high resolution protome data 有包子# Biology - 生物学
G*G
1 楼
在蛋质谱分析中，什么图是
"higher resolution views of the primary proteomic data"？
请指出这是要求补充什么图？
1个包子，小小谢意。
"higher resolution views of the primary proteomic data"？
请指出这是要求补充什么图？
1个包子，小小谢意。
G*G
2 楼
ding.
【在 G***G 的大作中提到】
: 在蛋质谱分析中，什么图是
: "higher resolution views of the primary proteomic data"？
: 请指出这是要求补充什么图？
: 1个包子，小小谢意。
【在 G***G 的大作中提到】
: 在蛋质谱分析中，什么图是
: "higher resolution views of the primary proteomic data"？
: 请指出这是要求补充什么图？
: 1个包子，小小谢意。
s*y
3 楼
我不是专家，但是看来对方就是想看看你的质谱的高分辨原图吧？
【在 G***G 的大作中提到】
: 在蛋质谱分析中，什么图是
: "higher resolution views of the primary proteomic data"？
: 请指出这是要求补充什么图？
: 1个包子，小小谢意。
【在 G***G 的大作中提到】
: 在蛋质谱分析中，什么图是
: "higher resolution views of the primary proteomic data"？
: 请指出这是要求补充什么图？
: 1个包子，小小谢意。
G*G
4 楼
我有一个raw文件，这个文件有一个总图（图中xaxis是time，yaxis是relative
abundance）图中每一个x点对应一个scan。
每一个scan对应一个图（xasix是m/z，yaxis是relative abundance）
另外，经过蛋白质identification后，每个识别出的peptide还有一个图
（xasis是m/z, yaxis 是relative abundance）
有很多scan，很多识别出的peptide，
请问，这个reviewer的意思是让我添加什么高分率原图？
【在 s******y 的大作中提到】
: 我不是专家，但是看来对方就是想看看你的质谱的高分辨原图吧？
abundance）图中每一个x点对应一个scan。
每一个scan对应一个图（xasix是m/z，yaxis是relative abundance）
另外，经过蛋白质identification后，每个识别出的peptide还有一个图
（xasis是m/z, yaxis 是relative abundance）
有很多scan，很多识别出的peptide，
请问，这个reviewer的意思是让我添加什么高分率原图？
【在 s******y 的大作中提到】
: 我不是专家，但是看来对方就是想看看你的质谱的高分辨原图吧？
s*y
5 楼
应该是指没有加工和剪切过的质谱的 M/Z 图。除了你感兴趣的产物，还要显示整个大图
【在 G***G 的大作中提到】
: 我有一个raw文件，这个文件有一个总图（图中xaxis是time，yaxis是relative
: abundance）图中每一个x点对应一个scan。
: 每一个scan对应一个图（xasix是m/z，yaxis是relative abundance）
: 另外，经过蛋白质identification后，每个识别出的peptide还有一个图
: （xasis是m/z, yaxis 是relative abundance）
: 有很多scan，很多识别出的peptide，
: 请问，这个reviewer的意思是让我添加什么高分率原图？
【在 G***G 的大作中提到】
: 我有一个raw文件，这个文件有一个总图（图中xaxis是time，yaxis是relative
: abundance）图中每一个x点对应一个scan。
: 每一个scan对应一个图（xasix是m/z，yaxis是relative abundance）
: 另外，经过蛋白质identification后，每个识别出的peptide还有一个图
: （xasis是m/z, yaxis 是relative abundance）
: 有很多scan，很多识别出的peptide，
: 请问，这个reviewer的意思是让我添加什么高分率原图？
W*o
6 楼
they want to see your RAW data file, this file can tell you lots of
information such as CID, fragmentation, signal-noise, signal intensities,
etc. I would use XCalibur to make series of figures to show the CID, signal-
noise ratio and intensities.
【在 G***G 的大作中提到】
: 在蛋质谱分析中，什么图是
: "higher resolution views of the primary proteomic data"？
: 请指出这是要求补充什么图？
: 1个包子，小小谢意。
information such as CID, fragmentation, signal-noise, signal intensities,
etc. I would use XCalibur to make series of figures to show the CID, signal-
noise ratio and intensities.
【在 G***G 的大作中提到】
: 在蛋质谱分析中，什么图是
: "higher resolution views of the primary proteomic data"？
: 请指出这是要求补充什么图？
: 1个包子，小小谢意。
K*S
7 楼
TIC is meaningless. You can probably ignore your 1st figure.
2nd figure (sounds like MS1), you need to zoom in the area where you detect
the intact peptides, for high resolution data, you need to show all the
isotopic peaks and at least 4 decimals of m/z, such as 1000.0000 (assuming
you use high resolution instrument)
3rd figure you mentioned sounds like MS2 spectra, did you label the
fragments?
【在 G***G 的大作中提到】
: 我有一个raw文件，这个文件有一个总图（图中xaxis是time，yaxis是relative
: abundance）图中每一个x点对应一个scan。
: 每一个scan对应一个图（xasix是m/z，yaxis是relative abundance）
: 另外，经过蛋白质identification后，每个识别出的peptide还有一个图
: （xasis是m/z, yaxis 是relative abundance）
: 有很多scan，很多识别出的peptide，
: 请问，这个reviewer的意思是让我添加什么高分率原图？
2nd figure (sounds like MS1), you need to zoom in the area where you detect
the intact peptides, for high resolution data, you need to show all the
isotopic peaks and at least 4 decimals of m/z, such as 1000.0000 (assuming
you use high resolution instrument)
3rd figure you mentioned sounds like MS2 spectra, did you label the
fragments?
【在 G***G 的大作中提到】
: 我有一个raw文件，这个文件有一个总图（图中xaxis是time，yaxis是relative
: abundance）图中每一个x点对应一个scan。
: 每一个scan对应一个图（xasix是m/z，yaxis是relative abundance）
: 另外，经过蛋白质identification后，每个识别出的peptide还有一个图
: （xasis是m/z, yaxis 是relative abundance）
: 有很多scan，很多识别出的peptide，
: 请问，这个reviewer的意思是让我添加什么高分率原图？
l*1
8 楼
Mark!
detect
【在 K******S 的大作中提到】
: TIC is meaningless. You can probably ignore your 1st figure.
: 2nd figure (sounds like MS1), you need to zoom in the area where you detect
: the intact peptides, for high resolution data, you need to show all the
: isotopic peaks and at least 4 decimals of m/z, such as 1000.0000 (assuming
: you use high resolution instrument)
: 3rd figure you mentioned sounds like MS2 spectra, did you label the
: fragments?
detect
【在 K******S 的大作中提到】
: TIC is meaningless. You can probably ignore your 1st figure.
: 2nd figure (sounds like MS1), you need to zoom in the area where you detect
: the intact peptides, for high resolution data, you need to show all the
: isotopic peaks and at least 4 decimals of m/z, such as 1000.0000 (assuming
: you use high resolution instrument)
: 3rd figure you mentioned sounds like MS2 spectra, did you label the
: fragments?
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