用RNA-seq的data看alternative splicing？# Biology - 生物学
u*p
1 楼
不需要性能，只要可靠性高点就可以，挂个WD的NAS硬盘是不是比一般硬盘更加耐用？
例如WD的黑盘，谢谢！
例如WD的黑盘，谢谢！
l*u
2 楼
想搞一个GSM的。
i*0
3 楼
我的RNA seq是用Hiseq2000做的，single read mode，然后read的长度是50bp。
这样得到的data能做alternative splicing分析么？
如果不行，什么样参数的RNA-seq数据才能做一个比较可靠的分析？
谢谢！
这样得到的data能做alternative splicing分析么？
如果不行，什么样参数的RNA-seq数据才能做一个比较可靠的分析？
谢谢！
H*i
4 楼
黑盘自然耐用。
但是黑盘不是nas硬盘，红的是
【在 u*****p 的大作中提到】
: 不需要性能，只要可靠性高点就可以，挂个WD的NAS硬盘是不是比一般硬盘更加耐用？
: 例如WD的黑盘，谢谢！
但是黑盘不是nas硬盘，红的是
【在 u*****p 的大作中提到】
: 不需要性能，只要可靠性高点就可以，挂个WD的NAS硬盘是不是比一般硬盘更加耐用？
: 例如WD的黑盘，谢谢！
l*r
5 楼
4s，300， price error， 算deal吧。
【在 l*****u 的大作中提到】
: 想搞一个GSM的。
【在 l*****u 的大作中提到】
: 想搞一个GSM的。
i*i
6 楼
我是外行，据说需要100bp pair-end，deep/more reads
u*p
7 楼
我意思是挂个红盘会不会比黑盘更加耐用？
x*g
8 楼
Doing alternative splicing will need paired end reads to get the high
resolution. 100PE will be the good choice for this.
resolution. 100PE will be the good choice for this.
c*n
9 楼
这可不一定。
追求性能还是黑。
现在硬盘没有什么一定靠谱的
【在 u*****p 的大作中提到】
: 我意思是挂个红盘会不会比黑盘更加耐用？
y*3
10 楼
需要PE的测序。
q*r
11 楼
这种想法没有任何意义。
因为无论用什么盘，都得有备份plan。
既然有了备份plan，你追求的那点差别（如果有的话），就微不足道了。
【在 u*****p 的大作中提到】
: 不需要性能，只要可靠性高点就可以，挂个WD的NAS硬盘是不是比一般硬盘更加耐用？
: 例如WD的黑盘，谢谢！
因为无论用什么盘，都得有备份plan。
既然有了备份plan，你追求的那点差别（如果有的话），就微不足道了。
【在 u*****p 的大作中提到】
: 不需要性能，只要可靠性高点就可以，挂个WD的NAS硬盘是不是比一般硬盘更加耐用？
: 例如WD的黑盘，谢谢！
O*4
12 楼
这样的数据是可以分析alternative splicing 的，只要你的coverage 足够深 （>100
M for human sample）。
【在 i*********0 的大作中提到】
: 我的RNA seq是用Hiseq2000做的，single read mode，然后read的长度是50bp。
: 这样得到的data能做alternative splicing分析么？
: 如果不行，什么样参数的RNA-seq数据才能做一个比较可靠的分析？
: 谢谢！
M for human sample）。
【在 i*********0 的大作中提到】
: 我的RNA seq是用Hiseq2000做的，single read mode，然后read的长度是50bp。
: 这样得到的data能做alternative splicing分析么？
: 如果不行，什么样参数的RNA-seq数据才能做一个比较可靠的分析？
: 谢谢！
s*l
13 楼
nas硬盘不是更耐用吗？
【在 q**********r 的大作中提到】
: 这种想法没有任何意义。
: 因为无论用什么盘，都得有备份plan。
: 既然有了备份plan，你追求的那点差别（如果有的话），就微不足道了。
【在 q**********r 的大作中提到】
: 这种想法没有任何意义。
: 因为无论用什么盘，都得有备份plan。
: 既然有了备份plan，你追求的那点差别（如果有的话），就微不足道了。
n*u
14 楼
it's designed for server, so more reliable when vibration, high temperature,
and not fully speed running.
doesn't all apply to PC environment.
【在 s*******l 的大作中提到】
: nas硬盘不是更耐用吗？
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