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Chip-seq DNA size 求助# Biology - 生物学
n*n
1
佛教不杀生,可是敌人要置你于死地,你该怎么办?依据是什么?
少林寺上说:我佛慈悲,亦惩恶。对吗?
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b*a
2
很不错,做工和nexus 7简直是天上地下的区别(nexus 7玩了两星期退了)。唯一不爽
的是屏幕分辨率,看惯了retina屏眼睛被惯坏了。以前用ipad2时也没觉得啥难受,现
在就觉得分辨率不够。不过还是很喜欢的,毕竟重量,大小,续航等都非常满意。
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t*x
3
现在的型号是dlink dcm-202
谢谢
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w*n
4
请有经验的大虾看看这个size是不是合适? 我担心有点over shared。
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C*r
5
阿育王
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p*n
6
和我感觉一样,开始爱不释手,后来就被屏幕打败了,退货了事

【在 b********a 的大作中提到】
: 很不错,做工和nexus 7简直是天上地下的区别(nexus 7玩了两星期退了)。唯一不爽
: 的是屏幕分辨率,看惯了retina屏眼睛被惯坏了。以前用ipad2时也没觉得啥难受,现
: 在就觉得分辨率不够。不过还是很喜欢的,毕竟重量,大小,续航等都非常满意。

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a*a
7
先想法确定是Modem的问题。
如果想买新的,就买Moto SB6121好了。稳定而且速度快。
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j*t
8
我得到过和你差不多的size,有时略大些,average size is 300-350bp
因为上sequencer之前要作size selection (切胶纯化,200-400bp左右),所以我觉
得把DNA打到300bp左右应该还是可以测序的。
你不放心的话,可以先找个positive control region 来测一下你的ChIP DNA.再上
sequencer
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n*n
9
谁说说?
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S*s
10
这个屏幕的确是个硬伤.
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l*e
11
我用的是linksys cm100.也还可以。
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s*s
12
你这个还早吧。我们都是打到mono的,你这个都是di

【在 w*********n 的大作中提到】
: 请有经验的大虾看看这个size是不是合适? 我担心有点over shared。
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d*r
13
看过《少林寺》没有?

【在 n********n 的大作中提到】
: 佛教不杀生,可是敌人要置你于死地,你该怎么办?依据是什么?
: 少林寺上说:我佛慈悲,亦惩恶。对吗?

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d*r
14
其实你们不喜欢那个屏幕, 不是因为分辨率, 而是颜色的原因, ipad mini的颜色只
有ipad 3的62%.
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a*a
15

这个是DOCSIS 2.0的。现在再买,应该尽量买3.0的。

【在 l*****e 的大作中提到】
: 我用的是linksys cm100.也还可以。
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w*n
16
多谢大虾指教。
请问你们做chip-seq的时候都送一个Input去测序吗?
公司说有的客户测,有的不测, 请问这个是必须的吗?
测出来有什么用途?

【在 w*********n 的大作中提到】
: 请有经验的大虾看看这个size是不是合适? 我担心有点over shared。
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n*n
17
看过,少林寺打打杀杀。佛经依据何在?
只知佛陀以身饲虎,与打杀无关。
西游记降魔,心魔要降的
这杀生何解?

【在 d******r 的大作中提到】
: 看过《少林寺》没有?
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d*I
18
Me 2. 等mini 2吧。
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t*x
19
哪个好一些呢? 再给讲讲。
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s*s
20
我制作sonication,其他实验用的。我们实验室做chip的那个
IgG control必须做一个的, input不知道有没有测过

【在 w*********n 的大作中提到】
: 多谢大虾指教。
: 请问你们做chip-seq的时候都送一个Input去测序吗?
: 公司说有的客户测,有的不测, 请问这个是必须的吗?
: 测出来有什么用途?

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n*n
21
基督教又如何?
大自然弱肉强食,这杀生是肉食动物之本能,也是人与动物的交叉点。好奇佛教、基督
教如何处理人类之死角。冠以正义之名义?
如果说吃肉允许,虽不是己杀,也是默许杀生之存在。
看来无解,只能闭上眼睛没看见了。
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b*a
22
颜色我注意到了,那个应该是NTSC标准的62%吧。anyway,我觉得主要还是分辨率太低
,homescreen里字的边缘很模糊很不爽。我用三星galaxy s3,很多人都说颜色失真啥
的,我看着觉得还好。ipad mini是饱和度有所欠缺,不过不是pro的话看上去应该差别
没那么大。

【在 d********r 的大作中提到】
: 其实你们不喜欢那个屏幕, 不是因为分辨率, 而是颜色的原因, ipad mini的颜色只
: 有ipad 3的62%.

