CRISPR 序列分析问题请教# Biology - 生物学m*i2015-07-17 07:071 楼一颗小的grapefruit树,今天一看顶上的一片树叶上全是虫子,挺吓人的,要杀虫么https://dl.dropboxusercontent.com/u/10291230/CAM00056.jpg
pc2015-07-17 07:072 楼 很好。。。直接用hdmi cable连电视,接上xbox的controller,很方便也很爽就有一个问题,电视上显示探测到了1080p的信号,从surface也可以看到输出1080p到second screen。可是实际现实出来的画面比屏幕稍大(可能1.05:1之类的)。。感觉画面应该可以更加sharp一点。这是为啥呢?cable问题?
f*e2015-07-17 07:073 楼最近在做CRISPR突变,得到一些indel mutation。因为是hetrozygous, 所以不做TOPOcloning就看不出每一个allele的序列是什么。记得以前有人曾经提到过用一个软件可以直接分析heterozygous的indel mutation序列,只是现在记不得了,不知有人知道有什么样的免费软件可以进行这方面的分析?另外,这样的准确度有多高?是不是就不用TOPO cloning了? 多谢指教!
M*t2015-07-17 07:074 楼蚜虫?【在 m****i 的大作中提到】: 一颗小的grapefruit树,今天一看顶上的一片树叶上全是虫子,挺吓人的,要杀虫么: https://dl.dropboxusercontent.com/u/10291230/CAM00056.jpg
l*e2015-07-17 07:076 楼能读有三个前提,第一只能有2个allele(或者一个...废话)第二要结果测得还不错(废话)第三至少要有一个是wildtype的allele满足以上前提的话,自己就可以读.感觉比软件靠谱多了.
pc2015-07-17 07:078 楼 wired的可以直接连usb,wireless的话需要一个adaptor,微软有卖的xbox live的game基本都support吧。。【在 l*******r 的大作中提到】: 怎么接Xbox controller? Wired or wireless? What games does it support?
f*e2015-07-17 07:079 楼我的情况就是有些复杂啊。三个allele……而且目前在突变体里从没有看到过WT,只要有突变就是所有allele一起突变。唉,如果事情像你说的那样我也就自己读了啊。 想想三个allele的TOPO clone 就头疼,纯体力劳动...【在 l********e 的大作中提到】: 能读有三个前提,: 第一只能有2个allele(或者一个...废话): 第二要结果测得还不错(废话): 第三至少要有一个是wildtype的allele: 满足以上前提的话,自己就可以读.感觉比软件靠谱多了.
c*e2015-07-17 07:0711 楼为什么一定要知道序列?把它KO掉不就好了?【在 f********e 的大作中提到】: 我的情况就是有些复杂啊。三个allele……而且目前在突变体里从没有看到过WT,只要: 有突变就是所有allele一起突变。唉,如果事情像你说的那样我也就自己读了啊。 想: 想三个allele的TOPO clone 就头疼,纯体力劳动...
l*e2015-07-17 07:0715 楼三个的话只有subclone,因为从理论上,你无法把一个位置上的三个峰正确分配到三个未知的allele上【在 f********e 的大作中提到】: 我的情况就是有些复杂啊。三个allele……而且目前在突变体里从没有看到过WT,只要: 有突变就是所有allele一起突变。唉,如果事情像你说的那样我也就自己读了啊。 想: 想三个allele的TOPO clone 就头疼,纯体力劳动...
C*n2015-07-17 07:0716 楼你筛了多少个突变子?遇到过三个allele 同样的突变吗?也就是Homozygous的情况。【在 f********e 的大作中提到】: 我的情况就是有些复杂啊。三个allele……而且目前在突变体里从没有看到过WT,只要: 有突变就是所有allele一起突变。唉,如果事情像你说的那样我也就自己读了啊。 想: 想三个allele的TOPO clone 就头疼,纯体力劳动...
f*e2015-07-17 07:0718 楼筛了四五十个,只有一个发生同源重组的是三个同样的突变,其他的突变体都是heterozygous。我的问题在于,我不只是想把基因全本KO,还想研究基因的dosage效应,所以还想要筛到只敲掉一个或者两个allele的突变体,难啊。以前在euploid细胞里做突变的时候,倒是看到一些两个allele一样的突变,但是现在变成三个allele,indel mutation就没有看到homozygous的情况了,可能allele太多了吧,呵呵。【在 C****n 的大作中提到】: 你筛了多少个突变子?遇到过三个allele 同样的突变吗?也就是Homozygous的情况。
C*n2015-07-17 07:0719 楼Great,你说得到一个homozygote。 我之前也问相同的问题。这里再请教一下,那据你分析,为什么会有相同的突变出现?【在 f********e 的大作中提到】: 筛了四五十个,只有一个发生同源重组的是三个同样的突变,其他的突变体都是: heterozygous。我的问题在于,我不只是想把基因全本KO,还想研究基因的dosage效应: ,所以还想要筛到只敲掉一个或者两个allele的突变体,难啊。: 以前在euploid细胞里做突变的时候,倒是看到一些两个allele一样的突变,但是现在: 变成三个allele,indel mutation就没有看到homozygous的情况了,可能allele太多了: 吧,呵呵。
f*e2015-07-17 07:0720 楼最大的可能就是发生了同源重组吧 :一条链先发生indel mutation,然后另外一条链以这个突变的链为模版进行同源重组,然后就是homozygous了。【在 C****n 的大作中提到】: Great,你说得到一个homozygote。 我之前也问相同的问题。这里再请教一下,那据你: 分析,为什么会有相同的突变出现?