a*x
2 楼
在前院清树叶发现的，看起来像蜥蜴，不过又好像是蛇，但是有脚。
s*z
3 楼
要是几年以后ＷＧＳ只要几十块钱，是不是所有传染病都用ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ检测
了？
了？
D*1
4 楼
有脚就不会是蛇了吧？
【在 a********x 的大作中提到】
: 在前院清树叶发现的，看起来像蜥蜴，不过又好像是蛇，但是有脚。
【在 a********x 的大作中提到】
: 在前院清树叶发现的，看起来像蜥蜴，不过又好像是蛇，但是有脚。
a*k
5 楼
不可能比PCR便宜，能用PCR的为啥要NGS？MRSA之类的用NGS有好处除外
【在 s********z 的大作中提到】
: 要是几年以后ＷＧＳ只要几十块钱，是不是所有传染病都用ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ检测
: 了？
【在 s********z 的大作中提到】
: 要是几年以后ＷＧＳ只要几十块钱，是不是所有传染病都用ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ检测
: 了？
a*x
6 楼
LD说好像是某种比较罕见的蛇，神探狄仁杰里面有一集里面有说到，是有毒的。。。。
【在 D*******1 的大作中提到】
: 有脚就不会是蛇了吧？
【在 D*******1 的大作中提到】
: 有脚就不会是蛇了吧？
s*z
7 楼
sometimes, one has to do multiple PCR to get a positive result, right?
if you add the time and cost together, it may exceed ngs.
plus, PCR gives a yes/no answer, with NGS you can possibly trace the
transmission of the pathogen.
i am not sure if I am thinking right though.
are there infectious diseases that you think NGS can add a lot of value?
thanks.
【在 a********k 的大作中提到】
: 不可能比PCR便宜，能用PCR的为啥要NGS？MRSA之类的用NGS有好处除外
if you add the time and cost together, it may exceed ngs.
plus, PCR gives a yes/no answer, with NGS you can possibly trace the
transmission of the pathogen.
i am not sure if I am thinking right though.
are there infectious diseases that you think NGS can add a lot of value?
thanks.
【在 a********k 的大作中提到】
: 不可能比PCR便宜，能用PCR的为啥要NGS？MRSA之类的用NGS有好处除外
D*1
8 楼
他是暗指美女蛇吧？
【在 a********x 的大作中提到】
: LD说好像是某种比较罕见的蛇，神探狄仁杰里面有一集里面有说到，是有毒的。。。。
【在 a********x 的大作中提到】
: LD说好像是某种比较罕见的蛇，神探狄仁杰里面有一集里面有说到，是有毒的。。。。
c*3
9 楼
WGS数据处理起来是难点，而且如果是和人序列一起测，细菌病毒的量极少，你不一定
能捕获的到
HCV就有人做啊，其他很多病毒细菌都有人在做
能捕获的到
HCV就有人做啊，其他很多病毒细菌都有人在做
L*a
10 楼
我们那有叫四脚蛇的，不过四脚蛇貌似就是种蜥蜴。
s*z
11 楼
数据处理就是把人的拿掉，再跟ｄａｔａｂａｓｅ比对吧，难是因为量大吗？
今天用ＷＧＳ查传染病的上了纽约时报的头版
In a First, Test of DNA Finds Root of Illness
http://www.nytimes.com/2014/06/05/health/in-first-quick-dna-tes
【在 c***3 的大作中提到】
: WGS数据处理起来是难点，而且如果是和人序列一起测，细菌病毒的量极少，你不一定
: 能捕获的到
: HCV就有人做啊，其他很多病毒细菌都有人在做
今天用ＷＧＳ查传染病的上了纽约时报的头版
In a First, Test of DNA Finds Root of Illness
http://www.nytimes.com/2014/06/05/health/in-first-quick-dna-tes
【在 c***3 的大作中提到】
: WGS数据处理起来是难点，而且如果是和人序列一起测，细菌病毒的量极少，你不一定
: 能捕获的到
: HCV就有人做啊，其他很多病毒细菌都有人在做
s*l
12 楼
gecko
c*3
13 楼
不单单是拿掉人的问题
本身测序深度和成本有直接关系，你测得不够深，里面就没包含多少病毒或者细菌的
reads，甚至很可能你挑出来的reads连1xcoverage都没有，你后面做鉴定本身自己心里
也打鼓。
如果用试验先提取病毒细菌，再测的问题就是容易被污染
【在 s********z 的大作中提到】
: 数据处理就是把人的拿掉，再跟ｄａｔａｂａｓｅ比对吧，难是因为量大吗？
: 今天用ＷＧＳ查传染病的上了纽约时报的头版
: In a First, Test of DNA Finds Root of Illness
: http://www.nytimes.com/2014/06/05/health/in-first-quick-dna-tes
本身测序深度和成本有直接关系，你测得不够深，里面就没包含多少病毒或者细菌的
