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genotyping PCR 结果是对的,但是目的基因没有被敲除
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genotyping PCR 结果是对的,但是目的基因没有被敲除# Biology - 生物学
d*i
1
genotyping PCR 结果是对的,但是WB结果显示目的基因没有被敲除
会是什么原因?
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n*w
2
Cre被silence不工作了?
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S*h
3
southern blot 看DNA
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f*e
4
太不详细了,ko,cko,iko....
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x*6
5
换抗体

【在 d*******i 的大作中提到】
: genotyping PCR 结果是对的,但是WB结果显示目的基因没有被敲除
: 会是什么原因?

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D*g
6
+1

【在 f*******e 的大作中提到】
: 太不详细了,ko,cko,iko....
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d*i
7
是conditional KO
fl/fl + tissue specific cre
两者genotyping 都是对的。
请教会是什么原因??

【在 f*******e 的大作中提到】
: 太不详细了,ko,cko,iko....
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d*i
8
是conditional KO
fl/fl + tissue specific cre
两者genotyping 都是对的。
请教会是什么原因??

【在 D****g 的大作中提到】
: +1
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a*g
9
是lysm cre吗?有效果不佳的,可能跟蛋白本身half life太长有关。其他的原因比如
,flox设计不合理,导致部分敲除,其余部分蛋白还能表达;被敲除片段过长,形成
episome。也可能产生了变化,但是变化比较小, wb要细心一点定量

【在 d*******i 的大作中提到】
: genotyping PCR 结果是对的,但是WB结果显示目的基因没有被敲除
: 会是什么原因?

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f*e
10
先假设抗体特异,cre好使,loxp正确。
你检测下你可以切掉的部分,有些时候切掉一个exon还能形成转录本,不frameshift还
能有蛋白。primer至少一头设计在切除的部分上。做个pcr。


: 是conditional KO

: fl/fl tissue specific cre

: 两者genotyping 都是对的。

: 请教会是什么原因??



【在 d*******i 的大作中提到】
: 是conditional KO
: fl/fl + tissue specific cre
: 两者genotyping 都是对的。
: 请教会是什么原因??

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d*i
11
谢谢你的建议。
我的flox mice 是别人给的,发过文章的。不过他们用的其他组织的cre
而我们用的另外一个组织的cre. 我们的cre也应该没有问题(和其他癌基因cross后能
成瘤)

【在 f*******e 的大作中提到】
: 先假设抗体特异,cre好使,loxp正确。
: 你检测下你可以切掉的部分,有些时候切掉一个exon还能形成转录本,不frameshift还
: 能有蛋白。primer至少一头设计在切除的部分上。做个pcr。
:
:
: 是conditional KO
:
: fl/fl tissue specific cre
:
: 两者genotyping 都是对的。
:
: 请教会是什么原因??
:

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n*e
12
可能是overlapping PCR,同源DNA在vector和基因组里面都有,两个不相干的DNA分子
粘在一起放大了。用过一个PCR enzyme特别好,也发生过这个现象。不好的PCR enzyme
不会发生。降低PCR的循环数会去除这个overlapping PCR。
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A*W
13

应为你组织不纯,里面是个mixture, 其实敲出了,没有敲出掩盖你敲出效率

【在 d*******i 的大作中提到】
: 是conditional KO
: fl/fl + tissue specific cre
: 两者genotyping 都是对的。
: 请教会是什么原因??

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s*v
14
这种组织或者细胞特异的ko,直接上IHC啊。
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