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关于SV40 poly A signal# Biology - 生物学
w*1
1
Wed, 27 Jun 2012 12:00:18 PDT
Earlier this week, The Next Web noted that some early purchasers of the
Retina MacBook Pro have been experiencing "ghosting" on their machines'
displays, with remnants of previously-displayed screen contents remaining
visible for some time afterward.
Some readers on the ASC forum have reported the image retention issue with
as little as 20 minutes worth of use. However it’s well worth noting that
the problem isn’t happening to everyone, and image retention isn’t
uncommon on IPS panels such as the one used in the new Pro.
Apple has reportedly been replacing machines affected by the issue, but
tight supplies of the Retina MacBook Pro could result in waits for the
replacement units.
Ghosting on Retina MacBook Pro display (Source: One More Thing)
DisplayMate's Ray Soneira notes on his news page that such behavior is not
restricted to IPS panels such as those used in the new Retina MacBook Pro,
suggesting that the issue is likely an early production problem that Apple
has perhaps already ironed out.
It used to be much more common, but now it's unusual to see it in a display.
The cause varies: an electrostatic build up, a chemical impurity build up,
a thermal imbalance, or an electronic levels issue within the panel.
Depending on the cause it can be better to leave the display on with a dark
uniform image, on with a bright uniform image, or turn the display off all
together.
Apple continues to cite shipping estimates of 3-4 weeks for new Retina
MacBook Pro orders amid high demand, and the company is apparently delaying
some early custom-configured orders from business customers by up to a month
from their original estimates.
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D*6
2
我准备买个thinkpad x220,因为没有光驱,准备另外买一个配上,什么牌子光驱比较
好?性能和价格都好?
好像在lenovo网站上买很贵耶。
包子答谢~~
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m*5
3
网上有两个版本,一个是长版本
ATCTAGATAACTGATCATAATCAGCCATACCACATTTGTAGAGGTTTTACTTGCTTTAAAAAACCTCCCACA
CCTCCCCCTGAACCTGAAACATAAAATGAATGCAATTGTTGTTGTTAACTTGTTTATTGCAGCTTATAATGG
TTACAAATAAAGCAATAGCATCACAAATTTCACAAATAAAGCATTTTTTTCACTGCATTCTAGTTGTGGTTT
GTCCAAACTCATCAATGTATCTTA
还有一个就是
TTACAAATAAAGCAATAGCATCACAAATTTCACAAATAAAGCA
一般做knock in contruct,是否后一个版本就足够drive knock in RNA 表达?
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L*y
4
这年头光驱没啥用了啊.

我准备买个thinkpad x220,因为没有光驱,准备另外买一个配上,什么牌子光驱比较
好?性能和价格都好?
好像在lenovo网站上买很贵耶。
包子答谢~~

【在 D******6 的大作中提到】
: 我准备买个thinkpad x220,因为没有光驱,准备另外买一个配上,什么牌子光驱比较
: 好?性能和价格都好?
: 好像在lenovo网站上买很贵耶。
: 包子答谢~~

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j*x
5
想要确保获得有效的RNA Polyadenylation,后一个可能是不够的。
狭义上的polyA signal,指的是RNA序列上的一个Conserved motif: AATAAA(AAUAAA)
。CPSF蛋白识别并结合该位点,在CstF的辅助下切割下游pre-mRNA,再由PAP完成加尾
。当然整个过程还需要其他一系列蛋白因子的共同左右,不细说了。
你的问题涉及到CstF这个关键因子,它识别并结合AATAAA下游一段GU rich region,对
于有效的RNA Polyadenylation processing是不可或缺的,尽管这段序列不像poly
signal motif那样具有比较严格的consensus sequence。而在你的第二个版本中,并没
有包含这段序列。

【在 m******5 的大作中提到】
: 网上有两个版本,一个是长版本
: ATCTAGATAACTGATCATAATCAGCCATACCACATTTGTAGAGGTTTTACTTGCTTTAAAAAACCTCCCACA
: CCTCCCCCTGAACCTGAAACATAAAATGAATGCAATTGTTGTTGTTAACTTGTTTATTGCAGCTTATAATGG
: TTACAAATAAAGCAATAGCATCACAAATTTCACAAATAAAGCATTTTTTTCACTGCATTCTAGTTGTGGTTT
: GTCCAAACTCATCAATGTATCTTA
: 还有一个就是
: TTACAAATAAAGCAATAGCATCACAAATTTCACAAATAAAGCA
: 一般做knock in contruct,是否后一个版本就足够drive knock in RNA 表达?

