郑春福教授等JMV新文章揭示SARS-CoV-2免疫逃避的关键等位基因

2023-09-13 01:09

近日郑春福教授与合作者在Journal of Medical Virology (JMV) 发表新文章：The binding profile of SARS-CoV-2 with HLA polymorphisms reveals critical alleles involved in immune evasion (SARS-CoV-2与HLA多态性的结合谱揭示免疫逃避的关键等位基因)。

JMV 2023年最新影响因子12.7，在所有的SCI杂志中排名341. 值得一提的是，6月底最新影响因子出来之后，10分以上杂志从去年的1000多本腰斩至517本。

由 SARS-CoV-2 引起的 COVID-19 大流行导致数百万人死亡。由于病毒新突变和免疫逃避，SARS-CoV-2的传播力非常迅速。然而，相关机制仍不清楚。本研究从T-CoV数据库中获得SARS-CoV-2变异体与HLA多态性之间的亲和力数据。文献中确定了关注变体(VOC)的流行病学数据。HLA蛋白序列从 IPD-IMGT/HLA获得。使用AlphaFold预测蛋白质结构，并使用PrankWeb 3预测HLA分子的结合位点。结果获得了 SARS-CoV-2 毒株与不同 HLA 蛋白的结合亲和力，并鉴定了 31 个风险等位基因。随后的结构预测确定了这些 HLA 蛋白中的 10 个可能促进免疫逃避的活性结合位点。特别地，还发现与 HLA I 类多态性的弱结合能力可能有助于 Omicron 的免疫逃避。总之，本研究重点关注 HLA 多态性与 SARS-CoV-2 毒株的结合亲和力及其与 SARS-CoV-2 免疫逃避的关系。研究结果对于防止 SARS-CoV-2 的免疫逃避具有重要意义，并为疫苗设计提供了新的见解。

图1. 不同SARS-COV2毒株与蛋白质结合的HLA等位基因的累积数量.

图2. HLA分子结合SARS-COV2肽

图3. S蛋白在VOC中的结合亲和力变化.

图4. 风险等位基因种族差异的筛查和分析。

图5. 关键多态性结合位点的预测.

图6. Omicro不同分支的HLA多态性及免疫逃避.

郑春福教授，入选Elsevier 2021/2022年全球Top 1%顶尖科学家榜单，中国科学院百人计划入选者；加拿大University of Calgary Adjunct Professor，在I型单纯疱疹病毒（HSV-1）感染与宿主相互作用的分子机制研究、HSV-1逃逸宿主抗病毒天然免疫研究中取得突破性研究成果，在Lancet Microbe (IF 86.208), Trends in Microbiology (´2; IF 18.230), Microbiology and Molecular Biology Reviews (封面文章, IF 13.044), Journal of Virology (´28，其中1篇为封面文章，2篇为亮点文章; IF 6.549), FEMS Microbiology Reviews (IF 15.177), Blood (IF 25.476), Cell Host & Microbe (IF 31.316), Signal Transduction and Targeted Therapy (IF 38.104), Journal of Medical Virology (´15; IF 12.7), Cytokine & Growth Factor Reviews (´2; IF 17.660), Reviews in Medical Virology (IF 11.043), Proceedings of the National Academy of Sciences USA (IF 12.173), mBio (IF 7.786), J Clin Microbiol. (IF 11.677), Journal of Biomedical Science (IF 12.771), Cellular and Molecular Life Sciences (´2; IF 9.207), Journal of Immunology (2篇, IF 5.426), Protein and Cell (IF 15.328; 2篇)，等主流期刊发表SCI 论文120余篇，总引用次数5000余次, H-index为38。

郑春福教授担任多个顶级期刊杂志的编辑和编委

mBio; JVI; CMLS; TBED; VJ; JMV; Microbes and Infection; Int. Immunophmaco.; J. of Innate Immunity; Virology; etc.

郑教授参与审稿的部分杂志：

Nature Microbiology, Lancet Microbe, Journal of Virology, Nature Comm, Advanced Material, Signal Transduction and Targeted Therapy, Cell Host & Microbe, Seminar in Immunology, Microbiome, Cell Report, PLoS Pathogen, Molecular Therapy, Cellular Molecular and Immunology, Acta Pharmaceutica Sinica B, Theranostics, Reviews in Medical Virology, Emerging Microbes and Infections, Bioactive Materials, Metabolism, etc.

郑春福还荣获2019全球Publons同行评议奖(微生物学领域TOP1%) 获得者，2019-2021连续三年荣登Journal of Virology杂志年度同行评议排行榜(TOP25, 年度审稿15-20篇)。2021年Frontiers杰出编辑奖，2022年Springer Nature杰出编辑奖。

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