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请教single particle tracking

请教single particle tracking# Biology - 生物学

f*e2012-11-01 07:11

1 楼

produced by CSSS of OSU

j*e2012-11-01 07:11

2 楼

最近老板要求做single particle tracking。研究的对象是膜蛋白，我自己用Qdot 605
标记了一抗，然后做拿TIRF microscope拍了time lapse video。可以看到结合在细胞
表面上的Qdot-抗体有明显的运动。
正在发愁怎么分析这些数据，我想要得到这些particle在细胞膜上运动的trajectory，
然后根据它分析运动的类型和速率。在网上看到一些信息说ImageJ可以用来做particle
tracking。然后找了教程，自己试着生成trajectory，但是发现得不到任何结果。想
问问谁有类似的经验，ImageJ有什么窍门没有。另外有没有别的常用软件可以做这种分
析。多谢帮助！

s*n2012-11-01 07:11

3 楼

Try u-Track from Danuser lab first
http://lccb.hms.harvard.edu/software.html

605
particle

【在 j*******e 的大作中提到】

: 最近老板要求做single particle tracking。研究的对象是膜蛋白，我自己用Qdot 605
: 标记了一抗，然后做拿TIRF microscope拍了time lapse video。可以看到结合在细胞
: 表面上的Qdot-抗体有明显的运动。
: 正在发愁怎么分析这些数据，我想要得到这些particle在细胞膜上运动的trajectory，
: 然后根据它分析运动的类型和速率。在网上看到一些信息说ImageJ可以用来做particle
: tracking。然后找了教程，自己试着生成trajectory，但是发现得不到任何结果。想
: 问问谁有类似的经验，ImageJ有什么窍门没有。另外有没有别的常用软件可以做这种分
: 析。多谢帮助！

y*u2012-11-01 07:11

4 楼

imageJ plugin Mosaic from ETH

j*e2012-11-01 07:11

5 楼

多谢，我去试试！

【在 s****n 的大作中提到】

: Try u-Track from Danuser lab first
: http://lccb.hms.harvard.edu/software.html
:
: 605
: particle

j*e2012-11-01 07:11

6 楼

我就是用的这个plugin，但是在我手里不work。我也不知道什么原因。以前也没有做过
类似的分析

【在 y**u 的大作中提到】

: imageJ plugin Mosaic from ETH

y*u2012-11-01 07:11

7 楼

我以前用过，而且和你的实验类似，也是TIRF。可以生成一个excel file, 有所有
chosen particle的信息，最后可以得到trajectory, displacement, dwelling time,
velocity, 还可以做成movie.
在那个网站上仔细找找，好像有一步很重要，要把你的file先convert一下，和bit有关
好像。

【在 j*******e 的大作中提到】

: 我就是用的这个plugin，但是在我手里不work。我也不知道什么原因。以前也没有做过
: 类似的分析