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大家对oxford nanopore 最近发表的数据有什么看法
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大家对oxford nanopore 最近发表的数据有什么看法# Biology - 生物学
l*y
1
在线急问:绿卡持有人离境是不能超过一年还是6个月? 谢谢
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r*n
2
是不是得需要工业界持H1的工作
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v*e
3
ZZ
在昨天,我看到了一条新闻,新闻说我候选了时代周刊的两百个影响全球的人物,中国
同时入选的还有敏感词,敏感词和敏感词等人。当时我正在我们村里挖笋(我挖的是自
己家的),没怎么注意,后来回去一看手机上有不少的短信,问我对此事的态度,我只
回复了新京报和南都的两位朋友,其他媒体写的均为凭着对我性格的猜测下的友好想象
。我没有想到大家还比较关心,在这里我就做一个统一的回复。
首先,我非常感叹和惋惜,为什么别人有这样的新闻媒体,当时代周刊弄一个人物榜的
评选的时候,能够让全世界其他的国家都起波澜。我多么渴望我们中国也能有类似的一
个新闻媒体,当他评选人物的时候,在全世界也引起关注。我们不能说这样的一个媒体
完全公正,但是它是有完全的公信力的,我多么渴望我们国家也有。可惜我们并没有。
不是说我们的媒体人要比其他地方的媒体人差,而是因为一些……原因,这些原因众所
周知,点到为止,多说必死,死后鞭尸。
我经常自问自己,我为这个充满着敏感词的社会做出了什么贡献,可能到最后我只贡献
了一个以我的名字命名的敏感词而已。我天天睡到中午,经常浪费钱买数码产品,还挑
食,但好在我也未曾给这个社会增加罪
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k*r
4
rt
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h*r
5
这个技术有戏吗?
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f*r
6
180天吧。
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x*3
7
感谢D,感谢GJ,敏感词社会就是河蟹社会!
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d*l
8
Holyshit
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h*r
9
第一条trace 有8000 readlength,但是accuracy怎么算?

【在 h*********r 的大作中提到】
: 这个技术有戏吗?
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c*2
10
you will be asked questions if > 6 months
even if it is over 1 year, if your GC not expired, you will still be allowed
in but need to appear in court later and let a judge determine whether you
have strong ties with USA.
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S*t
11
指望剧场拥有者自己拆了墙 免费入场, 明显是不可能的,
HH也是在人屋檐下, 欲言又止吧,

【在 v****e 的大作中提到】
: ZZ
: 在昨天,我看到了一条新闻,新闻说我候选了时代周刊的两百个影响全球的人物,中国
: 同时入选的还有敏感词,敏感词和敏感词等人。当时我正在我们村里挖笋(我挖的是自
: 己家的),没怎么注意,后来回去一看手机上有不少的短信,问我对此事的态度,我只
: 回复了新京报和南都的两位朋友,其他媒体写的均为凭着对我性格的猜测下的友好想象
: 。我没有想到大家还比较关心,在这里我就做一个统一的回复。
: 首先,我非常感叹和惋惜,为什么别人有这样的新闻媒体,当时代周刊弄一个人物榜的
: 评选的时候,能够让全世界其他的国家都起波澜。我多么渴望我们中国也能有类似的一
: 个新闻媒体,当他评选人物的时候,在全世界也引起关注。我们不能说这样的一个媒体
: 完全公正,但是它是有完全的公信力的,我多么渴望我们国家也有。可惜我们并没有。

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C*H
12
http://www.genomeweb.com//sequencing/first-oxford-nanopore-user
号称读单链accuracy 68%,好像很低的样子。
不过看起来最后的protocol是两条链一起读,不知道还有多久才work?如果读双链,而
且是随机错误的话,正确率大概就是1-(1-0.68)^2,90%的样子,好像还不错?
板上有用过的人没?

