b*n
2 楼
每个月各个用户开销最大的前五项都给5%
不像现在都是每个季度chase指定的几个选项才给5%
话说这个政策是啥时候改的？
不像现在都是每个季度chase指定的几个选项才给5%
话说这个政策是啥时候改的？
s*s
3 楼
http://cdis.uchicago.edu/careers/
各种level的都要，需要Linux底下做过基本的NGS分析，从来没做过NGS想过来练手的就
算了。
Project叫做Genomic Data Commons，google一下就知道了。
各种level的都要，需要Linux底下做过基本的NGS分析，从来没做过NGS想过来练手的就
算了。
Project叫做Genomic Data Commons，google一下就知道了。
s*d
4 楼
请问生化专业可以挂靠吗？收费多少？
t*j
5 楼
不知道，没用过。
[发表自未名空间手机版 - m.mitbbs.com]
[发表自未名空间手机版 - m.mitbbs.com]
r*0
6 楼
大侠是公司性质的还是研究所？谢谢啊
d*w
7 楼
coask, what about finance major? how much it cost?
u*r
8 楼
现在没刷一笔给10个点，有兴趣就刷2.5刀以下的单。
【在 b******n 的大作中提到】
: 每个月各个用户开销最大的前五项都给5%
: 不像现在都是每个季度chase指定的几个选项才给5%
: 话说这个政策是啥时候改的？
【在 b******n 的大作中提到】
: 每个月各个用户开销最大的前五项都给5%
: 不像现在都是每个季度chase指定的几个选项才给5%
: 话说这个政策是啥时候改的？
s*s
9 楼
芝大。
【在 r******0 的大作中提到】
: 大侠是公司性质的还是研究所？谢谢啊
【在 r******0 的大作中提到】
: 大侠是公司性质的还是研究所？谢谢啊
s*p
10 楼
请问任何专业都可以挂靠吗？如何收费？谢谢！
【在 x******7 的大作中提到】
: 本公司OPT挂靠名额有剩余，需要者可联系 x********[email protected]
【在 x******7 的大作中提到】
: 本公司OPT挂靠名额有剩余，需要者可联系 x********[email protected]
E*z
11 楼
这样刷的话，以后又没了
c*e
12 楼
希望能有好的API.
【在 s******s 的大作中提到】
: http://cdis.uchicago.edu/careers/
: 各种level的都要，需要Linux底下做过基本的NGS分析，从来没做过NGS想过来练手的就
: 算了。
: Project叫做Genomic Data Commons，google一下就知道了。
m*k
13 楼
楼主记错了。当年FREEDOM这个叫EXCLUSIVE。是给当月自己消费最多的5个类目的3%。
s*8
14 楼
正在上一门bioinformatics的课，在linux下分析NGS数据，两个月之后学会了能要我么
，呵呵.很想转bioinformatics.
【在 s******s 的大作中提到】
: http://cdis.uchicago.edu/careers/
: 各种level的都要，需要Linux底下做过基本的NGS分析，从来没做过NGS想过来练手的就
: 算了。
: Project叫做Genomic Data Commons，google一下就知道了。
，呵呵.很想转bioinformatics.
【在 s******s 的大作中提到】
: http://cdis.uchicago.edu/careers/
: 各种level的都要，需要Linux底下做过基本的NGS分析，从来没做过NGS想过来练手的就
: 算了。
: Project叫做Genomic Data Commons，google一下就知道了。
s*s
15 楼
如果你linux，python很熟的话，我看没问题，NGS pipeline这东西其实很简单的，
就是几个tool连起来，网上多看看，会装程序编程其实很容易上手。
不过，如果只靠一门两个月bioinfo的课学linux，编程，ngs，我看没啥戏。招来
是负责干活的，不是带研究生可以慢慢学。
【在 s********8 的大作中提到】
: 正在上一门bioinformatics的课，在linux下分析NGS数据，两个月之后学会了能要我么
: ，呵呵.很想转bioinformatics.
