Knowledge is power.
Bringing medical advances from the lab to the clinic.
关键词：大数据分析；新冠数据库；学术
2022年9月28日，美国Albert and Mary Lasker基金会宣布了2022年度拉斯克奖的五名获奖者【1】，来自于美国约翰·霍普金斯大学的Lauren Gardner获得公共服务奖，以奖励其对“创建 Covid-19 仪表板，为实时传播权威公共卫生数据设定了新标准。”Lauren Gardner创建的 COVID-19开放数据库，已经成为实时传播权威公共卫生数据设定了新标准。通过启动这一全球 COVID-19 监测工具，她提供了有关新发传染病传播的可访问且可靠的信息，从而填补了国际公共卫生系统的空白并建立了可效仿的模型。这一开创性的资源在大量错误信息环绕的网络中，为民众知情和个人选择开辟了道路。在读纽约时报的报道中，有一个细节让我很感动【2】。On Jan. 21, 2020, a doctoral student of hers, Ensheng Dong, approached her about tracking cases of a novel pneumonia in his home country, China. Mr. Dong had the tools: He could mine Chinese websites for early case data, and he knew how to build online maps. （2020 年 1 月 21 日，她的博士生Ensheng Dong来找她，询问在他的祖国中国追踪新型肺炎的病例。董先生有工具：他可以挖掘中国网站以获取早期案例数据，并且他知道如何构建在线地图。）而在拉斯克奖网站的介绍中，指出“初期，Gardner 的团队对中国数据的追踪依赖中国医疗专业人士在线社区 DXY.cn（丁香园 - 编者注）”。
（约翰·霍普金斯的“系统科学与工程中心”新冠数据库的表盘。截图于2022年9月29日）
由此，我们更关心的是：约翰·霍普金斯的“系统科学与工程中心(CSSE)”的新冠数据库如何在众多数据库中脱颖而出？新冠病毒数据库创建的其他两个关键角色（董恩生和丁香园）如何了？
（我们最早期关注的新冠来源站点）
初期，我们使用最多的是丁香园公布的病例报告及地图。为了更多掌握中国内地以外的病例信息及了解这个传染病，我们收集到了很多在线资源。既包括美国CDC和中国CDC的新冠专区，也有新英格兰医学杂志（NEJM）这样学术期刊的新冠专题，还有科学家的推特，更包括众多的开放数据库。这些数据库由牛津大学、约翰·霍普金斯大学及其他机构创建。近三年过去了，这些网络资源及数据库都在人们了解疫情、科学家研究疫情、政府监测疫情中起到重要作用。
但作用最大的无疑是约翰霍普金斯大学CSSE的新冠数据库，及牛津大学“数据世界”根据CSSE数据库做的可视化网站。（Gardner 与 COVID-19 仪表板。图源：Lasker Award）
沿着拉斯克奖官网的介绍，我们一起看美国约翰·霍普金斯的Lauren Gardner如何获得成功的。（A bright idea for research, a golden idea for humanity）美国约翰·霍普金斯大学的Lauren Gardner教授研究人们的行为以及其他因素如何影响疾病传播。2020 年 1 月 21 日，她与研究生董恩生（Ensheng Dong）会面，讨论疫苗犹豫如何导致麻疹风险。过程中，董同学提到，他最近在关注着祖国新出现的新冠肺炎病例，自己有技术通过网络地图追踪和显示这些病例分布。最开始他们也只是认为这只是小众人群关注的信息，所以使用名为 Esri 公司开发的可视化软件、董同学把数据库建在自己的google服务中。八个小时后，董同学即建好页面。红点的大小代表病例数，总共 322 例，点缀在一张亚洲地图上。2020年1月22日，Lauren Gardner教授通过推特宣布：“我们正在实时跟踪 2019-nCoV 的传播情况。案例和地点可以在这里查看；可供下载数据。”
