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请教少量细胞RT PCR的技术问题
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请教少量细胞RT PCR的技术问题# Biology - 生物学
p*s
1
说一个星期后给消息。这种情况是什么意思?拒的可能性大吗?
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d*6
2
犹豫中。。。
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b*r
3
请大家推荐一下protocol或者哪个公司的kit吧,我已经被折腾了几个星期了还是扩不.我不是做
realtime,所以kit里不能含有sybrgreen
出来
网上搜到beckman coutler有个AmpliGrid Single Cell One-Step RT-PCR System,有
人用过吗?
还有invitrogen有个RNA UltraSense™ One-Step Quantitative RT-PCR System
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p*e
4
check一下过去几个月你都用了多少流量喽
如果close to 2g,那就加点儿
如果离2g还远那就没必要浪费钱了:D

【在 d****6 的大作中提到】
: 犹豫中。。。
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r*y
5
这里好像有人用qiagen的

不.我不是做
System

【在 b****r 的大作中提到】
: 请大家推荐一下protocol或者哪个公司的kit吧,我已经被折腾了几个星期了还是扩不.我不是做
: realtime,所以kit里不能含有sybrgreen
: 出来
: 网上搜到beckman coutler有个AmpliGrid Single Cell One-Step RT-PCR System,有
: 人用过吗?
: 还有invitrogen有个RNA UltraSense™ One-Step Quantitative RT-PCR System

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l*u
6
如果现在2gb的data有corporate discount就绝对不要上3gb的,因为现在的3gb data不
打折

【在 d****6 的大作中提到】
: 犹豫中。。。
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M*a
7
俺们实验室用Zymo microRNA kit.
不管是细菌还是动物细胞,做RT-PCR成功率是100%。

不.我不是做
System

【在 b****r 的大作中提到】
: 请大家推荐一下protocol或者哪个公司的kit吧,我已经被折腾了几个星期了还是扩不.我不是做
: realtime,所以kit里不能含有sybrgreen
: 出来
: 网上搜到beckman coutler有个AmpliGrid Single Cell One-Step RT-PCR System,有
: 人用过吗?
: 还有invitrogen有个RNA UltraSense™ One-Step Quantitative RT-PCR System

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w*t
8
楼主,要听熊猫的。

【在 p*********e 的大作中提到】
: check一下过去几个月你都用了多少流量喽
: 如果close to 2g,那就加点儿
: 如果离2g还远那就没必要浪费钱了:D

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M*a
9
sorry,I talked about the single cell level.
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c*d
10
打折的啊
3GB for iPhone on 4G LTE $30.00
Service Discount -$5.70

【在 l******u 的大作中提到】
: 如果现在2gb的data有corporate discount就绝对不要上3gb的,因为现在的3gb data不
: 打折

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b*r
11
我就是说少量细胞,包括单个或者数个细胞
你用了这个kit提了RNA后进一步怎么做RT呢

【在 M**a 的大作中提到】
: sorry,I talked about the single cell level.
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d*6
12
有道理,不过我转眼一想,我多出来的一个G可以用来大胆tether我的ipad了,还是上
3GB吧,而且我查了,3GB也有discount,其实每个月也就多了3块5

【在 p*********e 的大作中提到】
: check一下过去几个月你都用了多少流量喽
: 如果close to 2g,那就加点儿
: 如果离2g还远那就没必要浪费钱了:D

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O*U
13
ambion的cells to cDNA还行
不过不如直接用水+RNaseOUT把细胞破了来得快
反正我从来都是直接加水破细胞,用clonetech的EcoDRY逆转录,简单快捷
10个细胞以下很稳定

不.我不是做
System

【在 b****r 的大作中提到】
: 请大家推荐一下protocol或者哪个公司的kit吧,我已经被折腾了几个星期了还是扩不.我不是做
: realtime,所以kit里不能含有sybrgreen
: 出来
: 网上搜到beckman coutler有个AmpliGrid Single Cell One-Step RT-PCR System,有
: 人用过吗?
: 还有invitrogen有个RNA UltraSense™ One-Step Quantitative RT-PCR System

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x*g
14
每个公司的discount plan都不一样。
我们公司现在就是3G不打折,5G才有折扣。
但以前2G的都grandfather in了。还可以26%。
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b*r
15
你这个做了逆转录后用什么酶做PCR? 大概多少个循环才行?要不要做nesting PCR呢?