就是几个tool连起来，网上多看看，会装程序编程其实很容易上手。
不过，如果只靠一门两个月bioinfo的课学linux，编程，ngs，我看没啥戏。招来
是负责干活的，不是带研究生可以慢慢学。
【在 s********8 的大作中提到】
: 正在上一门bioinformatics的课，在linux下分析NGS数据，两个月之后学会了能要我么
: ，呵呵.很想转bioinformatics.
g*y
16 楼
UChicago有个CRI http://cri.uchicago.edu/，我师兄在那里。
这个和CRI有关联吗？ CRI应该有各种pipeline吧。
这个和CRI有关联吗？ CRI应该有各种pipeline吧。
s*s
17 楼
你师兄是谁啊？
CDIS是一个center，这个center刚成立，只有一个lab叫做LAC。GDC是LAC做的若干
project之一。
CRI是给学校做生物信息service的。
LAC和CRI没有大关系，唯一的关联是LAC的PI正好兼职管着CRI的director。
【在 g**********y 的大作中提到】
: UChicago有个CRI http://cri.uchicago.edu/，我师兄在那里。
: 这个和CRI有关联吗？ CRI应该有各种pipeline吧。
CDIS是一个center，这个center刚成立，只有一个lab叫做LAC。GDC是LAC做的若干
project之一。
CRI是给学校做生物信息service的。
LAC和CRI没有大关系，唯一的关联是LAC的PI正好兼职管着CRI的director。
【在 g**********y 的大作中提到】
: UChicago有个CRI http://cri.uchicago.edu/，我师兄在那里。
: 这个和CRI有关联吗？ CRI应该有各种pipeline吧。
g*y
18 楼
我师兄 Lei Huang。我在UIC。
都是做bioinformatics的。
都是做bioinformatics的。
g*y
19 楼
我师兄 Lei Huang。我在UIC。
都是做bioinformatics的。
都是做bioinformatics的。
g*y
20 楼
我写的一个在cluster上并行运行pipeline的工具：
======================================================
../tools/run_cmd_pbs/run_cmd_pbs.py pipeline_rnaseq_gene_exp.sh -s 1-2 -p 2:
mem=10gb
PBS setting when it starts running the commands:
mem = 16gb
nodes = 1
ppn = 6
walltime = 20:00:00
base dir is: /cri/home2/zlei2/McLachlan
pipeline log file is: /cri/home2/zlei2/McLachlan/pipeline_log/pipeline_log.
20150129_182335.log
======================================================
2015-01-29 18:23:35 STEP1
2015-01-29 18:23:35 JOB_SUMMIT(19584) cuffquant -p 6 -o cq_B6312T -b /cri/
opinal/reference/m
2015-01-29 18:23:35 JOB_SUMMIT(19585) cuffquant -p 6 -o cq_B6585T -b /cri/
opinal/reference/m
2015-01-29 18:23:35 JOB_SUMMIT(19586) cuffquant -p 6 -o cq_B6839T -b /cri/
opinal/reference/m
2015-01-29 18:23:35 JOB_SUMMIT(19587) cuffquant -p 6 -o cq_B6312 -b /cri/
opinal/reference/mm
2015-01-29 18:23:35 JOB_SUMMIT(19588) cuffquant -p 6 -o cq_B6585 -b /cri/
opinal/reference/mm
2015-01-29 18:23:35 JOB_SUMMIT(19589) cuffquant -p 6 -o cq_B6839 -b /cri/
opinal/reference/mm
2015-01-29 18:23:35 JOB_SUMMIT(19590) cuffquant -p 6 -o cq_B6500 -b /cri/
opinal/reference/mm
2015-01-29 18:23:35 JOB_SUMMIT(19591) cuffquant -p 6 -o cq_B6591 -b /cri/
