m*b
2 楼
大儿子两岁半，中文说得还不错，但平时看的电视节目和DVD都是英文的，各位爸爸妈
妈有什么好的中文教育类的DVD推荐吗？
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j*n
3 楼
白羊座守护神-战神赫拉克勒斯
文//古易方
天生神力的赫拉克勒斯在１８岁时已成长为希腊最英俊、最强壮的男子汉。他的父
亲朱庇特将他召到天庭，让他自己选择人生道路。这时候在他面前出现了两位女神，一
位是雍荣华贵的幸福女神，另一位则是端庄矜持的美德女神。前者向赫拉克勒斯许诺取
之不尽的财富和安逸平静的生活，远离劳碌、痛苦和考验,一切收获和成果都是信手拈
来、坐享其成。而后者则许诺他会做出许多惊天动地的壮举，可以得到荣耀和尊重，但
是首先他要付出、为天庭和人类服务。没有劳动就没有收获，没有享之不尽的财富，只
有一份耕耘，一份收获。赫拉克勒斯听了以后，毫不犹豫地选择了后者，因为在对于勇
敢的他而言，生命的乐趣就在于挑战，在于不断地探索与征服。后来，赫拉克勒斯果然
成为了世上最勇敢的战士，他一生做了无数的义举，从未失败，成为了不折不扣的战神。
传说古代有个名叫阿耳克尤的不死巨人，只要他双脚落地，就永远不会被杀死。他危
害人间，到处抢劫杀戮，绝望中的人们就恳求赫拉克勒斯帮助他们除去这个祸害。于是
赫拉克勒斯就找到阿耳克尤并与他决一死战。在决斗当中，阿耳克尤被赫拉克勒斯打得
毫无还手之力，但是赫拉克勒斯每次将他打伤，伤口都会自动愈合。赫拉克勒斯心想：
也许是他皮糙肉厚，伤口不深不够致命吧。于是赫拉克勒斯拿出一把弓箭，使劲将箭射
进了阿耳克尤的心口。就在赫拉克勒斯以为大功告成的时候，奇怪的事情发生了：只见
阿耳克尤一倒地，又慢慢地复苏过来。这下赫拉克勒斯终于知道了不死的秘密，于是他
乘其不备之际从背后一把抱住他，让他双脚离地。离开大地的巨人阿耳克尤顿时失去了
力量，活活被扼死。赫拉克勒斯不但勇敢无畏，而且颇具智慧，在危机时刻屡屡能够想
到克敌制胜的方法。
文//古易方
天生神力的赫拉克勒斯在１８岁时已成长为希腊最英俊、最强壮的男子汉。他的父
亲朱庇特将他召到天庭，让他自己选择人生道路。这时候在他面前出现了两位女神，一
位是雍荣华贵的幸福女神，另一位则是端庄矜持的美德女神。前者向赫拉克勒斯许诺取
之不尽的财富和安逸平静的生活，远离劳碌、痛苦和考验,一切收获和成果都是信手拈
来、坐享其成。而后者则许诺他会做出许多惊天动地的壮举，可以得到荣耀和尊重，但
是首先他要付出、为天庭和人类服务。没有劳动就没有收获，没有享之不尽的财富，只
有一份耕耘，一份收获。赫拉克勒斯听了以后，毫不犹豫地选择了后者，因为在对于勇
敢的他而言，生命的乐趣就在于挑战，在于不断地探索与征服。后来，赫拉克勒斯果然
成为了世上最勇敢的战士，他一生做了无数的义举，从未失败，成为了不折不扣的战神。
传说古代有个名叫阿耳克尤的不死巨人，只要他双脚落地，就永远不会被杀死。他危
害人间，到处抢劫杀戮，绝望中的人们就恳求赫拉克勒斯帮助他们除去这个祸害。于是
赫拉克勒斯就找到阿耳克尤并与他决一死战。在决斗当中，阿耳克尤被赫拉克勒斯打得
毫无还手之力，但是赫拉克勒斯每次将他打伤，伤口都会自动愈合。赫拉克勒斯心想：
也许是他皮糙肉厚，伤口不深不够致命吧。于是赫拉克勒斯拿出一把弓箭，使劲将箭射
进了阿耳克尤的心口。就在赫拉克勒斯以为大功告成的时候，奇怪的事情发生了：只见
阿耳克尤一倒地，又慢慢地复苏过来。这下赫拉克勒斯终于知道了不死的秘密，于是他
乘其不备之际从背后一把抱住他，让他双脚离地。离开大地的巨人阿耳克尤顿时失去了
力量，活活被扼死。赫拉克勒斯不但勇敢无畏，而且颇具智慧，在危机时刻屡屡能够想
到克敌制胜的方法。
y*n
4 楼
南昌，江西巡抚衙门。
自从得知郑成功去世后，张朝的心思就活络了不少，认真分析了一下自己的形势后
，张朝发现自己还是东南督抚中最有优势的一个。景德镇握在张朝的手中，实行了统购
统销政策后，是一个稳定的出口创汇的财源，在很大程度上弥补了收入不如江南和湖广
的劣势。而且因为底盘小，江西的军费也比较低，受到邓名威胁的沿江地区也比较少，
因此这两年来攒了一点儿家当出来。
而且江西还有目标小的好处。江南是清廷异常重视的地区，如果东南不稳，蒋国柱