reads，甚至很可能你挑出来的reads连1xcoverage都没有，你后面做鉴定本身自己心里
也打鼓。
如果用试验先提取病毒细菌，再测的问题就是容易被污染
【在 s********z 的大作中提到】
: 数据处理就是把人的拿掉，再跟ｄａｔａｂａｓｅ比对吧，难是因为量大吗？
: 今天用ＷＧＳ查传染病的上了纽约时报的头版
: In a First, Test of DNA Finds Root of Illness
: http://www.nytimes.com/2014/06/05/health/in-first-quick-dna-tes
l*d
14 楼
c
l*y
15 楼
只要能找到signature序列就可以了吧
难道没有方法先把人的dna去掉再上机器测序吗？
【在 c***3 的大作中提到】
: 不单单是拿掉人的问题
: 本身测序深度和成本有直接关系，你测得不够深，里面就没包含多少病毒或者细菌的
: reads，甚至很可能你挑出来的reads连1xcoverage都没有，你后面做鉴定本身自己心里
: 也打鼓。
: 如果用试验先提取病毒细菌，再测的问题就是容易被污染
难道没有方法先把人的dna去掉再上机器测序吗？
【在 c***3 的大作中提到】
: 不单单是拿掉人的问题
: 本身测序深度和成本有直接关系，你测得不够深，里面就没包含多少病毒或者细菌的
: reads，甚至很可能你挑出来的reads连1xcoverage都没有，你后面做鉴定本身自己心里
: 也打鼓。
: 如果用试验先提取病毒细菌，再测的问题就是容易被污染
l*d
16 楼
蝾螈/鲵。他们生活在潮湿阴凉的地方，靠皮肤吸收水分，对环境敏感，只有在环境好
无污染的地方才能生存。所以说明你家环境很好，土壤没有被除草剂杀虫剂污染。另外
他们一点也不可怕，不咬人，有人还专门买来当宠物养。
无污染的地方才能生存。所以说明你家环境很好，土壤没有被除草剂杀虫剂污染。另外
他们一点也不可怕，不咬人，有人还专门买来当宠物养。
s*z
17 楼
不知道是在sample prep的时候去掉人的DNA便宜还是后来数据处理的时候去便宜。
【在 l***y 的大作中提到】
: 只要能找到signature序列就可以了吧
: 难道没有方法先把人的dna去掉再上机器测序吗？
【在 l***y 的大作中提到】
: 只要能找到signature序列就可以了吧
: 难道没有方法先把人的dna去掉再上机器测序吗？
a*x
18 楼
真的吗？我们没有用杀虫剂倒是真的，它倒是藏在我们家的玫瑰下面，这几天落叶堆了
好大一堆，它就躲在树叶里面，我差点就把它抓手里了，看到的时候下一大跳，不过好
像不怎么动，感觉像是在冬眠啊。
【在 l******d 的大作中提到】
: 蝾螈/鲵。他们生活在潮湿阴凉的地方，靠皮肤吸收水分，对环境敏感，只有在环境好
: 无污染的地方才能生存。所以说明你家环境很好，土壤没有被除草剂杀虫剂污染。另外
: 他们一点也不可怕，不咬人，有人还专门买来当宠物养。
好大一堆，它就躲在树叶里面，我差点就把它抓手里了，看到的时候下一大跳，不过好
像不怎么动，感觉像是在冬眠啊。
【在 l******d 的大作中提到】
: 蝾螈/鲵。他们生活在潮湿阴凉的地方，靠皮肤吸收水分，对环境敏感，只有在环境好
: 无污染的地方才能生存。所以说明你家环境很好，土壤没有被除草剂杀虫剂污染。另外
: 他们一点也不可怕，不咬人，有人还专门买来当宠物养。
s*z
19 楼
你觉得如果能做到有depth的sequencing，或者只sequence culture以后的isolates,
在infectious disease里面，NGS做那个最有可能啊？
多谢
【在 c***3 的大作中提到】
: 不单单是拿掉人的问题
: 本身测序深度和成本有直接关系，你测得不够深，里面就没包含多少病毒或者细菌的
: reads，甚至很可能你挑出来的reads连1xcoverage都没有，你后面做鉴定本身自己心里
: 也打鼓。
: 如果用试验先提取病毒细菌，再测的问题就是容易被污染
在infectious disease里面，NGS做那个最有可能啊？
多谢
【在 c***3 的大作中提到】
: 不单单是拿掉人的问题
: 本身测序深度和成本有直接关系，你测得不够深，里面就没包含多少病毒或者细菌的
: reads，甚至很可能你挑出来的reads连1xcoverage都没有，你后面做鉴定本身自己心里
: 也打鼓。
: 如果用试验先提取病毒细菌，再测的问题就是容易被污染
R*m
20 楼
我家地里许多。有几次被我误伤。同娃娃鱼同类的。吃昆从。
【在 a********x 的大作中提到】
: 在前院清树叶发现的，看起来像蜥蜴，不过又好像是蛇，但是有脚。
【在 a********x 的大作中提到】
: 在前院清树叶发现的，看起来像蜥蜴，不过又好像是蛇，但是有脚。
h*n
21 楼
为什么要用NGS?
s*n
22 楼
看文章
http://www.nejm.org/doi/pdf/10.1056/NEJMoa1401268
【在 h****n 的大作中提到】
: 为什么要用NGS?
http://www.nejm.org/doi/pdf/10.1056/NEJMoa1401268
【在 h****n 的大作中提到】
: 为什么要用NGS?
s*z
23 楼
以后drug resistant的mutation越来越多，现有的办法不能告诉你用什么药
【在 h****n 的大作中提到】
: 为什么要用NGS?
【在 h****n 的大作中提到】
: 为什么要用NGS?
a*y
24 楼
测了序就知道用什么药了吗？还不是要靠测MIC……
【在 s********z 的大作中提到】
: 以后drug resistant的mutation越来越多，现有的办法不能告诉你用什么药
【在 s********z 的大作中提到】
: 以后drug resistant的mutation越来越多，现有的办法不能告诉你用什么药
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