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无敌了!生信SCI照这4步写直接开挂,附赠对应13个数据库详细教程!

无敌了!生信SCI照这4步写直接开挂,附赠对应13个数据库详细教程!

公众号新闻

今天,课程君也把这份教程分享给你们!希望能帮小伙伴们多多发SCI~

13个生信数据库,超过1000页的资料,从表达差异到功能聚类,从交互网络到临床意义,都有相应的数据库教程。


不仅教你数据库的基本操作,更会教你根据数据库写科研论文的全部思路教你4步复现SCI!小白也能轻松上手!


这个教程已经获得10万+学员验证,当然也包括课程君,大家可以放心学!


目录


1000页+独家生信数据库教程

13个数据库

4步复现SCI

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表达差异

GEO数据库

这里有全网最好懂的的GEO数据库教程,无论是肿瘤、非肿瘤、芯片、NGS、差异分析,还是分子验证……你能想到的数据,这里几乎都有,还可以做一些在线分析。



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TCGA数据库


TCGA是一个非常重要的癌症数据库,其主要收录各种人类癌症(包括亚型在内的肿瘤)的临床数据,基因组变异,mRNA表达,miRNA表达,甲基化等数据,是癌症研究者很重要的数据来源。


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Networkanalyst数据库


Networkanalyst可以进行比对、定量、基因表达差异分析和富集分析、蛋白相互作用分析、多个数据集整合分析,还可以绘制像PCA、蛋白互作网络图、热图、火山图、韦恩图等高颜值的图片。


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ICGC数据库


ICGC数据库包括了TCGA的数据,同时也纳入了其他别的地区所做的队列的测序数据,使用ICGC进行检索的话,我们可以得到更多的数据。


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功能聚类


GSEA数据库


GSEA用来确定一组先验定义的基因集是否在两种生物状态之间显示出统计学上显著的、一致的差异。


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DAVID数据库


David数据库想必大家都熟悉,做KEGG和GO通路分析常用的工具,适合不会撸代码的同学。


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GeneCards数据库


Genecards是人类基因的综合数据库,综合了NCBI、UCSC、ENsembl、uniprot等125个网络来源的基因组、转录组、蛋白质组学的数据库,提供了基因组、蛋白组、转录、遗传和功能上所有已知和预测的人类基因。



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交互网络

STRING数据库


STRING数据库,蛋白互作研究神器,海量数据一键分析!还不赶紧来了解一下!


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TARGET肿瘤数据库

TARGET肿瘤数据库主要是利用分子特征来描述难治性儿童肿瘤发生和进展中基因变化,主要包含患者临床数据、全基因组测序数据、甲基化数据、miRNA 数据等。


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JASPAR肿瘤数据库

JASPAR总共包含9个数据集,是一个收录转录因子与DNA结合位点以及结合模式的开源的公共数据库,不需要注册或登录就可以使用。



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临床意义

UALCAN数据库

UALCAN数据库用于分析癌症组学数据, 在加速癌症研究方面非常有帮助。



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KM plotter数据库

KM plotter做生存分析,出图即可用于文献发表,无需任何处理,轻松获得高分期刊同款图表!


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CCLE数据库

我们将带大家详细学习CCLE数据库中数据的建立过程,以及如何利用这些数据进行科学研究。


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还在担心生信太卷?不要慌!有了这13个数据库,4步轻松复现5分+SCI!还不快来get?
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