肯定是主要的目标；张长庚的地盘最大，又与九省相邻，也是在通邓这个泥潭中陷得最
深的一个。而张朝就不同了，既不是主要打击目标，周围恶邻也相对少，要是清廷决心
对东南来一次再征服的话，那江西肯定是次要对象，而且拉拢招降的可能性也很大。
唯一的麻烦就是高邮湖一仗，参与谋杀先皇的事情一旦败露，张朝就是招供了，清
廷也会算账，而且肯定是一家都要处死。虽然此事极为隐秘，而且知情人都是顶级人员
，不过万一蒋国柱、张长庚被逼急了，说不定也要不惜一切代价地捅出来。
“唉，当初怎么就参与到这件事里了呢？”现在张朝一想起此事就后悔不迭，他不
禁想到就算自己当初装聋作哑，说不定邓名也能把顺治弄死——高邮湖事变发动前，张
朝唯恐邓名不能成功，也不敢留气力，可结果邓名那么轻松地取胜，人都没有死几个，
让江西巡抚产生了当初还不如旁观的念头来。
张朝还记得邓名当面和董卫国提起过“康熙”这件事，东南督抚私下密信来往，都
认为朝中还隐藏着一只大老虎。而这个通邓的神秘人物至少是辅政大臣之一，张朝和董
卫国甚至认定了就是索尼，也只有这老家伙才有能力排除众议定下这个年号。这个暗示
让东南督抚谁也不敢向朝廷出卖同伴，因为揭发邻居通邓不但增加了高邮湖事件曝光的
可能，密告还很可能落入邓名的那个同谋手中——董卫国曾经私下给张朝分析过，他怀
疑高邮湖索尼也有份，很可能就是索尼撺掇顺治亲征的，为的就是把东南督抚逼入死角
，不得不和看上去忠厚老实的邓名合作犯上，以致没有退路的。要是真如董卫国所料的
话，即使张朝不参加，邓名胜算也是很大的——就算江西巡抚不交这个投名状，邓名多
半也不会在江西常驻，这就让张朝感到更不上算了。
“而且郑成功怎么壮年就去世了呢？”直到整个消息传来前，张朝还觉得自己的位
置安如泰山，清廷在南方沿海的兵力都被郑成功死死钉住；去年浙江又遭大败，被川军
拉回去了几十万人口；而李国英虽然竭力给自己涂脂抹粉，但督抚们都看得出来重庆那
边也不乐观，在朝廷兵力捉襟见肘的时候，对东南也只能优容。自从进入康熙年以来，
北京对江西的官吏任命是百依百顺，只要张朝还能把额定的赋税给北京运去，那北京就
绝口不提让他挪挪位置的事。
不过郑成功去世虽然是危险也是机遇，那就是增加了和邓名讨价还价的筹码。张朝
觉得失去郑成功声援的邓名，对东南督抚的底气会变得差一些，张朝的位置变得更重要
了，起码瓷器涨点价是水到渠成的事了。
因此，那个成都发展银行的人到南昌来推销战争公债，对满怀自信和憧憬的张朝无
异于当头一棒。失去郑成功的声援的邓名不但没有服软，反倒更加强硬了。正琢磨着上
调瓷器价格的张朝怎么能咽得下这口气？还不用说来推销公债的只是个连功名都没有贱
民——同秀才这种功名张朝是不承认的；这个贱民甚至不是邓名委任的官员，就敢咆哮
公堂，还口口声声威胁张朝说：“叫川西大兵来打你！”
气急败坏的张朝差点当场把这个不懂上下尊卑的狂徒打死，好在他为官多年，养气
工夫已经十分了得了，最后只是下令把这个狂徒先关进大牢，他带来的五千万债券也都
查没入官——老成谋国的张朝没敢当场下令给烧了——不是说诸葛一生唯谨慎么？
成都发展银行的银行家被官兵拖走的时候，还暴跳如雷地向张朝翻来覆去地大喊：
“叫川西大兵来打你！叫川西大兵来打你！”
张朝不用说被气得七窍生烟，手一个劲地哆嗦。当初他找邓名托妻献子的时候，邓
名都没有对他这样大声嚷过。在恢复常态后，张朝嘱咐了左右一句，这个银行家和他随
从们住的牢房一定要打扫干净，一天三顿饭不可少。
过了两天，张朝又派人去打听了囚犯的动静，听说那个死贼囚每天不停地要水喝，
喝完了就扯着脖子喊：“叫川西大兵来打你！”
沉吟了一会儿后，张朝命令把这几个贼囚都从牢房里提出来，软禁到一间戒备森严
的小院子里去，还找了两个高僧陪他们下棋解闷，顺便给银行家讲讲佛法，消除他那一
身的戾气。
差不多就在这个时候，又跑来一个什么叙州建设银行的人推销公债。这次张朝的策
略就巧妙了不少，他把没收的债券拿出来给新来的人看，称南昌的银子都买了这个了。
这招还不错，来人一见就气馁了，检查了一下数量，发现有五千万之多后，叙州建设银
行的人还嘟哝着什么：“一点余额都没给我留啊。”
心中奇怪的张朝就请这个叙州人吃饭，从他嘴里套出来不少情报，好像在他们代售
公债的时候，四川银行的熊行长还给他们发了配额表，给下游各个府县都定了上限，让
他们不要超过配额，否则要罚款。