opinal/reference/mm
2015-01-29 18:24:05 JOB_RUN (19585) cuffquant -p 6 -o cq_B6585T -b /cri/
opinal/reference/m
2015-01-29 18:24:05 JOB_RUN (19588) cuffquant -p 6 -o cq_B6585 -b /cri/
opinal/reference/mm
2015-01-29 18:24:05 JOB_RUN (19590) cuffquant -p 6 -o cq_B6500 -b /cri/
opinal/reference/mm
2015-01-29 18:24:05 JOB_RUN (19584) cuffquant -p 6 -o cq_B6312T -b /cri/
opinal/reference/m
2015-01-29 18:24:05 JOB_RUN (19587) cuffquant -p 6 -o cq_B6312 -b /cri/
opinal/reference/mm
2015-01-29 18:24:05 JOB_RUN (19586) cuffquant -p 6 -o cq_B6839T -b /cri/
opinal/reference/m
2015-01-29 18:24:05 JOB_RUN (19591) cuffquant -p 6 -o cq_B6591 -b /cri/
opinal/reference/mm
2015-01-29 18:24:05 JOB_RUN (19589) cuffquant -p 6 -o cq_B6839 -b /cri/
opinal/reference/mm
2015-01-29 18:44:45 JOB_FINISH(19584) cuffquant -p 6 -o cq_B6312T -b /cri/
opinal/reference/m
2015-01-29 18:44:51 JOB_FINISH(19588) cuffquant -p 6 -o cq_B6585 -b /cri/
opinal/reference/mm
2015-01-29 18:45:14 JOB_FINISH(19586) cuffquant -p 6 -o cq_B6839T -b /cri/
opinal/reference/m
2015-01-29 18:45:16 JOB_FINISH(19589) cuffquant -p 6 -o cq_B6839 -b /cri/
opinal/reference/mm
2015-01-29 18:46:14 JOB_FINISH(19591) cuffquant -p 6 -o cq_B6591 -b /cri/
opinal/reference/mm
2015-01-29 18:46:14 JOB_FINISH(19590) cuffquant -p 6 -o cq_B6500 -b /cri/
opinal/reference/mm
2015-01-29 18:47:09 JOB_FINISH(19585) cuffquant -p 6 -o cq_B6585T -b /cri/
opinal/reference/m
2015-01-29 18:47:13 JOB_FINISH(19587) cuffquant -p 6 -o cq_B6312 -b /cri/
opinal/reference/mm
2015-01-29 18:47:14 STEP2
2015-01-29 18:47:14 JOB_SUMMIT(19592) cuffnorm -o gene_exp_test /cri/
opinal/reference/mm10/M
2015-01-29 18:47:36 JOB_RUN (19592) cuffnorm -o gene_exp_test /cri/
opinal/reference/mm10/M
2015-01-29 18:58:20 JOB_FINISH(19592) cuffnorm -o gene_exp_test /cri/
opinal/reference/mm10/M
======================================================
../tools/run_cmd_pbs/run_cmd_pbs.py pipeline_rnaseq_gene_exp.sh -s 1-2 -p 2:
mem=10gb
PBS setting when it starts running the commands:
mem = 16gb
nodes = 1
ppn = 6
walltime = 20:00:00
base dir is: /cri/home2/zlei2/McLachlan
pipeline log file is: /cri/home2/zlei2/McLachlan/pipeline_log/pipeline_log.