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m*t
23
Moto sb6121, 到staples match amazon, with 25 off 75 coupon, 好像是60左右到手
,用了2个月,BT有几百G了,没断过。以前老要重启router和modem。
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j*t
24
我一直送input的,用来找binding site (peak).
因为很多peak calling 的程序(peakseq, spp, MACS)scoring peaks from ChIP
samples relative to input.

【在 w*********n 的大作中提到】
: 多谢大虾指教。
: 请问你们做chip-seq的时候都送一个Input去测序吗?
: 公司说有的客户测,有的不测, 请问这个是必须的吗?
: 测出来有什么用途?

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d*r
25
《少林寺》最后一句台词就是回答你那问题的。

【在 n********n 的大作中提到】
: 看过,少林寺打打杀杀。佛经依据何在?
: 只知佛陀以身饲虎,与打杀无关。
: 西游记降魔,心魔要降的
: 这杀生何解?

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d*r
26
ipad3是100%.

【在 b********a 的大作中提到】
: 颜色我注意到了,那个应该是NTSC标准的62%吧。anyway,我觉得主要还是分辨率太低
: ,homescreen里字的边缘很模糊很不爽。我用三星galaxy s3,很多人都说颜色失真啥
: 的,我看着觉得还好。ipad mini是饱和度有所欠缺,不过不是pro的话看上去应该差别
: 没那么大。

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C*Y
28
After linker (~120 bp) ligation, fragments of 200-450 bp will be cut from
gel for purification, so your sonication result is very good.
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n*n
29
“杀心可息,匡扶正义之心不可息。”佛经依据何在?
这样回答,与俗人一样啊,没区别。

【在 d******r 的大作中提到】
: 《少林寺》最后一句台词就是回答你那问题的。
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j*8
30
网上订的,用了3天退货。
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k*e
31
online下单然后打电话pm?

【在 m****t 的大作中提到】
: Moto sb6121, 到staples match amazon, with 25 off 75 coupon, 好像是60左右到手
: ,用了2个月,BT有几百G了,没断过。以前老要重启router和modem。

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w*n
32
多谢各位大侠回贴,让我长了很多知识~

【在 w*********n 的大作中提到】
: 请有经验的大虾看看这个size是不是合适? 我担心有点over shared。
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d*r
33
你以为信佛的人就不俗啊?

【在 n********n 的大作中提到】
: “杀心可息,匡扶正义之心不可息。”佛经依据何在?
: 这样回答,与俗人一样啊,没区别。

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p*t
34
mini 实在是太差了,必须得等下一代。。。。
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l*g
35
俺在ebay上买的TJ-715X,邮到家总共不到$20,无比稳定,开机接近1年了也没问题。
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w*n
36
请有经验的大虾看看这个size是不是合适? 我担心有点over shared。
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n*n
37
总结:杀生时,只要心无杀心就可以了。
呵,这更冷血,杀生时没感觉。
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a*y
38
Also waiting for next gen iPad. With so much competition, expect the next
iPad in April with much better specs (lighter, thinner) with perhaps cheaper
starting price.
[发表自未名空间手机版 - m.mitbbs.com]
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i*h
39
樓主和我家原來的型號一樣,一直很不錯,但不久前一次雪災停電後,就經常斷了,調
試的結果是輸入信號不如以前質量高,這個Modem容錯性能太差,就不行了。說以說用
著沒問題不代表Modem好。換來sb6121後從來沒斷過,推薦一下。
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j*t
40
我得到过和你差不多的size,有时略大些,average size is 300-350bp
因为上sequencer之前要作size selection (切胶纯化,200-400bp左右),所以我觉
得把DNA打到300bp左右应该还是可以测序的。
你不放心的话,可以先找个positive control region 来测一下你的ChIP DNA.再上
sequencer
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C*r
41
反正都是一台机器,DNA,RNA编码决定,冷血热血顶个屁用。

【在 n********n 的大作中提到】
: 总结:杀生时,只要心无杀心就可以了。
: 呵,这更冷血,杀生时没感觉。

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m*t
42
是,查了一下,Amazon的涨了5刀,估计你这样搞,到手是65左右

【在 k***e 的大作中提到】
: online下单然后打电话pm?
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s*s
43
你这个还早吧。我们都是打到mono的,你这个都是di

【在 w*********n 的大作中提到】
: 请有经验的大虾看看这个size是不是合适? 我担心有点over shared。
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n*n
44
估计希特勒在这方面做得不错。

【在 C*******r 的大作中提到】
: 反正都是一台机器,DNA,RNA编码决定,冷血热血顶个屁用。
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w*n
45
多谢大虾指教。
请问你们做chip-seq的时候都送一个Input去测序吗?
公司说有的客户测,有的不测, 请问这个是必须的吗?
测出来有什么用途?