如此这般地送走了后来的几位银行家后，张朝紧锣密鼓地和其他东南督抚联系，在
私信中，张朝表示他认为应该团结起来对付邓名，如果邓名要来硬的，那就给他也安排
一场高邮湖，让他知道东南督抚同盟可不是好惹的。
蒋国柱在回信里大声叫好，说南京是武昌和南昌的坚强后盾，无论是北京还是成都
，谁敢来挑衅东南同盟就让谁铩羽而归，顺治就是他们的前车之鉴——当然这话蒋国柱
只敢在不留印章的信里说。
张长庚也表示，武昌同样遇到川西来的大明战争国债推销员了。从岳州开始，湖广
对这种变本加厉的勒索就断然拒绝。他希望两江能够支援他一些粮草，并把剿邓总理衙
门的余额先都拨给他，让他能够招募勇士，替东南同盟把邓名这个红眼强盗挡在武昌以
西。
湖广总督的话很动听，不过张朝对此将信将疑，而且看起来蒋国柱也不太相信资深
的通邓专家张长庚能够舍己为人，用自己的老本去拼战无不胜的邓名。最后两江犹犹豫
豫地拨给了张长庚二十万两银子，打算看看成果再说。
前天传来了好消息，张长庚宣称他陈师岳州，和邓名进行了有理、有据、有节的谈
判，在严阵以待的湖广官兵面前，不可一世的邓名也畏缩了，现在两军正在对峙中。张
长庚要两江火速行文给剿邓总理衙门，同意周培公把今年的财政结余都拨给武昌，好让
武昌能够集结更多的兵马去拦截邓名。
信上写的每一个字都是张朝愿意相信的，他估计张长庚肯定会被邓名揍个半死，要
是不服软的话武昌也休想保住。不过邓名痛打完张长庚肯定累坏了，好歹张长庚也是一
方总督呢。这样张朝和邓名谈瓷器涨价的底气就更足了，至于那个公债更是一点儿也不
会买。当然，张朝会把软禁的那个银行家放回去，继续保持和邓名的良好关系——据派
去讲解佛法的高僧说，那个银行家的脾气非常暴躁，下棋的时候吃了僧人的马就眉开眼
笑，可是他的车被吃了就掀棋盘，还指着高僧的鼻子大叫：“叫川西大兵来打你！”
张朝出于谨慎，并没有无条件地相信湖广总督，也没有立刻轰走那个银行家。这两
天武昌的使者每天能来两、三拨，翻来覆去就是要张朝赶快拨给协饷。最近一个来的使
者声泪俱下，说再不给钱，湖广总督就不能维持招募来的二十万雄师了。
经不住使者的苦苦哀求，张朝开始犹豫，是不是同意把剿邓总理衙门里江西的那份
钱先拨给湖广呢？
突然有一个使者跌跌撞撞地闯进来：“大人，大人，截住了，截住了！”
张朝在河南巡抚衙门部署了自己的眼线，这段时间来他们一直按照张朝的吩咐，睁
大眼睛盯着从湖广来的公函。
这个使者把偷偷抄来的公函递上来的时候，还由衷地赞叹道：“巡抚大人真是神算
啊，张总督果然没有按照惯常的路线送奏章，而是走河南送奏报。”
张朝站起身，匆匆走下座位迎上前去，从使者手里抢过了备忘录看起来，才看了两
眼就拍案大骂：“张长庚，老子就知道你人面兽心！”
湖广总督的急奏里说：邓名帅十万大军再次东征入寇，夔东巨寇李来亨、刘体纯也
都跟着来了，甚至连一贯龟缩的王光兴、党守素，游弋于汉水流域的郝摇旗、贺珍也都
出动了，就算本人没来也都派出了大将、子侄。十余万川寇、闯贼围攻岳州数日，岳州
知府督促满城军民誓死抵抗，击毙闯贼多员大将，城下尸体枕籍，最后邓名不得不撤围
转向武昌；而武昌在张长庚的领导下固若金汤。无机可乘的邓名、李来亨、刘体纯等人
于四月六日顺流而下，向江西去了。张长庚报告朝廷他已经警告了江西，现在水路不通
，所以转从河南送这份急报。
“这厮什么时候警告老子了？”张朝忙掰着指头算时间：“四月六日……快去九江
报警，让董布政使小心，邓名马上就要到他那儿了！”
自从得知郑成功去世后，张朝的心思就活络了不少，认真分析了一下自己的形势后
，张朝发现自己还是东南督抚中最有优势的一个。景德镇握在张朝的手中，实行了统购
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张朝在河南巡抚衙门部署了自己的眼线，这段时间来他们一直按照张朝的吩咐，睁
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w*e
5 楼
I'm not familiar with protein mass spec,I'd appreciate some help for a
question.
The protein samples was digested by trypsin, which cuts after K and R. But
