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结构生物学的意义？

结构生物学的意义？# Biology - 生物学

A*e2012-10-16 07:10

1 楼

【以下文字转载自 Tennis 讨论区】
发信人: TaurusFarmer (大冶金牛人), 信区: Tennis
标题: 我觉得费德勒走了一步好棋
发信站: BBS 未名空间站 (Sat Sep 11 20:18:24 2010, 美东)
首先，看今天的比赛，费德勒发球，正手，步伐等，和以前的几场比赛里的表现，尤其
是和所得零的那场比赛，实在是大相径庭，判若两人。虽然有很多可能，不过我觉得费
德勒极又可能是背伤和腿伤发作了。有人说纳豆进决赛，费德勒受到影响了。我觉得不
是。以费德勒的心理素质，以及他在硬地上的水平（6年里5个冠军，1个亚军，6个不同
的对手），如果他身体健康，在法拉盛的快速球场上是不惧怕任何人的。何况我看了纳豆和油滞泥的比赛，我
并不觉得现在的纳豆在美网的快速球场上，有能力击败一个健康的费德勒。
如果费德勒伤病发作了，那么就他今天的表现，就如很多朋友说的，他决赛击败纳豆的
可能性，比之德约还不如。我想费德勒心里是很清楚这一点的。那么，既然自己已经无
法确保能阻止纳豆美网夺冠，与其自己拼死为纳豆垫背，不如让更有希望阻止纳豆的德
约上。如果德约明天成功举杯（这并

z*12012-10-16 07:10

2 楼

现在结构生物学，CNS发的一篇接一篇的~ nobel prize也发了很多给结构生物学家~
弱问一下，结构生物学有这么重要的意义吗？

D*a2012-10-16 07:10

3 楼

据说是破解癌症的密码

l*12012-10-16 07:10

4 楼

心中无剑口中莫言无法解构分别是刺秦炸药文学和炸药生理医学的
各个境界吧
To be or not to be
色即是空空即是色

p*u2012-10-16 07:10

5 楼

结构生物学就类似于显微镜照相，一个蛋白质的功能了解了之后，那么为什么这个蛋白
质具有这个功能？其他的不行？结构搞好之后，具有类似结构的蛋白质是否具有类似的
功能？蛋白质很大，到底是那种motif决定了那些功能？其实结构的文章一篇一篇的发
cns其实是一种福利，crystalo很难做的，一般都要干好几年，最后再发个分低的文章
那就没人做了。现在其实做结构基本就是人海战术，谁人多谁占便宜。比如一个实验室
招10个博后做10个不同蛋白的结晶，总会有成功的，成功了那就是cns，也值了。

D*a2012-10-16 07:10

6 楼

哪个project不要做好几年
现在连plos one上都满眼是double 甚至triple的老鼠KO模型了

【在 p*****u 的大作中提到】

: 结构生物学就类似于显微镜照相，一个蛋白质的功能了解了之后，那么为什么这个蛋白
: 质具有这个功能？其他的不行？结构搞好之后，具有类似结构的蛋白质是否具有类似的
: 功能？蛋白质很大，到底是那种motif决定了那些功能？其实结构的文章一篇一篇的发
: cns其实是一种福利，crystalo很难做的，一般都要干好几年，最后再发个分低的文章
: 那就没人做了。现在其实做结构基本就是人海战术，谁人多谁占便宜。比如一个实验室
: 招10个博后做10个不同蛋白的结晶，总会有成功的，成功了那就是cns，也值了。

p*u2012-10-16 07:10

7 楼

做老鼠确实够麻烦的，主要是ko模型太慢，得等老鼠长起来，做老鼠的发cns的也不少
啊，做其他的课题总能写点儿文章，实在不march，至少可以投几篇低分的，做结构的
可是 yes or no的问题，要不就是cns要不就什么都没有，那种心情实在是要身临其境
才能体会，实在是有时刻做炮灰的心里准备才行，就悲剧的是自己做了3年的crystalo
快要发表了被人抢先发了，那么自己三年的工作等于零连个1,2分的杂志都不会要的。
做其他的很多被抢先了都是实在不行换换说法发个低分的也能出去。

【在 D*a 的大作中提到】

: 哪个project不要做好几年
: 现在连plos one上都满眼是double 甚至triple的老鼠KO模型了

u*d2012-10-16 07:10

8 楼

大家都在接结构，只是在不同的水平上解而已。晶体结构的人，他们的系统最简单纯粹
，干扰最小，所以相对容易出成果。
解了蛋白结构，我们可以解释它的功能，推测其它蛋白的功能。而另外的人则在了解细
胞内的各种网络，细胞间的协调，器官和系统间的协调。大家的最终目的就是解
生物个体的结构：生老病死，背后的原因是什么？
当然，有了蛋白的结构，我们还可以更有效地改造它，例如突变修饰或者开放小分子激
动剂或者拮抗剂。
同理，我们对各种分子调控网络，细胞，组织，器官，个体的生老病死了解的越多，我
们也就可以改造它们，让它们按我们的意愿发展变化。
这个不是谁看不起谁的问题，而是什么有没有意思的问题。我就觉得接结构太无聊了，
结构试验室的妹纸看去都是五大三粗的，肌肉很强壮，要不怎么扛得动那些大瓶子大转
子？
P.S.：如果地球上所有的生物有一个共同的始祖，都是由同一一个细胞样的东西分裂变
化而来，那么，这个细胞一直活着，我们则会死去。