【在 h*********r 的大作中提到】
: 第一条trace 有8000 readlength,但是accuracy怎么算?
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w*n
13
我不大清楚,但是你可以去这个网站看看,法佑网faayou.com,不知道能不能够帮上你
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v*e
14
挺好一孩子,我喜欢。看访谈其实很平和一人,讲话慢慢悠悠的,语气温和。此人如果
能健康、低调和谐地活到40岁,会写出比较牛逼的作品,也许可以比肩《黄金时代》。
但愿他能保持低调和独立。

【在 S********t 的大作中提到】
: 指望剧场拥有者自己拆了墙 免费入场, 明显是不可能的,
: HH也是在人屋檐下, 欲言又止吧,

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y*k
15
两条链不一样,该信谁啊?
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g*i
16
可不可以这样,比如2011年7月离境,然后2012年6月入境。这样子11和12年都在美国呆
了180天,但能连续在国内呆1年。
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S*t
17
HH有现在的成就都是自己凭能力闯出来的,
几乎没有一个媒体在后面支持,
HH只能在博客上说几句,
真是很不容易,
在中国要保持气节真的很难

【在 v****e 的大作中提到】
: 挺好一孩子,我喜欢。看访谈其实很平和一人,讲话慢慢悠悠的,语气温和。此人如果
: 能健康、低调和谐地活到40岁,会写出比较牛逼的作品,也许可以比肩《黄金时代》。
: 但愿他能保持低调和独立。

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C*H
18
应该说错误率是(1-0.68)^2,也就是两次都读错的。
又想了想,有四个碱基,所以要两次都读错,还错的一样的概率才是最后的错误率。如
果还是假设随机错误,那么错误率就是((1-0.68)^2)/3。不过错误估计肯定不是随机的
...
然后又想想,错误还有del和ins,就更复杂了...
唉,其实我是外行,也就是瞎说说。板上有没有懂行的出来说说?

【在 y***k 的大作中提到】
: 两条链不一样,该信谁啊?
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X*n
19
好像可以递个什么申请表,就不用在美国呆180天了。

【在 g*****i 的大作中提到】
: 可不可以这样,比如2011年7月离境,然后2012年6月入境。这样子11和12年都在美国呆
: 了180天,但能连续在国内呆1年。

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h*r
20
它能取代现有技术吗,比如pacbio?

【在 C***H 的大作中提到】
: 应该说错误率是(1-0.68)^2,也就是两次都读错的。
: 又想了想,有四个碱基,所以要两次都读错,还错的一样的概率才是最后的错误率。如
: 果还是假设随机错误,那么错误率就是((1-0.68)^2)/3。不过错误估计肯定不是随机的
: ...
: 然后又想想,错误还有del和ins,就更复杂了...
: 唉,其实我是外行,也就是瞎说说。板上有没有懂行的出来说说?

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s*s
21
看不到原文哈,我觉得应该这样算
显然,两条链不一样的就被filter掉了,所以只能用match的base
那么,正确的是 0.68^2 = 0.46, 错误的是 0.32^2 = 0.10
filter过以后的错误率实际上是0.10/(0.10+0.46) = 18%
这是假设双链错误的是一致的。 那么,如果双链错误的identity是随机的呢?
错误的就是CatOH算的 0.32^2/3 = 0.034
那么错误率其实是6.8%。 这个看上去比较靠谱

【在 C***H 的大作中提到】
: 应该说错误率是(1-0.68)^2,也就是两次都读错的。
: 又想了想,有四个碱基,所以要两次都读错,还错的一样的概率才是最后的错误率。如
: 果还是假设随机错误,那么错误率就是((1-0.68)^2)/3。不过错误估计肯定不是随机的
: ...
: 然后又想想,错误还有del和ins,就更复杂了...
: 唉,其实我是外行,也就是瞎说说。板上有没有懂行的出来说说?

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m*T
22
It's still too early to tell. Didn't follow it these days and not sure it
was based on engineering protein nanopore or solidstate?

★ 发自iPhone App: ChineseWeb 8.7

【在 h*********r 的大作中提到】
: 这个技术有戏吗?
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s*n
23
Protein pores

【在 m***T 的大作中提到】
: It's still too early to tell. Didn't follow it these days and not sure it
: was based on engineering protein nanopore or solidstate?
:
: ★ 发自iPhone App: ChineseWeb 8.7

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