b*7
2 楼
s*t
3 楼
用了一年多一直没问题。最近不知道怎么回事电池掉电非常厉害，刚刚充满电维持不到
两小时就没电了完全没法用。请问是不是电池坏了？需要去apple store换一块新电池
吗？谢谢
两小时就没电了完全没法用。请问是不是电池坏了？需要去apple store换一块新电池
吗？谢谢
u*1
4 楼
坦白说对genomics/sequencing技术还是很有兴趣的。也喜欢交叉科学。而且sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，bioinformatician好像都是在跑别人写好的program。做alignment就是BWA/bowtie；然后call SNP就是GATK/samtools啥的。也就是自学一点bash code来做一些很平常的处理；然后大规模的fastq就写一点简单的python来pre-processing
一点成就感都没有。或者说一点技术含量都没有。感觉人家CS的，学到了技术，学到了那就是自己的；以后用的到。而我们这种随便run个人家写好的program，感觉是个人就可以学会。
另外，我在的这个一般的medical school都没有CS course。我都是自学，觉得很野鸡，一点都不科班。这个破烂bioinformatics program也很一般，很小很新，都没什么人。各位在综合性大学bioinformaticics phd program的，你们都有上很正规的CS的course么？还是说CS这个东西，就是自己瞎捣弄就ok了？
所以有点想：
1.我还是很喜欢bioinformatics的。但觉得目前的状况下没什么training，都是自己摸索。所以想转到一个established的更好的bioinformatics program；但这不就把目前的老板给得罪了么
2.干脆直接转到cs的master算了。自己摸索了一年的bioinfor，对coding什么的好歹也有个大概的概念。但cs master，自己又没钱；而且担心身份出问题
大家来说说看法吧。谢谢
一点成就感都没有。或者说一点技术含量都没有。感觉人家CS的，学到了技术，学到了那就是自己的；以后用的到。而我们这种随便run个人家写好的program，感觉是个人就可以学会。
另外，我在的这个一般的medical school都没有CS course。我都是自学，觉得很野鸡，一点都不科班。这个破烂bioinformatics program也很一般，很小很新，都没什么人。各位在综合性大学bioinformaticics phd program的，你们都有上很正规的CS的course么？还是说CS这个东西，就是自己瞎捣弄就ok了？
所以有点想：
1.我还是很喜欢bioinformatics的。但觉得目前的状况下没什么training，都是自己摸索。所以想转到一个established的更好的bioinformatics program；但这不就把目前的老板给得罪了么
2.干脆直接转到cs的master算了。自己摸索了一年的bioinfor，对coding什么的好歹也有个大概的概念。但cs master，自己又没钱；而且担心身份出问题
大家来说说看法吧。谢谢
s*g
5 楼
有可能
建议给客服发个message
建议给客服发个message
c*o
6 楼
这张太old了。
【在 b***7 的大作中提到】
【在 b***7 的大作中提到】
h*e
7 楼
我11年10月買的iPhone 4S也是最近出現電池嚴重掉電問題。
原來每天一充毫無壓力，最近幾個星期以來，差不多要一天充個兩次才能維持。原來一
夜掉電5%，現在有20%甚至以上。
我本來以為是我這幾個月用iPhone當GPS用，過熱導致電池損壞。但如果普遍近期出現
電池問題，或許與iOS近期的升級有關？不過我LD的iPhone 4S也升級到了iOS6.1.3，她
就沒出現電池問題。
原來每天一充毫無壓力，最近幾個星期以來，差不多要一天充個兩次才能維持。原來一
夜掉電5%，現在有20%甚至以上。
我本來以為是我這幾個月用iPhone當GPS用，過熱導致電池損壞。但如果普遍近期出現
電池問題，或許與iOS近期的升級有關？不過我LD的iPhone 4S也升級到了iOS6.1.3，她
就沒出現電池問題。
d*r
8 楼
问题问得很好，可以转给SarahtheFool批阅。。
我的感觉是，这个主要看你的老板是bio background还是CS background的，你跟什么
背景的老板就学到什么东西，bio背景的老板用工具多一些，CS背景的老板主要自己
develop工具和算法。
Sarah以前实验室的工具都是自己C++写的。她好像也没有take什么课，就自己学，但是
他们学校的资源太强大了。应该是整个领域这方面最强的。
sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本
科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，
bioinformatician好像都是在跑别人写好的program。做alignment就是BWA/bowtie；然
后call SNP就是GATK/samtools啥的。也就是自学一点bash code来做一些很平常的处理
；然后大规模的fastq就写一点简单的python来pre-processing
了那就是自己的；以后用的到。而我们这种随便run个人家写好的program，感觉是个人
就可以学会。
鸡，一点都不科班。这个破烂bioinformatics program也很一般，很小很新，都没什么
人。各位在综合性大学bioinformaticics phd program的，你们都有上很正规的CS的
course么？还是说CS这个东西，就是自己瞎捣弄就ok了？
摸索。所以想转到一个established的更好的bioinformatics program；但这不就把目
前的老板给得罪了么
也有个大概的概念。但cs master，自己又没钱；而且单身身份出问题
【在 u*********1 的大作中提到】
: 坦白说对genomics/sequencing技术还是很有兴趣的。也喜欢交叉科学。而且sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，bioinformatician好像都是在跑别人写好的program。做alignment就是BWA/bowtie；然后call SNP就是GATK/samtools啥的。也就是自学一点bash code来做一些很平常的处理；然后大规模的fastq就写一点简单的python来pre-processing
: 一点成就感都没有。或者说一点技术含量都没有。感觉人家CS的，学到了技术，学到了那就是自己的；以后用的到。而我们这种随便run个人家写好的program，感觉是个人就可以学会。
: 另外，我在的这个一般的medical school都没有CS course。我都是自学，觉得很野鸡，一点都不科班。这个破烂bioinformatics program也很一般，很小很新，都没什么人。各位在综合性大学bioinformaticics phd program的，你们都有上很正规的CS的course么？还是说CS这个东西，就是自己瞎捣弄就ok了？
: 所以有点想：
: 1.我还是很喜欢bioinformatics的。但觉得目前的状况下没什么training，都是自己摸索。所以想转到一个established的更好的bioinformatics program；但这不就把目前的老板给得罪了么
: 2.干脆直接转到cs的master算了。自己摸索了一年的bioinfor，对coding什么的好歹也有个大概的概念。但cs master，自己又没钱；而且担心身份出问题
: 大家来说说看法吧。谢谢
我的感觉是，这个主要看你的老板是bio background还是CS background的，你跟什么
背景的老板就学到什么东西，bio背景的老板用工具多一些，CS背景的老板主要自己
develop工具和算法。
Sarah以前实验室的工具都是自己C++写的。她好像也没有take什么课，就自己学，但是
他们学校的资源太强大了。应该是整个领域这方面最强的。
sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本
科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，
bioinformatician好像都是在跑别人写好的program。做alignment就是BWA/bowtie；然
后call SNP就是GATK/samtools啥的。也就是自学一点bash code来做一些很平常的处理
；然后大规模的fastq就写一点简单的python来pre-processing
了那就是自己的；以后用的到。而我们这种随便run个人家写好的program，感觉是个人
就可以学会。
鸡，一点都不科班。这个破烂bioinformatics program也很一般，很小很新，都没什么
人。各位在综合性大学bioinformaticics phd program的，你们都有上很正规的CS的
course么？还是说CS这个东西，就是自己瞎捣弄就ok了？
摸索。所以想转到一个established的更好的bioinformatics program；但这不就把目
前的老板给得罪了么
也有个大概的概念。但cs master，自己又没钱；而且单身身份出问题
【在 u*********1 的大作中提到】
: 坦白说对genomics/sequencing技术还是很有兴趣的。也喜欢交叉科学。而且sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，bioinformatician好像都是在跑别人写好的program。做alignment就是BWA/bowtie；然后call SNP就是GATK/samtools啥的。也就是自学一点bash code来做一些很平常的处理；然后大规模的fastq就写一点简单的python来pre-processing
: 一点成就感都没有。或者说一点技术含量都没有。感觉人家CS的，学到了技术，学到了那就是自己的；以后用的到。而我们这种随便run个人家写好的program，感觉是个人就可以学会。
: 另外，我在的这个一般的medical school都没有CS course。我都是自学，觉得很野鸡，一点都不科班。这个破烂bioinformatics program也很一般，很小很新，都没什么人。各位在综合性大学bioinformaticics phd program的，你们都有上很正规的CS的course么？还是说CS这个东西，就是自己瞎捣弄就ok了？
: 所以有点想：
: 1.我还是很喜欢bioinformatics的。但觉得目前的状况下没什么training，都是自己摸索。所以想转到一个established的更好的bioinformatics program；但这不就把目前的老板给得罪了么
: 2.干脆直接转到cs的master算了。自己摸索了一年的bioinfor，对coding什么的好歹也有个大概的概念。但cs master，自己又没钱；而且担心身份出问题
: 大家来说说看法吧。谢谢
g*n
9 楼
最迟下个statement会到账
f*r
10 楼
这冬瓜长得真好。
【在 b***7 的大作中提到】
【在 b***7 的大作中提到】
s*t
11 楼
升级后没出现这问题。 我电池掉电问题看起来比你的严重很多啊，根本没办法用。出
门50%电，不到一个小时就没电了，而且是在我没用的情况下。我跟你差不多时侯买的。
【在 h*******e 的大作中提到】
: 我11年10月買的iPhone 4S也是最近出現電池嚴重掉電問題。
: 原來每天一充毫無壓力，最近幾個星期以來，差不多要一天充個兩次才能維持。原來一
: 夜掉電5%，現在有20%甚至以上。
: 我本來以為是我這幾個月用iPhone當GPS用，過熱導致電池損壞。但如果普遍近期出現
: 電池問題，或許與iOS近期的升級有關？不過我LD的iPhone 4S也升級到了iOS6.1.3，她
: 就沒出現電池問題。
门50%电，不到一个小时就没电了，而且是在我没用的情况下。我跟你差不多时侯买的。
【在 h*******e 的大作中提到】
: 我11年10月買的iPhone 4S也是最近出現電池嚴重掉電問題。
: 原來每天一充毫無壓力，最近幾個星期以來，差不多要一天充個兩次才能維持。原來一
: 夜掉電5%，現在有20%甚至以上。
: 我本來以為是我這幾個月用iPhone當GPS用，過熱導致電池損壞。但如果普遍近期出現
: 電池問題，或許與iOS近期的升級有關？不過我LD的iPhone 4S也升級到了iOS6.1.3，她
: 就沒出現電池問題。
d*m
12 楼
数学物理背景才是关键，bioinformatics里编程的部分，说个实话，是个人都学的好。
l*r
13 楼
电池换不了吧， 要是突然这样，只有restore了。 慢慢的加app，看是不是app的问题。
【在 s**t 的大作中提到】
: 用了一年多一直没问题。最近不知道怎么回事电池掉电非常厉害，刚刚充满电维持不到
: 两小时就没电了完全没法用。请问是不是电池坏了？需要去apple store换一块新电池
: 吗？谢谢
【在 s**t 的大作中提到】
: 用了一年多一直没问题。最近不知道怎么回事电池掉电非常厉害，刚刚充满电维持不到
: 两小时就没电了完全没法用。请问是不是电池坏了？需要去apple store换一块新电池
: 吗？谢谢
u*1
14 楼
well，我两个老板。一个是疾病研究的大牛，就是有钱做很多whole-genome
sequencing的。当然他对sequencing/bioinfor一无所知
主要跟另外一个bioinformatics的老板。但他自己又不是专业出身的。自己是生物背景
