Redian新闻
>
可能是史上最实用的GEO数据库挖掘教程

可能是史上最实用的GEO数据库挖掘教程

公众号新闻

作为一名科研小白,我对科研有着强烈的想法与好奇心,想着入组之后,好好努力,早点发篇SCI。

但是!导师把我交给师兄师姐之后便无影无踪了,师兄师姐忙于自己课题,根本无暇顾及我的科研,只让我做一些杂活。

我想靠实验发SCI,没人带;想靠生信发文,又不会R语言……

只能自己东一榔头西一棒子地进行实验,科研的速度迂回前进,自信心逐渐消磨殆尽……

一个偶然的机会,我得知学姐靠着GEO数据库,零代码零实验发了篇5+SCI!

出于好奇,我以“GENE EXPRESSION OMNIBUS”为关键词检索PubMed,截止目前已发表研究论文10884篇2020年1785篇,2021年2450篇,2022年3072篇,呈现快速增长的形势……不难看出,GEO数据挖掘真的超火!

图源PubMed

GEO数据库收录数据范围相当广泛,无论是肿瘤、非肿瘤、芯片、NGS、差异分析,还是分子验证……你能想到的数据,这里几乎都有!而且还可以做一些在线分析。

那GEO数据库究竟为什么这么受欢迎?

01

更新速度快且免费

数据由作者自由上传,所以更新速度非常快,并且完全免费,而且常有领域最新研究。

02

数据量丰富

GEO作为世界上最大的免费基因表达的储存数据库,包含了大约16亿个测量值,其中大部分都是未被解读的原始数据。

03

包含肿瘤和非肿瘤

同时含有肿瘤数据和非肿瘤数据,适合不同专业的小伙伴进行挖掘!

04

自带分析工具

可以选择Analyze with GEO2R,直接利用NCBI自带的工具进行数据分析。

大数据时代,科研人想要拿别人的数据,发自己的文章!学会GEO数据挖掘就应当提上日程。

这也是我想把7天入门GEO数据库训练营推荐给大家的原因。

GEO数据库训练营解螺旋专业团队精心打造,专门针对小白,每天抽出半小时,7天0基础就能入门。

看这课程大纲就知道,GEO数据库训练营绝对是细节化梳理,系统化学习

GEO免费训练营大纲👇

名超火爆,已经有上千学员通过这款课程迅速入门!

更重要的是,这么靠谱的课程,限时免费!是的,你没听错!为大家争取到7天GEO数据库训练营 100 个限时免费名额,赶紧先扫码抢占名额吧!


CEO数据库检索、下载
在线分析
 7天CEO数据库挖掘入门 
教你用别人的数据
发自己的高分SCI
仅限前100名0元
扫码抢位
👇👇👇

1

系统化教学 适合小白入门


GEO数据库检索、下载

GEO数据库提供了两种检索模式,一种是常用的Datasets子数据库,我们所需要的大部分数据集都是从里面下载的。
另一种是Profile子数据库,以基因为单位,检索其相应癌种的基因表达谱,用得较少。
带教老师会以实操的方式,演示GEO两种检索方式以及数据下载的具体操作方法。

GEO2R在线分析

GEO数据库提供官方在线工具GEO2R,用于比较2组或多组样本以获得差异性表达的基因,该工具主要是对系列数据(series)进行分析。

CEO数据库检索、下载
在线分析
 7天CEO数据库挖掘入门 
教你用别人的数据
发自己的高分SCI
仅限前100名0元
扫码抢位
👇👇👇

GEOexplorer工具

GEOexplorer 是一个用于探索、生成和分析转录组数据集的 Web 服务器和 R 包,使用户能够充分利用来自自己内部实验和公开数据库的高通量数据,且不需要编程能力或深入的统计知识即可使用。

2

专业老师实操演示 0基础也能学会


由解螺旋翡翠讲师郑玥主讲,郑玥老师目前已经发表10+篇SCI文章,担任多个医学专业期刊的审稿工作


3

专业老师指导 随时为你解答


每个班单独建群,由专属的班主任老师进行服务。

不懂的问题可在社群咨询,也可以私聊班主任,或直接丢群里都能得到解答。


其适合以下这些小伙伴:

01

零基础,但急需发SCI;

02

想做生信但是不知从哪入手;

03


不会挖掘、下载、分析数据。





科研路上,有GEO数据库加持,你离SCI发表又近了一步!

