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Pac Bio 的技术怎么样?
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Pac Bio 的技术怎么样?# Biology - 生物学
S*t
1

很多人想离开北上广这样的大城市,是因为在这里感到了某种“软弱”。
大部分人都是这样的状态:抱着拼搏的雄心,兴奋地想开启新生活,然后在某列早高峰
转不开身的地铁上,冒出离开的念头:“可能我太脆弱,承担不了这一切。”
你能从一座大城市混杂的空气里听到各种各样的声音。能听到人们谈论财富、野心、名
声,也能听到智慧、健美、时尚。这些吸引人,也给人压力。除了这些,你还能听到很
多关于城市生活的抱怨,并且很可能,你也是这些抱怨的参与者。
这些抱怨让大城市显得不迷人、可怕:频繁的雾霾、难以忍受的房价、拥挤不堪的交通
、极高的生存压力。
但下面才是我今天想要告诉你的:因为脆弱而“逃离”大城市是不明智的。
一旦你意识到大城市给你提供了多少安全和保护,你才会明白,“逃离”它本身反倒需
要强大和能力。大城市安置了你的脆弱,并且给你足够多的时间和耐心让你强大起来。
如果你脆弱,你更应该生活在大城市。

几乎所有感受过城市生活艰难的人都产生过逃离的念头。但普遍的城市生活状态是这样
的:不喜欢现在的生活,又不敢轻易放弃。
总结这些“总想走却走不掉”的理由,就能明白大城市到底提供了什么。让人不敢放弃
的那个部分,也就是脆弱的人最需要的部分。
那个部分是:“大城市的空气”。
“大城市的空气”给你提供了如下东西:机会、支持、保护和安慰。
1、机会
“从城市的本质来说,大都市应该提供人们只有在旅行中才能得到的东西,那就是新奇
。”
关键词|创业,跳槽,NGO,时装周,艺术展,讲座,拍电影……
伟大的城市是野心和抱负的聚集地,没有欲望的人才会对城市生活感到失落。“城市的
空气”为富足的人提供更多追求,也为匮乏的人提供更多可能。
总有可做的事情。
· 创业:全国 1900多 家创业公司中,有 798 家在北京
· 外企:北上广和江苏的外资规模占深占全国的 54.37%
· NGO:NGO从业人数前五:北京,上海,广东,四川,云南
· 影业:全国十大影视集团有 6 家在北京,1家在上海
· 活动:豆瓣上一线城市的同城活动是其它地方的2-5倍,甚至可以高达20倍
2、支持
“城市正迫切地等待着回答你的问题。”
关键词:私人医疗,共享单车,手机支付,外卖,网约车,公共WiFi,国际教育……
便利。城市有相对成熟和稳固的基础设施与运作体系,比如医疗,教育,新政策的优先
使用权,等等。送到家门口的午餐,出门可以不用带钱包,这些平凡的不太被注视的“
小支持”给生活提供便捷的同时,也带来小小的幸福感。
你早已经不适应没有这些东西的生活了。
· 共享经济:62%的“共享经济”服务使用者分布在一线城市
· 优质医疗:全国排名前10的医院有8家在北上广
· 网约车:70.5%的共享单车用户分布在一线城市,他们同时也是滴滴、Uber、易道的
高频用户
3、保护
“邻里间存在巨大的差异,这种差异要远远深于肤色间的差别,这在高密度的大城市里
才是可能和正常的。”
关键词:LGBT、小剧场、奇装异服、单身主义、二次元、整容、丁克……
城市是对多元文化最包容的地方。它保护人的野心、勇气、想象力和价值观。做职场强
人还是全职太太,闪婚或者不婚,考公务员还是当cosplayer,都会得到包容。
回到家乡,这些才是问题。
除此之外,城市之大决定了亲密的分寸,它也会保护你不想透露的部分。《美国大城市
的死与生》的作者简·雅各布斯是这样说的:“隐私是大城市生活的一个礼物”。
· LGBT:上海是中国内地第一个举办骄傲周的城市
· 单身:美国最适合单身人士生活的十大城市:纽约,洛杉矶,迈阿密,休斯敦,新
奥尔良,奥斯汀,亚特兰大,拉斯维加斯,明尼阿波利斯(Rent.com)
· 流浪汉:生活在纽约的流浪汉超过3万人
4、安慰和陪伴
“大城市能够提供听众,提供同行。”
关键词:24h便利店,居酒屋,手工作坊,独立书店,手冲咖啡,威士忌酒吧,迪士尼
游乐园……
城市给人提供力量上的支持,一个城市的整体性表现在能够把有共同兴趣的人集拢到一
起,这是你最容易找到同类的地方之一。
它也提供安慰。世界各地风味的餐厅,凌晨两点的街头酒馆,整夜亮着光的便利商店…
…城市为你的孤独和无力提供尽可能多的解决方案。它同时也了解你的抱怨,并让你有
机会抵抗和消解这些痛苦。
在一个深夜没什么灯光的地方,你会比现在孤独十倍。
· 便利店:平均每 3000 个上海人就拥有一家便利店,便利店数量是普通内陆城市的
10 倍以上
· 书店:全国 19 家 24 小时书店中有3家在北京,3家在武汉,其余分别在上海、广
州、杭州、成都、南京
· 星巴克:星巴克门店数量分布排行:首尔,纽约,上海,芝加哥,多伦多,墨西哥
,西雅图,北京,拉斯维加斯,休斯顿