20150129_182335.log
======================================================
2015-01-29 18:23:35 STEP1
2015-01-29 18:23:35 JOB_SUMMIT(19584) cuffquant -p 6 -o cq_B6312T -b /cri/
opinal/reference/m
2015-01-29 18:23:35 JOB_SUMMIT(19585) cuffquant -p 6 -o cq_B6585T -b /cri/
opinal/reference/m
2015-01-29 18:23:35 JOB_SUMMIT(19586) cuffquant -p 6 -o cq_B6839T -b /cri/
opinal/reference/m
2015-01-29 18:23:35 JOB_SUMMIT(19587) cuffquant -p 6 -o cq_B6312 -b /cri/
opinal/reference/mm
2015-01-29 18:23:35 JOB_SUMMIT(19588) cuffquant -p 6 -o cq_B6585 -b /cri/
opinal/reference/mm
2015-01-29 18:23:35 JOB_SUMMIT(19589) cuffquant -p 6 -o cq_B6839 -b /cri/
opinal/reference/mm
2015-01-29 18:23:35 JOB_SUMMIT(19590) cuffquant -p 6 -o cq_B6500 -b /cri/
opinal/reference/mm
2015-01-29 18:23:35 JOB_SUMMIT(19591) cuffquant -p 6 -o cq_B6591 -b /cri/
opinal/reference/mm
2015-01-29 18:24:05 JOB_RUN (19585) cuffquant -p 6 -o cq_B6585T -b /cri/
opinal/reference/m
2015-01-29 18:24:05 JOB_RUN (19588) cuffquant -p 6 -o cq_B6585 -b /cri/
opinal/reference/mm
2015-01-29 18:24:05 JOB_RUN (19590) cuffquant -p 6 -o cq_B6500 -b /cri/
opinal/reference/mm
2015-01-29 18:24:05 JOB_RUN (19584) cuffquant -p 6 -o cq_B6312T -b /cri/
opinal/reference/m
2015-01-29 18:24:05 JOB_RUN (19587) cuffquant -p 6 -o cq_B6312 -b /cri/
opinal/reference/mm
2015-01-29 18:24:05 JOB_RUN (19586) cuffquant -p 6 -o cq_B6839T -b /cri/
opinal/reference/m
2015-01-29 18:24:05 JOB_RUN (19591) cuffquant -p 6 -o cq_B6591 -b /cri/
opinal/reference/mm
2015-01-29 18:24:05 JOB_RUN (19589) cuffquant -p 6 -o cq_B6839 -b /cri/
opinal/reference/mm
2015-01-29 18:44:45 JOB_FINISH(19584) cuffquant -p 6 -o cq_B6312T -b /cri/
opinal/reference/m
2015-01-29 18:44:51 JOB_FINISH(19588) cuffquant -p 6 -o cq_B6585 -b /cri/
opinal/reference/mm
2015-01-29 18:45:14 JOB_FINISH(19586) cuffquant -p 6 -o cq_B6839T -b /cri/
opinal/reference/m
2015-01-29 18:45:16 JOB_FINISH(19589) cuffquant -p 6 -o cq_B6839 -b /cri/
opinal/reference/mm
2015-01-29 18:46:14 JOB_FINISH(19591) cuffquant -p 6 -o cq_B6591 -b /cri/
opinal/reference/mm
2015-01-29 18:46:14 JOB_FINISH(19590) cuffquant -p 6 -o cq_B6500 -b /cri/
opinal/reference/mm
2015-01-29 18:47:09 JOB_FINISH(19585) cuffquant -p 6 -o cq_B6585T -b /cri/
opinal/reference/m
2015-01-29 18:47:13 JOB_FINISH(19587) cuffquant -p 6 -o cq_B6312 -b /cri/
opinal/reference/mm
2015-01-29 18:47:14 STEP2
2015-01-29 18:47:14 JOB_SUMMIT(19592) cuffnorm -o gene_exp_test /cri/
opinal/reference/mm10/M
2015-01-29 18:47:36 JOB_RUN (19592) cuffnorm -o gene_exp_test /cri/
opinal/reference/mm10/M
2015-01-29 18:58:20 JOB_FINISH(19592) cuffnorm -o gene_exp_test /cri/
opinal/reference/mm10/M
n*7
21 楼
这种批量submit job的小玩意基本每个用pbs的学生都会写一个
发出来是欺负别人不懂这个吗...
我用pbs_array，连这都省了
2:
【在 g**********y 的大作中提到】
: 我写的一个在cluster上并行运行pipeline的工具：
: ======================================================
:
: ../tools/run_cmd_pbs/run_cmd_pbs.py pipeline_rnaseq_gene_exp.sh -s 1-2 -p 2:
: mem=10gb
: PBS setting when it starts running the commands:
:
: mem = 16gb
:
: nodes = 1
发出来是欺负别人不懂这个吗...
我用pbs_array，连这都省了
2:
【在 g**********y 的大作中提到】
: 我写的一个在cluster上并行运行pipeline的工具：
: ======================================================
:
: ../tools/run_cmd_pbs/run_cmd_pbs.py pipeline_rnaseq_gene_exp.sh -s 1-2 -p 2:
: mem=10gb
: PBS setting when it starts running the commands:
:
: mem = 16gb
:
: nodes = 1
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