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求助：About Southern hybridization with high GC content DNA

求助：About Southern hybridization with high GC content DNA# Biology - 生物学

s*f2011-05-16 07:05

1 楼

刚开始学CNN，跑了一个keras的例子。里边convolution layer定义时，只需要定义数
量和大小，但是具体用什么样的kernel并没说。请问这些kernel都是固定的吗？谢谢

c*b2011-05-16 07:05

2 楼

我用roche DIG kits, 研究对象的GC含量很高(>60％), 正常条件 (65~68度洗膜) 杂交
结果很不干净, 希望有经验的朋友能
给些建议。非常感谢。

f*32011-05-16 07:05

3 楼

这些kernel的数值(weights)都是随机初始化并在网络训练中不断update的，通常不需
要人为设置。不过你可以选择初始化方式(uniform，normal。。。)

c*b2011-05-16 07:05

4 楼

我用roche DIG kits, 研究对象的GC含量很高(>60％), 正常条件 (65~68度洗膜) 杂交
结果很不干净, 希望有经验的朋友能
给些建议。非常感谢。

x*i2011-05-16 07:05

5 楼

肯定不是固定的，这些参数都要后面自己调，很麻烦的。很多时候train data
accuracy很高，一用到test data就不行，都是参数的锅。

：刚开始学CNN，跑了一个keras的例子。里边convolution layer定义时，只需要定义数
：量和大小，但是具体用什么样的kernel并没说。请问这些kernel都是固定的吗？谢谢

l*12011-05-16 07:05

6 楼

那就分几段选GC含量不太高的段做roche DIG PCR labeling 如何? or try another
way:
: ligation-anchored PCR
一句话就是用内切酶对应的人工引物锚定:high GC contents and complex secondary
structure of long mRNA 的5'和3'端做人工锚定引物PCR 包括 DIG PCR labeling
Reference from published year earlier:
: 1)
: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC50225/
: 2)
: http://aem.asm.org/content/75/6/1552.abstract
: 3)
: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/14660366

x*u2011-05-16 07:05

7 楼

你这个是过拟合啊，和初始化参数无关

义数

【在 x**********i 的大作中提到】

: 肯定不是固定的，这些参数都要后面自己调，很麻烦的。很多时候train data
: accuracy很高，一用到test data就不行，都是参数的锅。
:
: ：刚开始学CNN，跑了一个keras的例子。里边convolution layer定义时，只需要定义数
: ：量和大小，但是具体用什么样的kernel并没说。请问这些kernel都是固定的吗？谢谢