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CD4+ T细胞分化和相关动物模型

CD4+ T细胞分化和相关动物模型# Biology - 生物学

t*h2014-11-18 08:11

1 楼

As laoda555 wrote below, ISI can offer a citation map. But it doesn't work
recently? I can access via library IP. Any suggestions? Thank you!
PART 2--------ISI
ISI, 又称ISI Web of Knowledge（ISI Web of Science）, Link如下：
http://apps.isiknowledge.com/UA_GeneralSearch_input.do?product=
ISI的优点是有做图功能，可以给了Citation随年代变化的图标来，若运用的好，还
可给出Citation在世界地图上的城市分布，如Categories，Countries/Territories，
Institutions，Map，Years分布图等。这些个图表是绿色的，当IO看材料看得头昏脑
胀心情阴郁时，来点绿色调剂一下是不是能让IO他老人家心情愉快一点？别小看这小
小的一点，没准这小小的一点就让石头变成了馅饼。

d*f2014-11-18 08:11

2 楼

【以下文字转载自 WaterWorld 讨论区】
发信人: SallyGarden (郁闷的土拨鼠), 信区: WaterWorld
标题: 遇上这样的师兄，实在是郁闷啊。。。。
发信站: BBS 未名空间站 (Wed May 4 19:55:11 2011, 美东)
最近遇上一件郁闷的事，注册个马甲上来发泄一下。
交待背景：小女子本科毕业后来美国读商科master，已经1年半了。师兄，大我四岁，
已婚还没孩子，是我们商学院毕业，去了附近一家很好的金融公司工作三年了，去年也
买了house。
我和师兄是在另一个学长家聚会认识，因为是一个专业的，当时就互留了联系方式。后
来也见过几次，大多是在网上聊天。感觉他人很好，经常会帮我们这些学弟学妹的忙。
因为人家有家庭了，接触也不多，见面不超过5次。他所在的公司很有名，待遇很好，
也不容易进，所以我们商学院的学生都希望能去这家公司工作。我也因为学业，找工作
的事常在网上请教他，希望他能够帮忙推荐什么的。
前段时间，他跟我说他们组有个新的project，人手不够，需要招个intern，他说可以
做9个月，暑假fulltime，秋季parttime。我听了很兴奋，立刻表达了兴趣，并希望他
帮忙。对于我来说这是个非常好的机会，因为年底就毕业了，无论以后能留那还是找其
他公司，这个工作经验会很有帮助。而且他说这个项目基本是他执行，所以选人他有80
%的决定权，他老板只是参考意见。
之后一切都很顺利，我给了他简历，他很快帮我安排了面试，他还专门选了Easter那个
Good Friday,说这样大家心情会很好。虽然是intern，面试还是进行了3个小时，他也
是面试官之一。那天他特地穿了西装，师兄的英文很好，谈吐也很专业，大方有序，难
怪能进去工作。那个公司内部环境让人感觉很舒服，如果能在里面工作，简直太完美了
。面完了我们就去吃午饭了，说是我请他，不过最后他还是抢着买了单，照顾我还是学
生。他说这个机会他只跟系里我一个人说了，我也是第一个面试者，他老板对我也挺满
意，他说应该没问题。
他帮这个忙，还请我吃饭，我实在过意不去，想了想还是应该请个客什么的。我原本是
打算周末邀请他们夫妇一起来我家，我自己下厨，加上roommate，四个人吃饭，也避免
尴尬。给他打电话，他说他老婆回国过五一去了，他就一个人过来。不料上周六，我
roommate临时改了team meeting的时间，没法在家，我告诉他后，他就说他家厨房大，
让我去他家做饭。我犹豫了一下还是答应了，下午我们去中国店买了些东西就去他家了。
他家很整洁，布置得也很好，随后我开始准备，他要打下手，我没让。他就去沙发上做
他工作上的ppt什么的了，还把电视打开，连着电脑放些综艺节目，怕我一个人太无聊
。就这样，我在做饭，他做他的事，让我有种居家过日子的感觉，我心里觉得挺温暖的
。后来就是吃饭，他还开了红酒，一切都挺好。
饭后我们又玩wii，又蹦又跳地，出了点汗，我也有点累了，正准备去沙发上休息时，
他过来一把从正面抱住了我，头靠在我肩上，我能感觉到他滚烫的脸，还有粗粗的呼吸
声。这个动作虽然很突然，但我也有所意料，之前犹豫来不来就是担心这样的事发生。
估计他看我没什么反抗，以为是我默许了，他抱我抱的更紧了，开始亲吻我的脖子，一
只手在我后背乱摸。说实话，如果师兄是单身，他的确可以是个理想的交往对象，而且
我去年底和男友分手，也希望身边有人陪伴。可是他毕竟结婚了，我绝不允许自己这么
做，我开始推他，但他反而更用力了，手也往腰部以下摸去，我突然感觉到了他的生理
反应，我有些害怕了，怕事情失去控制。我就大喝了他的名字，奋力把他推开。我呆在
那里不知该说什么。师兄也没说话，坐到沙发上去，低着头，捂着脸。过了几秒，他轻
轻地说了声‘对不起’。我说你赶紧送我回家吧。之后，从路上到我下车，我们一句话
也没说。
之后我们也没联系，关于intern的事，本来应该是这周会有结果，我今天给他打了电话
，他的语气很正常，就好像什么都没发生过一样，但也没那么热情。他说他老板这几天
很忙，推迟到下周决定。唉，事情搞成这样真是太郁闷了，那个实习机会很宝贵，但
我无论如何都不会去做超越我底线的事。
我想师兄也不是有所图而帮忙的，只是当时一时冲动而以。不知道他现在怎么想的，我
揣测两种可能，一种是他就当没事发生过，他也不希望自己搞坏名声吧。第二种就是干
脆远离我，省得事情复杂了。
我就上来发泄一下郁闷，也不想暴露身份，毕竟这事我也没说出去，也没人可说。师兄
应该不会看到，他一般不逛论坛。同时，也想听听从男生的角度，会怎么考虑这样的事
。唉，郁闷啊。。。。