（2020年1月22日，Lauren Gardner发布了对于该数据库上线第一天的推特。图源：Lauren Gardner的推特）
他们也没有想到新冠疫情会席卷地球，蜂拥而至的访问者很快崩溃了原有的服务器。由此该团队将资源移至 GitHub，这是一个基于 Internet 的数据存储库服务，还包含通信和文档功能。到月底，该资源已收到超过 10 亿条信息请求。最初，Gardner 的团队依赖中国医疗专业人士在线社区 DXY.cn，该网站按中国各省和其他国家/地区跟踪病例，尽管该网站没有及时报告中国以外的病例。下图是“Hanson临床科研”公众号于2020年1月21日采用的丁香园疫情地图（只有中国疫情图，而没有海外疫情图。）。
就在这一天，约翰·霍普金斯大学的新冠疫情图，以丁香园数据为基础发布。
尽管当时日本、韩国、泰国、美国都已经有了新冠病毒，但由于约翰·霍普金斯大学的新冠疫情图数据来自于丁香园，所以只是展示了亚洲的情况地图。
但约翰·霍普金斯大学的新冠疫情图已经超过了丁香园的展示范围。
从这天起，“从学习、到超越”被再现。
🔺我们公众号于2020年1月21日采用的丁香园疫情地图。丁香园只做了中国疫情图，而忽视了海外疫情图。就在这一天，约翰·霍普金斯大学的新冠疫情图，以丁香园数据为基础发布。截图来源：Hanson临床科研公众号。
随着病毒的扩散，科学家们手动梳理了非常规的信息来源--例如媒体渠道和公共卫生官员的推特帖子。但随着疫情爆发成大流行病，手动搜索数据变得不可持续。Gardner 在系统科学与工程中心的研究小组和她在约翰·霍普金斯大学应用物理实验室领导的另一个小组编写了计算机程序，以自动从每个来源“抓取”数据。他们还开发了异常检测软件，可以标记可疑的数据变化，并在团队调查这些突然的偏差是否真实时保留这些数据。Gardner 的团队审查每条有问题的数据，找出突然飙升或下降的原因。只有在验证它之后，他们才会在 GitHub 中发布它，它会提供地图。
通过这种质量控制机制，最多程度控制了错误信息被传播到仪表板。
（Information epidemic）
约翰·霍普金斯大学的新冠数据库已经成为全球最可靠的新冠信息来源。尽管许多机构、市政当局和国家建立了自己的新冠数据库，但 Gardner 的空间分辨率在大型数据聚合器中是无与伦比的。它仍然是大流行病的流行病学记录的金标准，并将继续发挥重要作用，因为人们回顾性研究 Covid-19 并制定公共卫生数据收集、监测和显示的方法。通过她富有远见的工作， Gardner 构想并推出了一个开创性的数据库，使世界第一次能够观察大流行病的发展过程，她将未来的健康危机与这一基准挂钩。及时、准确和可获取的信息，对于制定灵活合理的策略来对抗迅速蔓延的疫情至关重要。通过提供对新冠疫情最快速而准确的信息传递，美国约翰·霍普金斯大学的Lauren Gardner团队创建的新冠数据库使公众、媒体、政策制定者、企业和学者能够跟踪新冠病毒的传播，做出明智的决定以降低风险。除此之外，我们更应该记住董恩生（Ensheng Dong）这个名字。
（Ensheng Dong）
董恩生更是充分运用自己的知识，一起改写了流行病监测的方式。
（董恩生的研究被引用次数接近1万次，即达到Top级学者之列）
在完成对整个故事的回顾后，我们更想请教朋友们三个问题。
很难。初创者的个人能力和意愿将是做大的最大制约。因为想到一件事很容易，做成不易、想做到最强则极难。