【在 w*********n 的大作中提到】
: 请有经验的大虾看看这个size是不是合适? 我担心有点over shared。
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C*r
46
根据唯物论,希特勒的行为是由他的基因和历史环境决定的。要怪,还是要怪基因突变
出希特勒这种特别组合。

【在 n********n 的大作中提到】
: 估计希特勒在这方面做得不错。
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s*s
47
我制作sonication,其他实验用的。我们实验室做chip的那个
IgG control必须做一个的, input不知道有没有测过

【在 w*********n 的大作中提到】
: 多谢大虾指教。
: 请问你们做chip-seq的时候都送一个Input去测序吗?
: 公司说有的客户测,有的不测, 请问这个是必须的吗?
: 测出来有什么用途?

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n*n
48
机器杀机器。

【在 C*******r 的大作中提到】
: 根据唯物论,希特勒的行为是由他的基因和历史环境决定的。要怪,还是要怪基因突变
: 出希特勒这种特别组合。

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j*t
49
我一直送input的,用来找binding site (peak).
因为很多peak calling 的程序(peakseq, spp, MACS)scoring peaks from ChIP
samples relative to input.

【在 w*********n 的大作中提到】
: 多谢大虾指教。
: 请问你们做chip-seq的时候都送一个Input去测序吗?
: 公司说有的客户测,有的不测, 请问这个是必须的吗?
: 测出来有什么用途?

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z*n
50
杀人是很大的过失,这个因果你自己必然要承担,而且杀人的果报很重对证悟是非常
大的障碍,所以居士五戒不杀人为首。
可是是不是无论何时何地杀人都是绝对不允许的呢?佛经中也有类似的公案:
《佛說大方廣善巧方便經》故事中有記載 釋迦牟尼佛 本身也殺一人救五百人的事蹟
佛陀有一世也是修行人,有神通。祂坐一條商船出海,在這條船上還有500個商人同行。
這條船的船長知道這500個商人有錢就想重敽γ鹆藲⑿摹�
佛陀就知道了,祂用神
通觀察知道這500個商人都是菩薩轉世,這個船長如果趾�@500人,這個業障很
重的;
就算不是菩薩轉世,這個殺業也是很重的。
如果讓這個船長得逞的話,船長死後墮入惡道永無出期。為了不讓船長造這個惡業,佛
陀就把這個船長殺了,救了500商人。雖然救了500商人,可是佛陀也造了殺業呀。
其實佛陀雖然殺了船長,實際上是救了他,外表看是惡,動機用心是善的
佛陀在因地修行的時候,為了救五百個人而殺了一個人,這樣的作法合乎道德嗎?
佛陀正是抱著這種「我不入地獄,誰入地獄」的悲心,而殺一救百,所以在大乘的戒律
中是讚嘆他的行為。
我們在修行菩薩道時,除了動機要純正,抱持大慈悲心之外,還要具備心甘情願接受因
果制裁的膽識,因為有所造作,必有報應。
日本的井上日昭禪師殺了一位奸臣,替萬民除了百害。
山本玄峰禪師說:「一殺多生通於禪。」意思是:殺了一個人,因此而救了許多人,是
通於佛法的。
佛教是非常重視生命的宗教,不殺生是佛教徒共守的戒律,尤其小乘佛教更是嚴守。
殺生是不道德的行為,但是如果本著大慈悲,救人救世的心去殺生,在大乘的戒律是開
放的。
譬如為護衛自己的國家、人民,一旦戰爭爆發,佛教徒可以殺害敵人嗎?
如果是真正本著救民出於水火、殺一救百的願心,並且甘願承擔因果的責任,在大乘的
戒律是讚美這種行徑。
佛法本身超越道德,戒律严谨是为了累计善业,最终获得证悟。如果再爆发一次日军侵
华那样的非正义战争,为了保护我们的妇孺,作为佛弟子的我也会上战场。菩萨行有时
候是需要牺牲精神的,即使果报是下地狱。

【在 n********n 的大作中提到】
: 看过,少林寺打打杀杀。佛经依据何在?
: 只知佛陀以身饲虎,与打杀无关。
: 西游记降魔,心魔要降的
: 这杀生何解?

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C*Y
51
After linker (~120 bp) ligation, fragments of 200-450 bp will be cut from
gel for purification, so your sonication result is very good.
avatar
f*e
52
说的好!