L*o2014-11-18 08:11

3 楼

版上有没有做T细胞发育的？本人新手，第一次发帖求助。
我现在有个小课题，phenotype挺明显，但是和前期的结果似乎是矛盾的，大家帮忙看
看呢。
我做了一个CD4细胞特异性的某个基因KO的小鼠，先是想看看该基因条件性KO后对CD4 T
细胞的分化有没有影响，于是就分了Naive T, 分别用不同CD4 T亚型的分化条件体外
诱导分化，发现促进了向某一个亚型的分化，和WT小鼠相比，该亚型的特异性细胞因子
升高了1倍，其他亚型则没有变化。
同时又试着在naive T上overexpress该基因，结果发现向该亚型的分化几乎完全被抑制
。然后做了一个microarray，确实是显著的影响了相关的基因。总的说来前期这些结果
非常不错，影响很明显，而且是某一T细胞亚型特异性的。
之后做了EAE模型，依照前面的结果，理论上KO小鼠发病要更严重一些，但是重复了好
几遍，都是KO小鼠EAE的发病被显著抑制了。并且KO小鼠的CNS里的CD4+细胞数降低，
Foxp3+细胞比例也降低。
手上目前只有这些，大家觉得应该再做些什么实验来讲圆这个故事呢？
先谢谢了。

n*p2014-11-18 08:11

4 楼

还有啊。 In My ResearcherID，左上角有个 ResearcherID Labs，点击一下就能看见
各种选项
了。

work

【在 t**h 的大作中提到】

: As laoda555 wrote below, ISI can offer a citation map. But it doesn't work
: recently? I can access via library IP. Any suggestions? Thank you!
: PART 2--------ISI
: ISI, 又称ISI Web of Knowledge（ISI Web of Science）, Link如下：
: http://apps.isiknowledge.com/UA_GeneralSearch_input.do?product=
: ISI的优点是有做图功能，可以给了Citation随年代变化的图标来，若运用的好，还
: 可给出Citation在世界地图上的城市分布，如Categories，Countries/Territories，
: Institutions，Map，Years分布图等。这些个图表是绿色的，当IO看材料看得头昏脑
: 胀心情阴郁时，来点绿色调剂一下是不是能让IO他老人家心情愉快一点？别小看这小
: 小的一点，没准这小小的一点就让石头变成了馅饼。

Z*l2014-11-18 08:11

5 楼

Wii的广告。

c*n2014-11-18 08:11

6 楼

如果你说的该亚型不是Th17就挺好圆的吧。。

t*h2014-11-18 08:11

7 楼

Thanks a lot! I am still in trouble.
(1) I added papers to MY Publication list, then click :Citing Articles
Network" via my own Researcher ID Labs. It showed :This graph could not be
created because there is no data to display.
(2) Some papers do not show citations. Of course, I am sure there are some
citations by good journals.

A*e2014-11-18 08:11

8 楼

作者是男的还是女的？

80
了。

【在 d********f 的大作中提到】

: 【以下文字转载自 WaterWorld 讨论区】
: 发信人: SallyGarden (郁闷的土拨鼠), 信区: WaterWorld
: 标题: 遇上这样的师兄，实在是郁闷啊。。。。
: 发信站: BBS 未名空间站 (Wed May 4 19:55:11 2011, 美东)
: 最近遇上一件郁闷的事，注册个马甲上来发泄一下。
: 交待背景：小女子本科毕业后来美国读商科master，已经1年半了。师兄，大我四岁，
: 已婚还没孩子，是我们商学院毕业，去了附近一家很好的金融公司工作三年了，去年也
: 买了house。
: 我和师兄是在另一个学长家聚会认识，因为是一个专业的，当时就互留了联系方式。后
: 来也见过几次，大多是在网上聊天。感觉他人很好，经常会帮我们这些学弟学妹的忙。