的，然后又是医生。但稍微懂一点计算机。
所以可以说自己更像是做genomics study的，而不是bioinformatics；毕竟老板都不是
cs的。而且老板也是医生，压力不会像其他只搞学术的那么大。所以也很nice
加上自己是joint student；所以感觉都是自己弄。
【在 d*****r 的大作中提到】
: 问题问得很好，可以转给SarahtheFool批阅。。
: 我的感觉是，这个主要看你的老板是bio background还是CS background的，你跟什么
: 背景的老板就学到什么东西，bio背景的老板用工具多一些，CS背景的老板主要自己
: develop工具和算法。
: Sarah以前实验室的工具都是自己C++写的。她好像也没有take什么课，就自己学，但是
: 他们学校的资源太强大了。应该是整个领域这方面最强的。
:
: sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本
: 科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，
: bioinformatician好像都是在跑别人写好的program。做alignment就是BWA/bowtie；然
sequencing的。当然他对sequencing/bioinfor一无所知
主要跟另外一个bioinformatics的老板。但他自己又不是专业出身的。自己是生物背景
的，然后又是医生。但稍微懂一点计算机。
所以可以说自己更像是做genomics study的，而不是bioinformatics；毕竟老板都不是
cs的。而且老板也是医生，压力不会像其他只搞学术的那么大。所以也很nice
加上自己是joint student；所以感觉都是自己弄。
【在 d*****r 的大作中提到】
: 问题问得很好，可以转给SarahtheFool批阅。。
: 我的感觉是，这个主要看你的老板是bio background还是CS background的，你跟什么
: 背景的老板就学到什么东西，bio背景的老板用工具多一些，CS背景的老板主要自己
: develop工具和算法。
: Sarah以前实验室的工具都是自己C++写的。她好像也没有take什么课，就自己学，但是
: 他们学校的资源太强大了。应该是整个领域这方面最强的。
:
: sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本
: 科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，
: bioinformatician好像都是在跑别人写好的program。做alignment就是BWA/bowtie；然
r*y
15 楼
同是4s用户表示电池正常，虽不如新手机，但是一天一冲毫无压力。11年10月买的
u*1
16 楼
完全没数学物理背景
所以觉得我都不是bioinformatics的学生。只不过我比其他benchwork会用一点
software。人家benchwork做的是药剂药品的实验；我做的是人家写好的program的实验
【在 d********m 的大作中提到】
: 数学物理背景才是关键，bioinformatics里编程的部分，说个实话，是个人都学的好。
所以觉得我都不是bioinformatics的学生。只不过我比其他benchwork会用一点
software。人家benchwork做的是药剂药品的实验；我做的是人家写好的program的实验
【在 d********m 的大作中提到】
: 数学物理背景才是关键，bioinformatics里编程的部分，说个实话，是个人都学的好。
h*e
17 楼
我這兩天做了測試，把WIFI關掉，只用3G，電量下降速度絲毫不減。
把3G關掉，只用WIFI，就完全沒有問題。
我猜是iPHONE升級到iOS.6.1.3後，3G的管理出了問題，影響到部分用戶。
你的情況更嚴重，或許是電池本身的問題。
的。
【在 s**t 的大作中提到】
: 升级后没出现这问题。 我电池掉电问题看起来比你的严重很多啊，根本没办法用。出
: 门50%电，不到一个小时就没电了，而且是在我没用的情况下。我跟你差不多时侯买的。
把3G關掉，只用WIFI，就完全沒有問題。
我猜是iPHONE升級到iOS.6.1.3後，3G的管理出了問題，影響到部分用戶。
你的情況更嚴重，或許是電池本身的問題。
的。
【在 s**t 的大作中提到】
: 升级后没出现这问题。 我电池掉电问题看起来比你的严重很多啊，根本没办法用。出
: 门50%电，不到一个小时就没电了，而且是在我没用的情况下。我跟你差不多时侯买的。
G*y
18 楼
对我来说生物信息是工具不是问题。你现在要想明白的是你自己的兴趣到底在哪边，是
生物还是计算机。
如果你喜欢的是生物，你要找到你感兴趣的，可以用生物信息学方法解决的生物问题，
比如rare SNP对疾病的贡献。
如果你喜欢的是计算机或者算法，你可能要再上一些CS的课程。你的研究方向可以是如
何提高现有的算法，比如如何快速精确的进行whole genome de novo assembly。
这两个方向虽说都归在生物信息下面，但是用到的知识和研究的性质还是有很大区别的。
sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本
科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，
bioinformatician好像都是在跑别人写好的program。做alignment就是BWA/bowtie；然
后call SNP就是GATK/samtools啥的。也就是自学一点bash code来做一些很平常的处理
；然后大规模的fastq就写一点简单的python来pre-processing
了那就是自己的；以后用的到。而我们这种随便run个人家写好的program，感觉是个人
就可以学会。
鸡，一点都不科班。这个破烂bioinformatics program也很一般，很小很新，都没什么
人。各位在综合性大学bioinformaticics phd program的，你们都有上很正规的CS的
course么？还是说CS这个东西，就是自己瞎捣弄就ok了？
摸索。所以想转到一个established的更好的bioinformatics program；但这不就把目
前的老板给得罪了么
也有个大概的概念。但cs master，自己又没钱；而且单身身份出问题
【在 u*********1 的大作中提到】
: 坦白说对genomics/sequencing技术还是很有兴趣的。也喜欢交叉科学。而且sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，bioinformatician好像都是在跑别人写好的program。做alignment就是BWA/bowtie；然后call SNP就是GATK/samtools啥的。也就是自学一点bash code来做一些很平常的处理；然后大规模的fastq就写一点简单的python来pre-processing
: 一点成就感都没有。或者说一点技术含量都没有。感觉人家CS的，学到了技术，学到了那就是自己的；以后用的到。而我们这种随便run个人家写好的program，感觉是个人就可以学会。
: 另外，我在的这个一般的medical school都没有CS course。我都是自学，觉得很野鸡，一点都不科班。这个破烂bioinformatics program也很一般，很小很新，都没什么人。各位在综合性大学bioinformaticics phd program的，你们都有上很正规的CS的course么？还是说CS这个东西，就是自己瞎捣弄就ok了？
: 所以有点想：
: 1.我还是很喜欢bioinformatics的。但觉得目前的状况下没什么training，都是自己摸索。所以想转到一个established的更好的bioinformatics program；但这不就把目前的老板给得罪了么
: 2.干脆直接转到cs的master算了。自己摸索了一年的bioinfor，对coding什么的好歹也有个大概的概念。但cs master，自己又没钱；而且担心身份出问题
: 大家来说说看法吧。谢谢
生物还是计算机。
如果你喜欢的是生物，你要找到你感兴趣的，可以用生物信息学方法解决的生物问题，
比如rare SNP对疾病的贡献。
如果你喜欢的是计算机或者算法，你可能要再上一些CS的课程。你的研究方向可以是如
何提高现有的算法，比如如何快速精确的进行whole genome de novo assembly。
这两个方向虽说都归在生物信息下面，但是用到的知识和研究的性质还是有很大区别的。
sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本
科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，
bioinformatician好像都是在跑别人写好的program。做alignment就是BWA/bowtie；然
后call SNP就是GATK/samtools啥的。也就是自学一点bash code来做一些很平常的处理
；然后大规模的fastq就写一点简单的python来pre-processing
了那就是自己的；以后用的到。而我们这种随便run个人家写好的program，感觉是个人
就可以学会。
鸡，一点都不科班。这个破烂bioinformatics program也很一般，很小很新，都没什么
人。各位在综合性大学bioinformaticics phd program的，你们都有上很正规的CS的
course么？还是说CS这个东西，就是自己瞎捣弄就ok了？
摸索。所以想转到一个established的更好的bioinformatics program；但这不就把目
前的老板给得罪了么
也有个大概的概念。但cs master，自己又没钱；而且单身身份出问题
【在 u*********1 的大作中提到】
: 坦白说对genomics/sequencing技术还是很有兴趣的。也喜欢交叉科学。而且sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，bioinformatician好像都是在跑别人写好的program。做alignment就是BWA/bowtie；然后call SNP就是GATK/samtools啥的。也就是自学一点bash code来做一些很平常的处理；然后大规模的fastq就写一点简单的python来pre-processing
: 一点成就感都没有。或者说一点技术含量都没有。感觉人家CS的，学到了技术，学到了那就是自己的；以后用的到。而我们这种随便run个人家写好的program，感觉是个人就可以学会。
: 另外，我在的这个一般的medical school都没有CS course。我都是自学，觉得很野鸡，一点都不科班。这个破烂bioinformatics program也很一般，很小很新，都没什么人。各位在综合性大学bioinformaticics phd program的，你们都有上很正规的CS的course么？还是说CS这个东西，就是自己瞎捣弄就ok了？
: 所以有点想：
: 1.我还是很喜欢bioinformatics的。但觉得目前的状况下没什么training，都是自己摸索。所以想转到一个established的更好的bioinformatics program；但这不就把目前的老板给得罪了么
: 2.干脆直接转到cs的master算了。自己摸索了一年的bioinfor，对coding什么的好歹也有个大概的概念。但cs master，自己又没钱；而且担心身份出问题
: 大家来说说看法吧。谢谢
s*t
19 楼
我检查了手机，没有升级ios，还是ios5。 不知道是哪里出了问题。
【在 h*******e 的大作中提到】
: 我這兩天做了測試，把WIFI關掉，只用3G，電量下降速度絲毫不減。
: 把3G關掉，只用WIFI，就完全沒有問題。
: 我猜是iPHONE升級到iOS.6.1.3後，3G的管理出了問題，影響到部分用戶。
: 你的情況更嚴重，或許是電池本身的問題。
:
: 的。
【在 h*******e 的大作中提到】
: 我這兩天做了測試，把WIFI關掉，只用3G，電量下降速度絲毫不減。
: 把3G關掉，只用WIFI，就完全沒有問題。
: 我猜是iPHONE升級到iOS.6.1.3後，3G的管理出了問題，影響到部分用戶。
: 你的情況更嚴重，或許是電池本身的問題。
:
: 的。
d*m
20 楼
理解你啊哥们，以前在国内读硕士的时候，老板做的是microarray，我就整天埋头用软
件拼序列，美其名曰攻读生物信息学。
这种狗屁东西，做起来简直是郁闷到了极点，更郁闷的是，本科学的一大堆数学都生疏
了，完全没有用武之地。这辈子算是被这个狗屁行业狠狠坑了一次爹。
到了米国，找了个完全是benchwork的实验室做phd，估计我也是那种极少见的物理转纯benchwork的同志之一了。
纯发泄回帖
【在 u*********1 的大作中提到】
: 完全没数学物理背景
: 所以觉得我都不是bioinformatics的学生。只不过我比其他benchwork会用一点
: software。人家benchwork做的是药剂药品的实验；我做的是人家写好的program的实验
件拼序列，美其名曰攻读生物信息学。
这种狗屁东西，做起来简直是郁闷到了极点，更郁闷的是，本科学的一大堆数学都生疏
了，完全没有用武之地。这辈子算是被这个狗屁行业狠狠坑了一次爹。
到了米国，找了个完全是benchwork的实验室做phd，估计我也是那种极少见的物理转纯benchwork的同志之一了。
纯发泄回帖
【在 u*********1 的大作中提到】
: 完全没数学物理背景
