某KO小鼠表型分析求助-有图片 - 未名空间MITBBS历史存档

某KO小鼠表型分析求助-有图片# Biology - 生物学

m*j2013-06-01 07:06

1 楼

遛完狗回来之后就有点晚了，赶紧过去。
结果只能做在公共汽车站。AFU把附近的小朋友都舔了一遍。
一开始的时候，就好像是人手点的，非常慢，AFU都没有注意到。
慢慢才比较正常的速度，AFU听到邦邦的声音，就开始找声音的来源。
找到之后，看了大概2-3分钟也就没什么兴趣了，开始在地上寻觅。
中间公车还近了一次站，路边的浇水装置还启动了，淋了大家一身水，
回家一摸，连狗都淋了个半湿。
总的来讲，我觉得AFU还好，看到人多还是一贯的兴奋，
但是也没有什么出格的举动，就是把大家舔了一遍而已。
至于烟火的声音和味道，我觉得对他没什么影响。
一开始会找，找到之后也就无所谓了。

r*i2013-06-01 07:06

2 楼

我负责一KO小鼠colony，这个基因和一种免疫细胞相关。
此小鼠一岁时，spleen和liver出现tumor,明显比WT的大许多，见照片。
而且腿骨非常脆，一岁甚至8个月KO小鼠的腿骨就和2岁的WT的腿骨差不多，甚至更脆。
骨髓细胞中CD11b+细胞达到90%，有粒细胞白血病的征兆，正常的一岁的WT小鼠大约60-
70%。
请问大家我如何针对性的进行研究，比如spleen，liver和骨髓细胞。
我是个新手，老板对cancer也不是很熟，而且他也经常不在实验室，飞来飞去。
谢谢

s*g2013-06-01 07:06

3 楼

AFU还挺淡定。MTea和Coffee肯定很惊慌，估计狗小更害怕人群，我们没敢晚上带出去
。BTW，我们家附近都是那个自动浇水的，最搞笑的是它们拉一般突然开始，然后MTea
边拉边跑，边跑边拉--,- 然后我就追着捡屎

r*i2013-06-01 07:06

4 楼

【在 r*****i 的大作中提到】

: 我负责一KO小鼠colony，这个基因和一种免疫细胞相关。
: 此小鼠一岁时，spleen和liver出现tumor,明显比WT的大许多，见照片。
: 而且腿骨非常脆，一岁甚至8个月KO小鼠的腿骨就和2岁的WT的腿骨差不多，甚至更脆。
: 骨髓细胞中CD11b+细胞达到90%，有粒细胞白血病的征兆，正常的一岁的WT小鼠大约60-
: 70%。
: 请问大家我如何针对性的进行研究，比如spleen，liver和骨髓细胞。
: 我是个新手，老板对cancer也不是很熟，而且他也经常不在实验室，飞来飞去。
: 谢谢

Y*i2013-06-01 07:06

5 楼

我也刚看完焰火回来,你也在湾区?

r*i2013-06-01 07:06

6 楼

【在 r*****i 的大作中提到】

: 我负责一KO小鼠colony，这个基因和一种免疫细胞相关。
: 此小鼠一岁时，spleen和liver出现tumor,明显比WT的大许多，见照片。
: 而且腿骨非常脆，一岁甚至8个月KO小鼠的腿骨就和2岁的WT的腿骨差不多，甚至更脆。
: 骨髓细胞中CD11b+细胞达到90%，有粒细胞白血病的征兆，正常的一岁的WT小鼠大约60-
: 70%。
: 请问大家我如何针对性的进行研究，比如spleen，liver和骨髓细胞。
: 我是个新手，老板对cancer也不是很熟，而且他也经常不在实验室，飞来飞去。
: 谢谢

m*j2013-06-01 07:06

7 楼

是呀

【在 Y**i 的大作中提到】

: 我也刚看完焰火回来,你也在湾区?