L*o2014-11-18 08:11

9 楼

不是17，能展开说说不？我外行，谢谢啦

【在 c**********n 的大作中提到】

: 如果你说的该亚型不是Th17就挺好圆的吧。。

x*02014-11-18 08:11

10 楼

there are my publication, my publication list1 and list2. Use
my publication only. Otherwise won't work. In addition, you have to
search and load from web of science

s*52014-11-18 08:11

11 楼

n

T

【在 L**o 的大作中提到】

: 版上有没有做T细胞发育的？本人新手，第一次发帖求助。
: 我现在有个小课题，phenotype挺明显，但是和前期的结果似乎是矛盾的，大家帮忙看
: 看呢。
: 我做了一个CD4细胞特异性的某个基因KO的小鼠，先是想看看该基因条件性KO后对CD4 T
: 细胞的分化有没有影响，于是就分了Naive T, 分别用不同CD4 T亚型的分化条件体外
: 诱导分化，发现促进了向某一个亚型的分化，和WT小鼠相比，该亚型的特异性细胞因子
: 升高了1倍，其他亚型则没有变化。
: 同时又试着在naive T上overexpress该基因，结果发现向该亚型的分化几乎完全被抑制
: 。然后做了一个microarray，确实是显著的影响了相关的基因。总的说来前期这些结果
: 非常不错，影响很明显，而且是某一T细胞亚型特异性的。

t*h2014-11-18 08:11

12 楼

Thank you! I will try again!!

C*92014-11-18 08:11

13 楼

敢问您说的矛盾指的是 ko EAE 发病抑制跟foxp3 降低之间吗？

t*h2014-11-18 08:11

14 楼

It still works in my publication folder. Thank you all

l*32014-11-18 08:11

15 楼

我觉得应该更倾向于相信in vivo的数据，既然KO小鼠不发病，且CNS里CD4+细胞绝对数
降低，那么这就是一个promising的现象，可以围绕这个来开展实验。
至于体外分化的结果，我觉得除非敲掉的是t-bet，gata3这种基因，否则很难有很显
著的差异，我认识一个人做Th17，他体外分化后测Il17，有时候好一点大概是30% vs
40%，有时候差一点就基本没差别了，最后还是照样发NI，关键是in vivo的差异很明
显。
仅供参考。
另外，就是感觉这几年这种题材的文章越来越难发NI这种级别的杂志了，基本没有
novelty了，大家觉得呢？

r*g2014-11-18 08:11

16 楼

完全支持楼上的想法～
给楼主一点儿我的看法
1. 1X 2X protocol都试一下，看看能不能做出来什么expected results （KO more
severe），这样最好了
2. 考虑到study的novelty，建议楼主先把那个cytokine减低一倍的数据放在一边！先
把EAE实验完善，因为你应该相信in vivo的数据，这样更容易build story！广泛的读
EAE的paper，比较microarray数据，研究一下有没有可能是别的gene被up or down-
regulated！！ To be honest, 一个cytokine production变化一倍，其实不算一个非
常drastic的difference！
3. 如果有可能，把EAE in vivo的细胞sort出来做microarray。把in vitro的数据留
着，看以后能不能再写一个story
4. 广泛读paper，看看哪些in vivo实验里面，相关gene或者cytokine变化 correlate
to your microarray data，然后去做那些in vivo model，看有没有收获
5. institue内合作，看各种autoimmune和infection的model 能不能有phenotype
这可能是楼主build career的机会啊～
最后说一句，
真他妈羡慕楼主，想想自己，实验project垃圾，屁都做不出来，实验室又没有经费，
买个antibody要跟老板求半天，整天还要跟各个公司的rep写email，要free sample来
trial，好不容易做出来一点点有意思的结果，苦于找不到合适的动物模型，老板又怕
花钱breed 那些老鼠，真是不知道哪天才能毕业了～
楼主加油！

L*o2014-11-18 08:11

17 楼

谢谢大家的回复啊，受益匪浅。
那我就先把重点放在动物模型上，把之前的EAE再重复一下，然后我再试试transfer的
EAE模型，分别转Th1，Th17试试看。
是啊，现在这种paper很难投很牛的杂志了，如果最后能投JEM就很好了。

c*n2014-11-18 08:11

18 楼

1. 目前看来导致EAE发病的CD4 T亚型是Th17吧（领域里的文章都把EAE的发病和Th17放
一起）。
2. Overexpress该基因导致Th17细胞数上调，然后你的神秘亚型被suppress。
3. KO该基因以后，你的神秘亚型细胞数上调，Th17被suppress。所以in vivo EAE发病
被抑制。
其实CD4亚型之间的竞争与平衡是个很好玩的领域吧。
以上都是猜测，但是故事这么圆和你做的三个实验并没有矛盾。希望楼主能有更
conclusive的实验来支持或者反对这个故事。