也谈谈 Delta 病毒
一种病毒大体可有三种特征:传染性,致病性和抗免疫性能。这三种特性有时候很难分开,因为一种变异可能导致病毒一种特性或者多种特性的变化。如果传染性增加,其他变化不大,其结果就是染病的人多一些。致病性就不一样了。致病性增加,重症患者增多,会让医疗系统不堪重负。新冠的致病性应该主要由它的S蛋白引起(当然这是笔者的个人看法)理由是注射疫苗后在人体中仅仅生成了S蛋白,并没有病毒的其他组成成分没,但是人体的反应几乎等同感染了新冠后的许多症状。当然各种症状都很轻,因为S蛋白的浓度很轻很有限,不像真正的感染,S蛋白的“供应”源源不断那样。抗免疫性就是现有的抗体对病毒的中和能力下降或者消失。
传染性高有两个表现,第一,少量的病毒(吸入)就会导致感染,第二病毒进入人体后能很快复制自己,因此能在较短的时间内成为传染源。新冠病毒进入人体后, 首先要和人体细胞表面的受体(ACE2)结合。这个结合是动态的,就是说结合后,又会分开,分开后,又会再结合,再分开,这是一个平衡过程。有一个常数(Kd)衡量结合的紧密程度。野生的新冠Kd大约为75nM(呐摩尔)。如果病毒浓度低于75nM,则病毒处于闲散状态。这时,如果人体的免疫系统发达,从身体其他部门兼程赶来的免疫细胞,就会消灭这些外来的入侵者。如果病毒(S蛋白)超过这个浓度,就有一部分病毒和人体细胞的受体结合。和受体结合仅仅是第一步。第二步,病毒要进入细胞,利用人体细胞的复制能力繁殖自己。
新冠病毒的S蛋白有两个单元:S1和S2。S1负责和人体的受体(ACE2)结合,S2 负责在人体细胞表面打洞,当S2打好洞后,在整个病毒颗粒就会进入人体细胞。这两个单元是连接在一起的,只有当S1 和ACE2结合后,病毒就会利用人体细胞表面的剪切酶把S1和S2剪开。据说剪切的快慢会影响的病毒进入细胞的效率。记得去年有印度人在网上登出一篇文章,说是在S1和S2之间有一个插入了的小片段PRRA。因为有了这个小片段,弗林蛋白酶工作的效率会更高。据此,他们称,这个病毒是人造的。为什么有了这个小片段剪切酶的工作效率会增高?R是精氨酸的代号,它带一个正电荷。当两个精氨酸(正电荷)在一起 蛋白片段就会张开,形成一个环状。如同剪断拉紧了的绳子一样,弗林蛋白酶的工作自然容易得多。
好了,应该说说这个举世闻名的Delta病毒了。这个变种有什么特点?Delta变种有许多点为变异,T19R, G142D, 156del, 157del, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, D950N。前五个在结构区,一般认为对病毒的性质影响不大,因为结构区的变化,很少会影响到S蛋白和人体细胞表面的受体 (ACE2) 的结合能力。所谓的结构区,也就是搭个架子而已。好像一个人的腿受伤了,不会影响他的坐在键盘前的打字能力一样。
L452R, T478K属于和受体结合区部位,影响比较大。但是也不是特别大的影响,据报道 L452R, T478K两个合在一起,和ACE2的结合常数大约在57nM 左右,相比野生的新冠病毒RBD的结合常数75nM,虽然小了一点,不算很出格。那么Delta病毒的高传染性该怎么解释? 很可能是由于P681R。前面提到的PRRA中的P就是这个681处的。现在那个能提高弗林蛋白酶工作效率的PRRA就成了RRRA. 同样的道理,如果PRRA能提高剪切酶的效率,没有任何理由怀疑RRRA能进一步提高剪切效率。所以Delta病毒的高效复制就是自然的了。据说原来野生的新冠病毒的潜伏期大约是7-10天左右。现在据说这个Delta病毒的潜伏期缩短为4-5天。可能的原因是病毒进入人体的速度快了,复制的周期缩短了,发病“及时”了。如果以前怀疑PRRA是人为插入的,是否现在要进一步怀疑这个P681R是什么人的“杰作”? 我看不是,原来的所谓人为插入也是扯淡。
好在虽然Delta病毒具有很高的高传染性,但是现在的主要几个疫苗还管用,虽然保护效率也降低了许多。就是说疫苗所用的抗原和Delta病毒的抗原差别不很大。不像南非的那个beta变种,简直算是“男变女妆”,或者“变性”了,大约有少一半左右的疫苗所产生的抗体 对于beta变种完全无效(认不得了)。此外,beta变种和ACE2 的结合能力更强,而且现有疫苗的效率大大的降低,好在南非那个变种的传染性没有这个delta 厉害。如果将来有一天delta和beta 组成了新的联盟,人类就要抓瞎一段时间了。