一起学习GEO数据库挖掘,把省下来的时间专注于科研,或者去做你想做的事情,这样过你的人生,你一定能够成为你想要成为的人!


福利来袭

CEO数据库检索、下载
在线分析
 7天CEO数据库挖掘入门 
教你用别人的数据
发自己的高分SCI
仅限前100名0元
扫码抢位

微信扫码关注该文公众号作者

戳这里提交新闻线索和高质量文章给我们。
相关阅读
无论是自动化运维、数据库运维,大数据运维或云计算运维等,几乎都离不开 Linux这大概是史上最冤的一次违章2023或是史上最热一年,气候癌症灾难已难避免?没有洞洞的洞洞鞋来了!这可能是史上最好看的 Crocs太实用了!超硬核的SCI投稿教程来啦!选刊选得好,文章接收没烦恼......(附Coverletter书写)渡十娘|《乔治娅》:小网红Geogeo用一双无瑕的大眼睛治愈你的夏天Zilliz星爵:向量数据库,开创AI原生数据基础软件时代 | GGV OMEGA访谈录重返希腊:圣岛日落、徒步海景山道复现2.8分生信文章,TCGA数据库挖掘,0代码搞定6张图12岁一脱成名,她是史上最惨艳星《幾度花落時》大批澳人崩溃!一毛钱退税拿不到,反欠ATO数千刀!“该死的税务局”空港空旷最实用机场穿搭:省托运费,穿1单品连MacBook都能装入住一年,最实用的8个装修细节,建议直接抄!【装修干货】我是如何“白嫖”公共数据,用GEO数据库发表自己的第一篇SCI,速看!LinkedIn图数据库LIquid:为9.3亿会员提供实时数据访问出海从0到1精炼实用教程,融云《社交泛娱乐出海作战地图》即将线下发布|甲子光年超实用的100句工作邮件实用英语,收藏起来慢慢学习!数据库er的夏日盛宴 | 2023 可信数据库发展大会演讲议题征集限时开启!“白嫖”公共数据,用GEO数据库发表自己的第一篇SCI【谈谈女人的嫉妒】GEO+TCGA双重挖掘!8图3表,3.9分肿瘤生信SCI全文复现扯白||她或许是史上最不爱哗众取宠的时尚ICON“人性”新论马斯克用的GLP-1减肥药火了,背后垄断巨头是谁?|直播预告轻!薄!透!爽!它绝对是史上最舒服的内衣!!你敢信“白嫖”公共数据,用GEO数据库发表自己的第一篇SCI !迎向浪潮之巅,GOTC 2023 数据与数据库技术专题论坛即将召开OPPO造芯的最后18分钟:CEO数次低头哽咽,3000人团队原地解散他是史上最牛逼的坦克指挥官,单枪匹马干掉英国50多辆坦克和装甲图片太low,SCI论文一而再的被拒!师兄忍无可忍,拿出绘图杀手锏——ImegeJ实用教程TCGA数据库挖掘,差异分析GSEA富集分析SCI全文复现澳洲年轻人都在哪些区购房?最新数据曝光,这里的房子首付最实惠!从数据采集到价值挖掘,工业大数据这条路该怎么走?
logo
联系我们隐私协议©2024 redian.news
Redian新闻
Redian.news刊载任何文章,不代表同意其说法或描述,仅为提供更多信息,也不构成任何建议。文章信息的合法性及真实性由其作者负责,与Redian.news及其运营公司无关。欢迎投稿,如发现稿件侵权,或作者不愿在本网发表文章,请版权拥有者通知本网处理。