【在 z*******1 的大作中提到】

: 现在结构生物学，CNS发的一篇接一篇的~ nobel prize也发了很多给结构生物学家~
: 弱问一下，结构生物学有这么重要的意义吗？

D*a2012-10-16 07:10

9 楼

可以这样想，配子细胞就是immortal的，一代一代传下去

【在 u**********d 的大作中提到】

: 大家都在接结构，只是在不同的水平上解而已。晶体结构的人，他们的系统最简单纯粹
: ，干扰最小，所以相对容易出成果。
: 解了蛋白结构，我们可以解释它的功能，推测其它蛋白的功能。而另外的人则在了解细
: 胞内的各种网络，细胞间的协调，器官和系统间的协调。大家的最终目的就是解
: 生物个体的结构：生老病死，背后的原因是什么？
: 当然，有了蛋白的结构，我们还可以更有效地改造它，例如突变修饰或者开放小分子激
: 动剂或者拮抗剂。
: 同理，我们对各种分子调控网络，细胞，组织，器官，个体的生老病死了解的越多，我
: 们也就可以改造它们，让它们按我们的意愿发展变化。
: 这个不是谁看不起谁的问题，而是什么有没有意思的问题。我就觉得接结构太无聊了，

u*d2012-10-16 07:10

10 楼

所以所有的人类文明在早期都有生殖崇拜是有道理的。

【在 D*a 的大作中提到】

: 可以这样想，配子细胞就是immortal的，一代一代传下去

r*g2012-10-16 07:10

11 楼

今年nobel化学奖的那师徒两人，名正言顺啊~ 他们的GPCR的结构解析已经被广泛的运
用于药物开发，大量的small molecule分子都已经用于clinical trial了啊
我不是crystal guy,但是我的认识就是：
1. 终有一天，我们可以通过蛋白序列100%准确预测蛋白结构，蛋白interactions
2. 某个蛋白被解析之后，人们会做high-thoughput screening，他们可以找出high
affnity的小的化学分子，然后可以modify 小分子以后用于蛋白抑制剂~ 很多癌症细胞
重要survival/growth signaling中的tyrosine kinase不就是被解析了，然后制出了很
多重要的小分子抗癌药吗？
3. 认识最基本的细胞内蛋白功能和细胞机制~ 例如，RNAP的作用之类

【在 z*******1 的大作中提到】

: 现在结构生物学，CNS发的一篇接一篇的~ nobel prize也发了很多给结构生物学家~
: 弱问一下，结构生物学有这么重要的意义吗？

L*S2012-10-16 07:10

12 楼

结构不是science，而是一门技术了。找几个职业学校毕业的，大批量劳动密集型产业
化就行了

K*42012-10-16 07:10

13 楼

解结构如同基因组的测序部分
但是理解结构后面蕴藏的功能却有重大意义
你可以name一个基因或蛋白，没有结构，单靠生化试验对他的功能的理解是远远不够的。

【在 z*******1 的大作中提到】

: 现在结构生物学，CNS发的一篇接一篇的~ nobel prize也发了很多给结构生物学家~
: 弱问一下，结构生物学有这么重要的意义吗？

z*12012-10-16 07:10

14 楼

楼上们说的很有道理。只是现在的结构生物学实验室好像确实有劳动密集型工厂之嫌。
见过一些挺牛的实验室，学生很多，分工明确，就重复的表达蛋白，长晶体，结结构。
几十个蛋白一起做，哪天哪个蛋白长出来好的晶体就发达了，出文章也快，发的也好。
但是学生好像没什么training，略水啊~~~~

l*y2012-10-16 07:10

15 楼

所以说 ko 老鼠的工作应该 outsourcing。

【在 D*a 的大作中提到】

: 哪个project不要做好几年
: 现在连plos one上都满眼是double 甚至triple的老鼠KO模型了

b*y2012-10-16 07:10

16 楼

It doesn't work this way in really good labs. In those lab, each person has
his/her own defined project(s) and is responsible to make it(them) from
scratch.

【在 z*******1 的大作中提到】

: 楼上们说的很有道理。只是现在的结构生物学实验室好像确实有劳动密集型工厂之嫌。
: 见过一些挺牛的实验室，学生很多，分工明确，就重复的表达蛋白，长晶体，结结构。
: 几十个蛋白一起做，哪天哪个蛋白长出来好的晶体就发达了，出文章也快，发的也好。
: 但是学生好像没什么training，略水啊~~~~

C*I2012-10-16 07:10

17 楼

你说的那只是某一境界的lab。还有另一种境界的结构lab。我知道一个中国PI的lab，
人不多，各有课题。有时一篇文章只有两个作者。还经常是CNS。

【在 z*******1 的大作中提到】

a*q2012-10-16 07:10

18 楼

类似这次Brian Kobilka实验室就是一个很小的实验室，一直以来做晶体的也就一两个
人。

has

【在 b******y 的大作中提到】

: It doesn't work this way in really good labs. In those lab, each person has
: his/her own defined project(s) and is responsible to make it(them) from
: scratch.

b*y2012-10-16 07:10

19 楼

Exactly! And the (20 years of) study is worth a Nobel prize.

z*12012-10-16 07:10

20 楼

zheng ning?

【在 C*******I 的大作中提到】

: 你说的那只是某一境界的lab。还有另一种境界的结构lab。我知道一个中国PI的lab，
: 人不多，各有课题。有时一篇文章只有两个作者。还经常是CNS。

b*y2012-10-16 07:10

21 楼

He is a good guy.