新冠已经成为大流感？！却因为这个原因，重新成为美国的关注点

关键词：COVID；JN.1；FLiRT；监测

在全球普遍放开的情况下，新冠的主流毒株也越来越趋向一致。美国尽管也已经取消了全面监测，但仍有持续的数据更新，故对其他国家仍有借鉴意义。

本次推送

1）继续更新美国最新报告的主流病毒及美国的疫情变化；

2）回顾与流感相比，COVID所致住院及住院病死率的变化；

3）刘善虑团队关于人群中对JN.1及FLiRT毒株中和活性的最新进展，提示了今冬疫苗方向及我们是否需要接种疫苗。

一，美国新冠疫情的最新情况

1，JN.1系在美国是主流毒株

2024年5月25日，美国CDC更新的数据显示，新一代新冠毒株KP.2的占比已经达到28.5%，成为新的主流毒株；其他几乎都是JN.1家族毒株【1】。

从进化看，KP.2来自于JN.1.11.1、后者来自于JN.1、后者来自于BA.2.82；都是Omicron毒株的后代。

（图源：美国CDC）

早在4月18日，Eric Topol就曾警告，KP.2为代表的FLiRT具有更为明显的传播优势，有可能引发新一波新冠疫情【2】。这主要归因于 2 个添加的尖峰突变：456 位处的L为F ，346 位置处的T为R ，这被称为 FLiRT 变体组。

尽管FLiRT 突变毒株具有明显的传播优势，但Eric不认为其会转化为新的浪潮。

一方面，FLiRT是新毒株群，但这些突变是我们之前接触过的突变（特别是 F456L 和 R346T）。

另外，在过去的冬季，美国刚刚经历过一个感染率很高的新冠疫情。只是因为住院人数和病死人数都不是很突出，所以没有被注意到。

最重要的，尽管BA.2.86及其家族的KP.2等新毒株有非常多的突变，但由于仍然在Omicron突变株的大家族内；其临床特点仍然是：传染性极强、致病性较弱。

但经过一个月的传播，情况似乎发生了变化，在过去两周内，美国新冠疫情因为病例增加被重新关注。

（美国媒体广泛报道了美国新冠病例数重新增长，并且是由FLiRT毒株所致）

2，美国COVID-19疫情重起

检测指标中最早反映疫情变化的是废水中新冠病毒浓度和新冠检测阳性率，这两项指标都显示，美国新冠感染重起。

2.1 废水中新冠病毒浓度再次增长

根据美国CDC报告的废水中新冠病毒监测更新到2024年5月23日的数据【3】，美国废水新冠病毒浓度为1.35，而两周前仅为1.16。

这意味着美国新冠疫情持续缓解的情况终止，但目前流行度很低。

1. 中和抗体逃逸：
• SLip和KP.2（特别是FLiRT）相较于母体变种JN.1，表现出对COVID-19二价疫苗接种者血清和BA.2.86/JN.1波感染者血清的更高抵抗力。
• XBB.1.5单价疫苗接种的仓鼠血清对FLiRT和KP.2有较强的中和作用，但对SLip的效率较低。

2. 感染力和膜融合：
• SLip的感染力和膜融合活性显著低于JN.1，这与其刺突蛋白处理效率降低有关。
• 结构模拟表明，SLip的L455S和F456L突变降低了局部疏水性，从而减弱了与ACE2的结合。FLiRT和KP.2的额外R346T突变则增强了受体结合区的构象支持，抵消了L455S和F456L的影响。

3. 刺突蛋白处理和表达：
• SLip、FLiRT和KP.2的刺突蛋白在细胞膜上的表达和处理效率均低于JN.1。
• 这些变种的膜融合和感染力较低，可能是由于突变影响了刺突蛋白的处理和表达。
4. 抗体中和和抗原性：
• FLiRT和KP.2对类III单克隆抗体S309的中和完全抵抗，SLip也表现出显著抵抗。
• 抗原图谱分析显示，在XBB.1.5单价疫苗接种组和BA.2.86/JN.1感染组中，这些变种与JN.1和其他变种有明显的抗原性差异。