聚焦「难成药靶点」的新药「创新工厂」，AI制药公司「予路乾行」获天使轮融资｜36氪首发

2022-07-21 08:07

“将‘难成药靶点’变为‘热点靶点’，是AI技术未来在药物研发领域最广阔的应用前景和最有想象力的市场空间，这也是予路乾行差异化竞争策略。”

文 | 顿雨婷

封面来源 | Unsplash

36氪获悉，AI制药公司予路乾行已于今年5月份完成天使轮融资，投资方为杭州十棱投资管理有限公司。本轮融资主要为引进战略股东，为公司业务发展助力。据悉，公司新的募资计划已启动，将主要用于团队搭建和新的创新药物研发管线布局。

关于予路乾行，36氪曾有过详细报道，它定位于一家以分子模拟与建模技术驱动新药研发的交叉学科技术型企业。其核心技术是分子模拟运算平台，包括基于机器学习的分子力场引擎，以及平行化分子动力学模拟技术，意在从蛋白质靶点结构及其与药物分子作用的动态机理出发，设计和优化先导化合物，为药物研发提供新的切入点。

据予路乾行创始人郑铮博士介绍，国际计算机药物研发技术大致分为基于第一性原理的物理学方法和以AI算法为代表的统计学方法两种技术流派。其中物理模型是自下而上的解析式模型，具有精度高，对已知信息依赖较小，但计算成本昂贵等特点；AI算法则只需要将训练数据输入训练模型后等待模型收敛即可应用，开发成本较前者明显降低，但存在的问题是，模型的精度受限于训练数据的质量和生物体系多样性涵盖范围。

也因此，两种类型的算法开发呈现出完全不同的开发模式，前者（物理模型）往往开发周期长（数年），而开发完成后对算法迭代的频率要求比较低，同时开发难度高，目前国内具有物理模型开发能力的团队只有寥寥数个；后者（AI模型）的特点是开发难度相对较小（目前全球AI药物设计软件产品种类已不可枚举），但迭代频率高，需不断引入新数据库进行更新训练，但对于数据库之外的体系拓展适用性差，高度依赖前人研究体系的覆盖范围。

为此，予路乾行借助AI模型的开发特点及其对于算法开发模式的改变，将AI模型有针对性地引入物理引擎、用AI模型代替其中开发成本最高的分子力场部分，同时结合AI模型对于不同靶点体系在动力学过程中呈现的构象变化特征，对药物与靶点的结合位点及结合路径进行预学习，提高运算速度。简单来说，就是通过结合AI模型与物理模型来降低物理模型的开发成本，同时保有物理模型对不同生物体系的适用性，提高运算速度，来保留两种技术流派的优势——高精度、对数据依赖较小，以及速度快。

计算机药物设计技术通过数十年的发展，已深深植入药物研发的各个流程中，在以分子层面的药物设计及分析为主要应用场景的多个药物研发环节中发挥重要的作用。此外，业界对于计算机药物设计技术的主要需求从超大规模虚拟筛选、苗头化合物优化等方面，逐渐扩大到对于药物作用机理的探索以及复杂大分子药物及其药物递送系统的设计等领域。这不仅对于相关计算机算法的运算效率和精度提出了更高的要求，而且对算法在未知复杂分子体系中的泛化应用能力也带来了极大的挑战。

为此，予路乾行通过对多种药物与靶点体系进行大量的运算模拟研究及测试工作，开发并整合了一套药物分子研发平台，将视线从药物与靶点的结合界面拓展至结合药物分子后的靶点功能性构象改变的动力学表现上，通过对比未结合药物的空腔蛋白的动力学表现，并结合分析药物与靶点在结合过程中的热力学性质，对药物分子的体外活性进行综合性评估及预测。

具体来说，其技术平台的运算流程起始于靶点的结构建模与生理过程中的动态构象还原：通过分析靶点在构象变化过程中形成的稳定构象态，选取潜在的药物结合位点进行高速虚拟筛选算法与高精度分子模拟算法的高低搭配式运算，获得可靠的苗头化合物；随后通过干湿实验搭配的方式，明确分子层面的药效学机理，最终结合分子骨架跃迁原理，设计全新的先导化合物分子结构。

基于该技术，予路乾行未来发展的一个重点目标是，拓展在已知靶点中占据更大比例的“难成药靶点”市场，利用公司的技术优势对“难成药靶点”的结构和生理性质进行精确且快速的模拟，探索结合位点并设计可与其有效结合的药物分子。郑铮博士表示，将“难成药靶点”变为“热点靶点”，是AI技术未来在药物研发领域最广阔的应用前景和最有想象力的市场空间，这也是予路乾行差异化竞争策略。

据了解，予路乾行的模式对标美国AI制药上市公司Relay Therapeutics，这是一家以计算机药物设计为核心驱动力的药物研发公司，薛定谔公司也是该公司的大股东之一。Relay Therapeutics是以薛定谔公司的算法产品为核心，整合市场上其他优势算法产品并结合自身开发的AI模型形成了一套覆盖药物研发临床前阶段的运算平台，同时通过计算结合实验的方式进行药物研发。“这与公司目前及规划中的中长期模式高度相似。”

目前，公司已与国内外多家药企合作，针对数条药物管线开展联合研发工作，在一年内即助推一款药物进入临床试验阶段，同时通过联合研发模式推进一个“不可成药靶点”相关疾病的药物研发管线进入专利申报阶。商业化上，在继年初与南京瑞初达成三条关于神经退行性疾病联合研发的基础上，目前公司又新增一条金额为千万级联合研发管线合作；同时，与某CRO企业已达成LNP技术合作开发协议。

众所周知，新药研发是个极其庞大的市场。根据 EvaluatePharma 统计， 2019 年全球医药研发投入年达到 1789 亿美元，2013-2019 年的复合增速为 4.64%；预计 2024 年将达到 2130 亿美元，2019-2024 年的复合增速为 3.23%。

这一市场中，国内大多数AI制药企业管线仍处于研发阶段，将AI药物管线推进临床的相关公司也寥寥无几。郑铮博士认为，Me-too类或 FIC/BIC类药物研发管线开发成本类似，药物研发管线合同价一般均是千万起步，未来5年内AI制药企业有望拓展难成药靶点相关药物的研发空间，预计2025年AI药物研发市场规模达到100亿元量级。“近期可能形成突破的管线数量虽然有限，但管线收入仍然较为可观，且随着研发效率的提升以及合同‘里程碑’任务的完成，未来收入将实现翻倍增长。”

微信扫码关注该文公众号作者

戳这里提交新闻线索和高质量文章给我们。

来源: qq

点击查看作者最近其他文章