看看Lauren Gardner怎么做到的。创意来自于学生、技术来自于学生，面对这种情况，Lauren Gardner2），最重要的是把握住了宣传出口。第一时间在推特上宣布“我们做到了！”。3），根据需要招募和创建新团队，将自己置于领导者的位置。Lauren Gardner坚持做：招人做强业务、自己全力推广。
（推广：Gardner与科学记者讨论她的仪表板。图源：Lasker Award）
2，个人如何避免被挤出核心圈？
说实话，我们很为董恩生鸣不平。
创意是董恩生的、最初的构建是董恩生的。但是不仅奖项与他无关，搜索美国媒体，对于他的报告很罕见。
要知道，很多诺贝尔奖会同时奖励导师及其学生。
不知具体情况，我们不做太多评价。
只是想说一下美国朋友圈讨论最多的：为什么技术最好的中国人总干最苦最累的活、而印度人却占据了美国最大公司的大部分CEO位置？
我的观点是：个人意愿决定了大结局。
刚来美国时在实验室工作。我是最勤奋的，出的研究结果和论文也最多。与比我早来2个月的印度人在一个房间办公，她的工作量不到我的1/3，但是她每天都会去老板娘那里沟通。两年后，我成了实验室干活的主力，一遇到难做的实验，我成了第一接盘侠啃硬骨头身心疲惫；而她，成了大半个lab manager。他在小学二年级时的team一共三个人，另外两个分别是印度孩子和美国孩子。儿子回来给我抱怨，说他相当team leader，却总是印度孩子做。“可是他什么都不干！”。美国孩子只沉浸于做事、不想当组长；我儿子既做事、还想到组长；那个印度孩子几乎不做事，但是挨个沟通，还经常跑到别的组及找老师沟通。结果老师感觉成绩都是印度孩子的。
今年暑假去海边度假，我带两个孩子在海边筑长城，为此特意买了铲子。长城建得很雄伟，很多路过的人拍照。这时，跑过来两个印度孩子，要求加入；然后就开始向来往的人及其父母展示“他们的工作”。过程中，大些的印度孩子跟我要我正在用的铲子，我直接拒绝。然后他转向我儿子要用他正在用的小铲子，我儿子说等自己用完之后给他用。最后这个印度孩子转向我家四岁的女儿，借用她正在用的水桶；女儿爽快地给了他，然后自己无趣地看我们玩。我没有干预，但当时在想，如果我的孩子们看到别人的成功，他也想成功、会怎么做？他们几乎都会自己独立地、从头开始做类似的构建。而很明显，印度孩子则不仅直接接盘了别人的成果、还意图占走基本资源。讲这三个故事，我只是想表述：我们在做事时、对自己的最终定位，决定了我们早期的行动方案，也直接决定了自己以后的位置。
很多时候，我们努力做一个我们自认为勤奋、正直、善良的人，并不屑于争抢位置；但领导却会认为任劳任怨是你愿意做的、或者这就是你适合的位置；而其他人却利用你的退缩，而抢功上位。只是一个学生角色？还是项目的管理者、甚至一个未来公司的创建者？这个定位决定了他继续闷头做挖掘，还是借助这个项目推广自己、及提升自己的管理能力。3，丁香园为什么没有做出约翰·霍普金斯大学新冠数据库？丁香园的新冠病例报告板创建的最早，董同学最初用的数据也全来自于丁香园；结果却是：丁香园在这个改写了公卫流行病监测方式的“新冠动态报告板发展”史，只存在于一句描述的话语中。
而对比本文中同样展示2020年1月21日新冠疫情的DXY图和CSSE图，你会发现：尽管来源于丁香园的数据，尽管约翰·霍普金斯大学CSSE图还是只展示亚洲（当时美国已经有了病例），但从那时起，疫情报告就不被局限于仅展示中国的疫情。
初心，即决定了大结局。
【1】 https://laskerfoundation.org/winners/noninvasive-prenatal-testing-using-fetal-dna/【2】 https://www.nytimes.com/2022/09/28/health/lasker-award-medical-research.html
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Hanson临床科研团队，由6位在美国的医生及医学科学家组成；目前在美国主要从事新药研发和临床科研。
