斯坦福校长辞职,调查显示本人未涉及研究不端,但论文存在严重缺陷 | 环球科学要闻
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Marc Tessier-Lavigne(图片来源:L.A. CICERO/Stanford News Service)
调查显示斯坦福校长本人未有学术不端,但他仍将在下个月辞职
7月19日公布的一项调查结果显示,斯坦福大学校长马克·特希尔-拉维尼(Marc Tessier-Lavigne)未涉及学术不端。去年11月,特希尔-拉维尼被学生刊物《斯坦福日报》发现数篇论文涉嫌数据篡改,不久后斯坦福大学董事会委托一名前联邦法官和凯易律师事务所进行调查,并由5名主要科学家组成外部小组协助。如今调查结果出炉,但特希尔-拉维尼仍决定于下月辞职。
2022年11月29日,《斯坦福日报》报道称,欧洲分子生物学学会会刊(EMBO)向他们证实,已在调查一篇特希尔-拉维尼与他人合作发表于2008发表在该期刊的论文,这篇论文曾在大众审查网站PubPeer被公开指控存在图像篡改。当时,《斯坦福日报》也联系了生物学家兼著名学术诚信调查者伊丽莎白·比克(Elisabeth Bik),后者表示特希尔-拉维尼在《科学》和《自然》杂志发表过的另外三篇论文同样存在严重问题。此次调查组一共调查了12篇受到质疑的论文,特希尔-拉维尼是这些论文的中间作者或通讯作者。如今公布的调查报告,基于超过5万份文件、对超过50人的访问,以及法医学专家的意见,认为在7篇特希尔-拉维尼作为中间作者的论文中,他对数据篡改不承担责任,而主要作者承担责任。
针对另外5篇特希尔-拉维尼作为通讯作者或资深作者发表的论文,调查报告则显示它们都存在严重缺陷,其中包含1999年发表在《细胞》杂志的一篇论文,2001年的两篇《科学》论文,以及2004年和2009年的两篇《自然》论文。调查认为,其中4篇论文有“其他人明显操纵数据”,比如一张结果图在多个实验中重复使用、一篇文章中的结果图在另一篇文章中出现等等。但报告总体认为,特希尔-拉维尼“对研究数据的篡改没有实际了解”且“没有鲁莽地未能发现问题”,不过报告也提到当人们在20多年来的几个时间点出现质疑声时,他没有做出充分的回应。调查报告发表后,特希尔-拉维尼表示,针对自己的欺诈和不当行为指控已经被驳斥,但为了大学的利益他仍将结束自己的任期。
对人类来说,细胞的组织方式和细胞间的相互作用决定了器官和组织的功能。HuBMAP计划旨在绘制整个人体的细胞排列方式,帮助科学家研究细胞如何工作,以及细胞间的关系如何影响个体健康。为此,HuBMAP合作组一直在开发能在单细胞水平上绘制组织和器官内细胞分子组成空间图谱的工具,这些组成包括RNA、蛋白质和代谢物。这类工具已被用来构建人类肠道、肾脏以及与胎盘相连组织的参考细胞图谱。昨日,《自然》发表了三篇论文,报道了人体肠道、肾脏和母胎界面(胎盘和母体细胞共存处)的参考细胞图谱。这些工作揭示了各类型细胞排列以及它们与人体不同组织和器官相互作用的新信息,是研究人体生物学和疾病的宝贵资源。
美国斯坦福大学Michael Snyder带领的团队研究了人体肠道,这个复杂的器官有许多不同的结构和功能(从消化到支持免疫系统)。通过分析9个人的8个肠道部位,研究人员发现不同位置肠道组成具有巨大差异,并且发现了新的上皮细胞亚型,以及不同细胞类型会形成“社区”,其中有些“社区”可以特异性地调节免疫应答。这项研究结果揭示了促进肠道发挥功能的复杂、差异化的细胞组成。
美国华盛顿大学Sanjay Jain带领的团队分析了45个健康的和48个生病的人体肾脏。这些器官的损伤会触发肾细胞变化,最终影响肾脏功能。研究人员绘制了肾脏不同区域的51种主要细胞类型的单细胞和空间图谱,还发现了会在急性或慢性损伤下发生变化的细胞状态,以及肾脏免疫细胞、基质细胞和上皮细胞“社区”。
