illumina hiseq 2000(2*75PE) 包lane, 最大能够包含几个barcode啊?# Biology - 生物学
n*u
1 楼
http://www.illumina.com/systems/sequencing.ilmn
HiSeq 2500/2000 包一个lane 大概有30G的通量,0.3billion的reads,里面可以加
muliplexing index barcode 用来区分每一个样品,如果加一百个barcode的话,理论
上每个样品就有3million个reads,如果我这个是针对16sRNA 全长测序的话(比如说700
好了),也足够放在一起overlap成数量可观的tags了(有人有经验吗?3million
reads 可以reconstruct into how many tags?)但是 barcode 测序有偏向性的风险,
实际上如 10 个 barcode样品,一共测 1G 数据量,并不能保证每个 barcode 样品数
据均为 100M。 Barcode 越多,样品越混乱,越容易产生 Bias。有做过的人吗? 包
lane的话最多能放进几个barcode呢?
HiSeq 2500/2000 包一个lane 大概有30G的通量,0.3billion的reads,里面可以加
muliplexing index barcode 用来区分每一个样品,如果加一百个barcode的话,理论
上每个样品就有3million个reads,如果我这个是针对16sRNA 全长测序的话(比如说700
好了),也足够放在一起overlap成数量可观的tags了(有人有经验吗?3million
reads 可以reconstruct into how many tags?)但是 barcode 测序有偏向性的风险,
实际上如 10 个 barcode样品,一共测 1G 数据量,并不能保证每个 barcode 样品数
据均为 100M。 Barcode 越多,样品越混乱,越容易产生 Bias。有做过的人吗? 包
lane的话最多能放进几个barcode呢?