CRISPR 序列分析问题请教# Biology - 生物学
m*i
1 楼
一颗小的grapefruit树，今天一看顶上的一片树叶上全是虫子，挺吓人的，要杀虫么
https://dl.dropboxusercontent.com/u/10291230/CAM00056.jpg
https://dl.dropboxusercontent.com/u/10291230/CAM00056.jpg
pc
2 楼
很好。。。直接用hdmi cable连电视,接上xbox的controller，很方便也很爽
就有一个问题，电视上显示探测到了1080p的信号，从surface也可以看到输出1080p
到second screen。可是实际现实出来的画面比屏幕稍大(可能1.05:1之类的）。。感觉
画面应该可以更加sharp一点。这是为啥呢？cable问题?
就有一个问题，电视上显示探测到了1080p的信号，从surface也可以看到输出1080p
到second screen。可是实际现实出来的画面比屏幕稍大(可能1.05:1之类的）。。感觉
画面应该可以更加sharp一点。这是为啥呢？cable问题?
f*e
3 楼
最近在做CRISPR突变，得到一些indel mutation。因为是hetrozygous， 所以不做TOPO
cloning就看不出每一个allele的序列是什么。
记得以前有人曾经提到过用一个软件可以直接分析heterozygous的indel mutation序列
，只是现在记不得了，不知有人知道有什么样的免费软件可以进行这方面的分析？另外
，这样的准确度有多高？是不是就不用TOPO cloning了？ 多谢指教！
cloning就看不出每一个allele的序列是什么。
记得以前有人曾经提到过用一个软件可以直接分析heterozygous的indel mutation序列
，只是现在记不得了，不知有人知道有什么样的免费软件可以进行这方面的分析？另外
，这样的准确度有多高？是不是就不用TOPO cloning了？ 多谢指教！
M*t
4 楼
蚜虫？
【在 m****i 的大作中提到】
: 一颗小的grapefruit树，今天一看顶上的一片树叶上全是虫子，挺吓人的，要杀虫么
: https://dl.dropboxusercontent.com/u/10291230/CAM00056.jpg
【在 m****i 的大作中提到】
: 一颗小的grapefruit树，今天一看顶上的一片树叶上全是虫子，挺吓人的，要杀虫么
: https://dl.dropboxusercontent.com/u/10291230/CAM00056.jpg
l*r
5 楼
怎么接Xbox controller? Wired or wireless? What games does it support?
l*e
6 楼
能读有三个前提,
第一只能有2个allele(或者一个...废话)
第二要结果测得还不错(废话)
第三至少要有一个是wildtype的allele
满足以上前提的话,自己就可以读.感觉比软件靠谱多了.
第一只能有2个allele(或者一个...废话)
第二要结果测得还不错(废话)
第三至少要有一个是wildtype的allele
满足以上前提的话,自己就可以读.感觉比软件靠谱多了.
m*i
7 楼
怎么贴图的？url放到browser里面可以看到图片，怎么在帖子里不显示出来
pc
8 楼
wired的可以直接连usb，wireless的话需要一个adaptor，微软有卖的
xbox live的game基本都support吧。。
【在 l*******r 的大作中提到】
: 怎么接Xbox controller? Wired or wireless? What games does it support?
xbox live的game基本都support吧。。
【在 l*******r 的大作中提到】
: 怎么接Xbox controller? Wired or wireless? What games does it support?
f*e
9 楼
我的情况就是有些复杂啊。三个allele……而且目前在突变体里从没有看到过WT，只要
有突变就是所有allele一起突变。唉，如果事情像你说的那样我也就自己读了啊。 想
想三个allele的TOPO clone 就头疼，纯体力劳动...
【在 l********e 的大作中提到】
: 能读有三个前提,
: 第一只能有2个allele(或者一个...废话)
: 第二要结果测得还不错(废话)
: 第三至少要有一个是wildtype的allele
: 满足以上前提的话,自己就可以读.感觉比软件靠谱多了.
有突变就是所有allele一起突变。唉，如果事情像你说的那样我也就自己读了啊。 想
想三个allele的TOPO clone 就头疼，纯体力劳动...
【在 l********e 的大作中提到】
: 能读有三个前提,
: 第一只能有2个allele(或者一个...废话)
: 第二要结果测得还不错(废话)
: 第三至少要有一个是wildtype的allele
: 满足以上前提的话,自己就可以读.感觉比软件靠谱多了.
a*1
10 楼
电视机需要scan一下才能正确当显示器
你用遥控器打开电视机的menu，貌似有个什么screening之类的选项，你试一下就行了
。
你用遥控器打开电视机的menu，貌似有个什么screening之类的选项，你试一下就行了
。
c*e
11 楼
为什么一定要知道序列？把它KO掉不就好了？
【在 f********e 的大作中提到】
: 我的情况就是有些复杂啊。三个allele……而且目前在突变体里从没有看到过WT，只要
: 有突变就是所有allele一起突变。唉，如果事情像你说的那样我也就自己读了啊。 想
: 想三个allele的TOPO clone 就头疼，纯体力劳动...
