超赞的免疫浸润分析网站，数据挖掘新高度！

肿瘤的发生发展与肿瘤微环境是密不可分的，肿瘤微环境中的免疫浸润不但影响着肿瘤的进展，更关系着肿瘤治疗的方式与疗效。

今天为大家介绍两个评价肿瘤免疫浸润的数据库，不费吹灰之力即可了解你所关注的肿瘤的免疫浸润情况。

网址：http://timer.comp-genomics.org/

TIMER是一个全面的资源，系统地分析不同癌症类型的免疫浸润，目前TIMER数据库已经升级到了TIMER 2.0版本。

在这个页面中可以看到该数据库不仅能探索基因与肿瘤免疫浸润的关系，还可以探索基因表达、临床预后以及基于不同算法的肿瘤免疫浸润等模块。

今天先为大家首先介绍TIMER最常用的使用——评价某肿瘤中某基因与该肿瘤免疫细胞浸润的关系。

以探索TGFB1在肾癌（KIRC）中与肿瘤细胞免疫浸润的关系为例。

选择Immune 条目的Gene模块下，在Gene expression中输入TGFB1，在下方选择T cell CD8+。

除此之外我们还可以选则T cell CD4+，B cells，Tregs，Neutrophil等20种免疫相关细胞。点击下方下载（根据需求三选一），我们以JPG为例。

从图片中找到KIRC，第一列是基于TIMER数据库自身得到的结果，发现TGFB1与CD8+T cells相关性较弱。

同样，我们探索了CD4+Tcells，Tregs，Macrophages及MDSC，从图中我们观察到，TGFB1与Tregs，Macrophage和MDSC呈较强的正相关，一定程度说明TGFB1高表达与KIRC的免疫抑制呈正相关。

同样，我们可以在TIMER 1.0进行同样的探索。

Submit后得到上图所示的结果，小伙伴们可根据自己的喜爱选择合适的图。

网址：http://cis.hku.hk/TISIDB/index.php

TISIDB是一个肿瘤与免疫系统交互的门户网站，整合了多种异构数据类型。

在输入框中输入TGFB1，点击Submit。 

点击TGFB1

选择Lymphocyte

找到KIRC，可以得到TGFB1在KIRC中与免疫细胞浸润的初步关系，随后可以在右侧选择具体的免疫细胞进行研究，如：Treg。

通过以上操作，可以得到在KIRC中，TGFB1与Treg表达呈正相关，R=0.281，P＜0.05。