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A*s
6
Amazon上买个ASUS的外置刻录机即可
比如:
http://www.amazon.com/Asus-External-Optical-SDRW-08D2S-U-Black/

【在 D******6 的大作中提到】
: 我准备买个thinkpad x220,因为没有光驱,准备另外买一个配上,什么牌子光驱比较
: 好?性能和价格都好?
: 好像在lenovo网站上买很贵耶。
: 包子答谢~~

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m*5
7
非常感谢!
还有一个问题,挺多人设计knock in allelle,往往并未提及如何添加poly A
sequence,在这种情况下是什么原因

【在 j****x 的大作中提到】
: 想要确保获得有效的RNA Polyadenylation,后一个可能是不够的。
: 狭义上的polyA signal,指的是RNA序列上的一个Conserved motif: AATAAA(AAUAAA)
: 。CPSF蛋白识别并结合该位点,在CstF的辅助下切割下游pre-mRNA,再由PAP完成加尾
: 。当然整个过程还需要其他一系列蛋白因子的共同左右,不细说了。
: 你的问题涉及到CstF这个关键因子,它识别并结合AATAAA下游一段GU rich region,对
: 于有效的RNA Polyadenylation processing是不可或缺的,尽管这段序列不像poly
: signal motif那样具有比较严格的consensus sequence。而在你的第二个版本中,并没
: 有包含这段序列。

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D*6
8
哦。。。我觉得装软件的时候还是有光驱更方便。

【在 L*****y 的大作中提到】
: 这年头光驱没啥用了啊.
:
: 我准备买个thinkpad x220,因为没有光驱,准备另外买一个配上,什么牌子光驱比较
: 好?性能和价格都好?
: 好像在lenovo网站上买很贵耶。
: 包子答谢~~

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m*5
9
非常感谢你的提示
根据你的提示读了很多文章,得知GU rich sequence确实对于其process必不可少
但是又有一个很大的疑问:很多内源的polyA signal并不含有GU rich sequence,只有
AATAAA这个conserved motif,下游是一堆随机碱基,请问这种情况下polyA加尾是如何
实现的呢?
这是一个有共识的问题么?或者只是一个伪命题?

【在 j****x 的大作中提到】
: 想要确保获得有效的RNA Polyadenylation,后一个可能是不够的。
: 狭义上的polyA signal,指的是RNA序列上的一个Conserved motif: AATAAA(AAUAAA)
: 。CPSF蛋白识别并结合该位点,在CstF的辅助下切割下游pre-mRNA,再由PAP完成加尾
: 。当然整个过程还需要其他一系列蛋白因子的共同左右,不细说了。
: 你的问题涉及到CstF这个关键因子,它识别并结合AATAAA下游一段GU rich region,对
: 于有效的RNA Polyadenylation processing是不可或缺的,尽管这段序列不像poly
: signal motif那样具有比较严格的consensus sequence。而在你的第二个版本中,并没
: 有包含这段序列。

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j*x
11
其实分子生物学的反例太多,所谓规律很大程度上只是基于统计
举个例子,起始ATG有所谓Kozak consensus,但是这也只是大约70%的真核mRNA所“遵
循”的一个规律,仍大量的mRNA不符合这个规则一样可以翻译,甚至翻译的很好。
polyA processing这里是同样的问题,比如AATAAA并不绝对,TATAAA已经其他一些变体
也非常普遍,甚至没有这个polyA signal在下游其他一些motif的帮助下也一样可以完
成。GU rich region就更模糊了,要多少个repeats才算rich,怎么算?从哪里开始算
?这些都并不非常清楚,只能说,基于统计存在这个规律,同时在一些研究的比较透彻
的polyA signal序列中找到了一定的实验证据。至于是不是伪命题,你应该有你自己的
判断。

【在 m******5 的大作中提到】
: 非常感谢你的提示
: 根据你的提示读了很多文章,得知GU rich sequence确实对于其process必不可少
: 但是又有一个很大的疑问:很多内源的polyA signal并不含有GU rich sequence,只有
: AATAAA这个conserved motif,下游是一堆随机碱基,请问这种情况下polyA加尾是如何
: 实现的呢?
: 这是一个有共识的问题么?或者只是一个伪命题?

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t*t
12
if you already have desktop, you can shared the optical driver on it.
otherwise prepare an external.