why some peptide fragments follow amino acids other than K and R in the
result file? and the same fragment appears more then once. are those
fragments real?
Thanks a lot!
question.
The protein samples was digested by trypsin, which cuts after K and R. But
why some peptide fragments follow amino acids other than K and R in the
result file? and the same fragment appears more then once. are those
fragments real?
Thanks a lot!
C*n
6 楼
怎么这个时候新生才入学？哎。你去Local branch找大哥哥大姐姐问吧
p*i
7 楼
推荐看中文的托马斯。。。。。。。
【在 m******b 的大作中提到】
: 大儿子两岁半，中文说得还不错，但平时看的电视节目和DVD都是英文的，各位爸爸妈
: 妈有什么好的中文教育类的DVD推荐吗？
【在 m******b 的大作中提到】
: 大儿子两岁半，中文说得还不错，但平时看的电视节目和DVD都是英文的，各位爸爸妈
: 妈有什么好的中文教育类的DVD推荐吗？
wy
8 楼
叫川西大兵来打你！叫川西大兵来打你！
【在 y*****n 的大作中提到】
: 南昌，江西巡抚衙门。
: 自从得知郑成功去世后，张朝的心思就活络了不少，认真分析了一下自己的形势后
: ，张朝发现自己还是东南督抚中最有优势的一个。景德镇握在张朝的手中，实行了统购
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: 因此这两年来攒了一点儿家当出来。
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【在 y*****n 的大作中提到】
: 南昌，江西巡抚衙门。
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o*4
9 楼
之后蛋白片段好像还是要被电子束什么的再打碎一次，所以测序不一定是peptide的第
一个氨基酸开始的
【在 w********e 的大作中提到】
: I'm not familiar with protein mass spec,I'd appreciate some help for a
: question.
: The protein samples was digested by trypsin, which cuts after K and R. But
: why some peptide fragments follow amino acids other than K and R in the
: result file? and the same fragment appears more then once. are those
: fragments real?
: Thanks a lot!
一个氨基酸开始的
【在 w********e 的大作中提到】
: I'm not familiar with protein mass spec,I'd appreciate some help for a
: question.
: The protein samples was digested by trypsin, which cuts after K and R. But
: why some peptide fragments follow amino acids other than K and R in the
: result file? and the same fragment appears more then once. are those
: fragments real?