: 所以觉得我都不是bioinformatics的学生。只不过我比其他benchwork会用一点
: software。人家benchwork做的是药剂药品的实验；我做的是人家写好的program的实验
u*d
21 楼
10有8九，电池坏了。
【在 s**t 的大作中提到】
: 我检查了手机，没有升级ios，还是ios5。 不知道是哪里出了问题。
【在 s**t 的大作中提到】
: 我检查了手机，没有升级ios，还是ios5。 不知道是哪里出了问题。
S*l
22 楼
没关系的。别郁闷了。其实本科毕业，要是学生自己没兴趣的话什么都做不了，不管是
bio还是CS的。自己闲下来的时候提高提高就可以了。
sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本
科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，
bioinformatician好像都是在跑别人写好的program。做alignment就是BWA/bowtie；然
后call SNP就是GATK/samtools啥的。也就是自学一点bash code来做一些很平常的处理
；然后大规模的fastq就写一点简单的python来pre-processing
了那就是自己的；以后用的到。而我们这种随便run个人家写好的program，感觉是个人
就可以学会。
鸡，一点都不科班。这个破烂bioinformatics program也很一般，很小很新，都没什么
人。各位在综合性大学bioinformaticics phd program的，你们都有上很正规的CS的
course么？还是说CS这个东西，就是自己瞎捣弄就ok了？
摸索。所以想转到一个established的更好的bioinformatics program；但这不就把目
前的老板给得罪了么
也有个大概的概念。但cs master，自己又没钱；而且担心身份出问题
【在 u*********1 的大作中提到】
: 坦白说对genomics/sequencing技术还是很有兴趣的。也喜欢交叉科学。而且sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，bioinformatician好像都是在跑别人写好的program。做alignment就是BWA/bowtie；然后call SNP就是GATK/samtools啥的。也就是自学一点bash code来做一些很平常的处理；然后大规模的fastq就写一点简单的python来pre-processing
: 一点成就感都没有。或者说一点技术含量都没有。感觉人家CS的，学到了技术，学到了那就是自己的；以后用的到。而我们这种随便run个人家写好的program，感觉是个人就可以学会。
: 另外，我在的这个一般的medical school都没有CS course。我都是自学，觉得很野鸡，一点都不科班。这个破烂bioinformatics program也很一般，很小很新，都没什么人。各位在综合性大学bioinformaticics phd program的，你们都有上很正规的CS的course么？还是说CS这个东西，就是自己瞎捣弄就ok了？
: 所以有点想：
: 1.我还是很喜欢bioinformatics的。但觉得目前的状况下没什么training，都是自己摸索。所以想转到一个established的更好的bioinformatics program；但这不就把目前的老板给得罪了么
: 2.干脆直接转到cs的master算了。自己摸索了一年的bioinfor，对coding什么的好歹也有个大概的概念。但cs master，自己又没钱；而且担心身份出问题
: 大家来说说看法吧。谢谢
bio还是CS的。自己闲下来的时候提高提高就可以了。
sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本
科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，
bioinformatician好像都是在跑别人写好的program。做alignment就是BWA/bowtie；然
后call SNP就是GATK/samtools啥的。也就是自学一点bash code来做一些很平常的处理
；然后大规模的fastq就写一点简单的python来pre-processing
了那就是自己的；以后用的到。而我们这种随便run个人家写好的program，感觉是个人
就可以学会。
鸡，一点都不科班。这个破烂bioinformatics program也很一般，很小很新，都没什么
人。各位在综合性大学bioinformaticics phd program的，你们都有上很正规的CS的
course么？还是说CS这个东西，就是自己瞎捣弄就ok了？
摸索。所以想转到一个established的更好的bioinformatics program；但这不就把目
前的老板给得罪了么
也有个大概的概念。但cs master，自己又没钱；而且担心身份出问题
【在 u*********1 的大作中提到】
: 坦白说对genomics/sequencing技术还是很有兴趣的。也喜欢交叉科学。而且sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，bioinformatician好像都是在跑别人写好的program。做alignment就是BWA/bowtie；然后call SNP就是GATK/samtools啥的。也就是自学一点bash code来做一些很平常的处理；然后大规模的fastq就写一点简单的python来pre-processing
: 一点成就感都没有。或者说一点技术含量都没有。感觉人家CS的，学到了技术，学到了那就是自己的；以后用的到。而我们这种随便run个人家写好的program，感觉是个人就可以学会。
: 另外，我在的这个一般的medical school都没有CS course。我都是自学，觉得很野鸡，一点都不科班。这个破烂bioinformatics program也很一般，很小很新，都没什么人。各位在综合性大学bioinformaticics phd program的，你们都有上很正规的CS的course么？还是说CS这个东西，就是自己瞎捣弄就ok了？
: 所以有点想：
: 1.我还是很喜欢bioinformatics的。但觉得目前的状况下没什么training，都是自己摸索。所以想转到一个established的更好的bioinformatics program；但这不就把目前的老板给得罪了么
: 2.干脆直接转到cs的master算了。自己摸索了一年的bioinfor，对coding什么的好歹也有个大概的概念。但cs master，自己又没钱；而且担心身份出问题
: 大家来说说看法吧。谢谢
h*e
23 楼
UPDATE:
Backup to iCloud --- Reset: Erase All Content and Settings --- Restore from
iCloud
之後，電池問題基本解決了。看來確是 iOS 升級之後的Bug，Reset之後重新安裝可以
避免。
【在 h*******e 的大作中提到】
: 我這兩天做了測試，把WIFI關掉，只用3G，電量下降速度絲毫不減。
: 把3G關掉，只用WIFI，就完全沒有問題。
: 我猜是iPHONE升級到iOS.6.1.3後，3G的管理出了問題，影響到部分用戶。
: 你的情況更嚴重，或許是電池本身的問題。
:
: 的。
Backup to iCloud --- Reset: Erase All Content and Settings --- Restore from
iCloud
之後，電池問題基本解決了。看來確是 iOS 升級之後的Bug，Reset之後重新安裝可以
避免。
【在 h*******e 的大作中提到】
: 我這兩天做了測試，把WIFI關掉，只用3G，電量下降速度絲毫不減。
: 把3G關掉，只用WIFI，就完全沒有問題。
: 我猜是iPHONE升級到iOS.6.1.3後，3G的管理出了問題，影響到部分用戶。
: 你的情況更嚴重，或許是電池本身的問題。
:
: 的。
S*l
24 楼
是的。主要看你对什么感兴趣，毕业了想干啥，职业理想是什么。然后再选择学什么。
我一般上厕所的时候或者等appointment的时候，都是带一本algorithm或者machine
learning，这两个跟我们做的比较相关。
【在 G***y 的大作中提到】
: 对我来说生物信息是工具不是问题。你现在要想明白的是你自己的兴趣到底在哪边，是
: 生物还是计算机。
: 如果你喜欢的是生物，你要找到你感兴趣的，可以用生物信息学方法解决的生物问题，
: 比如rare SNP对疾病的贡献。
: 如果你喜欢的是计算机或者算法，你可能要再上一些CS的课程。你的研究方向可以是如
: 何提高现有的算法，比如如何快速精确的进行whole genome de novo assembly。
: 这两个方向虽说都归在生物信息下面，但是用到的知识和研究的性质还是有很大区别的。
:
: sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本
: 科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，
我一般上厕所的时候或者等appointment的时候，都是带一本algorithm或者machine
learning，这两个跟我们做的比较相关。
【在 G***y 的大作中提到】
: 对我来说生物信息是工具不是问题。你现在要想明白的是你自己的兴趣到底在哪边，是
: 生物还是计算机。
: 如果你喜欢的是生物，你要找到你感兴趣的，可以用生物信息学方法解决的生物问题，
: 比如rare SNP对疾病的贡献。
: 如果你喜欢的是计算机或者算法，你可能要再上一些CS的课程。你的研究方向可以是如
: 何提高现有的算法，比如如何快速精确的进行whole genome de novo assembly。
: 这两个方向虽说都归在生物信息下面，但是用到的知识和研究的性质还是有很大区别的。
:
: sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本
: 科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，
d*r
25 楼
嗯，你现在带学生有感而发？
【在 S**********l 的大作中提到】
: 没关系的。别郁闷了。其实本科毕业，要是学生自己没兴趣的话什么都做不了，不管是
: bio还是CS的。自己闲下来的时候提高提高就可以了。
:
: sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本
: 科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，
: bioinformatician好像都是在跑别人写好的program。做alignment就是BWA/bowtie；然
: 后call SNP就是GATK/samtools啥的。也就是自学一点bash code来做一些很平常的处理
: ；然后大规模的fastq就写一点简单的python来pre-processing
: 了那就是自己的；以后用的到。而我们这种随便run个人家写好的program，感觉是个人
: 就可以学会。
【在 S**********l 的大作中提到】
: 没关系的。别郁闷了。其实本科毕业，要是学生自己没兴趣的话什么都做不了，不管是
: bio还是CS的。自己闲下来的时候提高提高就可以了。
:
: sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本
: 科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，
: bioinformatician好像都是在跑别人写好的program。做alignment就是BWA/bowtie；然
: 后call SNP就是GATK/samtools啥的。也就是自学一点bash code来做一些很平常的处理
: ；然后大规模的fastq就写一点简单的python来pre-processing
: 了那就是自己的；以后用的到。而我们这种随便run个人家写好的program，感觉是个人
: 就可以学会。
d*r
26 楼
你们algo主要用哪一类算法？
graph的algo用得多吗？
【在 S**********l 的大作中提到】
: 是的。主要看你对什么感兴趣，毕业了想干啥，职业理想是什么。然后再选择学什么。
: 我一般上厕所的时候或者等appointment的时候，都是带一本algorithm或者machine
: learning，这两个跟我们做的比较相关。
graph的algo用得多吗？
【在 S**********l 的大作中提到】
: 是的。主要看你对什么感兴趣，毕业了想干啥，职业理想是什么。然后再选择学什么。
: 我一般上厕所的时候或者等appointment的时候，都是带一本algorithm或者machine
: learning，这两个跟我们做的比较相关。
S*l
27 楼
呵呵。我原来就发现了。
最近比较有感而发的还是中国的学生确实是好，特别实诚。我们面试的时候一般我们问
，是不是会XXX，90%的学生不会但是听说过，摸过的那种。我们国内的学生就是说那个
东西我不会，而别的学生有时会说会（程度不同）。然后我们再follow一个detail的问
题，一下就露馅。。。这一点确实我都觉得中国的学生还是好，至少诚实，真是不会吹
牛。
【在 d*****r 的大作中提到】
: 嗯，你现在带学生有感而发？
最近比较有感而发的还是中国的学生确实是好，特别实诚。我们面试的时候一般我们问