【在 f********e 的大作中提到】
: 我的情况就是有些复杂啊。三个allele……而且目前在突变体里从没有看到过WT，只要
: 有突变就是所有allele一起突变。唉，如果事情像你说的那样我也就自己读了啊。 想
: 想三个allele的TOPO clone 就头疼，纯体力劳动...
d*e
12 楼
有overscan，看电视机manual，调成原始分辨率
s*g
13 楼
pc
14 楼
回头试一下。楼上两位，多谢
【在 d*****e 的大作中提到】
: 有overscan，看电视机manual，调成原始分辨率
【在 d*****e 的大作中提到】
: 有overscan，看电视机manual，调成原始分辨率
l*e
15 楼
三个的话只有subclone,
因为从理论上,你无法把一个位置上的三个峰正确分配到三个未知的allele上
【在 f********e 的大作中提到】
: 我的情况就是有些复杂啊。三个allele……而且目前在突变体里从没有看到过WT，只要
: 有突变就是所有allele一起突变。唉，如果事情像你说的那样我也就自己读了啊。 想
: 想三个allele的TOPO clone 就头疼，纯体力劳动...
因为从理论上,你无法把一个位置上的三个峰正确分配到三个未知的allele上
【在 f********e 的大作中提到】
: 我的情况就是有些复杂啊。三个allele……而且目前在突变体里从没有看到过WT，只要
: 有突变就是所有allele一起突变。唉，如果事情像你说的那样我也就自己读了啊。 想
: 想三个allele的TOPO clone 就头疼，纯体力劳动...
C*n
16 楼
你筛了多少个突变子？遇到过三个allele 同样的突变吗？也就是Homozygous的情况。
【在 f********e 的大作中提到】
: 我的情况就是有些复杂啊。三个allele……而且目前在突变体里从没有看到过WT，只要
: 有突变就是所有allele一起突变。唉，如果事情像你说的那样我也就自己读了啊。 想
: 想三个allele的TOPO clone 就头疼，纯体力劳动...
【在 f********e 的大作中提到】
: 我的情况就是有些复杂啊。三个allele……而且目前在突变体里从没有看到过WT，只要
: 有突变就是所有allele一起突变。唉，如果事情像你说的那样我也就自己读了啊。 想
: 想三个allele的TOPO clone 就头疼，纯体力劳动...
z*t
17 楼
try mi-seq
【在 c********e 的大作中提到】
: 为什么一定要知道序列？把它KO掉不就好了？
【在 c********e 的大作中提到】
: 为什么一定要知道序列？把它KO掉不就好了？
f*e
18 楼
筛了四五十个，只有一个发生同源重组的是三个同样的突变，其他的突变体都是
heterozygous。我的问题在于，我不只是想把基因全本KO，还想研究基因的dosage效应
，所以还想要筛到只敲掉一个或者两个allele的突变体，难啊。
以前在euploid细胞里做突变的时候，倒是看到一些两个allele一样的突变，但是现在
变成三个allele，indel mutation就没有看到homozygous的情况了，可能allele太多了
吧，呵呵。
【在 C****n 的大作中提到】
: 你筛了多少个突变子？遇到过三个allele 同样的突变吗？也就是Homozygous的情况。
heterozygous。我的问题在于，我不只是想把基因全本KO，还想研究基因的dosage效应
，所以还想要筛到只敲掉一个或者两个allele的突变体，难啊。
以前在euploid细胞里做突变的时候，倒是看到一些两个allele一样的突变，但是现在
变成三个allele，indel mutation就没有看到homozygous的情况了，可能allele太多了
吧，呵呵。
【在 C****n 的大作中提到】
: 你筛了多少个突变子？遇到过三个allele 同样的突变吗？也就是Homozygous的情况。
C*n
19 楼
Great,你说得到一个homozygote。 我之前也问相同的问题。这里再请教一下，那据你
分析，为什么会有相同的突变出现？
【在 f********e 的大作中提到】
: 筛了四五十个，只有一个发生同源重组的是三个同样的突变，其他的突变体都是
: heterozygous。我的问题在于，我不只是想把基因全本KO，还想研究基因的dosage效应
: ，所以还想要筛到只敲掉一个或者两个allele的突变体，难啊。
: 以前在euploid细胞里做突变的时候，倒是看到一些两个allele一样的突变，但是现在
: 变成三个allele，indel mutation就没有看到homozygous的情况了，可能allele太多了
: 吧，呵呵。
分析，为什么会有相同的突变出现？
【在 f********e 的大作中提到】
: 筛了四五十个，只有一个发生同源重组的是三个同样的突变，其他的突变体都是
: heterozygous。我的问题在于，我不只是想把基因全本KO，还想研究基因的dosage效应
: ，所以还想要筛到只敲掉一个或者两个allele的突变体，难啊。
: 以前在euploid细胞里做突变的时候，倒是看到一些两个allele一样的突变，但是现在
: 变成三个allele，indel mutation就没有看到homozygous的情况了，可能allele太多了
: 吧，呵呵。
f*e
20 楼
最大的可能就是发生了同源重组吧 ：一条链先发生indel mutation，然后另外一条链
以这个突变的链为模版进行同源重组，然后就是homozygous了。
【在 C****n 的大作中提到】
: Great,你说得到一个homozygote。 我之前也问相同的问题。这里再请教一下，那据你
: 分析，为什么会有相同的突变出现？
以这个突变的链为模版进行同源重组，然后就是homozygous了。
【在 C****n 的大作中提到】
: Great,你说得到一个homozygote。 我之前也问相同的问题。这里再请教一下，那据你
: 分析，为什么会有相同的突变出现？
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