: Thanks a lot!
s*u
10 楼
哪里可以买到中文的托马斯啊？
h*k
11 楼
张朝这下要被剥夺购买债卷的权利了
【在 wy 的大作中提到】
: 叫川西大兵来打你！叫川西大兵来打你！
【在 wy 的大作中提到】
: 叫川西大兵来打你！叫川西大兵来打你！
w*e
12 楼
thanks for the information! so do you mean that those fragments are as real
as the fragments following K and R?
Thanks!
【在 o**4 的大作中提到】
: 之后蛋白片段好像还是要被电子束什么的再打碎一次，所以测序不一定是peptide的第
: 一个氨基酸开始的
as the fragments following K and R?
Thanks!
【在 o**4 的大作中提到】
: 之后蛋白片段好像还是要被电子束什么的再打碎一次，所以测序不一定是peptide的第
: 一个氨基酸开始的
p*1
13 楼
巧虎
中文的dora
中文的天线宝宝
喜羊羊
下载
【在 s****u 的大作中提到】
: 哪里可以买到中文的托马斯啊？
中文的dora
中文的天线宝宝
喜羊羊
下载
【在 s****u 的大作中提到】
: 哪里可以买到中文的托马斯啊？
b*s
14 楼
会让他买更多的
【在 h**k 的大作中提到】
: 张朝这下要被剥夺购买债卷的权利了
【在 h**k 的大作中提到】
: 张朝这下要被剥夺购买债卷的权利了
o*4
15 楼
我觉得是，
real
【在 w********e 的大作中提到】
: thanks for the information! so do you mean that those fragments are as real
: as the fragments following K and R?
: Thanks!
real
【在 w********e 的大作中提到】
: thanks for the information! so do you mean that those fragments are as real
: as the fragments following K and R?
: Thanks!
p*i
16 楼
我都是网上看的
pps
【在 s****u 的大作中提到】
: 哪里可以买到中文的托马斯啊？
pps
【在 s****u 的大作中提到】
: 哪里可以买到中文的托马斯啊？
s*t
17 楼
正解
不过edit一下，我觉得应该是张朝自己哭着喊着要买更多
【在 b*******s 的大作中提到】
: 会让他买更多的
不过edit一下，我觉得应该是张朝自己哭着喊着要买更多
【在 b*******s 的大作中提到】
: 会让他买更多的
l*n
18 楼
那些peptide是non-specific cleavage引起的，这个很常见，能占到快20%，搜索的时
候一般都会包括这些partial cleavage的peptides。peptide的两端里有一端是non-
specific cleavage问题不大。可信不可信主要看score， 和重复出现的次数没什么关
系。
【在 w********e 的大作中提到】
: I'm not familiar with protein mass spec,I'd appreciate some help for a
: question.
: The protein samples was digested by trypsin, which cuts after K and R. But
: why some peptide fragments follow amino acids other than K and R in the
: result file? and the same fragment appears more then once. are those
: fragments real?
: Thanks a lot!
候一般都会包括这些partial cleavage的peptides。peptide的两端里有一端是non-
specific cleavage问题不大。可信不可信主要看score， 和重复出现的次数没什么关
系。
【在 w********e 的大作中提到】
: I'm not familiar with protein mass spec,I'd appreciate some help for a
: question.
: The protein samples was digested by trypsin, which cuts after K and R. But
: why some peptide fragments follow amino acids other than K and R in the
: result file? and the same fragment appears more then once. are those
: fragments real?
: Thanks a lot!
w*e
19 楼
how do those non-specific cleavage happen? are they also cut by trypsin?
Thanks!
【在 l****n 的大作中提到】
: 那些peptide是non-specific cleavage引起的，这个很常见，能占到快20%，搜索的时
: 候一般都会包括这些partial cleavage的peptides。peptide的两端里有一端是non-
: specific cleavage问题不大。可信不可信主要看score， 和重复出现的次数没什么关
: 系。
Thanks!
【在 l****n 的大作中提到】
: 那些peptide是non-specific cleavage引起的，这个很常见，能占到快20%，搜索的时
: 候一般都会包括这些partial cleavage的peptides。peptide的两端里有一端是non-
: specific cleavage问题不大。可信不可信主要看score， 和重复出现的次数没什么关
: 系。
l*n
20 楼
是来自trypsin。这些酶的特异性都一般，经常认错切割位点，在不该切的地方切一刀
。其他常用的酶（chymotrypsin, GluC, ...）也一样。
【在 w********e 的大作中提到】
: how do those non-specific cleavage happen? are they also cut by trypsin?
: Thanks!
