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问一个关于cDNA的问题。

问一个关于cDNA的问题。# Biology - 生物学

I*W2012-04-20 07:04

1 楼

如果一个human的cDNA sequence不能够在human genomic sequence上找到相应的位置，
说明什么？
我感兴趣的一个cDNA sequence，是从human的特定组织cDNA library sequencing得到
的，但是当我Blast这个cDNA找不到任何match的序列（对，是任何，包括human和其他
）。所以觉得很奇怪，是blast的问题，还是根本就是contanmination或者是Chimera
gene?

I*W2012-04-20 07:04

2 楼

自己顶一下！

s*y2012-04-20 07:04

3 楼

大部分情况下，是blast 选项的问题。
极少情况下，可能是病毒感染的DNA

【在 I***W 的大作中提到】

: 如果一个human的cDNA sequence不能够在human genomic sequence上找到相应的位置，
: 说明什么？
: 我感兴趣的一个cDNA sequence，是从human的特定组织cDNA library sequencing得到
: 的，但是当我Blast这个cDNA找不到任何match的序列（对，是任何，包括human和其他
: ）。所以觉得很奇怪，是blast的问题，还是根本就是contanmination或者是Chimera
: gene?

I*W2012-04-20 07:04

4 楼

主要是觉得这个cDNA不应该在这种组织里出现，所以才怀疑是不是污染了其他的东东。
我在调整一下Blast的参数试一下。
Thanks a lot!

【在 s******y 的大作中提到】

: 大部分情况下，是blast 选项的问题。
: 极少情况下，可能是病毒感染的DNA