分SCI文章的小伙伴赶快来冲吧!
如果你想快速入门信号通路研究?想借助AI工具来了解检测信号通路时的注意事项和重难点?那真的建议你先来学学这节【AI辅助信号通路研究】伴学营课程!内容由浅入深,超多干货,助力0基础小白轻松掌握信号通路,发表高分SCI文章!点击下方图片 添加班主任学习
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