l*4
2 楼
100多号人看了没一个回的
自己顶一下
自己顶一下
l*1
3 楼
RE LD
你这问题问的是高中生高考水平或生化系大学3年前水平的话
答案是 stable同位素标定Steroid Legend 然后 assay 然后单离steroid receptor 质谱分析receptor里边有无
那同位素
如果问的是PD PhD thesis 水平
输入你那个目标steroid receptor 之
Protein ID Protein Sequence
然后
http://www.pathblast.org/
查一下先
偶这也是借以色列的某教授的花
http://www.cs.tau.ac.il/~roded/
Selected Web-Servers / Software:
· ANAT
· Torque
· NetworkBLAST
· EXPANDER
献佛仅此而已
【在 l*****4 的大作中提到】
: 100多号人看了没一个回的
: 自己顶一下
你这问题问的是高中生高考水平或生化系大学3年前水平的话
答案是 stable同位素标定Steroid Legend 然后 assay 然后单离steroid receptor 质谱分析receptor里边有无
那同位素
如果问的是PD PhD thesis 水平
输入你那个目标steroid receptor 之
Protein ID Protein Sequence
然后
http://www.pathblast.org/
查一下先
偶这也是借以色列的某教授的花
http://www.cs.tau.ac.il/~roded/
Selected Web-Servers / Software:
· ANAT
· Torque
· NetworkBLAST
· EXPANDER
献佛仅此而已
【在 l*****4 的大作中提到】
: 100多号人看了没一个回的
: 自己顶一下
l*4
4 楼
非常感谢你的回复
有几个问题再问一下
也许我没说清楚我也要的是在动物体内直接实验证明两者的相互作用
第二的生物信息学的方法好像不适用
第一个方法
如果你的结果是negative的
你如何证明 同位素标记ligand和receptor的分离不是因为提蛋白或assay或其他什么过
程中两者分离了呢
质谱分析receptor里边有无
【在 l**********1 的大作中提到】
: RE LD
: 你这问题问的是高中生高考水平或生化系大学3年前水平的话
: 答案是 stable同位素标定Steroid Legend 然后 assay 然后单离steroid receptor 质谱分析receptor里边有无
: 那同位素
: 如果问的是PD PhD thesis 水平
: 输入你那个目标steroid receptor 之
: Protein ID Protein Sequence
: 然后
: http://www.pathblast.org/
: 查一下先
有几个问题再问一下
也许我没说清楚我也要的是在动物体内直接实验证明两者的相互作用
第二的生物信息学的方法好像不适用
第一个方法
如果你的结果是negative的
你如何证明 同位素标记ligand和receptor的分离不是因为提蛋白或assay或其他什么过
程中两者分离了呢
质谱分析receptor里边有无
【在 l**********1 的大作中提到】
: RE LD
: 你这问题问的是高中生高考水平或生化系大学3年前水平的话
: 答案是 stable同位素标定Steroid Legend 然后 assay 然后单离steroid receptor 质谱分析receptor里边有无
: 那同位素
: 如果问的是PD PhD thesis 水平
: 输入你那个目标steroid receptor 之
: Protein ID Protein Sequence
: 然后
: http://www.pathblast.org/
: 查一下先
l*1
5 楼
Two ways:
No. 1
Patch clamp Single-channel recording
htp://parkerlab.bio.uci.edu/publication%20attachments/Demuro2003_CellCalcium_120.pdf
No. 2
single-molecule fluorescence methods
hp://iopscience.iop.org/1478-3975/7/3/031001/pdf/1478-3975_7_3_031001.pdf
have the possibilities i think.