，是不是会XXX，90%的学生不会但是听说过，摸过的那种。我们国内的学生就是说那个
东西我不会，而别的学生有时会说会（程度不同）。然后我们再follow一个detail的问
题，一下就露馅。。。这一点确实我都觉得中国的学生还是好，至少诚实，真是不会吹
牛。
【在 d*****r 的大作中提到】
: 嗯，你现在带学生有感而发？
S*M
28 楼
能把别人的算法发扬光大了，也是不错的事情
sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本
科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，
bioinformatician好像都是在跑别人写好的program。做alignment就是BWA/bowtie；然
后call SNP就是GATK/samtools啥的。也就是自学一点bash code来做一些很平常的处理
；然后大规模的fastq就写一点简单的python来pre-processing
了那就是自己的；以后用的到。而我们这种随便run个人家写好的program，感觉是个人
就可以学会。
鸡，一点都不科班。这个破烂bioinformatics program也很一般，很小很新，都没什么
人。各位在综合性大学bioinformaticics phd program的，你们都有上很正规的CS的
course么？还是说CS这个东西，就是自己瞎捣弄就ok了？
摸索。所以想转到一个established的更好的bioinformatics program；但这不就把目
前的老板给得罪了么
也有个大概的概念。但cs master，自己又没钱；而且担心身份出问题
【在 u*********1 的大作中提到】
: 坦白说对genomics/sequencing技术还是很有兴趣的。也喜欢交叉科学。而且sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，bioinformatician好像都是在跑别人写好的program。做alignment就是BWA/bowtie；然后call SNP就是GATK/samtools啥的。也就是自学一点bash code来做一些很平常的处理；然后大规模的fastq就写一点简单的python来pre-processing
: 一点成就感都没有。或者说一点技术含量都没有。感觉人家CS的，学到了技术，学到了那就是自己的；以后用的到。而我们这种随便run个人家写好的program，感觉是个人就可以学会。
: 另外，我在的这个一般的medical school都没有CS course。我都是自学，觉得很野鸡，一点都不科班。这个破烂bioinformatics program也很一般，很小很新，都没什么人。各位在综合性大学bioinformaticics phd program的，你们都有上很正规的CS的course么？还是说CS这个东西，就是自己瞎捣弄就ok了？
: 所以有点想：
: 1.我还是很喜欢bioinformatics的。但觉得目前的状况下没什么training，都是自己摸索。所以想转到一个established的更好的bioinformatics program；但这不就把目前的老板给得罪了么
: 2.干脆直接转到cs的master算了。自己摸索了一年的bioinfor，对coding什么的好歹也有个大概的概念。但cs master，自己又没钱；而且担心身份出问题
: 大家来说说看法吧。谢谢
sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本
科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，
bioinformatician好像都是在跑别人写好的program。做alignment就是BWA/bowtie；然
后call SNP就是GATK/samtools啥的。也就是自学一点bash code来做一些很平常的处理
；然后大规模的fastq就写一点简单的python来pre-processing
了那就是自己的；以后用的到。而我们这种随便run个人家写好的program，感觉是个人
就可以学会。
鸡，一点都不科班。这个破烂bioinformatics program也很一般，很小很新，都没什么
人。各位在综合性大学bioinformaticics phd program的，你们都有上很正规的CS的
course么？还是说CS这个东西，就是自己瞎捣弄就ok了？
摸索。所以想转到一个established的更好的bioinformatics program；但这不就把目
前的老板给得罪了么
也有个大概的概念。但cs master，自己又没钱；而且担心身份出问题
【在 u*********1 的大作中提到】
: 坦白说对genomics/sequencing技术还是很有兴趣的。也喜欢交叉科学。而且sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，bioinformatician好像都是在跑别人写好的program。做alignment就是BWA/bowtie；然后call SNP就是GATK/samtools啥的。也就是自学一点bash code来做一些很平常的处理；然后大规模的fastq就写一点简单的python来pre-processing
: 一点成就感都没有。或者说一点技术含量都没有。感觉人家CS的，学到了技术，学到了那就是自己的；以后用的到。而我们这种随便run个人家写好的program，感觉是个人就可以学会。
: 另外，我在的这个一般的medical school都没有CS course。我都是自学，觉得很野鸡，一点都不科班。这个破烂bioinformatics program也很一般，很小很新，都没什么人。各位在综合性大学bioinformaticics phd program的，你们都有上很正规的CS的course么？还是说CS这个东西，就是自己瞎捣弄就ok了？
: 所以有点想：
: 1.我还是很喜欢bioinformatics的。但觉得目前的状况下没什么training，都是自己摸索。所以想转到一个established的更好的bioinformatics program；但这不就把目前的老板给得罪了么
: 2.干脆直接转到cs的master算了。自己摸索了一年的bioinfor，对coding什么的好歹也有个大概的概念。但cs master，自己又没钱；而且担心身份出问题
: 大家来说说看法吧。谢谢
w*y
29 楼
可以去修math/stat的课程
sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本
科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，
bioinformatician好像都是在跑别人写好br />
都没有。感觉人家CS的，学到了技术，学到了那就是自己的；以后用的到。而我们这种
随便run个人家写好的program，感觉是个人就可以学会。
鸡，一点都不科班。这个破烂bioinformatics program也很一般，很小很新，都没什么
人。各位在综合性大学bioinformaticics phd program的，你们都有上很正规的CS的
course么？还是说CS这个东西br />
摸索。所以想转到一个established的更好的bioinformatics program；但这不就把目
前的老板给得罪了么
也有个大概的概念。但cs master，自己又没钱；而且担心身份出问题
【在 u*********1 的大作中提到】
: 坦白说对genomics/sequencing技术还是很有兴趣的。也喜欢交叉科学。而且sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，bioinformatician好像都是在跑别人写好的program。做alignment就是BWA/bowtie；然后call SNP就是GATK/samtools啥的。也就是自学一点bash code来做一些很平常的处理；然后大规模的fastq就写一点简单的python来pre-processing
: 一点成就感都没有。或者说一点技术含量都没有。感觉人家CS的，学到了技术，学到了那就是自己的；以后用的到。而我们这种随便run个人家写好的program，感觉是个人就可以学会。
: 另外，我在的这个一般的medical school都没有CS course。我都是自学，觉得很野鸡，一点都不科班。这个破烂bioinformatics program也很一般，很小很新，都没什么人。各位在综合性大学bioinformaticics phd program的，你们都有上很正规的CS的course么？还是说CS这个东西，就是自己瞎捣弄就ok了？
: 所以有点想：
: 1.我还是很喜欢bioinformatics的。但觉得目前的状况下没什么training，都是自己摸索。所以想转到一个established的更好的bioinformatics program；但这不就把目前的老板给得罪了么
: 2.干脆直接转到cs的master算了。自己摸索了一年的bioinfor，对coding什么的好歹也有个大概的概念。但cs master，自己又没钱；而且担心身份出问题
: 大家来说说看法吧。谢谢
sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本
科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，
bioinformatician好像都是在跑别人写好br />
都没有。感觉人家CS的，学到了技术，学到了那就是自己的；以后用的到。而我们这种
随便run个人家写好的program，感觉是个人就可以学会。
鸡，一点都不科班。这个破烂bioinformatics program也很一般，很小很新，都没什么
人。各位在综合性大学bioinformaticics phd program的，你们都有上很正规的CS的
course么？还是说CS这个东西br />
摸索。所以想转到一个established的更好的bioinformatics program；但这不就把目
前的老板给得罪了么
也有个大概的概念。但cs master，自己又没钱；而且担心身份出问题
【在 u*********1 的大作中提到】
: 坦白说对genomics/sequencing技术还是很有兴趣的。也喜欢交叉科学。而且sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，bioinformatician好像都是在跑别人写好的program。做alignment就是BWA/bowtie；然后call SNP就是GATK/samtools啥的。也就是自学一点bash code来做一些很平常的处理；然后大规模的fastq就写一点简单的python来pre-processing
: 一点成就感都没有。或者说一点技术含量都没有。感觉人家CS的，学到了技术，学到了那就是自己的；以后用的到。而我们这种随便run个人家写好的program，感觉是个人就可以学会。
: 另外，我在的这个一般的medical school都没有CS course。我都是自学，觉得很野鸡，一点都不科班。这个破烂bioinformatics program也很一般，很小很新，都没什么人。各位在综合性大学bioinformaticics phd program的，你们都有上很正规的CS的course么？还是说CS这个东西，就是自己瞎捣弄就ok了？
: 所以有点想：
: 1.我还是很喜欢bioinformatics的。但觉得目前的状况下没什么training，都是自己摸索。所以想转到一个established的更好的bioinformatics program；但这不就把目前的老板给得罪了么
: 2.干脆直接转到cs的master算了。自己摸索了一年的bioinfor，对coding什么的好歹也有个大概的概念。但cs master，自己又没钱；而且担心身份出问题
: 大家来说说看法吧。谢谢
d*r
30 楼
看来你面试的学生都不错。。
吹牛比较大的是哪里的？阿三？
【在 S**********l 的大作中提到】
: 呵呵。我原来就发现了。
: 最近比较有感而发的还是中国的学生确实是好，特别实诚。我们面试的时候一般我们问
: ，是不是会XXX，90%的学生不会但是听说过，摸过的那种。我们国内的学生就是说那个
: 东西我不会，而别的学生有时会说会（程度不同）。然后我们再follow一个detail的问
: 题，一下就露馅。。。这一点确实我都觉得中国的学生还是好，至少诚实，真是不会吹
: 牛。
吹牛比较大的是哪里的？阿三？
【在 S**********l 的大作中提到】
: 呵呵。我原来就发现了。
: 最近比较有感而发的还是中国的学生确实是好，特别实诚。我们面试的时候一般我们问
: ，是不是会XXX，90%的学生不会但是听说过，摸过的那种。我们国内的学生就是说那个
: 东西我不会，而别的学生有时会说会（程度不同）。然后我们再follow一个detail的问
: 题，一下就露馅。。。这一点确实我都觉得中国的学生还是好，至少诚实，真是不会吹
: 牛。
N*n
31 楼
很多生物信息学program或者faculty都是半路出家，水平可想而知。但是，他对个人的
要求很高，起码是EE，CS的本科基础知识，加上生物的课程，当然还有编程和数据库的
经验，没有4-5年，很难。
现在网络的资源很多，都很容易学的到。
至少要统计硕士的课程， cs算法课程，还有，一些sampling method, Bayesian,
optimization....这些是基本的工具。
sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本
科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，
bioinformatician好像都是在跑别人写好的program。做alignment就是BWA/bowtie；然
后call SNP就是GATK/samtools啥的。也就是自学一点bash code来做一些很平常的处理
；然后大规模的fastq就写一点简单的python来pre-processing
了那就是自己的；以后用的到。而我们这种随便run个人家写好的program，感觉是个人
就可以学会。
鸡，一点都不科班。这个破烂bioinformatics program也很一般，很小很新，都没什么
人。各位在综合性大学bioinformaticics phd program的，你们都有上很正规的CS的
course么？还是说CS这个东西，就是自己瞎捣弄就ok了？
摸索。所以想转到一个established的更好的bioinformatics program；但这不就把目
前的老板给得罪了么
也有个大概的概念。但cs master，自己又没钱；而且担心身份出问题
【在 u*********1 的大作中提到】
: 坦白说对genomics/sequencing技术还是很有兴趣的。也喜欢交叉科学。而且sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，bioinformatician好像都是在跑别人写好的program。做alignment就是BWA/bowtie；然后call SNP就是GATK/samtools啥的。也就是自学一点bash code来做一些很平常的处理；然后大规模的fastq就写一点简单的python来pre-processing
: 一点成就感都没有。或者说一点技术含量都没有。感觉人家CS的，学到了技术，学到了那就是自己的；以后用的到。而我们这种随便run个人家写好的program，感觉是个人就可以学会。
: 另外，我在的这个一般的medical school都没有CS course。我都是自学，觉得很野鸡，一点都不科班。这个破烂bioinformatics program也很一般，很小很新，都没什么人。各位在综合性大学bioinformaticics phd program的，你们都有上很正规的CS的course么？还是说CS这个东西，就是自己瞎捣弄就ok了？
: 所以有点想：
: 1.我还是很喜欢bioinformatics的。但觉得目前的状况下没什么training，都是自己摸索。所以想转到一个established的更好的bioinformatics program；但这不就把目前的老板给得罪了么
: 2.干脆直接转到cs的master算了。自己摸索了一年的bioinfor，对coding什么的好歹也有个大概的概念。但cs master，自己又没钱；而且担心身份出问题
: 大家来说说看法吧。谢谢
要求很高，起码是EE，CS的本科基础知识，加上生物的课程，当然还有编程和数据库的
经验，没有4-5年，很难。
现在网络的资源很多，都很容易学的到。
至少要统计硕士的课程， cs算法课程，还有，一些sampling method, Bayesian,
optimization....这些是基本的工具。
sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本
科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，
bioinformatician好像都是在跑别人写好的program。做alignment就是BWA/bowtie；然
后call SNP就是GATK/samtools啥的。也就是自学一点bash code来做一些很平常的处理
；然后大规模的fastq就写一点简单的python来pre-processing
了那就是自己的；以后用的到。而我们这种随便run个人家写好的program，感觉是个人
就可以学会。
鸡，一点都不科班。这个破烂bioinformatics program也很一般，很小很新，都没什么
人。各位在综合性大学bioinformaticics phd program的，你们都有上很正规的CS的
course么？还是说CS这个东西，就是自己瞎捣弄就ok了？
摸索。所以想转到一个established的更好的bioinformatics program；但这不就把目
前的老板给得罪了么
也有个大概的概念。但cs master，自己又没钱；而且担心身份出问题
【在 u*********1 的大作中提到】
: 坦白说对genomics/sequencing技术还是很有兴趣的。也喜欢交叉科学。而且sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，bioinformatician好像都是在跑别人写好的program。做alignment就是BWA/bowtie；然后call SNP就是GATK/samtools啥的。也就是自学一点bash code来做一些很平常的处理；然后大规模的fastq就写一点简单的python来pre-processing
: 一点成就感都没有。或者说一点技术含量都没有。感觉人家CS的，学到了技术，学到了那就是自己的；以后用的到。而我们这种随便run个人家写好的program，感觉是个人就可以学会。
: 另外，我在的这个一般的medical school都没有CS course。我都是自学，觉得很野鸡，一点都不科班。这个破烂bioinformatics program也很一般，很小很新，都没什么人。各位在综合性大学bioinformaticics phd program的，你们都有上很正规的CS的course么？还是说CS这个东西，就是自己瞎捣弄就ok了？
: 所以有点想：
: 1.我还是很喜欢bioinformatics的。但觉得目前的状况下没什么training，都是自己摸索。所以想转到一个established的更好的bioinformatics program；但这不就把目前的老板给得罪了么
: 2.干脆直接转到cs的master算了。自己摸索了一年的bioinfor，对coding什么的好歹也有个大概的概念。但cs master，自己又没钱；而且担心身份出问题
: 大家来说说看法吧。谢谢
G*G
32 楼
NIU.
do you have tutorial about how to use bwa and samtools?
sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本
科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，
bioinformatician好像都是在跑别人写好br />
都没有。感觉人家CS的，学到了技术，学到了那就是自己的；以后用的到。而我们这种
随便run个人家写好的program，感觉是个人就可以学会。
鸡，一点都不科班。这个破烂bioinformatics program也很一般，很小很新，都没什么
人。各位在综合性大学bioinformaticics phd program的，你们都有上很正规的CS的
course么？还是说CS这个东西br />
摸索。所以想转到一个established的更好的bioinformatics program；但这不就把目
前的老板给得罪了么
也有个大概的概念。但cs master，自己又没钱；而且担心身份出问题
【在 u*********1 的大作中提到】
: 坦白说对genomics/sequencing技术还是很有兴趣的。也喜欢交叉科学。而且sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，bioinformatician好像都是在跑别人写好的program。做alignment就是BWA/bowtie；然后call SNP就是GATK/samtools啥的。也就是自学一点bash code来做一些很平常的处理；然后大规模的fastq就写一点简单的python来pre-processing
: 一点成就感都没有。或者说一点技术含量都没有。感觉人家CS的，学到了技术，学到了那就是自己的；以后用的到。而我们这种随便run个人家写好的program，感觉是个人就可以学会。
: 另外，我在的这个一般的medical school都没有CS course。我都是自学，觉得很野鸡，一点都不科班。这个破烂bioinformatics program也很一般，很小很新，都没什么人。各位在综合性大学bioinformaticics phd program的，你们都有上很正规的CS的course么？还是说CS这个东西，就是自己瞎捣弄就ok了？
: 所以有点想：
: 1.我还是很喜欢bioinformatics的。但觉得目前的状况下没什么training，都是自己摸索。所以想转到一个established的更好的bioinformatics program；但这不就把目前的老板给得罪了么
: 2.干脆直接转到cs的master算了。自己摸索了一年的bioinfor，对coding什么的好歹也有个大概的概念。但cs master，自己又没钱；而且担心身份出问题
: 大家来说说看法吧。谢谢
do you have tutorial about how to use bwa and samtools?
sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本
科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，
bioinformatician好像都是在跑别人写好br />
都没有。感觉人家CS的，学到了技术，学到了那就是自己的；以后用的到。而我们这种
随便run个人家写好的program，感觉是个人就可以学会。
鸡，一点都不科班。这个破烂bioinformatics program也很一般，很小很新，都没什么
人。各位在综合性大学bioinformaticics phd program的，你们都有上很正规的CS的
course么？还是说CS这个东西br />
摸索。所以想转到一个established的更好的bioinformatics program；但这不就把目
前的老板给得罪了么
也有个大概的概念。但cs master，自己又没钱；而且担心身份出问题
【在 u*********1 的大作中提到】
: 坦白说对genomics/sequencing技术还是很有兴趣的。也喜欢交叉科学。而且sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，bioinformatician好像都是在跑别人写好的program。做alignment就是BWA/bowtie；然后call SNP就是GATK/samtools啥的。也就是自学一点bash code来做一些很平常的处理；然后大规模的fastq就写一点简单的python来pre-processing
: 一点成就感都没有。或者说一点技术含量都没有。感觉人家CS的，学到了技术，学到了那就是自己的；以后用的到。而我们这种随便run个人家写好的program，感觉是个人就可以学会。
: 另外，我在的这个一般的medical school都没有CS course。我都是自学，觉得很野鸡，一点都不科班。这个破烂bioinformatics program也很一般，很小很新，都没什么人。各位在综合性大学bioinformaticics phd program的，你们都有上很正规的CS的course么？还是说CS这个东西，就是自己瞎捣弄就ok了？
: 所以有点想：
: 1.我还是很喜欢bioinformatics的。但觉得目前的状况下没什么training，都是自己摸索。所以想转到一个established的更好的bioinformatics program；但这不就把目前的老板给得罪了么
: 2.干脆直接转到cs的master算了。自己摸索了一年的bioinfor，对coding什么的好歹也有个大概的概念。但cs master，自己又没钱；而且担心身份出问题
: 大家来说说看法吧。谢谢
w*y
33 楼
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学到了那就是自己的；以后用的到。而我们这种
【在 G***G 的大作中提到】
: NIU.
: do you have tutorial about how to use bwa and samtools?
:
: sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本
: 科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，
: bioinformatician好像都是在跑别人写好br />
: 都没有。感觉人家CS的，学到了技术，学到了那就是自己的；以后用的到。而我们这种
: 随便run个人家写好的program，感觉是个人就可以学会。
: 鸡，一点都不科班。这个破烂bioinformatics program也很一般，很小很新，都没什么
: 人。各位在综合性大学bioinformaticics phd program的，你们都有上很正规的CS的
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学到了那就是自己的；以后用的到。而我们这种
【在 G***G 的大作中提到】
: NIU.
: do you have tutorial about how to use bwa and samtools?