除了这些之外,大城市还有一些更笼统的保护,让人能够在其中安全生活。
大城市提供的更大的安全感:确认自己没有落后。这种“与最新的事情息息相关”的感
受,是它不可替代的一个优势。
大城市给人欲望,让懒惰的人也更容易保留上进之心。它提供的欲望类型包括:创造的
欲望;因为看见缺憾并渴望满足而升起的欲望。大城市还把这些人类欲望的精华变成实
物,比如汽车楼房和霓虹灯。
大城市带来更多交换。不仅仅是金钱与货物的交换,也包括身份、角色与生活的交换。
卡尔维诺说,城市里每一个街巷角落、窗户护栏、楼梯扶手和旗杆上都有人留下痕迹。
最后,软弱的人总会一逃再逃,希望逃离那些自己不愿意回答的人生问题。但大城市逼
迫你对很多问题作出回答,这是你最终明白自己究竟是什么人的最好的方式。
和人们想象得不一样,大城市并非不允许软弱者生存,相反,它是软弱者生存的最好方
式。如果你在大城市感到过短暂的脆弱,这也许是你应该坚持留下来的理由。反过来说
,你之所以至今尚未离开,也许正是因为这些理由。
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B*E
2
一般是485的时候才要吗?
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s*n
3
里面的人没一个演得好的,什么破片子啊
果断抛弃
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s*l
4
有经验的给讲讲?
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f*u
5
是,交485时
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i*y
6
刘恺威的电视剧能看吗?

【在 s******n 的大作中提到】
: 里面的人没一个演得好的,什么破片子啊
: 果断抛弃

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G*y
7
so far no good.

【在 s****l 的大作中提到】
: 有经验的给讲讲?
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B*E
8
谢谢

【在 f*********u 的大作中提到】
: 是,交485时
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m*e
9
赞同!

【在 i********y 的大作中提到】
: 刘恺威的电视剧能看吗?
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s*l
10
他家的仪器没卖多少出去吧,好像大家都不太有hands-on experience.
去年底的文章倒是发的挺高级的,新英格兰。

【在 G***y 的大作中提到】
: so far no good.
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s*n
11
芒果台这选剧的水平也太次了

【在 i********y 的大作中提到】
: 刘恺威的电视剧能看吗?
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s*l
12
会不会是第二个helicos?
其实helicos不算真正的sms,他这个是,但是single read accuracy太低,通量也不行
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g*r
13
你没发现芒果台的剧都是纯偶像剧,给各家粉丝看的。

【在 s******n 的大作中提到】
: 芒果台这选剧的水平也太次了
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f*e
14
他家牛皮已经吹三年了,Field 还是没多少 users。 拿到文章上发表的
数字是 75% 1X accuracy,这种精度不太像人类能用的机器。通量也
不行。我看好他家是下一个 Helicos。
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m*T
15
哈哈,最近还好吧?是呀,PacBio现在压力肯定非常大。资金也不象当初那么充足了(
VC的钱应该不会再有大的进项了。IPO的钱不知道还能维持多久?如果error rate
在一年内没有质的提高,估计就不会再有太好的机会了。庆幸当初没选择它家。这里谁
买了它家的股票了?

