世界首个!建成公众号新闻2023-04-12 04:04◎ 蒋朝常 科技日报记者 吴纯新近日,华中农业大学张建伟教授课题组联合国内外高校与科研团队,以代表亚洲稻群体结构的高质量基因组为对象,构建并全面分析基因组倒位图谱,建成了世界上首个基于同源基因簇的水稻泛基因组综合数据库——水稻基因索引数据库。相关研究成果已在《自然·通讯》与《分子植物》发表。图片来源:视觉中国张建伟介绍,全球有约五百万份水稻种质及其野生近缘种,这些资源的基因组变异中(单核苷酸多态性、插入缺失、倒位和易位等)蕴藏着品种改良的重要信息,对其开展基于泛基因组的多组学研究具有重要意义。水稻基因索引数据库能为用户提供丰富的模块和工具,方便研究人员对不同种质基因以及基因同源关系进行查询、分析和可视化,为全球水稻研究学者提供免费在线检索和分析服务。该平台为每个水稻基因建立一张“综合图文信息卡片”,实现不同功能和常用数据库之间的快速链接,记录包括OGI、基因通用名、序列、功能、表达等基本信息,并以可交互示意图展示该基因转录本结构、可变剪接事件、同源关系网络图和系统发育树等。研究人员可以通过关键词、序列、同源关系等三种方式在数据库中进行搜索,并在微观和宏观尺度对种质间基因组共线性进行分析和可视化。来源:科技日报编辑:王宇审核:朱丽终审:王郁微信扫码关注该文公众号作者戳这里提交新闻线索和高质量文章给我们。来源: qq点击查看作者最近其他文章