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求助酶切问题,不胜感激
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求助酶切问题,不胜感激# Biology - 生物学
c*h
1
att的4s,冲了一晚上了,最多只能到99%,而且感觉掉电比4快。。。。
需要去苹果店换一个吗?
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c*9
2
我正在做一种固氮菌的酶切。chromosome材料应该没问题的,quantification是200ng/
ul.所以我用了5ul的chromosome, 1ul EcoR1, 4ul Eco buffer, 30ul diH2O.再分开
入4个小试管里面,保存在37度的水浴里面分别5MIN, 30MIN, 1H, 2H,然后移入65度的
水浴30分钟,再跑胶,但是做了2次,发现DNA都没有被切开。然后换了HindIII和NEB
Buffer2,结果也是没有切开。请教各位这个是哪个环节出问题了呢?是否有更好的办法
做酶切呢?谢谢。
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a*a
3
rp wenti

【在 c*****h 的大作中提到】
: att的4s,冲了一晚上了,最多只能到99%,而且感觉掉电比4快。。。。
: 需要去苹果店换一个吗?

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k*c
4
Let them run O/N
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l*7
5
Of course. 换机子没商量 用Amex 买的?用purchase protection too.

【在 c*****h 的大作中提到】
: att的4s,冲了一晚上了,最多只能到99%,而且感觉掉电比4快。。。。
: 需要去苹果店换一个吗?

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c*9
6
Thanks. What's the meaning of O/N?
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c*h
7
好像忘了用amex了。
刚才去了苹果店。不给换。非要我去att。可local几家att都没货。
怎么办?

★ 发自iPhone App: ChineseWeb - 中文网站浏览器

【在 l**7 的大作中提到】
: Of course. 换机子没商量 用Amex 买的?用purchase protection too.
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T*t
8
O/N = overnight
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c*9
9
请问是放在水浴37度里面通宵吗?谢谢
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m*7
10
首先,你有没有确定这个菌的chromosome有多大?有没有你这两个酶的酶切位点?
其次,按照识别位点6个碱基来算,4096个bp才能随机出现一个EcoRI的位点,考虑正反
向的话减一半就是2048bp。你跑胶的浓度是否合适来区分切开和没切开的状态?
你的描述中并没有出现非酶切对照,你是如何判断没切开的?
另外,你的实验目的是什么?为啥要用这两个酶来切?
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n*w
11
是的~

【在 c****9 的大作中提到】
: 请问是放在水浴37度里面通宵吗?谢谢
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s*s
12
一般来说chromosome DNA overnight切完应该是smear。

200ng/

【在 c****9 的大作中提到】
: 我正在做一种固氮菌的酶切。chromosome材料应该没问题的,quantification是200ng/
: ul.所以我用了5ul的chromosome, 1ul EcoR1, 4ul Eco buffer, 30ul diH2O.再分开
: 入4个小试管里面,保存在37度的水浴里面分别5MIN, 30MIN, 1H, 2H,然后移入65度的
: 水浴30分钟,再跑胶,但是做了2次,发现DNA都没有被切开。然后换了HindIII和NEB
: Buffer2,结果也是没有切开。请教各位这个是哪个环节出问题了呢?是否有更好的办法
: 做酶切呢?谢谢。

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s*s
13
什么叫做chromosome应该没有问题?phenol再抽一遍再切看看

200ng/

【在 c****9 的大作中提到】
: 我正在做一种固氮菌的酶切。chromosome材料应该没问题的,quantification是200ng/
: ul.所以我用了5ul的chromosome, 1ul EcoR1, 4ul Eco buffer, 30ul diH2O.再分开
: 入4个小试管里面,保存在37度的水浴里面分别5MIN, 30MIN, 1H, 2H,然后移入65度的
: 水浴30分钟,再跑胶,但是做了2次,发现DNA都没有被切开。然后换了HindIII和NEB
: Buffer2,结果也是没有切开。请教各位这个是哪个环节出问题了呢?是否有更好的办法
: 做酶切呢?谢谢。

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k*s
14
gDNA酶切有几个注意事项
1. gDNA一定要干净,质量好。酶切之前要跑胶看看。
2. 酶切体积要大些,1ug的要50uL体积更好
3. 酶要多加些,一般要总体积的5%
4. 酶切反应时间可以延长到overnight. 一般在反应几个小时后,可以再加几ul酶继
续切。
5. 最后跑胶应该是很好的smear现象。
酶切gDNA一帮可用来做Southern blot.

200ng/

【在 c****9 的大作中提到】
: 我正在做一种固氮菌的酶切。chromosome材料应该没问题的,quantification是200ng/
: ul.所以我用了5ul的chromosome, 1ul EcoR1, 4ul Eco buffer, 30ul diH2O.再分开
: 入4个小试管里面,保存在37度的水浴里面分别5MIN, 30MIN, 1H, 2H,然后移入65度的
: 水浴30分钟,再跑胶,但是做了2次,发现DNA都没有被切开。然后换了HindIII和NEB
: Buffer2,结果也是没有切开。请教各位这个是哪个环节出问题了呢?是否有更好的办法
: 做酶切呢?谢谢。

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