:
: sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本
: 科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，
: bioinformatician好像都是在跑别人写好br />
: 都没有。感觉人家CS的，学到了技术，学到了那就是自己的；以后用的到。而我们这种
: 随便run个人家写好的program，感觉是个人就可以学会。
: 鸡，一点都不科班。这个破烂bioinformatics program也很一般，很小很新，都没什么
: 人。各位在综合性大学bioinformaticics phd program的，你们都有上很正规的CS的
r*t
34 楼
当时你老板没有 follow 一个 perl 的问题啊？
【在 S**********l 的大作中提到】
: 呵呵。我原来就发现了。
: 最近比较有感而发的还是中国的学生确实是好，特别实诚。我们面试的时候一般我们问
: ，是不是会XXX，90%的学生不会但是听说过，摸过的那种。我们国内的学生就是说那个
: 东西我不会，而别的学生有时会说会（程度不同）。然后我们再follow一个detail的问
: 题，一下就露馅。。。这一点确实我都觉得中国的学生还是好，至少诚实，真是不会吹
: 牛。
【在 S**********l 的大作中提到】
: 呵呵。我原来就发现了。
: 最近比较有感而发的还是中国的学生确实是好，特别实诚。我们面试的时候一般我们问
: ，是不是会XXX，90%的学生不会但是听说过，摸过的那种。我们国内的学生就是说那个
: 东西我不会，而别的学生有时会说会（程度不同）。然后我们再follow一个detail的问
: 题，一下就露馅。。。这一点确实我都觉得中国的学生还是好，至少诚实，真是不会吹
: 牛。
t*d
35 楼
看你自己适合什么了。和很多其它学科一样，bioinformatics也分理论多一些，和应用
多一些的领域。象物理中理论物理对数学要求高一些，实验物理就比较繁琐一些。
编程那点东西也是很繁琐的，是把别人开发好的成千上万 API，module 拼在一起用一
用。学起来不见得比bioinformatics更清爽。不过cs的应用面广，工作好找，工资也就
高了。
你先需要把自己的目标弄清楚。你是想写出一个大家都喜欢用的程序呢，还是想找出一
些 biomarker，drug targets。有了一个清楚的目标，再去学需要的技术。
写程序也很 boring 的。问问 macs 的作者 Tao Liu，看看每天对付mail-list 上的那
么多问题，不停的找出 bug，debug 一个程序是不是也蛮烦人的。
sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本
科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，
bioinformatician好像都是在跑别人写好的program。做alignment就是BWA/bowtie；然
后call SNP就是GATK/samtools啥的。也就是自学一点bash code来做一些很平常的处理
；然后大规模的fastq就写一点简单的python来pre-processing
了那就是自己的；以后用的到。而我们这种随便run个人家写好的program，感觉是个人
就可以学会。
鸡，一点都不科班。这个破烂bioinformatics program也很一般，很小很新，都没什么
人。各位在综合性大学bioinformaticics phd program的，你们都有上很正规的CS的
course么？还是说CS这个东西，就是自己瞎捣弄就ok了？
摸索。所以想转到一个established的更好的bioinformatics program；但这不就把目
前的老板给得罪了么
也有个大概的概念。但cs master，自己又没钱；而且担心身份出问题
【在 u*********1 的大作中提到】
: 坦白说对genomics/sequencing技术还是很有兴趣的。也喜欢交叉科学。而且sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，bioinformatician好像都是在跑别人写好的program。做alignment就是BWA/bowtie；然后call SNP就是GATK/samtools啥的。也就是自学一点bash code来做一些很平常的处理；然后大规模的fastq就写一点简单的python来pre-processing
: 一点成就感都没有。或者说一点技术含量都没有。感觉人家CS的，学到了技术，学到了那就是自己的；以后用的到。而我们这种随便run个人家写好的program，感觉是个人就可以学会。
: 另外，我在的这个一般的medical school都没有CS course。我都是自学，觉得很野鸡，一点都不科班。这个破烂bioinformatics program也很一般，很小很新，都没什么人。各位在综合性大学bioinformaticics phd program的，你们都有上很正规的CS的course么？还是说CS这个东西，就是自己瞎捣弄就ok了？
: 所以有点想：
: 1.我还是很喜欢bioinformatics的。但觉得目前的状况下没什么training，都是自己摸索。所以想转到一个established的更好的bioinformatics program；但这不就把目前的老板给得罪了么
: 2.干脆直接转到cs的master算了。自己摸索了一年的bioinfor，对coding什么的好歹也有个大概的概念。但cs master，自己又没钱；而且担心身份出问题
: 大家来说说看法吧。谢谢
多一些的领域。象物理中理论物理对数学要求高一些，实验物理就比较繁琐一些。
编程那点东西也是很繁琐的，是把别人开发好的成千上万 API，module 拼在一起用一
用。学起来不见得比bioinformatics更清爽。不过cs的应用面广，工作好找，工资也就
高了。
你先需要把自己的目标弄清楚。你是想写出一个大家都喜欢用的程序呢，还是想找出一
些 biomarker，drug targets。有了一个清楚的目标，再去学需要的技术。
写程序也很 boring 的。问问 macs 的作者 Tao Liu，看看每天对付mail-list 上的那
么多问题，不停的找出 bug，debug 一个程序是不是也蛮烦人的。
sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本
科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，
bioinformatician好像都是在跑别人写好的program。做alignment就是BWA/bowtie；然
后call SNP就是GATK/samtools啥的。也就是自学一点bash code来做一些很平常的处理
；然后大规模的fastq就写一点简单的python来pre-processing
了那就是自己的；以后用的到。而我们这种随便run个人家写好的program，感觉是个人
就可以学会。
鸡，一点都不科班。这个破烂bioinformatics program也很一般，很小很新，都没什么
人。各位在综合性大学bioinformaticics phd program的，你们都有上很正规的CS的
course么？还是说CS这个东西，就是自己瞎捣弄就ok了？
摸索。所以想转到一个established的更好的bioinformatics program；但这不就把目
前的老板给得罪了么
也有个大概的概念。但cs master，自己又没钱；而且担心身份出问题
【在 u*********1 的大作中提到】
: 坦白说对genomics/sequencing技术还是很有兴趣的。也喜欢交叉科学。而且sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，bioinformatician好像都是在跑别人写好的program。做alignment就是BWA/bowtie；然后call SNP就是GATK/samtools啥的。也就是自学一点bash code来做一些很平常的处理；然后大规模的fastq就写一点简单的python来pre-processing
: 一点成就感都没有。或者说一点技术含量都没有。感觉人家CS的，学到了技术，学到了那就是自己的；以后用的到。而我们这种随便run个人家写好的program，感觉是个人就可以学会。
: 另外，我在的这个一般的medical school都没有CS course。我都是自学，觉得很野鸡，一点都不科班。这个破烂bioinformatics program也很一般，很小很新，都没什么人。各位在综合性大学bioinformaticics phd program的，你们都有上很正规的CS的course么？还是说CS这个东西，就是自己瞎捣弄就ok了？
: 所以有点想：
: 1.我还是很喜欢bioinformatics的。但觉得目前的状况下没什么training，都是自己摸索。所以想转到一个established的更好的bioinformatics program；但这不就把目前的老板给得罪了么
: 2.干脆直接转到cs的master算了。自己摸索了一年的bioinfor，对coding什么的好歹也有个大概的概念。但cs master，自己又没钱；而且担心身份出问题
: 大家来说说看法吧。谢谢
u*1
36 楼
谢谢。你说的很有道理。
我的问题基本也是找rare SNP vs de novo assembly算法的开发。
我自己在独立的医学院，根本就没有CS的course；所以其实目前的现实是：偏生物的。
好像老板的意思也是先computational work的找target，至于以后怎么弄再说（比如以
后要是找到target，或许也可能回归benchwork做validation，这样就成纯生物了）但
我挺不甘心啊，我想学CS。但又怕自己小打小闹的效率不高或者根本是野鸡。
说到兴趣，我其实还是很喜欢biology的。但一定做的东西是“真"的，而不是一堆
artifact自己都不相信，那就太没意思了。
但我还是羡慕CS的，积累一些真经验真本事。而且工资高。
所以我自己也迷茫
的。
【在 G***y 的大作中提到】
: 对我来说生物信息是工具不是问题。你现在要想明白的是你自己的兴趣到底在哪边，是
: 生物还是计算机。
: 如果你喜欢的是生物，你要找到你感兴趣的，可以用生物信息学方法解决的生物问题，
: 比如rare SNP对疾病的贡献。
: 如果你喜欢的是计算机或者算法，你可能要再上一些CS的课程。你的研究方向可以是如
: 何提高现有的算法，比如如何快速精确的进行whole genome de novo assembly。
: 这两个方向虽说都归在生物信息下面，但是用到的知识和研究的性质还是有很大区别的。
:
: sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本
: 科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，
我的问题基本也是找rare SNP vs de novo assembly算法的开发。
我自己在独立的医学院，根本就没有CS的course；所以其实目前的现实是：偏生物的。
好像老板的意思也是先computational work的找target，至于以后怎么弄再说（比如以
后要是找到target，或许也可能回归benchwork做validation，这样就成纯生物了）但
我挺不甘心啊，我想学CS。但又怕自己小打小闹的效率不高或者根本是野鸡。
说到兴趣，我其实还是很喜欢biology的。但一定做的东西是“真"的，而不是一堆
artifact自己都不相信，那就太没意思了。
但我还是羡慕CS的，积累一些真经验真本事。而且工资高。
所以我自己也迷茫
的。
【在 G***y 的大作中提到】
: 对我来说生物信息是工具不是问题。你现在要想明白的是你自己的兴趣到底在哪边，是
: 生物还是计算机。
: 如果你喜欢的是生物，你要找到你感兴趣的，可以用生物信息学方法解决的生物问题，
: 比如rare SNP对疾病的贡献。
: 如果你喜欢的是计算机或者算法，你可能要再上一些CS的课程。你的研究方向可以是如
: 何提高现有的算法，比如如何快速精确的进行whole genome de novo assembly。
: 这两个方向虽说都归在生物信息下面，但是用到的知识和研究的性质还是有很大区别的。
:
: sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本
: 科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，
u*1
37 楼
您的意思是，我还是继续做下去。
空闲的时候自己多多自学CS的course？
【在 S**********l 的大作中提到】
: 没关系的。别郁闷了。其实本科毕业，要是学生自己没兴趣的话什么都做不了，不管是
: bio还是CS的。自己闲下来的时候提高提高就可以了。
:
: sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本
: 科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，
: bioinformatician好像都是在跑别人写好的program。做alignment就是BWA/bowtie；然
: 后call SNP就是GATK/samtools啥的。也就是自学一点bash code来做一些很平常的处理
: ；然后大规模的fastq就写一点简单的python来pre-processing
: 了那就是自己的；以后用的到。而我们这种随便run个人家写好的program，感觉是个人
: 就可以学会。
空闲的时候自己多多自学CS的course？
【在 S**********l 的大作中提到】
: 没关系的。别郁闷了。其实本科毕业，要是学生自己没兴趣的话什么都做不了，不管是
: bio还是CS的。自己闲下来的时候提高提高就可以了。
:
: sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本
: 科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，
: bioinformatician好像都是在跑别人写好的program。做alignment就是BWA/bowtie；然
: 后call SNP就是GATK/samtools啥的。也就是自学一点bash code来做一些很平常的处理
: ；然后大规模的fastq就写一点简单的python来pre-processing
: 了那就是自己的；以后用的到。而我们这种随便run个人家写好的program，感觉是个人
: 就可以学会。
u*1
38 楼
http://bio-bwa.sourceforge.net/bwa.shtml
http://samtools.sourceforge.net/samtools.shtml
这个，自己多实验几下就应该很容易吧。
一下子读完所有tutorial其实还是一头雾水。要不断实践，才慢慢明白那些parameter
啥意思
【在 G***G 的大作中提到】
: NIU.
: do you have tutorial about how to use bwa and samtools?
:
: sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本
: 科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，
: bioinformatician好像都是在跑别人写好br />
: 都没有。感觉人家CS的，学到了技术，学到了那就是自己的；以后用的到。而我们这种
: 随便run个人家写好的program，感觉是个人就可以学会。
: 鸡，一点都不科班。这个破烂bioinformatics program也很一般，很小很新，都没什么
: 人。各位在综合性大学bioinformaticics phd program的，你们都有上很正规的CS的
http://samtools.sourceforge.net/samtools.shtml
这个，自己多实验几下就应该很容易吧。
一下子读完所有tutorial其实还是一头雾水。要不断实践，才慢慢明白那些parameter
啥意思
【在 G***G 的大作中提到】
: NIU.
: do you have tutorial about how to use bwa and samtools?