美国斯坦福大学Michael Angelo带领的团队构建了妊娠前半期的人体胎盘图谱。他们分析了来自66例人体母胎界面(母体和胎盘细胞共同为胎儿提供生命支持的位置)样本的约50万个细胞和588个动脉。具体而言,他们研究了胎盘和子宫之间的界面,这里的母体动脉会发生改变,从而给胎儿供血。这些图谱覆盖了不同的发育阶段(妊娠6-20周),识别了胎盘和免疫细胞之间的相互作用。
石墨烯。图片来源:wikimedia, CC BY-SA 3.0
石墨烯是一种只有一个原子层厚度的碳,首次于2004年通过胶带法被撕了出来。但目前,石墨烯大规模生产的方法需要超过1000℃的温度,非常困难。据New
Scientist报道,7月10日在法国里昂举行的Goldschmid地球化学会议上,来自日本北海道大学的研究人员表示他们在南非金矿赋存的32亿年前的岩石中,首次发现了天然形成的石墨烯——这片金矿是在温度低于300℃的条件下形成的。
研究团队在南非示巴金矿采集了24个岩石样本,然后利用电子显微镜分析,发现了不寻常且罕见的碳结构,包括几微米长的细碳丝和几微米宽的薄片。他们认为,这也许是在岩石中尺寸较大的纳米晶粒周围形成的石墨烯薄膜。此外,研究人员通过测量碳同位素水平,发现这些碳很有可能来自在海洋表面附近死亡并落入海底的细菌。这些沉入海底的“碎屑”会随后形成含碳化合物,并在高温高压的条件下,最终转化为特殊形式的碳。研究人员表示,这些物质的确切结构和形式仍有待确定。例如,石墨烯薄膜看起来是透明的,而不是通常呈现出的黑色,表明它的结构中可能还含有其他元素。
乳头状颅咽管瘤(PCP)是一种发病率很高的罕见脑肿瘤。其治疗手段通常为手术和放射治疗,但由于肿瘤很难被完全切除,且放疗会带来一定的机体损伤,因此患者可能会遭受长期的痛苦。来自美国医疗机构麻总百瀚(Mass General Brigham)的研究人员提出,直接干预PCP致病基因能够有效阻止病情发展,使肿瘤大幅度缩小。基于此疗法,麻省总医院癌症中心(Mass General Cancer Center)进行了II期临床试验,其结果显示,患者肿瘤平均缩小了91%。这项研究成果被发表在《新英格兰医学杂志》。
此前,布莱根妇女医院的病理实验室发现,大约95%的PCP患者都带有基因BRAF的一种突变,称为BRAF V600E突变,是引发癌变的重要因素。近期, BRAF/MEK抑制剂被美国食品药物管理局(FDA)批准作为同样存在该突变的黑色素瘤(melanoma)的治疗药物。这使得研究人员提出假设:该药物也能用来治疗PCP。为了验证该假设,研究人员通过BRAF V600E突变筛查出16名PCP患者参与试验,随后使用BRAF/MEK抑制剂进行治疗,其中15名患者完成了至少1个治疗周期(28天),中位数为8个治疗周期。经过4个周期的治疗后,患者肿瘤缩小的百分比中位数为91%。值得注意的是,药物仍会产生副作用,其中最常见的是皮疹。接下来的研究方向,一是测出该药物的最佳治疗周期数量,二是推动更多针对于脑膜瘤和颅内转移瘤的的精准医疗临床试验。
· 天文学 ·
近日,一项发表于《自然》的研究描述了韦布空间望远镜(JWST)的观察,展示了少于10亿年历史的星系中存在碳尘埃。这些元素比氢和氦重,此前认为是只有更古老星系(超过130亿年)中才有的特征,如银河系。这些较古老的星系被观测到对特定紫外频率光的吸收出现“驼峰”,即存在碳尘埃粒,如芳香烃。
研究人员使用JWST的设备对年轻得多的星系——包括一个大爆炸后仅存在约10亿年的星系——进行观测时,在紫外吸收光谱中观察到了一个类似驼峰,表明这样的星系也存在含碳的尘埃。研究人员表示,早期星系中碳粒形成的时间相对较短意味着存在一个快速产生的过程。这些发现挑战了现有的、认为较重元素的形成没有那么快的假设。
撰文:栗子、王怡博
编辑:栗子、王怡博
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