简单5张图，用最简单生信SCI的模板套路复现！快速发表毕业就它了！
本文主要研究类风湿关节炎与性别相关的差异表达基因，只用了简单的5张图，可以说是最简配生信SCI的模板套路啦~大家可以跟着一起复现，轻松入门非肿瘤生信研究！
思路：
通过对数据集进行去批次校正合并，完成差异分析。
找到两个数据集中共同的DEGs（完成合并的话显示的就是共同的DEGs，如果没有合并需要分别将两个数据集的上调和下调分别取交集）
通过的DEGs完成富集分析和ppi互作网络（MCC）
使用工具：
1，仙桃生信工具（https://www.xiantao.love/）
2，Metascape数据库（http://metascape.org/）
3，String数据库（https://cn.string-db.org/）
4，Cytoscape
使用仙桃生信工具-数据集检索
输入数据集（本文中两个数据集都是仙桃收录可直接清洗，文章中进行数据集合并）
将选择的样本分组，提交分析，下载结果
分析后的结果部分
校正前后boxplot
Pca图
差异分析火山图，热图
下载差异分析表格
通过阈值筛选基因|logFC|＞1 padj＜0.05
升序降序调整top前50基因（文章热图展示结果）
使用公共数据库在线分析
将DEGs整理成新的表格
输入基因列表
提交分析
结果下载
输入基因，选择物种
结果下载后，使用cytoscape进行可视化调整
上传下载的文件
画圆
常用参数
下载插件
点击calculate
选择mcc算法
调整参数
结果部分
画圆（同上一步一样）
下载结果（不下载也可以）。
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来源: qq
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