:
: sequencing成本越来越低，越来越多的data要产生。所以我是很看好这一行的。所以本
: 科是读生物的；然后来了美国半路转到bioinformatics。但我觉得很郁闷的是，
: bioinformatician好像都是在跑别人写好br />
: 都没有。感觉人家CS的，学到了技术，学到了那就是自己的；以后用的到。而我们这种
: 随便run个人家写好的program，感觉是个人就可以学会。
: 鸡，一点都不科班。这个破烂bioinformatics program也很一般，很小很新，都没什么
: 人。各位在综合性大学bioinformaticics phd program的，你们都有上很正规的CS的
u*1
39 楼
我觉得我双重人格。
我有时候很ambitious想做faculty，就是生物医学统计计算机基因组学sequencing全部
都懂。我骨子里还是那种精神化的人，想做有趣的事情的
但有时候也会妥协现实，就想改行做个马工算了；或者bioinfor facility core帮人家
打杂，混口饭吃算了。爱情对我更重要。
不过感觉自己在目前这个破烂program，CS的course都没的修，根本就没那个flatform
实现这些理想啊。只自学就ok？
【在 t*d 的大作中提到】
: 看你自己适合什么了。和很多其它学科一样，bioinformatics也分理论多一些，和应用
: 多一些的领域。象物理中理论物理对数学要求高一些，实验物理就比较繁琐一些。
: 编程那点东西也是很繁琐的，是把别人开发好的成千上万 API，module 拼在一起用一
: 用。学起来不见得比bioinformatics更清爽。不过cs的应用面广，工作好找，工资也就
: 高了。
: 你先需要把自己的目标弄清楚。你是想写出一个大家都喜欢用的程序呢，还是想找出一
: 些 biomarker，drug targets。有了一个清楚的目标，再去学需要的技术。
: 写程序也很 boring 的。问问 macs 的作者 Tao Liu，看看每天对付mail-list 上的那
: 么多问题，不停的找出 bug，debug 一个程序是不是也蛮烦人的。
:
我有时候很ambitious想做faculty，就是生物医学统计计算机基因组学sequencing全部
都懂。我骨子里还是那种精神化的人，想做有趣的事情的
但有时候也会妥协现实，就想改行做个马工算了；或者bioinfor facility core帮人家
打杂，混口饭吃算了。爱情对我更重要。
不过感觉自己在目前这个破烂program，CS的course都没的修，根本就没那个flatform
实现这些理想啊。只自学就ok？
【在 t*d 的大作中提到】
: 看你自己适合什么了。和很多其它学科一样，bioinformatics也分理论多一些，和应用
: 多一些的领域。象物理中理论物理对数学要求高一些，实验物理就比较繁琐一些。
: 编程那点东西也是很繁琐的，是把别人开发好的成千上万 API，module 拼在一起用一
: 用。学起来不见得比bioinformatics更清爽。不过cs的应用面广，工作好找，工资也就
: 高了。
: 你先需要把自己的目标弄清楚。你是想写出一个大家都喜欢用的程序呢，还是想找出一
: 些 biomarker，drug targets。有了一个清楚的目标，再去学需要的技术。
: 写程序也很 boring 的。问问 macs 的作者 Tao Liu，看看每天对付mail-list 上的那
: 么多问题，不停的找出 bug，debug 一个程序是不是也蛮烦人的。
:
u*1
40 楼
我倒不想像heng li那样能写BWA/samtools，甚至ANNOVAR这样的非常popular大家都用
的爽的软件。
因为我竞争不过那些科班出身的牛人；其次目前NGS的各种平台软件已经搭好了；我晚
出生很多年，没赶上。
但我只想根据自己的意愿，希望能写一些相对复杂的program；而不是每天傻里巴几的
用人家的program。我一个bioinformatician，都写不出属于自己的program，真是没脸混
但你说写那写复杂的软件；一方面C++/java要学；另外一方面很多statistics啊，
algorithm啊，我都没上类似的course。也比较没头绪
【在 t*d 的大作中提到】
: 看你自己适合什么了。和很多其它学科一样，bioinformatics也分理论多一些，和应用
: 多一些的领域。象物理中理论物理对数学要求高一些，实验物理就比较繁琐一些。
: 编程那点东西也是很繁琐的，是把别人开发好的成千上万 API，module 拼在一起用一
: 用。学起来不见得比bioinformatics更清爽。不过cs的应用面广，工作好找，工资也就
: 高了。
: 你先需要把自己的目标弄清楚。你是想写出一个大家都喜欢用的程序呢，还是想找出一
: 些 biomarker，drug targets。有了一个清楚的目标，再去学需要的技术。
: 写程序也很 boring 的。问问 macs 的作者 Tao Liu，看看每天对付mail-list 上的那
: 么多问题，不停的找出 bug，debug 一个程序是不是也蛮烦人的。
:
的爽的软件。
因为我竞争不过那些科班出身的牛人；其次目前NGS的各种平台软件已经搭好了；我晚
出生很多年，没赶上。
但我只想根据自己的意愿，希望能写一些相对复杂的program；而不是每天傻里巴几的
用人家的program。我一个bioinformatician，都写不出属于自己的program，真是没脸混
但你说写那写复杂的软件；一方面C++/java要学；另外一方面很多statistics啊，
algorithm啊，我都没上类似的course。也比较没头绪
【在 t*d 的大作中提到】
: 看你自己适合什么了。和很多其它学科一样，bioinformatics也分理论多一些，和应用
: 多一些的领域。象物理中理论物理对数学要求高一些，实验物理就比较繁琐一些。
: 编程那点东西也是很繁琐的，是把别人开发好的成千上万 API，module 拼在一起用一
: 用。学起来不见得比bioinformatics更清爽。不过cs的应用面广，工作好找，工资也就
: 高了。
: 你先需要把自己的目标弄清楚。你是想写出一个大家都喜欢用的程序呢，还是想找出一
: 些 biomarker，drug targets。有了一个清楚的目标，再去学需要的技术。
: 写程序也很 boring 的。问问 macs 的作者 Tao Liu，看看每天对付mail-list 上的那
: 么多问题，不停的找出 bug，debug 一个程序是不是也蛮烦人的。
:
f*d
41 楼
缺乏数理思维玩儿不转的
【在 u*********1 的大作中提到】
: 完全没数学物理背景
: 所以觉得我都不是bioinformatics的学生。只不过我比其他benchwork会用一点
: software。人家benchwork做的是药剂药品的实验；我做的是人家写好的program的实验
【在 u*********1 的大作中提到】
: 完全没数学物理背景
: 所以觉得我都不是bioinformatics的学生。只不过我比其他benchwork会用一点
: software。人家benchwork做的是药剂药品的实验；我做的是人家写好的program的实验
f*d
42 楼
靠，Tao Liu也这么出名了
【在 t*d 的大作中提到】
: 看你自己适合什么了。和很多其它学科一样，bioinformatics也分理论多一些，和应用
: 多一些的领域。象物理中理论物理对数学要求高一些，实验物理就比较繁琐一些。
: 编程那点东西也是很繁琐的，是把别人开发好的成千上万 API，module 拼在一起用一
: 用。学起来不见得比bioinformatics更清爽。不过cs的应用面广，工作好找，工资也就
: 高了。
: 你先需要把自己的目标弄清楚。你是想写出一个大家都喜欢用的程序呢，还是想找出一
: 些 biomarker，drug targets。有了一个清楚的目标，再去学需要的技术。
: 写程序也很 boring 的。问问 macs 的作者 Tao Liu，看看每天对付mail-list 上的那
: 么多问题，不停的找出 bug，debug 一个程序是不是也蛮烦人的。
:
【在 t*d 的大作中提到】
: 看你自己适合什么了。和很多其它学科一样，bioinformatics也分理论多一些，和应用
: 多一些的领域。象物理中理论物理对数学要求高一些，实验物理就比较繁琐一些。
: 编程那点东西也是很繁琐的，是把别人开发好的成千上万 API，module 拼在一起用一
: 用。学起来不见得比bioinformatics更清爽。不过cs的应用面广，工作好找，工资也就
: 高了。
: 你先需要把自己的目标弄清楚。你是想写出一个大家都喜欢用的程序呢，还是想找出一
: 些 biomarker，drug targets。有了一个清楚的目标，再去学需要的技术。
: 写程序也很 boring 的。问问 macs 的作者 Tao Liu，看看每天对付mail-list 上的那
: 么多问题，不停的找出 bug，debug 一个程序是不是也蛮烦人的。
:
G*y
43 楼
"其次目前NGS的各种平台软件已经搭好了,我晚出生很多年，没赶上。"
很不同意这个.NGS数据从最基础的base call到variant call需要改进的东西不要太多,
大家做都做不过来.你如果真的对写算法感兴趣的话这方面大有潜力.不过这个对编程和
统计的要求都比较高,估计还得正经学几年.
脸混
【在 u*********1 的大作中提到】
: 我倒不想像heng li那样能写BWA/samtools，甚至ANNOVAR这样的非常popular大家都用
: 的爽的软件。
: 因为我竞争不过那些科班出身的牛人；其次目前NGS的各种平台软件已经搭好了；我晚
: 出生很多年，没赶上。
: 但我只想根据自己的意愿，希望能写一些相对复杂的program；而不是每天傻里巴几的
: 用人家的program。我一个bioinformatician，都写不出属于自己的program，真是没脸混
: 但你说写那写复杂的软件；一方面C++/java要学；另外一方面很多statistics啊，
: algorithm啊，我都没上类似的course。也比较没头绪
很不同意这个.NGS数据从最基础的base call到variant call需要改进的东西不要太多,
大家做都做不过来.你如果真的对写算法感兴趣的话这方面大有潜力.不过这个对编程和
统计的要求都比较高,估计还得正经学几年.
脸混
【在 u*********1 的大作中提到】
: 我倒不想像heng li那样能写BWA/samtools，甚至ANNOVAR这样的非常popular大家都用
: 的爽的软件。
: 因为我竞争不过那些科班出身的牛人；其次目前NGS的各种平台软件已经搭好了；我晚
: 出生很多年，没赶上。
: 但我只想根据自己的意愿，希望能写一些相对复杂的program；而不是每天傻里巴几的
: 用人家的program。我一个bioinformatician，都写不出属于自己的program，真是没脸混
: 但你说写那写复杂的软件；一方面C++/java要学；另外一方面很多statistics啊，
: algorithm啊，我都没上类似的course。也比较没头绪
f*d
44 楼
这些东西我不信lz就用的很爽了
肯定有这样那样的问题缺陷
改进一下，有点效果，就是篇paper
多,
【在 G***y 的大作中提到】
: "其次目前NGS的各种平台软件已经搭好了,我晚出生很多年，没赶上。"
: 很不同意这个.NGS数据从最基础的base call到variant call需要改进的东西不要太多,
: 大家做都做不过来.你如果真的对写算法感兴趣的话这方面大有潜力.不过这个对编程和
: 统计的要求都比较高,估计还得正经学几年.
:
: 脸混
肯定有这样那样的问题缺陷
改进一下，有点效果，就是篇paper
多,
【在 G***y 的大作中提到】
: "其次目前NGS的各种平台软件已经搭好了,我晚出生很多年，没赶上。"
: 很不同意这个.NGS数据从最基础的base call到variant call需要改进的东西不要太多,
: 大家做都做不过来.你如果真的对写算法感兴趣的话这方面大有潜力.不过这个对编程和
: 统计的要求都比较高,估计还得正经学几年.
