請教：how to identify metastasis-related genes in cancer# Biology - 生物学
a*u
1 楼
上次發了一個關於tumor suppressor gene 的帖子，得到大家的熱情指教。因為本人以
前不是做 cancer的，很多問題很糊塗，也找不到人討論，希望大家多多指教。
今天聽了本實驗室一個 韓國來的volunteer postdoc 的data presentation, 他的
project 是identify 某種 cancer 的metastasis driver基因。前面我說過，我們老板
是醫生，不懂research， 都是二老板指導我們做。這個韓國postdoc 是這麼做的：拿
來一個egfr mutation 的細胞株，提rna，做miroarray, 得到的結果跟public
database里另一個 egfr mutation的細胞株結果比較，他把 fold 設在1.5的時候找到
這兩個細胞株共同上調（相對於parental cell)的基因是41个，fold 設在2.0的時候是
7个，他然後用realtime pcr confirm, 找出大概五個基因，然後再用western blot最
後只剩 1－2个是real 上調的，然後他找到這個基因的相關 background， 有一些
paper(我看他列出的都是一些小paper）說這個基因跟metastasis 有關，然後就很興奮
，準備大幹下去。
我覺得這個project這麼develop似乎有問題，但具體我說不出來。哪位做cancer 的同
學上來說說這樣做reasonable嗎？缺陷在哪呢？
主要相弄明白心中這個疑問，另外也為這個韓國人著急，他是自費過來的，md 出生，
已經來了一年了，想博一篇好paper回去找工作，
前不是做 cancer的，很多問題很糊塗，也找不到人討論，希望大家多多指教。
今天聽了本實驗室一個 韓國來的volunteer postdoc 的data presentation, 他的
project 是identify 某種 cancer 的metastasis driver基因。前面我說過，我們老板
是醫生，不懂research， 都是二老板指導我們做。這個韓國postdoc 是這麼做的：拿
來一個egfr mutation 的細胞株，提rna，做miroarray, 得到的結果跟public
database里另一個 egfr mutation的細胞株結果比較，他把 fold 設在1.5的時候找到
這兩個細胞株共同上調（相對於parental cell)的基因是41个，fold 設在2.0的時候是
7个，他然後用realtime pcr confirm, 找出大概五個基因，然後再用western blot最
後只剩 1－2个是real 上調的，然後他找到這個基因的相關 background， 有一些
paper(我看他列出的都是一些小paper）說這個基因跟metastasis 有關，然後就很興奮
，準備大幹下去。
我覺得這個project這麼develop似乎有問題，但具體我說不出來。哪位做cancer 的同
學上來說說這樣做reasonable嗎？缺陷在哪呢？
主要相弄明白心中這個疑問，另外也為這個韓國人著急，他是自費過來的，md 出生，
已經來了一年了，想博一篇好paper回去找工作，