【在 f**********e 的大作中提到】
: 他家牛皮已经吹三年了,Field 还是没多少 users。 拿到文章上发表的
: 数字是 75% 1X accuracy,这种精度不太像人类能用的机器。通量也
: 不行。我看好他家是下一个 Helicos。

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s*9
16
几个月前San Diego会仪上,他们强调他们的real time优势最大的应用是在epigenetics,是其他测序技术无法做到的。
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A*n
17
被套中,可惜没有买complete genomics的
rate
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s*9
18
DNA nanoball arrays现在用的人多吗?

【在 A*****n 的大作中提到】
: 被套中,可惜没有买complete genomics的
: rate

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s*s
19
//nod. 他们原来想和life/illumina竞争,显然是自视过高了。
现在终于明白了,还是退回来搞小众市场,不至于倒闭

epigenetics,是其他测序技术无法做到的。

【在 s******9 的大作中提到】
: 几个月前San Diego会仪上,他们强调他们的real time优势最大的应用是在epigenetics,是其他测序技术无法做到的。
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A*n
20
最近听到的一些报告都提到他们在用complete genomics测病人的基因组数据。
而且他们家的股票从3月份开始已经翻了一倍多了。

【在 s******9 的大作中提到】
: DNA nanoball arrays现在用的人多吗?
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A*n
21
要是他们的正确率能够高一点的,metagenome倒是个很好的市场。

【在 s******s 的大作中提到】
: //nod. 他们原来想和life/illumina竞争,显然是自视过高了。
: 现在终于明白了,还是退回来搞小众市场,不至于倒闭
:
: epigenetics,是其他测序技术无法做到的。

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m*T
22
这个正确率提高比较难呀,越到最后越难。所以面临这么这么残酷竞争的市场,他们的
压力实在太大。

【在 A*****n 的大作中提到】
: 要是他们的正确率能够高一点的,metagenome倒是个很好的市场。
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m*T
23
complete genomics的模式注定它做不大(就是个拥有自己技术的service provider)。
随着越来越多的benchtop的sequencers进入市场(而且throughput越来越高),它的生
意一到两年后应该不会这么好了。

【在 A*****n 的大作中提到】
: 被套中,可惜没有买complete genomics的
: rate

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s*9
24
从技术上讲,我觉得DNA nanoball(rolony)比DNA cluster(polony)在测序上有先天不
足,而且sequence by ligation限制了read length。
所以现阶段能让Illumina有压力的还是Ion Torrent,Illumina正在研发的技术融入了
Ion Torrent的一些东西。

【在 m***T 的大作中提到】
: complete genomics的模式注定它做不大(就是个拥有自己技术的service provider)。
: 随着越来越多的benchtop的sequencers进入市场(而且throughput越来越高),它的生
: 意一到两年后应该不会这么好了。

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w*y
25
Life就靠Ion Torrent了
Solid已经是一塌糊涂了

【在 s******9 的大作中提到】
: 从技术上讲,我觉得DNA nanoball(rolony)比DNA cluster(polony)在测序上有先天不
: 足,而且sequence by ligation限制了read length。
: 所以现阶段能让Illumina有压力的还是Ion Torrent,Illumina正在研发的技术融入了
: Ion Torrent的一些东西。

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s*l
26
有同感

【在 m***T 的大作中提到】
: complete genomics的模式注定它做不大(就是个拥有自己技术的service provider)。
: 随着越来越多的benchtop的sequencers进入市场(而且throughput越来越高),它的生
: 意一到两年后应该不会这么好了。

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s*l
27
呵呵,老实说,我就是想空它,才问的。IPO的钱也就够烧两年的。
不过它反复测能提高准确率。长度也还行。
至少有一点,它家的市场大不起来。机器那么贵。

rate

【在 m***T 的大作中提到】
: 哈哈,最近还好吧?是呀,PacBio现在压力肯定非常大。资金也不象当初那么充足了(
: VC的钱应该不会再有大的进项了。IPO的钱不知道还能维持多久?如果error rate
: 在一年内没有质的提高,估计就不会再有太好的机会了。庆幸当初没选择它家。这里谁
: 买了它家的股票了?

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s*l
28
为什么在epigenetics上有优势?

epigenetics,是其他测序技术无法做到的。

【在 s******9 的大作中提到】
: 几个月前San Diego会仪上,他们强调他们的real time优势最大的应用是在epigenetics,是其他测序技术无法做到的。
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s*l
29
怎么知道solid不行了?