【在 D******6 的大作中提到】
: 哦。。。我觉得装软件的时候还是有光驱更方便。
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m*5
13
非常感谢! 主要是我设计了一个漏掉了GU rich sequence的poly A 在我的knock in
sequence的尾端,现在已经拿到老鼠了,刚意识到这个问题。
现在不知道严重程度,因为还没有检测基因的表达

【在 j****x 的大作中提到】
: 其实分子生物学的反例太多,所谓规律很大程度上只是基于统计
: 举个例子,起始ATG有所谓Kozak consensus,但是这也只是大约70%的真核mRNA所“遵
: 循”的一个规律,仍大量的mRNA不符合这个规则一样可以翻译,甚至翻译的很好。
: polyA processing这里是同样的问题,比如AATAAA并不绝对,TATAAA已经其他一些变体
: 也非常普遍,甚至没有这个polyA signal在下游其他一些motif的帮助下也一样可以完
: 成。GU rich region就更模糊了,要多少个repeats才算rich,怎么算?从哪里开始算
: ?这些都并不非常清楚,只能说,基于统计存在这个规律,同时在一些研究的比较透彻
: 的polyA signal序列中找到了一定的实验证据。至于是不是伪命题,你应该有你自己的
: 判断。

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D*6
14
是呀,就是没有desktop,所以才想着买个轻便的没有光驱的笔记本出门的时候不沉,
加上一个外接光驱用着方便。

【在 t****t 的大作中提到】
: if you already have desktop, you can shared the optical driver on it.
: otherwise prepare an external.

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j*x
15
Relax. Life will find a way.

【在 m******5 的大作中提到】
: 非常感谢! 主要是我设计了一个漏掉了GU rich sequence的poly A 在我的knock in
: sequence的尾端,现在已经拿到老鼠了,刚意识到这个问题。
: 现在不知道严重程度,因为还没有检测基因的表达

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A*s
16
should be fine
optical storage will be in garbage within 5 years

【在 D******6 的大作中提到】
: 对呀,我也看到这个了,就是不知道质量怎么样,谢谢推荐~~
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m*5
17
Thank you!

【在 j****x 的大作中提到】
: Relax. Life will find a way.
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m*5
19
I still want more suggestion
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m*5
21
up…………
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c*r
22
做个虚拟光驱, U盘拷进去不行?
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m*5
23
upup
avatar
H*8
24
搭车问个问题,我在某个基因内部插入cre 基因,cre基因的终止子后面就没放poly a
,转录出来的mRNA是融合的,翻译成蛋白的时候能不能在cre 终止子处终止翻译呢?
谢谢!
avatar
j*x
25
你这个问题的表述里面基本概率有些问题啊,你说的终止子是指终止密码子吗?如果是
的话,能不能终止要看是否in frame reading

a

【在 H*********8 的大作中提到】
: 搭车问个问题,我在某个基因内部插入cre 基因,cre基因的终止子后面就没放poly a
: ,转录出来的mRNA是融合的,翻译成蛋白的时候能不能在cre 终止子处终止翻译呢?
: 谢谢!

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H*8
26
如果是在in frame reading,我就想知道,如果没有poly a,能不能够在终止密码子处
停止翻译。 不要说理论的,我想理论上是可以的。我想知道有没有人有这方面的经历。

【在 j****x 的大作中提到】
: 你这个问题的表述里面基本概率有些问题啊,你说的终止子是指终止密码子吗?如果是
: 的话,能不能终止要看是否in frame reading
:
: a

avatar
j*x
27
sorry,你的描述我没看懂。
你的问题如果不能表述清楚,别人没法帮你

历。

【在 H*********8 的大作中提到】
: 如果是在in frame reading,我就想知道,如果没有poly a,能不能够在终止密码子处
: 停止翻译。 不要说理论的,我想理论上是可以的。我想知道有没有人有这方面的经历。

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j*x
28
sorry,你的描述我没看懂。
你的问题如果不能表述清楚,别人没法帮你

历。

【在 H*********8 的大作中提到】
: 如果是在in frame reading,我就想知道,如果没有poly a,能不能够在终止密码子处
: 停止翻译。 不要说理论的,我想理论上是可以的。我想知道有没有人有这方面的经历。

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m*5
29
我觉得这里就不是inframe 不inframe的问题了
你的cre前面如果没有IRES根本就没机会表达
如果有IRES,polya和translation是否终止没关系

历。

【在 H*********8 的大作中提到】
: 如果是在in frame reading,我就想知道,如果没有poly a,能不能够在终止密码子处
: 停止翻译。 不要说理论的,我想理论上是可以的。我想知道有没有人有这方面的经历。

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