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protein complex的PDB structure如何拆开成各个protein来看?
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f*e
2
用 rasmol 打开,用 restrict 指令选 chain id

protein

【在 w***c 的大作中提到】
: 比如http://www.pdb.org/pdb/explore/explore.do?structureId=1id3
: 是好几个histones的complex,想只看其中一个,怎么把*.pdb文件拆开成每个protein
: 的*.pdb文件来看?

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w*c
3
chain id是叫比如Chain B吗,试了Restrict Chain B或者restrict B都显示error。

【在 f**********e 的大作中提到】
: 用 rasmol 打开,用 restrict 指令选 chain id
:
: protein

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W*e
4
pymol里选chain id
或者用记事本打开pdb每个蛋白单独存成一个pdb

protein

【在 w***c 的大作中提到】
: 比如http://www.pdb.org/pdb/explore/explore.do?structureId=1id3
: 是好几个histones的complex,想只看其中一个,怎么把*.pdb文件拆开成每个protein
: 的*.pdb文件来看?

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l*e
5
in pymol, type: select chain XXX.
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w*c
6
搞定了,我用的版本,RasMol V2.4,用restrict :F就是选中F chain。

【在 w***c 的大作中提到】
: chain id是叫比如Chain B吗,试了Restrict Chain B或者restrict B都显示error。
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