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【精彩!】刘善虑团队更新“人类对BQ.1.1等新毒株“的中和活性;一图回答:感染过BA.5是否就无敌了?

【精彩!】刘善虑团队更新“人类对BQ.1.1等新毒株“的中和活性;一图回答:感染过BA.5是否就无敌了?

科学

用数据,来辨清事实。


只要有SCI论文,就可以全家获得美国绿卡)


关键词:COVID-19;刘善虑;


导言:


2022年10月22日,美国疾控中心(CDC)发布消息,“CDC主任 Rochelle Walensky 博士确诊COVID-19”;尤其是,Walensky 博士于9月份接种了二价的更新疫苗


这个消息令人大惑不解:二价疫苗不是刚更新的专门预防新毒株的疫苗吗?


2022年6月15美国俄亥俄州立大学病毒学家刘善虑团队针对BQ.1.1等最新突变株的最新研究发布在bioRxiv,非常清楚地解释了新毒株的免疫逃逸研究。

这项研究更能够让我们看清新冠疫情的未来。



这篇文章的题目是“Distinct Neutralizing Antibody Escape of SARS-CoV-2 Omicron Subvariants BQ.1, BQ.1.1, BA.4.6, BF.7 and BA.2.75.2”【1】。


1,美国目前的流行毒株


我们先看一下美国于2022年10月22日公布的最新新冠病毒株变化。

BA.4.6, BQ.1, BQ.1.1, BF.7, BA.2.75, BA.2.75.2等突变株是在BA.4/5之后新出现的毒株,并且正在与BA.4/5竞争并缓慢取得优势。



看到这张图,我们不由得再次感慨刘善虑团队对于新冠病毒突变株方向敏感而准确地把握。


2,目前流行毒株的来源及突变位点


刘善虑团队的研究观察了不同免疫状态的人群对D614G,BA.2, BA.4/5,BA.4.6, BF.7, BQ.1, BQ.1.1, BA.2.75, BA.2.75.2等毒株的中和活性。


文章特别用图1A来解释了目前最新的突变株的来源和突变位点

这篇文章没有观察引起新加坡疫情的XBB,我们在图1A的基础上加上了XBB;因为中国香港特区已经检出XBB。


(目前主要毒株的来源及突变位点。图源:刘善虑团队研究,Hanson临床科研做了修改)


3,新毒株感染人类细胞能力增强、但感染肺细胞能力降低

该研究首通过应用D614G,BA.2, BA.4/5,BA.4.6, BF.7, BQ.1, BQ.1.1, BA.2.75, BA.2.75.2等假病毒感染293T-ACE2和CaLu-3细胞系。
结果发现与原始毒株(D614G)相比,BA.2, BA.4/5,BA.4.6, BF.7, BQ.1, BQ.1.1, BA.2.75等突变株感染293T-ACE2细胞能力增强,提示BA.4,BA.5,BA.2.12.1结合ACE2能力增强,从而解释了这些亚型传播能力的上升
但有意思的是,它们结合人肺腺癌细胞系CaLu-3的能力普遍下降,感染CaLu-3能力的下降恰可以解释其对于肺脏致病力的下降




4,疫苗接种或Omicron感染后,保护力多有效?

研究进一步评估了3剂疫苗接种者、BA.1或BA.5感染者的血清中和活性
结果发现:
3剂mRNA疫苗接种者的血清对D614G中和滴度NT50为2616,对Omicron BA.2为759,对BA.2后代毒株的中和活性均大幅降低,甚至对 BA.2.72.2仅为54
显示3剂mRNA疫苗接种对预防最新突变株的有效性已经大打折扣

最有意思的结果是对BA.1和BA.4/5两组感染者中和活性的比较。
结果显示,BA.1和BA.4/5感染者针对最新突变株的中和活性很低,显然也无法建立起有效的预防保护;但是BA.1感染者的中和活性似乎还稍好于BA.4/5感染者。
这一方面确认Omicron感染绝不是”天然疫苗“,也对目前美国CDC采用BA.4/5+原始毒株的二价疫苗提出了疑问;英国用的则是BA.1+原始毒株的二价疫苗。


5,哪个突变位点导致了最强的中和抗性?

现在的突变株太多了,不同的突变株又有不同的关键突变位点。哪个对于免疫逃逸最重要?也对于评判目前疫苗的有效性和未来的疫苗研发非常关键。
这项研究显示,N460K和F486S两个突变最重要;而这两个突变恰好分别是BQ.1和BA.2.75.2的核心突变。


6,免疫逃逸的机制

本研究最后通过分子模型,揭示了受体结合和非受体结合单克隆抗体介导的 R346T、K444T、F486S 和 D1199N 突变免疫逃避的机制。


简析:

刘善虑团队的这项研究丝毫不差地覆盖了美国正在流行的新毒株,一个不多、一个不少!
实际上,该团队已经不止一次地令我们惊讶于其研究的敏感性、创新性和前瞻性。

简单总结这项研究的核心结果:
1)美国目前流行的毒株与人类细胞ACE2的结合力普遍增强,但是感染肺细胞的能力普遍降低;这与其祖先Omicron BA.2的特征保持了一致。
2)美国目前流行毒株的免疫逃逸显著增强,尤其是BQ.1.1和BA.2.75.2,不仅能够逃逸3剂疫苗接种,还能够逃逸BA.1或者BA.5感染后的免疫
3)这些新毒株的免疫逃逸主要是由于N460K和F486S两个关键位点的突变

刘善虑团队的这项研究也很清楚地展示:在一个放开的社区中,感染过BA.5只是人类生命中Omicron感染的一次计数。
正如,美国CDC主任接种了二价疫苗,还是不可避免地感染了新冠病毒;也正如,辉瑞CEO感染两次Omicron突变株了。。。


这项研究也可以做疫苗研究的模板,有非常经典而规范的科研设计

我们由此特别对刘善虑团队的系列研究发生了兴趣。大数据分析显示,该团队已经发表了3篇NEJM,2篇LancetScienceNature各一篇,还有很多其他顶刊。

也期待这项精彩的研究发表到NEJM等顶刊。


(刘善虑团队发表论文的期刊。作图:Hanson临床科研;App:文献鸟)


原文链接:
【1】https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.10.19.512891v1
【2】 https://covid.cdc.gov/covid-data-tracker/#variant-proportions


本期编辑Henry,微信号healsan。
Hanson临床科研团队,由6位在美国的医生及医学科学家组成;目前在美国主要从事新药研发和临床科研。

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