r*i2013-06-01 07:06

8 楼

顶

a*82013-06-01 07:06

9 楼

AFU真是淡定啊，昨天还没带屁屁出门，就让他在后院尿尿，结果有人家开始放烟花，
屁屁尿都不尿了，扭头就往家里冲，然后就躲在他爸爸的桌子下面坐着喘，看着可可
怜了，可是不知道怎么让他克服，我们也尽量不去摸他，免得他更害怕，就让他去，可
看他可怜劲儿的。

r*i2013-06-01 07:06

10 楼

顶

t*u2013-06-01 07:06

11 楼

我家昨晚可热闹了……

z*q2013-06-01 07:06

12 楼

这个可以从血液成分入手吧

b*n2013-06-01 07:06

13 楼

昨晚帮饭吓得对着外面吼，被我关笼子里去才安静下来。然后山山兴奋地要往外面跑，
唧唧唧一个劲叫着要我给他开门，我没理他

D*a2013-06-01 07:06

14 楼

accelerated aging?
很热的，跳吧。

D*g2013-06-01 07:06

15 楼

Checking the cell population in blood and bone marrow of young animals to
figure out the abnormality of certain cell lineage, and then pinpoint the
pathway and molecules involved in this lineage abnomormality. Good luck.

r*i2013-06-01 07:06

16 楼

谢谢楼上各位

r*i2013-06-01 07:06

17 楼

谢谢你，我有个疑问，血液细胞的异变会引起liver cancer吗？我对liver cancer不
懂。
另外，你觉得用serum （KO vs WT）做个cytokine array如何？
谢谢你

【在 D****g 的大作中提到】

: Checking the cell population in blood and bone marrow of young animals to
: figure out the abnormality of certain cell lineage, and then pinpoint the
: pathway and molecules involved in this lineage abnomormality. Good luck.

L*S2013-06-01 07:06

18 楼

immunosurveillance挂了呗，cancer就出来了

【在 r*****i 的大作中提到】

: 谢谢你，我有个疑问，血液细胞的异变会引起liver cancer吗？我对liver cancer不
: 懂。
: 另外，你觉得用serum （KO vs WT）做个cytokine array如何？
: 谢谢你

f*e2013-06-01 07:06

19 楼

这么厉害的基因啊

60-

【在 r*****i 的大作中提到】

: 我负责一KO小鼠colony，这个基因和一种免疫细胞相关。
: 此小鼠一岁时，spleen和liver出现tumor,明显比WT的大许多，见照片。
: 而且腿骨非常脆，一岁甚至8个月KO小鼠的腿骨就和2岁的WT的腿骨差不多，甚至更脆。
: 骨髓细胞中CD11b+细胞达到90%，有粒细胞白血病的征兆，正常的一岁的WT小鼠大约60-
: 70%。
: 请问大家我如何针对性的进行研究，比如spleen，liver和骨髓细胞。
: 我是个新手，老板对cancer也不是很熟，而且他也经常不在实验室，飞来飞去。
: 谢谢

o*d2013-06-01 07:06

20 楼

建议分析一下年轻老鼠的脾，1岁老鼠有这些自发的症状，年轻老鼠也应该会有一些
phenotype。

D*g2013-06-01 07:06

21 楼

I am not in cancer field, I can not give exact answer about whether there is
liver cancer originated from blood or not, but I guess the answer should be
YES. Because both spleen and liver get cancer in your mice and both tissues
have cells originated from bone morrow (macrophages for both tissues and
erythroblast precursor for spleen), there is high chance that the cancer is
related with bone marrow, it will be very helpful if you can check the cell
population in the bone marrow, blood and spleen in the young animals.
Probably you can ask some experts to check the section of the tumor in the
spleen and liver and tell the cell type and origin of the tumor.
To me, cytokine array is helpful but it is not the prior test that you
should do. Good luck.

【在 r*****i 的大作中提到】

: 谢谢你，我有个疑问，血液细胞的异变会引起liver cancer吗？我对liver cancer不
: 懂。
: 另外，你觉得用serum （KO vs WT）做个cytokine array如何？
: 谢谢你

n*b2013-06-01 07:06

22 楼

Sounds like myeloproliferative disorders.

