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CHAP:用于处理和分析瞳孔测量数据的开源软件

CHAP:用于处理和分析瞳孔测量数据的开源软件

教育

大家好,我是陈锐。

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最近在github上看到这个用于分析眼动瞳孔数据的开源软件,使用了一下。感觉还是非常友好,图形化的用户界面。有一定的预处理排除数据的方法和对瞳孔的时程分析,对出图上看上去还行。

网址:

https://in.bgu.ac.il/en/Labs/CNL/chap

安装

CHAP的安装包括三个主要步骤:
1.从GitHub上下载CHAP(
https://github.com/ronenno1/chap/archive/master.zip)
2.解压缩ZIP文件。
3.运行CHAP_installation.m文件或将CHAP添加到MATLAB路径中

matlab版本建议使用2016以上。

读取EyeLink的edf数据前,需要安装其development kit sdk开发包。


基本预处理

排除异常样本
排除异常试验
排除被试


高级时程图

除了数据的基本预处理外,CHAP还支持的高级分析功能。如图所示:
Bins:通过对X(自定义)毫秒的相邻采样取平均值来执行下采样。
时间窗口:数据与第一个选定事件的开始对齐,作为起始点。
相对变化:将数据转换为相对变化分数。相对变化表示与基线的差异(相减或相除)。
方法:转换为Z分数或任意单位
散射:用户可以在每条曲线的平均值周围添加散射。散射是标准误差或95%的置信区间。

输出

Chap支持三种输出:
CSV/MATLAB文件,包含每个被试的相关变量和事件的所有数据。
被试的PNG图像。


视频教程


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本文作者:陈锐

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