行。

【在 z**n 的大作中提到】
: 杀人是很大的过失,这个因果你自己必然要承担,而且杀人的果报很重对证悟是非常
: 大的障碍,所以居士五戒不杀人为首。
: 可是是不是无论何时何地杀人都是绝对不允许的呢?佛经中也有类似的公案:
: 《佛說大方廣善巧方便經》故事中有記載 釋迦牟尼佛 本身也殺一人救五百人的事蹟
: 佛陀有一世也是修行人,有神通。祂坐一條商船出海,在這條船上還有500個商人同行。
: 這條船的船長知道這500個商人有錢就想重敽γ鹆藲⑿摹�
: 佛陀就知道了,祂用神
: 通觀察知道這500個商人都是菩薩轉世,這個船長如果趾�@500人,這個業障很
: 重的;
: 就算不是菩薩轉世,這個殺業也是很重的。

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w*n
53
多谢各位大侠回贴,让我长了很多知识~

【在 w*********n 的大作中提到】
: 请有经验的大虾看看这个size是不是合适? 我担心有点over shared。
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z*n
54
神医也来这里混了?呵呵。

【在 f*******e 的大作中提到】
: 说的好!
:
: 行。

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l*1
55
EN
last stage:
try this
CisGenome: An integrated tool for tiling array, ChIP-seq, genome and cis-
regulatory element analysis.
//www.biostat.jhsph.edu/~hji/cisgenome/index.htm
//www.stanford.edu/group/wonglab/software.html

【在 s******s 的大作中提到】
: 你这个还早吧。我们都是打到mono的,你这个都是di
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l*t
56
绝对不能杀生
如果敌人要置你于死地:你就逃跑 积极防御, 或者干脆送死都可以,随你自己选择,
但前提是不杀死对方, 可以把对方打伤打到 但不能伤害对方的生命,在不能肯定的情
况下, 就不能动手。
少林寺上说:我佛慈悲,亦惩恶。完全对
所以少林寺只有棍棒 没有刀,惩恶并不代表要杀死对方。就像美国很多州 已经取消死
刑。

【在 n********n 的大作中提到】
: 佛教不杀生,可是敌人要置你于死地,你该怎么办?依据是什么?
: 少林寺上说:我佛慈悲,亦惩恶。对吗?

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w*r
57
这个size没问题,我们做的是超声到peak的中心在250bp,比你这个稍微大一点点。
不过我觉得片段稍微小一点的话测序也没问题,RNA-Seq的片段还要更小。况且后来还
要按照size回收DNA。
有的用input做control,有的用IgG IP做control,都可以。开会问过一个大牛,他说
他们input和IgG两个control都做。
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Y*u
58
佛教其实并不强调惩恶。当有敌人要置你于死地,不同层次的修行人会有不同的反应,
可能会反抗, 可能会顺从,也可能会避让, 都是可以的, 关键是看是为什么而做。
同样是接受, 有的人是因为我为鱼肉,没有能力的原因。 有的人却可以是就是要随顺
因缘。 同样是反抗, 有的人是为了自己, 有的人是为了别人。 同样是避让, 有的
人是因为害怕自己受到伤害, 有的人是担心他人造更大的杀业。。所以不能完全从行
为上去做的行为准则。。比如说佛大概可以用自己的生命来保护他人, 而一般人如果
能用武力保护自己和他人也没有什么不对。。有多大的能力和智慧做多大的事。
上面有人说, 杀人只要心中无杀就可以。 我觉的这是个不小的误解。 因为如果能做
到心无所住的无心境界, 必然已经是通达智慧的大悲行者。 作为解脱的人, 看我们
凡夫的颠倒如同母亲看见儿子在受苦, 所以根本就不可能再起害人之心, 更何况杀人
。 那些说学佛的人可以杀人而不起杀心, 那是颠倒了因果的说法。 杀人魔王也可以
杀人不眨眼,但是那是轻视生命和因果的表现。 而佛教恰恰相反, 是重视生命和因果
的教法, 所以不能混为一谈。。

【在 n********n 的大作中提到】
: 佛教不杀生,可是敌人要置你于死地,你该怎么办?依据是什么?
: 少林寺上说:我佛慈悲,亦惩恶。对吗?

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C*r
59
吐蕃早就皈依佛教,历代都没有死刑吗?

【在 l*******t 的大作中提到】
: 绝对不能杀生
: 如果敌人要置你于死地:你就逃跑 积极防御, 或者干脆送死都可以,随你自己选择,
: 但前提是不杀死对方, 可以把对方打伤打到 但不能伤害对方的生命,在不能肯定的情
: 况下, 就不能动手。
: 少林寺上说:我佛慈悲,亦惩恶。完全对
: 所以少林寺只有棍棒 没有刀,惩恶并不代表要杀死对方。就像美国很多州 已经取消死
: 刑。

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l*t
60
"吐蕃早就皈依佛教“ 这个我还真不知道。

【在 C*******r 的大作中提到】
: 吐蕃早就皈依佛教,历代都没有死刑吗?
avatar
C*r
61
老姐啊,吐蕃就是西藏,所以西藏的英文是Tibet。

【在 l*******t 的大作中提到】
: "吐蕃早就皈依佛教“ 这个我还真不知道。
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