:
: 脸混
s*9
45 楼
要转的话可以先去附近学校看看嘛~财力证明只要一年的I-20就行~暑假找到实习的话赚
的钱还挺多的
的钱还挺多的
l*1
46 楼
最好是到你的那Medical School 的其它校区或联盟校 选科班的课程 C or C++ plus R
至少 掌握用其中一种可以 改写完善
NGS RNA-seq的 platform likes:
HTTPS://wiki.nbic.nl/index.php/NGS_Tools
那里边的一个软件的source code的能力
R book:
//manuals.bioinformatics.ucr.edu/home/R_BioCondManual
please refer:
回复]
[ 9 ]
发信人: Leucothea (Leucothea), 信区: Biology
标 题: Re: illumina测序数据分析
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Aug 3 16:54:03 2011, 美东)
如果完全新手又没有计算资源，找个合作者是最快出结果的方法了。
如果一定要自己搞：
（1）找个靠谱的cloud或其他cluster，把数据传上去。或者花2000多刀买一个work
station。16g内存，8cpu。
（2）找地方参加个workshop。对怎么分析这类数据有个大概的sense。
（3）知道哪些能用公共软件做，哪些需要自己coding，应该从哪些方面入手分析之后
，自己学coding，至少懂两样。perl/python 以及R。
这一套下来半年算很快了。还是在有人能时不时指导下的情况下。
http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/31549213.html
and
http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/31659225.html
13th floor
flatform
【在 u*********1 的大作中提到】
: 我觉得我双重人格。
: 我有时候很ambitious想做faculty，就是生物医学统计计算机基因组学sequencing全部
: 都懂。我骨子里还是那种精神化的人，想做有趣的事情的
: 但有时候也会妥协现实，就想改行做个马工算了；或者bioinfor facility core帮人家
: 打杂，混口饭吃算了。爱情对我更重要。
: 不过感觉自己在目前这个破烂program，CS的course都没的修，根本就没那个flatform
: 实现这些理想啊。只自学就ok？
至少 掌握用其中一种可以 改写完善
NGS RNA-seq的 platform likes:
HTTPS://wiki.nbic.nl/index.php/NGS_Tools
那里边的一个软件的source code的能力
R book:
//manuals.bioinformatics.ucr.edu/home/R_BioCondManual
please refer:
回复]
[ 9 ]
发信人: Leucothea (Leucothea), 信区: Biology
标 题: Re: illumina测序数据分析
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Aug 3 16:54:03 2011, 美东)
如果完全新手又没有计算资源，找个合作者是最快出结果的方法了。
如果一定要自己搞：
（1）找个靠谱的cloud或其他cluster，把数据传上去。或者花2000多刀买一个work
station。16g内存，8cpu。
（2）找地方参加个workshop。对怎么分析这类数据有个大概的sense。
（3）知道哪些能用公共软件做，哪些需要自己coding，应该从哪些方面入手分析之后
，自己学coding，至少懂两样。perl/python 以及R。
这一套下来半年算很快了。还是在有人能时不时指导下的情况下。
http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/31549213.html
and
http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/31659225.html
13th floor
flatform
【在 u*********1 的大作中提到】
: 我觉得我双重人格。
: 我有时候很ambitious想做faculty，就是生物医学统计计算机基因组学sequencing全部
: 都懂。我骨子里还是那种精神化的人，想做有趣的事情的
: 但有时候也会妥协现实，就想改行做个马工算了；或者bioinfor facility core帮人家
: 打杂，混口饭吃算了。爱情对我更重要。
: 不过感觉自己在目前这个破烂program，CS的course都没的修，根本就没那个flatform
: 实现这些理想啊。只自学就ok？
t*d
47 楼
且不提他是 macs 的作者。如果你也能在一个mail list 孜孜不倦的回到各种问题，你
也会出名的。
【在 f*******d 的大作中提到】
: 靠，Tao Liu也这么出名了
也会出名的。
【在 f*******d 的大作中提到】
: 靠，Tao Liu也这么出名了
y*n
48 楼
找个bioinformatics做得好的组合作吧，能学到不少东西
p*r
49 楼
flatform
感觉你还是做应用比较靠谱，靠对你那个具体疾病的深刻理解。
爱情最重要也，同意，哈哈。
【在 u*********1 的大作中提到】
: 我觉得我双重人格。
: 我有时候很ambitious想做faculty，就是生物医学统计计算机基因组学sequencing全部
: 都懂。我骨子里还是那种精神化的人，想做有趣的事情的
: 但有时候也会妥协现实，就想改行做个马工算了；或者bioinfor facility core帮人家
: 打杂，混口饭吃算了。爱情对我更重要。
: 不过感觉自己在目前这个破烂program，CS的course都没的修，根本就没那个flatform
: 实现这些理想啊。只自学就ok？
p*r
50 楼
关键这些tool很快就过时了。感觉长序列的测序仪器很快就要出来了。一出来，这些算
法就过时了。
我个人不爱搞这类算法开发，因为过时太快。我还是喜欢搞能揭示fundamental
science的模型和分析方法。
我觉得现在比较有意义的领域是 population genetics. 现在这领域的模型太初级了。
大规模测序会给我们很多数据，怎么分析？
脸混
建议你多学点statistics。至于编程，其实扔给别人去做是最爽的。哈哈。 ：）
我觉得未来的走向还是用informatics 的方法来研究fundamental biology。
Focus on scientific problems, not particular methods.
【在 u*********1 的大作中提到】
: 我倒不想像heng li那样能写BWA/samtools，甚至ANNOVAR这样的非常popular大家都用
: 的爽的软件。
: 因为我竞争不过那些科班出身的牛人；其次目前NGS的各种平台软件已经搭好了；我晚
: 出生很多年，没赶上。
: 但我只想根据自己的意愿，希望能写一些相对复杂的program；而不是每天傻里巴几的
: 用人家的program。我一个bioinformatician，都写不出属于自己的program，真是没脸混
: 但你说写那写复杂的软件；一方面C++/java要学；另外一方面很多statistics啊，
: algorithm啊，我都没上类似的course。也比较没头绪
法就过时了。
我个人不爱搞这类算法开发，因为过时太快。我还是喜欢搞能揭示fundamental
science的模型和分析方法。
我觉得现在比较有意义的领域是 population genetics. 现在这领域的模型太初级了。
大规模测序会给我们很多数据，怎么分析？
脸混
建议你多学点statistics。至于编程，其实扔给别人去做是最爽的。哈哈。 ：）
我觉得未来的走向还是用informatics 的方法来研究fundamental biology。
Focus on scientific problems, not particular methods.
【在 u*********1 的大作中提到】
: 我倒不想像heng li那样能写BWA/samtools，甚至ANNOVAR这样的非常popular大家都用
: 的爽的软件。
: 因为我竞争不过那些科班出身的牛人；其次目前NGS的各种平台软件已经搭好了；我晚
: 出生很多年，没赶上。
: 但我只想根据自己的意愿，希望能写一些相对复杂的program；而不是每天傻里巴几的
: 用人家的program。我一个bioinformatician，都写不出属于自己的program，真是没脸混
: 但你说写那写复杂的软件；一方面C++/java要学；另外一方面很多statistics啊，
: algorithm啊，我都没上类似的course。也比较没头绪
M*P
51 楼
拜托查查bowtie的引用次数。
【在 p*******r 的大作中提到】
: 关键这些tool很快就过时了。感觉长序列的测序仪器很快就要出来了。一出来，这些算
: 法就过时了。
: 我个人不爱搞这类算法开发，因为过时太快。我还是喜欢搞能揭示fundamental
: science的模型和分析方法。
: 我觉得现在比较有意义的领域是 population genetics. 现在这领域的模型太初级了。
: 大规模测序会给我们很多数据，怎么分析？
:
: 脸混
: 建议你多学点statistics。至于编程，其实扔给别人去做是最爽的。哈哈。 ：）
: 我觉得未来的走向还是用informatics 的方法来研究fundamental biology。
【在 p*******r 的大作中提到】
: 关键这些tool很快就过时了。感觉长序列的测序仪器很快就要出来了。一出来，这些算
: 法就过时了。
: 我个人不爱搞这类算法开发，因为过时太快。我还是喜欢搞能揭示fundamental
: science的模型和分析方法。
: 我觉得现在比较有意义的领域是 population genetics. 现在这领域的模型太初级了。
: 大规模测序会给我们很多数据，怎么分析？
:
: 脸混
: 建议你多学点statistics。至于编程，其实扔给别人去做是最爽的。哈哈。 ：）
: 我觉得未来的走向还是用informatics 的方法来研究fundamental biology。
p*r
52 楼
引用次数 means nothing. :)
I am just giving my personal opinion here BTW.
【在 M*P 的大作中提到】
: 拜托查查bowtie的引用次数。
I am just giving my personal opinion here BTW.
【在 M*P 的大作中提到】
: 拜托查查bowtie的引用次数。
y*8
53 楼
Many people are addicted to used methods.
【在 p*******r 的大作中提到】
: 引用次数 means nothing. :)
: I am just giving my personal opinion here BTW.
【在 p*******r 的大作中提到】
: 引用次数 means nothing. :)
: I am just giving my personal opinion here BTW.
G*y
54 楼
Pop Gen这个领域很多就不是算法的问题了，涉及更多的还是BioStat吧。当然如果会写
MCMC之类的肯定有帮助。
【在 p*******r 的大作中提到】
: 关键这些tool很快就过时了。感觉长序列的测序仪器很快就要出来了。一出来，这些算
: 法就过时了。
: 我个人不爱搞这类算法开发，因为过时太快。我还是喜欢搞能揭示fundamental
: science的模型和分析方法。
: 我觉得现在比较有意义的领域是 population genetics. 现在这领域的模型太初级了。
: 大规模测序会给我们很多数据，怎么分析？
:
: 脸混
: 建议你多学点statistics。至于编程，其实扔给别人去做是最爽的。哈哈。 ：）
: 我觉得未来的走向还是用informatics 的方法来研究fundamental biology。
MCMC之类的肯定有帮助。
【在 p*******r 的大作中提到】
: 关键这些tool很快就过时了。感觉长序列的测序仪器很快就要出来了。一出来，这些算
: 法就过时了。
: 我个人不爱搞这类算法开发，因为过时太快。我还是喜欢搞能揭示fundamental
: science的模型和分析方法。
: 我觉得现在比较有意义的领域是 population genetics. 现在这领域的模型太初级了。
: 大规模测序会给我们很多数据，怎么分析？
:
: 脸混
: 建议你多学点statistics。至于编程，其实扔给别人去做是最爽的。哈哈。 ：）
: 我觉得未来的走向还是用informatics 的方法来研究fundamental biology。
b*7
55 楼
考虑一下join Tao Liu的Lab，喜欢coding的话
【在 t*d 的大作中提到】
: 看你自己适合什么了。和很多其它学科一样，bioinformatics也分理论多一些，和应用
: 多一些的领域。象物理中理论物理对数学要求高一些，实验物理就比较繁琐一些。
: 编程那点东西也是很繁琐的，是把别人开发好的成千上万 API，module 拼在一起用一
: 用。学起来不见得比bioinformatics更清爽。不过cs的应用面广，工作好找，工资也就
: 高了。
: 你先需要把自己的目标弄清楚。你是想写出一个大家都喜欢用的程序呢，还是想找出一
: 些 biomarker，drug targets。有了一个清楚的目标，再去学需要的技术。
: 写程序也很 boring 的。问问 macs 的作者 Tao Liu，看看每天对付mail-list 上的那
: 么多问题，不停的找出 bug，debug 一个程序是不是也蛮烦人的。
:
【在 t*d 的大作中提到】
: 看你自己适合什么了。和很多其它学科一样，bioinformatics也分理论多一些，和应用
: 多一些的领域。象物理中理论物理对数学要求高一些，实验物理就比较繁琐一些。
: 编程那点东西也是很繁琐的，是把别人开发好的成千上万 API，module 拼在一起用一
: 用。学起来不见得比bioinformatics更清爽。不过cs的应用面广，工作好找，工资也就
: 高了。
: 你先需要把自己的目标弄清楚。你是想写出一个大家都喜欢用的程序呢，还是想找出一
: 些 biomarker，drug targets。有了一个清楚的目标，再去学需要的技术。
: 写程序也很 boring 的。问问 macs 的作者 Tao Liu，看看每天对付mail-list 上的那
: 么多问题，不停的找出 bug，debug 一个程序是不是也蛮烦人的。
:
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