【在 O**U 的大作中提到】
: ambion的cells to cDNA还行
: 不过不如直接用水+RNaseOUT把细胞破了来得快
: 反正我从来都是直接加水破细胞,用clonetech的EcoDRY逆转录,简单快捷
: 10个细胞以下很稳定
:
: 不.我不是做
: System

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G*C
16
unlimited data的飘过~~~
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s*s
17
加dnase?

【在 O**U 的大作中提到】
: ambion的cells to cDNA还行
: 不过不如直接用水+RNaseOUT把细胞破了来得快
: 反正我从来都是直接加水破细胞,用clonetech的EcoDRY逆转录,简单快捷
: 10个细胞以下很稳定
:
: 不.我不是做
: System

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l*u
18
原来还可以打折啊,我从macrumors上看的不准啊

【在 c*****d 的大作中提到】
: 打折的啊
: 3GB for iPhone on 4G LTE $30.00
: Service Discount -$5.70

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b*r
19
楼上说的对啊,你这个不加DNAse吗?不加对后续有影响的可能,加了也可能影响接下
来的PCR,DNAse又不容易去掉吧

【在 O**U 的大作中提到】
: ambion的cells to cDNA还行
: 不过不如直接用水+RNaseOUT把细胞破了来得快
: 反正我从来都是直接加水破细胞,用clonetech的EcoDRY逆转录,简单快捷
: 10个细胞以下很稳定
:
: 不.我不是做
: System

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d*d
20
顺带问一下如何离心回收少量的细胞。
我也是要从少量的细胞中提RNA然后做qPCR。之前要做FACS staining 淋巴细胞, 然后
sort出大约1000个细胞在0.5ml的buffer中。所以提RNA前要将细胞沉淀。但因为细胞太
少,即使全部离心下来也不可见。所以想请问一下大家有什么高招可以确保细胞都离心
下来。

【在 b****r 的大作中提到】
: 我就是说少量细胞,包括单个或者数个细胞
: 你用了这个kit提了RNA后进一步怎么做RT呢

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a*a
21
少量细胞是多少?
以前用10个小鼠oocyte抽rna,用专门的微量rna 吸附柱kit
我在国内用天根,那么qiagen应该也有类似的
抽提过程加DNAse消化的,洗下来全部反转录到20ul体系
取1ul做realtime, gapdh ct大概17-18
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a*a
22
能不能低温浓缩一下, 直接加lysis buffer。。

【在 d****d 的大作中提到】
: 顺带问一下如何离心回收少量的细胞。
: 我也是要从少量的细胞中提RNA然后做qPCR。之前要做FACS staining 淋巴细胞, 然后
: sort出大约1000个细胞在0.5ml的buffer中。所以提RNA前要将细胞沉淀。但因为细胞太
: 少,即使全部离心下来也不可见。所以想请问一下大家有什么高招可以确保细胞都离心
: 下来。

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b*r
23
你这个方法似乎超强啊,17,8循环那都比得上普通RT了,难以置信

【在 a*******a 的大作中提到】
: 少量细胞是多少?
: 以前用10个小鼠oocyte抽rna,用专门的微量rna 吸附柱kit
: 我在国内用天根,那么qiagen应该也有类似的
: 抽提过程加DNAse消化的,洗下来全部反转录到20ul体系
: 取1ul做realtime, gapdh ct大概17-18

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a*a
24
我们反转录用的是toyobo的kit
一般1ug total RNA反转录到20ul体系里,取0.5ul做realtime
toyobo的realtime kit ct大概15+-0.3
18个cycle就又是10倍的浓度差了
而且我用的是卵细胞, 比较大mRNA也比较多
10个普通细胞肯定不会有这个效率的。

【在 b****r 的大作中提到】
: 你这个方法似乎超强啊,17,8循环那都比得上普通RT了,难以置信
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