60-

【在 r*****i 的大作中提到】

: 我负责一KO小鼠colony，这个基因和一种免疫细胞相关。
: 此小鼠一岁时，spleen和liver出现tumor,明显比WT的大许多，见照片。
: 而且腿骨非常脆，一岁甚至8个月KO小鼠的腿骨就和2岁的WT的腿骨差不多，甚至更脆。
: 骨髓细胞中CD11b+细胞达到90%，有粒细胞白血病的征兆，正常的一岁的WT小鼠大约60-
: 70%。
: 请问大家我如何针对性的进行研究，比如spleen，liver和骨髓细胞。
: 我是个新手，老板对cancer也不是很熟，而且他也经常不在实验室，飞来飞去。
: 谢谢

z*t2013-06-01 07:06

23 楼

spleen和肝脏看起来像myeloid sarcoma，建议外周血，骨髓染色看看
还要做外周血CBC分析

60-

【在 r*****i 的大作中提到】

: 我负责一KO小鼠colony，这个基因和一种免疫细胞相关。
: 此小鼠一岁时，spleen和liver出现tumor,明显比WT的大许多，见照片。
: 而且腿骨非常脆，一岁甚至8个月KO小鼠的腿骨就和2岁的WT的腿骨差不多，甚至更脆。
: 骨髓细胞中CD11b+细胞达到90%，有粒细胞白血病的征兆，正常的一岁的WT小鼠大约60-
: 70%。
: 请问大家我如何针对性的进行研究，比如spleen，liver和骨髓细胞。
: 我是个新手，老板对cancer也不是很熟，而且他也经常不在实验室，飞来飞去。
: 谢谢

n*b2013-06-01 07:06

24 楼

It does, but myeloid sarcoma is generally regarded as a descriptive term for
a subset of myeloproliferative disorders.

【在 z*t 的大作中提到】

: spleen和肝脏看起来像myeloid sarcoma，建议外周血，骨髓染色看看
: 还要做外周血CBC分析
:
: 60-

z*t2013-06-01 07:06

25 楼

MPD是应该有的，不过没有CBC/bone marrow imprint不好说

for

【在 n*********b 的大作中提到】

: It does, but myeloid sarcoma is generally regarded as a descriptive term for
: a subset of myeloproliferative disorders.

N*n2013-06-01 07:06

26 楼

I am just thinking. Can you find out first the origin of the tumor cells in
liver and spleen?

r*i2013-06-01 07:06

27 楼

thank all of you,
I discussed with my boss, he suggested me to do the following experiment:
1. measure the density of bone of KO mice, young KO vs WT, old KO vs WT
2. sections for live and spleen to verify the tumor: myeloid sarcoma,
lymphoma or others,
3. transplantation experiment: KO mice as recipient and donor to check
intrinsic or extrinsic influence,
4. Irradiate young KO mice (sub-lethal) to check DNA damage-inducible
changes in bone marrow, sleen, thymus.
5. analyze different sub-population between WT and KO.
How do you think?

i*02013-06-01 07:06

28 楼

i think the priority should be 5-2-3/1-4.

r*i2013-06-01 07:06

29 楼

THANK YOU

【在 i*********0 的大作中提到】

: i think the priority should be 5-2-3/1-4.

r*i2013-06-01 07:06

30 楼

有更新，看第一楼
谢谢

s*n2013-06-01 07:06

31 楼

敲的是跟CSF-1或者phosphoinositide信号通路有关的么？Meyloid progenitor 分化成
monocyte/osteoblast/osteoclast那一类细胞的分化通路受到影响了么？

r*i2013-06-01 07:06

32 楼

thank you for your suggestions.
Differentiation of myeloid progenitor into monocyte/osteoblast/osteoclast
could be influenced. We have litter evidence for it, but not enough.
We found there is more osteoclast in KO mice compared to WT ctl at the same
age. and bone density is less compared to control mice.
As for your suggestion: Meyloid progenitor 分化成monocyte/osteoblast/
osteoclast那一类细胞的分化通路受到影响了么.
How can we check it?
Here is my plan: check MPP, CMP, MEP, GMP and monocyte number for KO and
control mice.
Is there any pivotal pathway invovled in differentiation of myeloid
progenitor into monocyte/osteoblast/osteoclast?
how do you think?
thank you and sorry the language issue because I cannot input chinese by
using this computor in my office.

