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茅台集团微生物研究团队顶刊发表“菌群识别技术”重要成果

茅台集团微生物研究团队顶刊发表“菌群识别技术”重要成果

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一种基于MALDI-TOF MS对微生物群样本进行分型的方法

导  读

近期,茅台集团微生物研究团队王莉研究员(通讯作者)等在中科院生物学1区Top国际期刊Microbiology Spectrum(Q1,IF=9.043)发表了题为“MALDI-TOF MS Is an Effective Technique To Classify Specific Microbiota”的研究论文。宁波大学余绍宁教授为共同通讯作者。
该研究选用不同浓度的九种细菌菌株构建了20种特定的微生物群,使用MALDI-TOF MS收集其重叠光谱,通过层聚类分析(HCA)对每个微生物群的重叠光谱进行分类。虽然特定微生物群的MS谱图与组分细菌的重叠谱图不同,但是特定微生物群的MS谱图表现出优异的重复性,并且更容易通过HCA进行分类,准确度接近90%。这些结果表明,广泛使用的单个细菌的MALDI-TOF MS鉴定方法可以扩展到微生物群的分类。

研究亮点

  • 提出了一种基于MALD-TOF MS能直接应用于混菌的鉴定识别方法。
  • 验证了基于MALDI-TOF MS区分混菌的方法的可行性(准确度近90%)。

研究结论

  • MALDI-TOF MS可直接用于对特定模型微生物群进行分类。另外,模型微生物群的实际MS谱并不是由单个细菌谱以一定比例的简单叠加,而是具有特定的光谱指纹。该指纹的特异性可以提高基于MALDI-TOF MS微生物群分类的准确性。
  • 该项研究结果表明,MALDI-TOF MS 技术可实现单个微生物至微生物群的广域性分类鉴定,首次将 MALDI-TOF MS 对单一微生物鉴定,拓展到在大曲等体系混合菌系识别的全新应用。

图文赏析

图1. 基于 MALDI-TOF MS 的微生物群分类工作流程
图2. 20个特定模型微生物群的重叠光谱

图3. 基于HCA的重叠光谱分类。红线表示模型微生物群区分的阈值,绿点表示模型微生物群正确聚类。横坐标表示分类距离

原文链接

https://doi.org/10.1128/spectrum.00307-23
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来源:科学私享
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