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弱问：genome-wide RNAi Screening

弱问：genome-wide RNAi Screening# Biology - 生物学

b*l2010-11-23 08:11

1 楼

《奇皇后》我看完了。非常精彩比武媚娘好看多了。没有露胸没有浓妆没有床戏，但演
员演的眼睛都是红的，那个不是装的是真的入戏，特别到位。真心推荐。我最近在跟着
戏里学着画韩式粗眉，感觉效果比以前好，口红也跟着戏里学的涂薄薄一层，无唇线，
淡粉色，很喜欢。

s*92010-11-23 08:11

2 楼

市场上能买到的是哪款？二手的也行

E*e2010-11-23 08:11

3 楼

paper上说的不是太详细，只是说screen with a siRNA library targeting 21000
human
genes. 请问这个具体怎么操作的？这个library拿到手是2万多个管子吗？然后一个个
的做transfection？
这个工作量太大了吧？

s*42010-11-23 08:11

4 楼

【在 b*****l 的大作中提到】

: 《奇皇后》我看完了。非常精彩比武媚娘好看多了。没有露胸没有浓妆没有床戏，但演
: 员演的眼睛都是红的，那个不是装的是真的入戏，特别到位。真心推荐。我最近在跟着
: 戏里学着画韩式粗眉，感觉效果比以前好，口红也跟着戏里学的涂薄薄一层，无唇线，
: 淡粉色，很喜欢。

S*r2010-11-23 08:11

5 楼

HD2?

s*s2010-11-23 08:11

6 楼

有人做好了，都是trangenic rnai，robot操作的，普通实验室就不要想了

【在 E*****e 的大作中提到】

: paper上说的不是太详细，只是说screen with a siRNA library targeting 21000
: human
: genes. 请问这个具体怎么操作的？这个library拿到手是2万多个管子吗？然后一个个
: 的做transfection？
: 这个工作量太大了吧？

c*02010-11-23 08:11

7 楼

贝贝上张妆后图呗

w*x2010-11-23 08:11

8 楼

wp7 penny phones.

【在 s****9 的大作中提到】

: 市场上能买到的是哪款？二手的也行

z*g2010-11-23 08:11

9 楼

一般是micoplate version and reverse transfection.普通实验室在现在这个大环境
下恐怕完不起,并且后期N多data处理也不是普通实验室能干的活.

【在 E*****e 的大作中提到】

n*02010-11-23 08:11

10 楼

支持。坐等。

【在 c***0 的大作中提到】

: 贝贝上张妆后图呗

n*72010-11-23 08:11

11 楼

得签约吧？

【在 w******x 的大作中提到】

: wp7 penny phones.

n*n2010-11-23 08:11

12 楼

好像是在96孔板里面，操作的时候都是用机械臂取样的，转染可以用反向转染，一般普
通实验室确实没办法操作，通常有辅助中心一类的吧，1个月差不多能做一遍吧

【在 E*****e 的大作中提到】

s*42010-11-23 08:11

13 楼

讨厌阴暗的宫廷剧。

K*e2010-11-23 08:11

14 楼

得有一个机器人才行。
我们实验室有4个课题是这样的，动不动老板就叫嚣要把全基因组RNAi筛一遍。针对每
个基因都有3个不同的siRNA。除了针对基因的，也有针对小RNA的库
还分成很多sub库，比如跟细胞周期有关的库，跟damage有关的等等。并不一定每次都
得筛2万多基因

b*l2010-11-23 08:11

15 楼

我得先去买根细眉笔：）

【在 c***0 的大作中提到】

: 贝贝上张妆后图呗

d*p2010-11-23 08:11

16 楼

siRNA，合成的，不能做pool screeing，所以全基因组的必须要有机械臂。
shRNA，在病毒载体上，可pool screeing. 全基因组的，可分成多个pool，你收到的是
plasmid mixture。普通实验室都可以做，只要你能拿到这个library.

b*l2010-11-23 08:11

17 楼

比现在天朝真实剧情明亮多了啊。

【在 s*********4 的大作中提到】

: 讨厌阴暗的宫廷剧。

c*r2010-11-23 08:11

18 楼

俺们实验室原来的那个就是siRNA的genome RNAi筛选，有机械臂。
但是我觉得前期的优化和后期的数据处理都是问题。比如设计好的程序来尽量减少假阳
性，总之需要一定编程能力的人是最好，否则只能针对一些很简单的表形。
比如今年nature有一篇EMBL的mitocheck的那个筛选，人力物力巨大，但是我们组至少
就发现他们在某些表形上漏了很多candidates。。。当然没有完美的东东啦。。
后期数据处理分析需要服务器，数据库等等。。。总之需要的技术支持不少。
那个筛选开始的时候我们学校还没有BIO-screen facility center,所以所有的程序优
化，数据处理基本都是一个PHD做的。。。
现在学校有辅助中心了，工作量小了很多，他们也买了很多LIBRARY,药物的，化合物的
，部分基因组的等等。
当然最重要的还是要有钱。。。老板当年为了做这个筛选四处要钱都抓狂了。。。我还
记得我刚进实验室的时候老板跟我说："靠，现在总算有钱来实施我的雄伟计划X了。。
哦哈哈哈"...汗

b*l2010-11-23 08:11

19 楼

嘻嘻

【在 n******0 的大作中提到】

: 支持。坐等。