【在 s********n 的大作中提到】

: 敲的是跟CSF-1或者phosphoinositide信号通路有关的么？Meyloid progenitor 分化成
: monocyte/osteoblast/osteoclast那一类细胞的分化通路受到影响了么？

r*i2013-06-01 07:06

33 楼

This gene I am working on is not related to CSF1 or phosphoinositide.
It is not well known or studied.

【在 s********n 的大作中提到】

: 敲的是跟CSF-1或者phosphoinositide信号通路有关的么？Meyloid progenitor 分化成
: monocyte/osteoblast/osteoclast那一类细胞的分化通路受到影响了么？

r*i2013-06-01 07:06

34 楼

F4/80---->macrophage
CD115&Mac1---->monocyte

r*i2013-06-01 07:06

35 楼

some suggestions from my boss:
1. colony forming assay,
2. RBC count,
3. body weight measure,
4. blood smear assay (cytospin)

j*12013-06-01 07:06

36 楼

一岁的老鼠太老了，很难说是自发形成的tumor还是ko的结果

r*i2013-06-01 07:06

37 楼

第一，我的对照小鼠在一岁多的时候没有一个发现tumor，但是我的KO小鼠30%出现
tumor。
第二，有的KO小鼠在8-9个月大的时候，BM里面就出现CD11b+达到90%的状况。
所以，我觉得这不是偶然现象。

【在 j******1 的大作中提到】

: 一岁的老鼠太老了，很难说是自发形成的tumor还是ko的结果

z*t2013-06-01 07:06

38 楼

不仅要做cmp/mep/gmp lt-hsc/st-hsc/mpp staining,还要有完整的lineage analysis:
erythroid: ter119/cd71, myeloid: Gr1, mac1， B cell lineage: CD19, B220 T
cell lineage: CD4,CD8。这些外周血、骨髓，spleen都做一下.对于block of
differentiation,主要还是FACS和giemsa-wright stain来确定。
还有为了排除microenvironment的影响，还要把KO mice的bm移植给wt mice。至于
osteoclast,最近认为lymphnoid progenitor会呆在osteoblast旁边，并受cxcl12调控
。去年的ASH也有人在osteoblast overexpress beta-catenin可以导致leukemia的

same

【在 r*****i 的大作中提到】

: thank you for your suggestions.
: Differentiation of myeloid progenitor into monocyte/osteoblast/osteoclast
: could be influenced. We have litter evidence for it, but not enough.
: We found there is more osteoclast in KO mice compared to WT ctl at the same
: age. and bone density is less compared to control mice.
: As for your suggestion: Meyloid progenitor 分化成monocyte/osteoblast/
: osteoclast那一类细胞的分化通路受到影响了么.
: How can we check it?
: Here is my plan: check MPP, CMP, MEP, GMP and monocyte number for KO and
: control mice.

r*i2013-06-01 07:06

39 楼

thank you.

analysis:

【在 z*t 的大作中提到】

: 不仅要做cmp/mep/gmp lt-hsc/st-hsc/mpp staining,还要有完整的lineage analysis:
: erythroid: ter119/cd71, myeloid: Gr1, mac1， B cell lineage: CD19, B220 T
: cell lineage: CD4,CD8。这些外周血、骨髓，spleen都做一下.对于block of
: differentiation,主要还是FACS和giemsa-wright stain来确定。
: 还有为了排除microenvironment的影响，还要把KO mice的bm移植给wt mice。至于
: osteoclast,最近认为lymphnoid progenitor会呆在osteoblast旁边，并受cxcl12调控
: 。去年的ASH也有人在osteoblast overexpress beta-catenin可以导致leukemia的
:
: same

r*i2013-06-01 07:06

40 楼

western blot发现nfkb１在ko小鼠中显著低表达

r*i2013-06-01 07:06

41 楼

western blot发现p53在ko小鼠中显著低表达

i*02013-06-01 07:06

42 楼

还在折腾这个呀。

r*i2013-06-01 07:06

43 楼

集思广益