Nat Commun：科学家识别出驱动结肠癌发生的关键新型基因

相比正常组织而言，肿瘤往往会表现出增强的重编程效应，其病因主要归咎于细胞内在的基因组改变。近日，一篇发表在国际杂志Nature Communications上题为“A local tumor microenvironment acquired super-enhancer induces an oncogenic driver in colorectal carcinoma”的研究报告中，来自西奈山医学院等机构的科学家们通过研究识别出一种对结肠癌生长非常重要的新基因，同时还发现，肿瘤周围外部环境中的炎症或许会导致肿瘤细胞的生长。

这项研究中，研究人员通过研究首次发现，结肠癌肿瘤周围的环境或许能对所谓的“超级增强子”（super enhancer）进行重编程，其是一种复杂的DNA区域，拥有较高浓度的能控制细胞是否恶变的转录机器。这种超级增强子在细胞所有增强子中占到了1%-2%的比例，其能调节PDZK1IP1基因，该基因此前被识别为癌基因。一旦研究人员剔除PDZK1IP1基因，结肠癌的生长就会减缓，这或许就表明，PDZK1IP1及其超级增强子能作为新型抗癌疗法的作用靶点。

图片来源：Nature Communications (2022). DOI:10.1038/s41467-022-33377-8

研究者Royce Zhou说道：“在美国，结肠癌是第三大流行和第二大致死性癌症，这种癌症依赖于手术进行治疗，而免疫疗法的出现彻底改变了结肠癌患者的治疗模式，但其仅对一小部分患者有效，这就是为何科学家们需要识别出新型作用靶点的原因了。”

本文研究结果表明，超级增强子或许能被肿瘤微环境中的周围炎症所激活，这种炎症能允许癌细胞在一种其原本不会生存的环境中生存，炎性肠病就是结肠癌发生的已知风险因素，本文研究还能帮助研究人员理解结肠癌发生的新型分子机制。

Ramon Parsons博士说道，对于大部分结肠癌患者而言，这意味着肿瘤中所发生的炎症会促进肿瘤的生长，这或许强调了研究人员通过预防或理解饮食对结肠微环境的影响，进而遏制结肠中炎性效应的重要性；在治疗方面，如今有遗传证据表明，靶向作用特殊基因实际上能抑制肿瘤进展，而通过理解所有的组分，研究人员或许就拥有特殊工具能尽可能地预防结肠癌的发生。

本文研究发现是通过对15名结肠癌患者术后的活体肿瘤组织和周围的健康组织进行研究来实现的，能够准备和分析活细胞或许就能帮助研究人员观察肿瘤微环境以及诱发结肠癌的遗传和生物学驱动因素。

研究者Parsons表示，我们拥有直接来自手术室的活体标本活细胞，这或许就能让我们立即测定肿瘤的表观遗传状态，如果没有西奈山医院的基础设备或许就无法实现。

综上，本文研究结果强调了对来自结肠癌患者的原始标本进行表观基因组分析的意义和重要性。

原始出处：

Zhou, R.W., Xu, J., Martin, T.C. et al. A local tumor microenvironment acquired super-enhancer induces an oncogenic driver in colorectal carcinoma. Nat Commun 13, 6041 (2022).doi：10.1038/s41467-022-33377-8