请教：microarray的false negative - 未名空间MITBBS历史存档

请教：microarray的false negative# Biology - 生物学

x*a2011-08-08 07:08

1 楼

父母要回去了，刚才上网站上用他们的信息查找了一下是否能找到他们ENTRY的 I-94电
子记录。发现能找到爸爸的，不能找到妈妈的，这邪门了？
不知道是否影响他们回国航班，或者是否影响他们下次来美国？我感觉是老美输入
DATABASE的时候可能弄错了，所以妈妈的信息虽然我确认都输入对了，但是还是NOT
FOUND。而且用爸爸的姓换了一次ENTRY，还是没有找到，以为他们会把我妈妈也输成我
爸爸的姓。
请教各位，谢谢！

l*42011-08-08 07:08

2 楼

玩具里有猫草,然后我把玩具挂在窝前.
两个奶猫醉熏熏的.
会不会对身体不好啦老闻?
有一只还在食物盆傍边做掩埋动作~~~虽然没有pee 或poo

h*g2011-08-08 07:08

3 楼

目前的microarry studies更关注false positives，是因为通常统计分析能提供大量的
candiate genes。
可还有另外一种情况，统计分析（比如ttest＋FDR control)无法得到任何基因或很少
的基因，这时false negatives应该很高吧。一个true positive在什么情况下会被
microarray整成false negative呢？是否和这个true positive的在细胞内的表达水平
有关系？拍脑袋想想，低表达的true positive很可能成为false negative，因为在
microarray的信号和noise差不多。那高表达的true positive会怎么样呢？
网上搜了一圈，很少有专门讨论microarray false negative的，至于和true positive
的expression level有啥关系就更不清楚了。大家有何高见？

i*i2011-08-08 07:08

4 楼

我专门查过,好像没什么限制.一般的猫5分钟就能清醒过来.
猫埋剩饭是正常得,在外面掩埋踪迹是可以保命得

n*72011-08-08 07:08

5 楼

感觉这类似统计的test，宁可错杀一千，不能放过一个（False positive）

e*t2011-08-08 07:08

6 楼

that's why microarray is dying. Hydridization always gives u low signal/
noise ratio, which is hard to overcome in some sense. Sequencing may have
bright future even error rate is still high so far.

A*y2011-08-08 07:08

7 楼

Yet, the current high through put sequencing is based on hybirdization...btw
, two are completely different things.

【在 e*****t 的大作中提到】

: that's why microarray is dying. Hydridization always gives u low signal/
: noise ratio, which is hard to overcome in some sense. Sequencing may have
: bright future even error rate is still high so far.

o*r2011-08-08 07:08

8 楼

We are never tagged by false negatives.某生统中牛面试时对俺说的话

h*g2011-08-08 07:08

9 楼

目前的microarry studies更关注false positives，是因为通常统计分析能提供大量的
candiate genes。
可还有另外一种情况，统计分析（比如ttest＋FDR control)无法得到任何基因或很少
的基因，这时false negatives应该很高吧。一个true positive在什么情况下会被
microarray整成false negative呢？是否和这个true positive的在细胞内的表达水平
有关系？拍脑袋想想，低表达的true positive很可能成为false negative，因为在
microarray的信号和noise差不多。那高表达的true positive会怎么样呢？
网上搜了一圈，很少有专门讨论microarray false negative的，至于和true positive
的expression level有啥关系就更不清楚了。大家有何高见？

n*72011-08-08 07:08

10 楼

感觉这类似统计的test，宁可错杀一千，不能放过一个（False positive）

e*t2011-08-08 07:08

11 楼

that's why microarray is dying. Hydridization always gives u low signal/
noise ratio, which is hard to overcome in some sense. Sequencing may have
bright future even error rate is still high so far.

A*y2011-08-08 07:08

12 楼

Yet, the current high through put sequencing is based on hybirdization...btw
, two are completely different things.

【在 e*****t 的大作中提到】

: that's why microarray is dying. Hydridization always gives u low signal/
: noise ratio, which is hard to overcome in some sense. Sequencing may have
: bright future even error rate is still high so far.

o*r2011-08-08 07:08

13 楼

We are never tagged by false negatives.某生统中牛面试时对俺说的话

l*12011-08-08 07:08

14 楼

Just up once
from almost bioinformatics Niu-Ren were on upper floors.
plus:
//www.biodiscovery.com/software/imagene/
//myweb.ncku.edu.tw/~wjcnmr/Software.HTM#C

positive

【在 h*****g 的大作中提到】

: 目前的microarry studies更关注false positives，是因为通常统计分析能提供大量的
: candiate genes。
: 可还有另外一种情况，统计分析（比如ttest＋FDR control)无法得到任何基因或很少
: 的基因，这时false negatives应该很高吧。一个true positive在什么情况下会被
: microarray整成false negative呢？是否和这个true positive的在细胞内的表达水平
: 有关系？拍脑袋想想，低表达的true positive很可能成为false negative，因为在
: microarray的信号和noise差不多。那高表达的true positive会怎么样呢？
: 网上搜了一圈，很少有专门讨论microarray false negative的，至于和true positive
: 的expression level有啥关系就更不清楚了。大家有何高见？

N*n2011-08-08 07:08

15 楼

ROC

positive

【在 h*****g 的大作中提到】

: 目前的microarry studies更关注false positives，是因为通常统计分析能提供大量的
: candiate genes。
: 可还有另外一种情况，统计分析（比如ttest＋FDR control)无法得到任何基因或很少
: 的基因，这时false negatives应该很高吧。一个true positive在什么情况下会被
: microarray整成false negative呢？是否和这个true positive的在细胞内的表达水平
: 有关系？拍脑袋想想，低表达的true positive很可能成为false negative，因为在
: microarray的信号和noise差不多。那高表达的true positive会怎么样呢？
: 网上搜了一圈，很少有专门讨论microarray false negative的，至于和true positive
: 的expression level有啥关系就更不清楚了。大家有何高见？