【在 l*****4 的大作中提到】
: 非常感谢你的回复
: 有几个问题再问一下
: 也许我没说清楚我也要的是在动物体内直接实验证明两者的相互作用
: 第二的生物信息学的方法好像不适用
: 第一个方法
: 如果你的结果是negative的
: 你如何证明 同位素标记ligand和receptor的分离不是因为提蛋白或assay或其他什么过
: 程中两者分离了呢
:
: 质谱分析receptor里边有无
No. 1
Patch clamp Single-channel recording
htp://parkerlab.bio.uci.edu/publication%20attachments/Demuro2003_CellCalcium_120.pdf
No. 2
single-molecule fluorescence methods
hp://iopscience.iop.org/1478-3975/7/3/031001/pdf/1478-3975_7_3_031001.pdf
have the possibilities i think.
【在 l*****4 的大作中提到】
: 非常感谢你的回复
: 有几个问题再问一下
: 也许我没说清楚我也要的是在动物体内直接实验证明两者的相互作用
: 第二的生物信息学的方法好像不适用
: 第一个方法
: 如果你的结果是negative的
: 你如何证明 同位素标记ligand和receptor的分离不是因为提蛋白或assay或其他什么过
: 程中两者分离了呢
:
: 质谱分析receptor里边有无
l*4
6 楼
再次谢谢你的回复
大体看了一下两篇文章
第一篇好像没什么帮助
第二篇中的提到的FRET我之前也考虑过但是要在体内监测有些困难 还有就是让
recepptor带荧光标记不难 但是steroid ligand 是可以直接跨膜的如果挂上荧光标记
的话就很有可能不能跨膜了
CellCalcium_120.pdf
【在 l**********1 的大作中提到】
: Two ways:
: No. 1
: Patch clamp Single-channel recording
: htp://parkerlab.bio.uci.edu/publication%20attachments/Demuro2003_CellCalcium_120.pdf
: No. 2
: single-molecule fluorescence methods
: hp://iopscience.iop.org/1478-3975/7/3/031001/pdf/1478-3975_7_3_031001.pdf
: have the possibilities i think.
大体看了一下两篇文章
第一篇好像没什么帮助
第二篇中的提到的FRET我之前也考虑过但是要在体内监测有些困难 还有就是让
recepptor带荧光标记不难 但是steroid ligand 是可以直接跨膜的如果挂上荧光标记
的话就很有可能不能跨膜了
CellCalcium_120.pdf
【在 l**********1 的大作中提到】
: Two ways:
: No. 1
: Patch clamp Single-channel recording
: htp://parkerlab.bio.uci.edu/publication%20attachments/Demuro2003_CellCalcium_120.pdf
: No. 2
: single-molecule fluorescence methods
: hp://iopscience.iop.org/1478-3975/7/3/031001/pdf/1478-3975_7_3_031001.pdf
: have the possibilities i think.
l*1
7 楼
Your comment are right
>但是steroid ligand 是可以直接跨膜的如果挂上荧光标记
But you can try
single-molecule pull-down (SiMPull) assay with YFP
paper NCBI link:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21614075
full text pdf link:
htp://saturn.med.nyu.edu/research/mp/littmanlab/Immunology_Journal_Club/
Papers_files/Jain.pdf
by Dr. Taekjip Ha now at
http://bio.physics.illinois.edu/
Ps:
Dr. Ha and
Zhuang Xiaowei with same advisor: Steve Chu at Stanford 12 years ago.
http://www.stanford.edu/group/chugroup/steve_personal.html
But Ha did better than Zhuang in this field from both Cell papers count within 5 year.
>但是steroid ligand 是可以直接跨膜的如果挂上荧光标记
But you can try
single-molecule pull-down (SiMPull) assay with YFP
paper NCBI link:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21614075
full text pdf link:
htp://saturn.med.nyu.edu/research/mp/littmanlab/Immunology_Journal_Club/
Papers_files/Jain.pdf
by Dr. Taekjip Ha now at
http://bio.physics.illinois.edu/
Ps:
Dr. Ha and
Zhuang Xiaowei with same advisor: Steve Chu at Stanford 12 years ago.
http://www.stanford.edu/group/chugroup/steve_personal.html
But Ha did better than Zhuang in this field from both Cell papers count within 5 year.
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