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荧光团标记蛋白质问题

荧光团标记蛋白质问题# Biology - 生物学

s*42010-12-28 08:12

1 楼

青春荷尔蒙爆笑片段屌丝男给苍老师请安，求赐大胸妹子！
青春我们当中有着各有各样的奇葩！
不是我们不纯洁是这世间接触多了！
不是我们不单纯，表面上我们还是装着，其实我们想法很简单。
只为心中那不切实际的梦想。。。。。
此时此刻我不得不想起“贤哥”的那句话：” 你想成为百万富翁吗？你想成为魅力型
男吗？你想主宰这世界吗！？
别做梦了好好学习吧！！“
http://youtu.be/g_dXqbhsly0

x*o2010-12-28 08:12

2 楼

准备用Cy5 label 一个ribosomal 蛋白,这个蛋白有一个自带的Cys基团,是在一个loop
上,晶体上看起来跟别的部分没有什么interaction. 但是从我做的alignment上看,这个
Cys是conserved的.如果我用Cy5和这个cys反应,会不会对功能有影响?
还有一个蛋白sequence alignment 的问题, 从CLUSTAL的结果来看,我不明白那个一个
点的,semi-conserved substitution (similar shape),这个是什么意思阿?
多谢!

s*y2010-12-28 08:12

3 楼

loop
这个，如果在所有种类里面（比方说从酵母到人类）都是保守的话，最好就不要去
碰。

【在 x*****o 的大作中提到】

: 准备用Cy5 label 一个ribosomal 蛋白,这个蛋白有一个自带的Cys基团,是在一个loop
: 上,晶体上看起来跟别的部分没有什么interaction. 但是从我做的alignment上看,这个
: Cys是conserved的.如果我用Cy5和这个cys反应,会不会对功能有影响?
: 还有一个蛋白sequence alignment 的问题, 从CLUSTAL的结果来看,我不明白那个一个
: 点的,semi-conserved substitution (similar shape),这个是什么意思阿?
: 多谢!

e*s2010-12-28 08:12

4 楼

这个很难说，除非你做了一遍。最好有方法验证一下标记后的蛋白还有同样的功能。
但觉对值得一试。
其实Cys在蛋白里就功能方面而言，相对于Lys等其他可以Label的基团是最安全的。特
别如果这个蛋白只有这一个Cys暴露在表面的话，大部分情况问题都不大。因为单位点
的表面标记的影响都很有限。Cy5好像有点大就是了，看看结构附近会不会影响其他基
团的空间位置。

loop

【在 x*****o 的大作中提到】

x*o2010-12-28 08:12

5 楼

多谢

【在 e****s 的大作中提到】

: 这个很难说，除非你做了一遍。最好有方法验证一下标记后的蛋白还有同样的功能。
: 但觉对值得一试。
: 其实Cys在蛋白里就功能方面而言，相对于Lys等其他可以Label的基团是最安全的。特
: 别如果这个蛋白只有这一个Cys暴露在表面的话，大部分情况问题都不大。因为单位点
: 的表面标记的影响都很有限。Cy5好像有点大就是了，看看结构附近会不会影响其他基
: 团的空间位置。
:
: loop