。其他常用的酶（chymotrypsin, GluC, ...）也一样。
【在 w********e 的大作中提到】
: how do those non-specific cleavage happen? are they also cut by trypsin?
: Thanks!
w*e
21 楼
Thanks a lot! so seems the mass spec software knows that it can search for
fragments following amino acids that are not K and R.
usually what peptide score is trustable?
【在 l****n 的大作中提到】
: 是来自trypsin。这些酶的特异性都一般，经常认错切割位点，在不该切的地方切一刀
: 。其他常用的酶（chymotrypsin, GluC, ...）也一样。
fragments following amino acids that are not K and R.
usually what peptide score is trustable?
【在 l****n 的大作中提到】
: 是来自trypsin。这些酶的特异性都一般，经常认错切割位点，在不该切的地方切一刀
: 。其他常用的酶（chymotrypsin, GluC, ...）也一样。
fe
22 楼
一般expect要0.05以下，ion score在75以上才是保险的吧，低于这个分数的不一定就
不是正确序
列，可以手工确认一下。另外还要看parent ion的delta value是不是在所用mass
analyzer的合
理误差范围内
for
【在 w********e 的大作中提到】
: Thanks a lot! so seems the mass spec software knows that it can search for
: fragments following amino acids that are not K and R.
: usually what peptide score is trustable?
不是正确序
列，可以手工确认一下。另外还要看parent ion的delta value是不是在所用mass
analyzer的合
理误差范围内
for
【在 w********e 的大作中提到】
: Thanks a lot! so seems the mass spec software knows that it can search for
: fragments following amino acids that are not K and R.
: usually what peptide score is trustable?
l*n
23 楼
看你用什么software了。Sequest 一般用Xcorr1.8，2.5, 3.5, deltaCN 0.08; X!
tandem 用E-value < 0.01, mascot用ion-identity>0 。在这些score以上的就非常可
信。
有的版本的软件也会直接告诉你比如95% confidence，也就是20个里面错1个。
基本上根据score判断的对错都是个统计学上的概念。一般说结果的时候都会提一下可
信度，比如"at 1% false discovery rate, 200 peptides/proteins are identified"。
【在 w********e 的大作中提到】
: Thanks a lot! so seems the mass spec software knows that it can search for
: fragments following amino acids that are not K and R.
: usually what peptide score is trustable?
tandem 用E-value < 0.01, mascot用ion-identity>0 。在这些score以上的就非常可
信。
有的版本的软件也会直接告诉你比如95% confidence，也就是20个里面错1个。
基本上根据score判断的对错都是个统计学上的概念。一般说结果的时候都会提一下可
信度，比如"at 1% false discovery rate, 200 peptides/proteins are identified"。
【在 w********e 的大作中提到】
: Thanks a lot! so seems the mass spec software knows that it can search for
: fragments following amino acids that are not K and R.
: usually what peptide score is trustable?
K*S
24 楼
trypsin cuts K/R EXCEPT KP/RP and when there are acidic amino acids around
like E, you will expect miss cleavage. And trypsin usually have 1-2 miss
cleave depending on individual protocol. (You will have to try it on some
standard proteins to find out the usual miss cleavage rate)
It's normal that same peptide appears more than once (assuming from LC-
MS/MS data) because there are a lot of data points during peptide elution
time. Some instrument setting can eliminate it to a certain level. But for
high abundant and easy-to-fly peptides, you will see them multiple times.
But
【在 w********e 的大作中提到】
: I'm not familiar with protein mass spec,I'd appreciate some help for a
: question.
: The protein samples was digested by trypsin, which cuts after K and R. But
: why some peptide fragments follow amino acids other than K and R in the
: result file? and the same fragment appears more then once. are those
: fragments real?
: Thanks a lot!
like E, you will expect miss cleavage. And trypsin usually have 1-2 miss
cleave depending on individual protocol. (You will have to try it on some
standard proteins to find out the usual miss cleavage rate)
It's normal that same peptide appears more than once (assuming from LC-
MS/MS data) because there are a lot of data points during peptide elution
time. Some instrument setting can eliminate it to a certain level. But for
high abundant and easy-to-fly peptides, you will see them multiple times.
But
【在 w********e 的大作中提到】
: I'm not familiar with protein mass spec,I'd appreciate some help for a
: question.
: The protein samples was digested by trypsin, which cuts after K and R. But
: why some peptide fragments follow amino acids other than K and R in the
: result file? and the same fragment appears more then once. are those
: fragments real?
: Thanks a lot!
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