【在 w******y 的大作中提到】
: Life就靠Ion Torrent了
: Solid已经是一塌糊涂了

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m*T
30
反复测就和HiSeq和SOLiD区别不大了,running cost一下子就上去了,而且大家肯定不
希望在一个还没被证明的平台上花那么多的钱。唯一的优势是read length长。
不过它家这几天刚release了Ecoli的data,似乎别人的总体评价还相对正面。只是内部
data有多大水分这个不好说。

【在 s****l 的大作中提到】
: 呵呵,老实说,我就是想空它,才问的。IPO的钱也就够烧两年的。
: 不过它反复测能提高准确率。长度也还行。
: 至少有一点,它家的市场大不起来。机器那么贵。
:
: rate

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f*e
31
还好啊。不碰生物了以后人生快乐了不少。

【在 m***T 的大作中提到】
: 哈哈,最近还好吧?是呀,PacBio现在压力肯定非常大。资金也不象当初那么充足了(
: VC的钱应该不会再有大的进项了。IPO的钱不知道还能维持多久?如果error rate
: 在一年内没有质的提高,估计就不会再有太好的机会了。庆幸当初没选择它家。这里谁
: 买了它家的股票了?

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s*s
32
我不这样觉得。complete genomics可以从成本方面下苦工,如果
你请他们做比自己做不仅省时省力,而且省钱

【在 m***T 的大作中提到】
: complete genomics的模式注定它做不大(就是个拥有自己技术的service provider)。
: 随着越来越多的benchtop的sequencers进入市场(而且throughput越来越高),它的生
: 意一到两年后应该不会这么好了。

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s*s
33
illumina那个cluster是不是有专利?ms别人都被逼着搞emulsified PCR,
这个啥时候过期?

【在 s******9 的大作中提到】
: 从技术上讲,我觉得DNA nanoball(rolony)比DNA cluster(polony)在测序上有先天不
: 足,而且sequence by ligation限制了read length。
: 所以现阶段能让Illumina有压力的还是Ion Torrent,Illumina正在研发的技术融入了
: Ion Torrent的一些东西。

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s*s
34
如果能直接读modified DNA

【在 s****l 的大作中提到】
: 为什么在epigenetics上有优势?
:
: epigenetics,是其他测序技术无法做到的。

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A*n
35
没有买GNOM就是不看好他的business model,可惜股票的短期表现还真是不错。

【在 m***T 的大作中提到】
: complete genomics的模式注定它做不大(就是个拥有自己技术的service provider)。
: 随着越来越多的benchtop的sequencers进入市场(而且throughput越来越高),它的生
: 意一到两年后应该不会这么好了。

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A*n
36
316的数据貌似看上去还可以,至少Ion Torrent进步的速度挺快的。
不过能从hiseq和miseq那里抢到多少份额还真不好说,

【在 w******y 的大作中提到】
: Life就靠Ion Torrent了
: Solid已经是一塌糊涂了

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m*T
37
它市场肯定会一直有,因为它规模化的流程成本可能比自己实验室做要低些。不过它和
BGI有太大的区别吗?只是多了自己的技术而已。如果business model一直如此,除
非它的技术有质的飞跃,否则不大可能在NGS市场上有太大的作为。

【在 s******s 的大作中提到】
: 如果能直接读modified DNA
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m*T
38
和hiseq针对的不是一个市场,所以抢不到什么份额。主要是和miseq争,但miseq还没
上市,所以它暂时还没份额。
我个人的感觉,miseq可能会因为hiseq在ultra-high throughput市场上的domination
而受影响。为什么这么说?因为hiseq的data不能用和其chemistry一样的miseq平台来
validate,所以势必在一定程度上会影响它的销量。当然对于新进入NGS领域的,不存
在这个问题。
另外,Ion能进步这么快基本上是靠lifetech这条大船。Invitrogen和ambion可以有多少resources供它调用,再加上AB在instrument方面的expertise?你看看现在Ion的protocol和kits里面有多少SOLiD的痕迹就知道了

【在 A*****n 的大作中提到】
: 316的数据貌似看上去还可以,至少Ion Torrent进步的速度挺快的。
: 不过能从hiseq和miseq那里抢到多少份额还真不好说,

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a*e
39
这里谁有 Ion Torrent 的使用经验? 到底怎么样?
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